دکتر حبیب ضیغمی
-
ادغام هوش مصنوعی در تشخیص های آزمایشگاهی بالینی، انقلابی در تشخیص، شناسایی و مدیریت بیماری های عفونی ایجاد کرده است. تکنیک های مبتنی بر هوش مصنوعی، تجزیه و تحلیل سریع تر، دقیق تر و جامع تر منابع داده های متنوع مرتبط با تشخیص بیماری های عفونی را ممکن می سازند. مدل های یادگیری ماشینی را می توان بر روی داده های ساختار یافته مانند علائم بیمار، نتایج آزمایش های آزمایشگاهی و اطلاعات جمعیت شناختی برای کمک به تشخیص بیماری و پیش بینی خطر آموزش داد. الگوریتم های یادگیری عمیق می توانند داده های بدون ساختار مانند تصاویر میکروسکوپ دیجیتال، طیف های جرمی و توالی های ژنومی را برای شناسایی خودکار عوامل بیماری زا تجزیه و تحلیل کنند. در این مقاله به بررسی و تحلیل کاربردهای هوش مصنوعی در تشخیص های آزمایشگاهی می پردازیم، خواهیم دید که چگونه هوش مصنوعی می تواند دقت و کارایی تشخیص های آزمایشگاهی را افزایش داده و در نهایت منجر به بهبود نتایج درمانی بیماران شود.
کلید واژگان: تست های آزمایشگاهی, تشخیص, هوش مصنوعیArtificial intelligence has revolutionized the diagnosis, identification, and management of infectious diseases in clinical laboratory diagnostics. Techniques based on artificial intelligence enable faster, more accurate, and more comprehensive analysis of diverse data sources related to the diagnosis of infectious diseases. Machine learning models can be trained on structured data such as patient symptoms, laboratory test results, and demographic information to aid in disease diagnosis and risk prediction. Deep learning algorithms can analyze unstructured data such as digital microscope images, mass spectra, and genomic sequences to automatically identify pathogens. This article reviews and analyzes the applications of artificial intelligence in laboratory diagnostics, exploring how AI can increase the accuracy and efficiency of laboratory diagnoses and ultimately lead to improved patient outcomes.
Keywords: Laboratory Tests, Diagnosis, Artificial Intelligence -
مقدمه و روش
بیماری قلبی عروقی (CVD) یکی از علل اصلی مرگ و میر در سراسر جهان است و شیوع آن نسبت به دهه های گذشته به دلیل پیری جمعیت جهان همچنان در حال افزایش است. هر ساله موارد بیمارستانی CVD که یک نگرانی حیاتی بهداشتی در کشورهایی با درآمد پایین و متوسط است، افزایش می یابد. پیشگیری اولیه از CVD در درجه اول به توانایی شناسایی افراد در معرض خطر، قبل از ایجاد رویدادهای آشکار بستگی دارد. این امر نیاز به طبقه بندی دقیق ریسک را برجسته می کند. ارزیابی ریسک برای شناسایی افراد در معرض خطر که نیاز به توجه فوری دارند و همچنین به منظور هدایت شدت درمان پزشکی برای کاهش خطر بعدی CVD بسیار مهم است. مجموعه رو به رشدی از تحقیقات بالینی با هدف شناسایی این افراد با جستجوی مولکول های زیستی وجود دارد. پیشرفت های مرتبط با CVD در 30 سال گذشته و همچنین پیشرفت های علمی در تحقیقات نشانگرهای زیستی منجر به ایجاد روش های غربالگری حساس تر، تاکید بیشتر بر تشخیص، تشخیص زود هنگام این بیماری ها، درمان های بهبود یافته و نتایج بالینی مطلوب تر در جامعه شده است.
نتایج و بحث:
تعداد زیادی از نشانگرهای زیستی جدید برای پیش بینی حوادث قلبی عروقی شناسایی شده اند که این نشانگرها نقش مهمی در تعریف، پیش بینی و تصمیم گیری در مورد مدیریت حوادث قلبی عروقی دارند. این بررسی کاربردهای بالینی بیومارکرهای کلاسیک و جدید مانند تروپونین قلبی (cTn)، تروپونین با حساسیت بالا (cTn-hs)، گالکتین-3 (Gal3)، منبع تومورزایی 2 (ST2)، پپتید ناتریورتیک نوع B و C (BNP و CNP)، فاکتور تمایز رشد 15 (GDF-15)، میلوپراکسیداز (MPO)، پروتیین اتصال دهنده به اسید چرب نوع قلبی (H-FABP)، پروتیین واکنشی C با حساسیت بالا (hsCRP)، فسفولیپاز A2 مرتبط با لیپوپروتیین (Lp-PLA2)، میکرو RNA ها (miRNAs) و غیره را مورد بحث قرار داده است.
کلید واژگان: تست تشخیصی, بیماری های قلبی عروقیIntroduction and MethodsCardiovascular disease (CVD) is one of the main causes of death worldwide, and its prevalence continues to increase compared to previous decades due to the aging of the world population. Hospital cases of CVD, which are a critical health concern in low- and middle-income countries, are increasing every year. Primary prevention of CVD depends primarily on the ability to identify at-risk individuals before overt events development. This highlights the need for accurate risk stratification. Risk assessment is important to identify at-risk individuals who require immediate attention, as well as to guide the intensity of medical treatment to reduce subsequent CVD risk. There is a growing body of clinical research aimed at identifying these individuals by searching for biomolecules. Advances related to CVD in the past 30 years, as well as scientific advances in biomarker research, have led to more sensitive screening methods, greater emphasis on diagnosis, early detection of these diseases, improved treatments, and more favorable clinical outcomes in society.
Results and discussionA large number of new biomarkers have been identified for predicting cardiovascular events, and these markers play an important role in defining, predicting and deciding on the management of cardiovascular events. This review of the clinical applications of classical and new biomarkers such as cardiac troponin (cTn), high-sensitivity troponin (cTn-hs), galectin-3 (Gal3), Source of Tumorigenicity2 (ST2), type B and C natriuretic peptide (BNP and CNP), growth differentiation factor 15 (GDF-15), myeloperoxidase (MPO), heart-type fatty acid-binding protein (H-FABP), high-sensitivity C-reactive protein (hsCRP), lipoprotein-associated phospholipase A2 (Lp-PLA2 ), microRNAs (miRNAs) and others have been discussed.
Keywords: Diagnostic Test, Cardiovascular Diseases -
سابقه و هدف
پوسیدگی دندانی شایعترین بیماری مزمن فراگیر در دنیاست. برای جلوگیری از گسترش پوسیدگی و کنترل آن روش های مختلف پیشگیری و درمانی وجود دارد. با توجه به عوارض محصولات شیمیایی و کارایی نانو ذرات، پژوهش حاضر به منظور تعیین اثر ضد میکروبی نانو ذرات نقره تهیه شده به روش سنتز سبز عصاره گیاه خرمالو بر برخی باکتری های دهان صورت گرفت.
مواد و روش هادر این مطالعه آزمایشگاهی عصاره گیاه خرمالو به روش ماسراسیون (خیساندن) در دانشگاه علوم پزشکی زنجان تهیه شد. تاثیر نانو ذرات نقره تهیه شده به روش سنتز سبز در رقت های مختلف نسبت به انتروکوک، استرپتوکوک موتانس، استرپتوکوک سوبرینی، لاکتوباسیل، استرپتوکوک سالیواریوس توسط چاهک پلیت تعیین گردید. متغیرهای حداقل غلظت مهار کنندگی (MIC: minimum inhibitory concentration) و حداقل غلظت کشندگی (MBC: minimum bacterial concentration) محاسبه شد. اطلاعات توسط نرم افزار SPSS24 وارد کامپیوتر و با تست های Wilcoxan, Mann-,withny Kruskal-wallis تحلیل شدند.
یافته هامقادیر MIC برای استرپتوکوک موتانس و سالیواریوس و انتروکوک μgr⁄mL 1024 و برای استرپتوکوک سوبرینی و لاکتوباسیل μgr⁄mL512 برآورد گردید. لذا میزان مقاومت گونه های استرپتوکوک موتانس و سالیواریوس و انتروکوک نسبت به نانو ذرات نقره تولید شده به روش سنتز سبز گیاه خرمالو از گونه های استرپتوکوک سوبرینی، لاکتوباسیل بیشتر بود. (0/014=P) بر اساس نتایج هاله عدم رشد و آزمایش MBC، میزان مقاومت باکتری ها نسبت به نانو ذرات نقره تولید شده به روش سنتز سبز گیاه خرمالو به ترتیب انتروکوک، استرپتوکوک موتانس، لاکتو باسیل، استرپتوکوک سالیواریوس و سوبرینی کاهش یافت.
نتیجه گیرینانو ذرات نقره تهیه شده به روش سنتز سبز گیاه خرمالو اثر باکتریواستاتیک بر باکتری های دهان داشتند. با توجه به زیست بوم این گیاه شاید بتوان از آن در تولید دهانشویه و خمیر دندان بهره برد.
کلید واژگان: عوامل ضد عفونت, باکتری, نانوپارتیکل, عصاره گیاهیBackground and AimDental caries is the most widespread chronic disease.There are several medical procedures to prevent and control its extension.Based on side effects of chemical products and effectiveness of nanoparticles, this study done inorder to evaluate the antimicrobial effect of silver nanoparticles produced by green synthesis using diospyros extract on oral bacteria.
Materials and MethodsIn this experimental study the diospyros extract was produced by Maceration procedures at Zanjan university of medical sciences in 2019 .The effect of silver nanoparticles produced by green synthesis was determined on various concentrations of Enterococcus, Streptococcus Mutans, Streptococcus Subrinus, Streptococcus Salivarius, Lactobacillus micro organisms by cap plate method. Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Bacterial Concentration (MBC) factors was determined. The datas was imported to the SPSS 24 program and analysed by Wilcoxan , Mann-Withny, Kruskal-wallis tests.
Results.the MIC factor for streptococcus mutans, enterococcus, streptococcus salivarius was determined 1024 μgr⁄mL and for streptococcus subrinus and lactobacillus 512 μgr⁄Ml. Although the antimicrobial resistance due to MBC factor is decreased from Enterococcus to, streptococcus mutans, lactobacillus, streptococcus salivarius, streptococcus subrinus sequentially (P=0.014). The finding showed that the antimicrobial resistance of streptococcus mutans, enterococcus, streptococcus salivarius due to MIC factor is more than streptococcus subrinus and lactobacillus.
ConclusionThe results showed the bacteriostatic effect of silver nanoparticles produced by green synthesis using Diospyros extract on oral pathogens.due to herbal source an being native, maybe this plant can be useful to produce mouthwashes and toothpastes.
Keywords: Antimicrobial effect, Nanoparticles, herbal extract -
براساس گزارش سازمان جهانی بهداشت WHO، بیماری های قلبی عروقی CVDs)) موجب مرگ 9/17 میلیون نفر در سال در سراسر جهان می شوند که معادل 31 درصد از کل مرگ ها می باشد. از این تعداد، 85 درصد به طور مستقیم با سکته مغزی و حمله قلبی مرتبط هستند. CVD اصطلاحی است که برای توصیف انواع بیماری ها و اختلالاتی که رگ های خونی و در نهایت قلب را تحت تاثیر قرار می دهند استفاده می شود. آترواسکلروز، نارسایی قلبی و فشار خون بالا عواملی هستند که می توانند منجر به CVD شوند. میکروبیوتای روده به تریلیون ها میکروارگانیسم مشترک در روده اطلاق می شود که به نسبت معینی در روده قرار دارند که تعادل آن ها به راحتی توسط مصرف غذا، سبک زندگی و محیط به هم می خورد. شواهد بسیاری از تاثیر میکروبیوتای روده بر فشار خون و عوارض آن مانند بیماری مزمن کلیه، سکته مغزی، نارسایی قلبی و انفارکتوس میوکارد وجود دارد. میکروبیوتای روده و متابولیت های روده با افزایش فشار خون، دیس لیپیدمی و التهاب سیستمیک در ارتباط بوده و به عنوان ریسک فاکتورهای MI مطرح می باشند. میکروبیوتای روده و متابولیت های آن مانند اسیدهای چرب با زنجیره کوتاه (SCFA)، لیپوپلی ساکاریدها (LPS) و تری متیل آمین N-اکسید (TMAO) بر سلامت قلب و عروق تاثیر می گذارند. ترکیب میکروبیوتای روده تا حد زیادی با قرار گرفتن در معرض عوامل غذایی تعیین می شود. شناسایی دیس بیوز میکروبیوتای روده در بیماری های مختلف و تعیین رابطه علی بین میکروبیوتای روده و بیماری می تواند در فرمول بندی مداخلات درمانی وکاهش عوارض مرتبط با آن مفید باشد. از آنجایی که CVD علت اصلی مرگ و میر در سطح جهان است، بررسی میکروبیوتای روده به عنوان یک منبع مداخله، یک راه جدید و از نظر بالینی مرتبط برای تحقیقات آینده است.
کلید واژگان: دیسبیوزیس, میکروبیوتای روده, بیماری های قلبی و عروقی -
میکروبیوتا مجموعه‌ای از میکروارگانیسم‌ها است که در حفره دهان، دستگاه تنفسی و روده موجودات چند سلولی زندگی می‌کند. میکروبیوتا اثرات فیزیولوژیکی و پاتولوژیک متعددی را بر ارگانیسمی که در آن به سر می‌برد اعمال می‌کند. توجه فزاینده‌ای به تعامل میزبان و میکروبیوتا معطوف شده است، که بسیار به توسعه سرطان زایی مرتبط است. تغییرات ایجاد شده در ترکیب میکروبیوتا همراه با دیس بیوزیس، زیستگاه گوارشی نامتعادلی را برای میکروبیوتا فراهم کرده است که باعث تولید متابولیت های غیرطبیعی می‌شود. پولیپ‌های آدنوماتوز یکی از نشانه‌های رایج سرطان کولورکتال، دومین علت اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان زایی در سراسر جهان در نظر گرفته می‌شوند. شناخت ارتباط ترکیب میکروبیوتای روده با پولیپ های آدنوماتوز کولون ممکن است یک ابزار غیرتهاجمی برای تشخیص موثر و همچنین با کاهش هزینه‌های مراقبت بهداشتی همراه باشد. در این مقاله مروری سعی بر این است تا به طور خلاصه ارتباط بین میکروبیوتای روده و پولیپ های آدنوماتوز را مورد بررسی قرار دهیم.
کلید واژگان: پولیپ های آدنوماتوز کولون, میکروبیوتای روده, دیس بیوزیسMicrobiota is a collection of microorganisms that live in the oral cavity, respiratory tract and intestine of multicellular organisms. Microbiota exerts numerous physiological and pathological effects on the organism in which it resides. Increasing attention has been directed to the host-microbiota interaction, which is highly relevant to the development of carcinogenesis. Changes in the composition of the microbiota along with dysbiosis have provided an unbalanced digestive habitat for the microbiota, which causes the production of abnormal metabolites. Adenomatous polyps are a common symptom of colorectal cancer, the second leading cause of cancer-related deaths worldwide. Understanding the relationship between gut microbiota composition and colon adenomatous polyps may be a non-invasive tool for effective diagnosis as well as reducing health care costs. In this review article, we try to briefly examine the relationship between intestinal microbiota and adenomatous polyps.
Keywords: Colon adenomatous polyp, Intestinal microbiota, Dysbiosis -
سابقه و هدف
دروس عملی و آزمایشگاهی در پرورش مهارت های تخصصی دانشجویان پزشکی اهمیت و جایگاه ویژه ای دارد. هدف از انجام این مطالعه مقایسه روش استفاده از لاگ بوک و روش سنتی گزارش کار، در آموزش و ارزیابی دروس میکرب شناسی عملی در دانشگاه علوم پزشکی زنجان می باشد.
مواد و روش هادر این مطالعه نیمه تجربی با یک گروه کنترل، ابتدا دانشجویان رشته پزشکی به دو گروه شاهد و آزمون تقسیم شدند. ابتدا لاگ بوک ساختارمند برای درس عملی باکتری شناسی مطابق با طرح درس و سرفصل دروس ابلاغی وزارت بهداشت طراحی شد. سپس دانشجویان گروه مداخله با تکمیل لاگ بوک مورد ارزیابی قرار گرفتند. میزان رضایتمندی و یادگیری دانشجویان در پایان ترم تحصیلی با استفاده آزمون تی مستقل مورد مقایسه قرار گرفت.
یافته هادر نمرات درس باکتری شناسی عملی اختلاف آماری معنی داری بین دو گروه آزمون (31/2 ± 82/14) و شاهد (87/2 ± 04/15) مشاهده نشد. رضایتمندی از کاربرگ طراحی شده در حیطه های مختلف اهداف آموزشی، انگیزش، ارزشیابی و روش تدریس در سطح زیاد تا خیلی زیاد به دست آمد.
نتیجه گیریاستفاده از لاگ بوک آزمایشگاه، موجب شفاف سازی اهداف آموزشی، انسجام مطالب و اطلاعات طبقه بندی شده، ترغیب دانشجویان به جستجوی مطالب علمی مرتبط با موضوعات درسی، افزایش یادگیری فعال، تعامل بیشتر دانشجویان با استاد درس و با یکدیگر می گردد.
کلید واژگان: ارزشیابی, کاربرگ آزمایشگاه, لاگ بوک, باکتری شناسیBackground and ObjectiveLaboratory courses have a special importance in developing of medical students' Practical skills. The aim of this study was to comparison of logbook and traditional Laboratory worksheet in teaching and evaluating of Bacteriology courses in accoedance with the educational objectives.
MethodsThe students were divided into control and experimental groups. The logbook for practical courses in bacteriology was designed according to the lesson plan and course plan. Then, the students of the intervention group were evaluated by completing the logbook. Students' satisfaction and learning at the end of the semester in the two groups were compared using independent t-test.
FindingsBacteriology course scores were no statistically significant difference between the control and experimental groups (P = 0.137). Satisfactory level in all areas was high to very high.
ConclusionAccording to the analysis of the results of the satisfaction questionnaire, The use of the laboratory log book, causes clarification of educational objectives, classified information, encouraging students to search for scientific materials related to subjects, increasing active learning, and more interaction between students and teacher.
Keywords: Evaluation, Laboratory Worksheet, Log Book, Bacteriology -
زمینه و هدف
میکروبیوتا مجموعه ای از میکروارگانیسم ها است که در حفره دهان، دستگاه تنفسی و روده موجودات چند سلولی زندگی می کند. میکروبیوتا اثرات فیزیولوژیکی و پاتولوژیک متعددی بر میزبانی که در آن زندگی می کند اعمال می کند. توجه فزآینده ای به تعامل میزبان و میکروبیوتا معطوف شده است. پولیپ های آدنوماتوز یکی از نشانه های رایج سرطان روده بزرگ، دومین علت اصلی مرگ ناشی از سرطان در سراسر جهان در نظر گرفته می شوند. مطالعه ما تلاش می کند تا رابطه بین باکتری های لاکتوباسیلوس ، بیفیدوباکتریوم ، انتروکوکوس فیکالیس و فوزوباکتریوم نوکلئاتوم را در نمونه های بافت پارافینه روده بیماران پولیپ آدنوماتوز و افراد سالم نشان دهد.
مواد و روش هادر این مطالعه ، جهت بررسی باکتری های ذکر شده در مجموع 100 نمونه بافت پارافینه روده از بیماران پولیپ آدنوماتوز (50 نفر) و شاهد سالم (50 نفر) جهت حضور ، تعداد کپی و کمیت نسبی گونه های باکتریایی فوق با استفاده از Real-time polymerase chain reaction (PCR)، در مقایسه با ژن مرجع مورد بررسی قرار گرفتند.
نتایجدر نمونه های مورد مطالعه، حضور و تعداد کپی باکتری های انتروکوکوس فیکالیس در نمونه های پولیپ آدنوماتوز به طور معنی داری بیشتر از سه گروه دیگر بود. تفاوت معنی داری در جهت فراوانی و حضور گونه های فوزوباکتریوم نوکلئاتوم و لاکتوباسیلوس بین دو گروه مشاهده نشد. همچنین کاهش میانگین تعداد گپی و فراوانی نسبی جهت گونه باکتریایی بیفیدوباکتریوم درپولیپ آدنوماتوز نسبت به گروه شاهد به دست آمد.
نتیجه گیریمطالعه ما تعداد بیشتری از باکتری انتروکوکوس فیکالیس و کاهش تعداد جهت گونه باکتریایی بیفیدوباکتریوم را در نمونه های بافت پارافینه روده بیماران مبتلا به پولیپ آدنوماتوز نسبت به گروه شاهد نشان داد. با این حال، هر گونه ارتباط بین دیس بیوز میکروبیوم روده و پولیپ آدنوماتوز ناشناخته باقی مانده است.
کلید واژگان: میکروبیوم, پولیپ آدنوماتوز, لاکتوباسیلوس, بیفیدوباکتریوم, انتروکوکوس فیکالیس, فوزوباکتریوم نوکلئاتومBackground & AimMicrobiota is a collection of microorganisms that live in the oral cavity, respiratory system and intestine of multicellular organisms. Microbiota exerts numerous physiological and pathological effects on the host in which it lives. Increasing attention has been directed to the interaction of host and microbiota. Adenomatous polyps are one of the common symptoms of colon cancer, the second leading cause of cancer-related death worldwide. Our study tries to show the relationship between Lactobacillus, Bifidobacterium, Enterococcus faecalis and Fusobacterium nucleatum in the intestinal paraffin tissue samples of adenomatous polyp patients and healthy individuals.
Materials & methodsIn this study, in order to investigate the mentioned bacteria in a total of 100 samples of intestinal paraffin tissue from adenomatous polyp patients (50 people) and healthy controls (50 people) for the presence, copy number and relative quantity of the above bacterial species using Real-time polymerase chain reaction (PCR), compared to the reference gene, were investigated.
ResultsIn the studied samples, the presence and number of copies of Enterococcus faecalis bacteria in adenomatous polyp samples was significantly higher than the other three groups. There was no significant difference in the abundance and presence of Fusobacterium nucleatum and Lactobacillus species between the two groups. Also, a decrease in the average number of gaps and the relative abundance of Bifidobacterium species in adenomatous polyps compared to the control group was obtained.
ConclusionOur study showed a higher number of Enterococcus faecalis bacteria and a decrease in the number of Bifidobacterium species in the samples of intestinal paraffin tissue of patients with adenomatous polyps compared to the control group. However, any association between gut microbiome dysbiosis and adenomatous polyps remains unknown.
Keywords: Microbiome, Adenomatous Polyp, Lactobacillus, Bifidobacterium, Enterococcus Faecalis, Fusobacterium Nucleatum -
سابقه و هدف
کاندیدمی (عفونت خون ناشی ازگونه های کاندیدا) یکی از جدیترین مشکلات بخشهای مراقبت ویژه بزرگسالان و نوزادان است. تکنیکهای مولکولی در شناسایی عفونتهای قارچی از جایگاه ارزشمندی برخوردار بوده که درکنار روشهای تشخیص قارچ شناسی مانند تهیه اسمیر و کشت خون، مفید میباشد. این مطالعه با هدف تعیین گونه های کاندیدا جدا شده از کشت خون بیماران بستری در بخشهای انکولوژی و مراقبتهای ویژه بیمارستان ولیعصر، انجام پذیرفت.
مواد و روش ها:
در این مطالعه توصیفی- مقطعی، 154 بیمار از بخش های انکولوژی و مراقبت های ویژه بیمارستان ولیعصر (عج) زنجان در بازه زمانی آبان 1396 تا اردیبهشت 1397 از نظرکاندیدمی مورد بررسی قرارگرفتند. سپس روی نمونه های خون پس از کشت و استخراج DNA، تست واکنش زنجیرهای پلیمراز یا PCR (Polymerase Chain Reaction) انجام گردید.
یافته ها:
در این مطالعه نشان داده شد که کاندیدمی در مردان با میانگین سنی 72 سال به طور چشمگیری بیش از زنان میباشد، به علاوه، نشان داده شد که وجود بیش از یک پراسیجر در بیمار، بروز تب و مصرف آنتیبیوتیک میتواند به عنوان عوامل مهم زمینه ساز در ایجاد کاندیدمی مطرح گردد. نتایج این مطالعه نشان داد که در 2/6 درصد بیماران (کاندیدا آلبیکنس در 1/3درصد و کاندیدا تروپیکالیس 0/65 درصد و کاندیدا گلابراتا 0/65 درصد) کشت خون از نظر رشد مخمر مثبت بوده است.
استنتاجگونه های کاندیدا از جمله عوامل مهم ایجادکننده عفونت خون در بیماران بستری در بخش مراقبتهای ویژه می‌باشند که میزان مرگ و میر ناشی از آنها در صورت عدم تشخیص به موقع میتواند 100درصد باشد.
کلید واژگان: کاندیدا, شناسایی DNA, کشت خونBackground and purposeCandidiasis is one of the most serious problems in adult and neonatal intensive care units. Molecular techniques play a key role in identifying invasive fungal infections and could be of great benefit beside other mycological diagnostic methods such as smear preparation and blood culture. The aim of this study was to detect candida species isolated from patients in oncology unit and intensive care unit in Zanjan Valiasr Hospital, Iran.
Materials and methodsIn this cross-sectional descriptive study, we examined 154 patients between November 2017 and May 2018. Blood culture was done and PCR was carried out after DNA extraction.
ResultsIn this study, Candidemia was found to be considerably higher in men with a mean age of 72 years old compared with women. Also, more than one procedure in a patient, fever, and antibiotic treatments were the main underlying factors causing Candidemia. In this study, blood cultures were positive for yeast growth in 2.6% of the patients (C. albicans in 1.3%, C. tropicalis in 0.65%, and C. glabrata in 0.65 %(.
ConclusionCandida species are among the main causes of blood infection in patients admitted to intensive care units and death rate of the condition can approach 100% in case of late diagnosis.
Keywords: Candida, DNA determination, blood sample -
به دنبال شیوع بیماری های متابولیک در سراسر جهان، دیابت به عنوان شایع ترین بیماری غددی رو به افزایش می باشد. همچنین دیابت پنجمین عامل مرگ و میر در جهان به شمار می آید. بیماران دیابت نوع 2 حدود 90% مبتلایان به دیابت را به خود اختصاص می دهند. مطالعات انجام شده در طی سال های گذشته ارتباط قابل توجهی بین میکروبیوتای روده، دیس بیوزیس روده و ایجاد سندروم متابولیک را نشان می دهد. تغییرات ایجاد شده در ترکیب میکروبیوتا همراه با دیس بیوزیس، زیستگاه گوارشی نامتعادلی را برای میکروبیوتا فراهم کرده است که باعث تولید متابولیت های غیرطبیعی همراه با تغییر در متابولیسم گلوکز و مقاومت به انسولین شده است. کاهش فراوانی Akkermansia muciniphila تقریبا در تمام مبتلایان دیابت نوع 2 و افراد پیش دیابتی وجود داشته است. در این مقاله مروری سعی بر این است تا به طور خلاصه ارتباط بین میکروبیوتای روده و بیماری دیابت نوع 2 را مورد بررسی قرار دهیم.
کلید واژگان: سندروم متابولیک, دیابت نوع 2, میکروبیوتای روده, دیس بیوزیسDiabetes is the most common endocrine disease following the spread of metabolic diseases worldwide. Diabetes is also the fifth leading cause of death in the world. Patients with type 2 diabetes account for about 90% of people with diabetes. Studies over the past years have shown a significant association between intestinal microbiota, intestinal dysbiosis, and metabolic syndrome. Changes in the composition of microbiota with dys Biosis provides an unbalanced digestive habitat for microbiota that results in the production of abnormal metabolites with altered glucose metabolism and insulin resistance. Decreased frequency of Akkermansia muciniphila has been present in almost all patients with type 2 diabetes and pre-diabetic individuals. In this review article, we try to briefly examine the relationship between intestinal microbiota and type 2 diabetes.
Keywords: Metabolic syndrome, Type 2 diabetes, Intestinal microbiota, Dysbiosis -
سابقه و هدف
بیماری های دهان به ویژه پوسیدگی های دندانی، هنوز هم در اکثر کشورهای در حال توسعه شیوع دارد که هزینه زیادی را برای بیمار و سیستم درمانی به همراه دارد. یکی از روش های مهم در کاهش هزینه ها، پیشگیری در ایجاد پوسیدگی است. لذا این تحقیق با هدف بررسی اثر دهانشویه کلرهگزیدین و فلوراید در مقایسه با دهانشویه ترکیبی نانوسیل D1+F بر روی استرپتوکوکوس موتانس در محیط آزمایشگاهی انجام شد.
مواد و روش هادر این مطالعه آزمایشگاهی، از روش چاهک پلیت جهت بررسی قطر هاله عدم رشد دهانشویه ها (کلرهگزیدین 0/2%، فلوراید 0/05%، نانوسیل D1+F) استفاده شد. سپس MIC (حداقل غلظت مهارکنندگی) و MBC (حداقل غلظت کشندگی) دهانشویه ها با روش میکرودایلوشن ارزیابی شد.
یافته هابر اساس نتایج روش چاهک پلیت، قطر هاله عدم رشد برای دهانشویه های فلوراید، کلرهگزیدین و نانوسیل به ترتیب 9، 18 و 32 میلی متر بود. مقادیر MIC برای دهانشویه فلوراید 125 میلی گرم بر میلی لیتر ، دهانشویه کلرهگزیدین 3/9 میلی گرم بر میلی لیتر و برای دهانشویه نانوسیل D1+F نیز 1/95 میلی گرم بر میلی لیتر بود. مقادیر MIC و MBC برای هر دهانشویه با هم برابر بود.
نتیجه گیریبر طبق نتایج مطالعه حاضر، دهانشویه نانوسیل D1+F نسبت به کلرهگزیدین 0/2 درصد و فلوراید 0/05 درصد دارای اثرات ضد میکروبی قوی تری بر روی استرپتوکوکوس موتانس بود.
کلید واژگان: استرپتوکوکوس موتانس, پوسیدگی دندان, دهانشویه, فلورایدBackground & AimOral diseases, especially dental caries, are still prevalent in the most developing countries which cost a lot for patients and the health care system. One of the most important ways to reduce costs is to prevent caries. Therefore, the aim of this study was to evaluate the effect of chlorhexidine and fluoride mouthwashes in comparison with Nanosil D1+F combined mouthwash on Streptococcus mutans in vitro.
Material and MethodsIn this experimental study, well diffusion method was used to evaluate the diameter of the growth inhibition zone of the mouthwashes (chlorhexidine 0.2%, fluoride 0.05%, nanosil D1+F). Then, MIC (minimum inhibitory concentration) and MBC (minimum bactericidal concentration) of the mouthwashes were evaluated by the standard microdilution method.
ResultsBased on the results of the well diffusion method, the diameter of the growth inhibition zone for fluoride, chlorhexidine, and nanosil mouthwashes was 9, 18 and 32 mm, respectively. MIC values were 125 mg/ml for fluoride mouthwash, 3.9 mg/ml for chlorhexidine mouthwash and 1.95 mg/ml for nanosil D1+F mouthwash. The MIC and MBC values were the same for each mouthwash.
ConclusionAccording to the results of the present study, Nanosil D1+F mouthwash had stronger antimicrobial effects on Streptococcus mutans than chlorhexidine 0.2% and fluoride 0.05%.
Keywords: Streptococcus mutans, dental caries, mouthwash, fluoride -
بیماری های عفونی همچنان یک تهدید جهانی محسوب که سالانه افراد زیادی به این بیماری همه گیر مبتلا می شوند. شناخت بهتر چگونگی بیماری زایی باکتری ها، ویروس ها، قارچ ها و انگل ها به همراه تشخیص سریع و درمان عفونت های انسانی برای بهبود نتایج بیماری های عفونی در سراسر جهان ضروری است. در بسیاری از ژنوم باکتری ها و آرکیی باکتر ها، توانستند تناوب های کوتاه پالیندروم فاصله‌دار منظم خوشه ای که با عنوان سیستم کریسپر یا سیستم کریسپر مرتبط با ژن casاست را شناسایی کنند. نقش فیزیولوژیکی این سیستم در پروکاریوت ها با عنوان سیستم ایمنی دفاعی در مقابل مهاجم خارجی، تشخیص داده شده است. از عناصر اصلی این سیستم دفاعی پروکاریوتی، RNA های راهنما کوچک است که نوکلیاز ها را به سوی اسید نوکلییک های مکمل خود در ویروس ها و پلاسمید ها هدایت می کنند. در حال حاضر فناوری CRISPR-Cas9 به طور معمول برای پیشرفت در علم پزشکی بیولوژیکی در حوزه ویرایش کارآمد ژن ها، نقش به سزایی دارند. در این مقاله مروری، به طور خلاصه زیست شناسی و مکانیسم سیستم های CRISPR-Cas را مورد بررسی قرار می دهیم و همچنین کاربردهای جدید را برای ارزیابی این سیستم از جمله: ارتباط بین میزبان و پاتوژن، تشخیص دقیق، پیشگیری و درمان بیماری های عفونی را مورد بحث قرار خواهیم داد.
کلید واژگان: بیماری های عفونی, سیستم CRISPR-Cas, ویرایش ژنوم -
زمینه
اسینتوباکتر بومانی با قابلیت کسب مقاومت با مکانیسم های جدید تبدیل به مشکل جهانی در عفونت های بیمارستانی شده است. هدف از انجام این مطالعه، تعیین فراوانی سویه های مقاوم و ژن های مقاومتی و نیز تیپ بندی مولکولی سویه های بیمارستانی در زنجان بود.
مواد و روش ها250 نمونه کلینیکی جدا شده از بیماران بستری در بخش مراقبت های ویژه بیمارستان های زنجان، کشت داده شده و ایزوله ها به روش بیوشیمیایی و ردیابی ژن blaOXA-51، تعیین هویت شدند. الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی سویه ها تعیین شد. حضور اینتگرون های 1، 2، 3 و همچنین ژن های اگزاسیلینازی با روش واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) بررسی گردید. تیپ بندی به روش پالس فیلد ژل الکتروفورز (PFGE) انجام شد. ارتباط بین ژن های مقاومتی و الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی و کلاسترها تعیین گردید.
یافته هااز مجموع 250 نمونه، 68 ایزوله به عنوان اسینتوباکتر تشخیص داده شده که از این میان 48 ایزوله به عنوان اسینتوباکتر بومانی شناسایی شدند. 94 درصد نمونه ها به عنوان سویه های MDR و 46 درصد به عنوان سویه های XDR و 12 درصد آن ها PDR تشخیص داده شدند. بیشترین میزان مقاومت 48 ایزوله اسینتوباکتر بومانی به سفتازیدیم، سفوتاکسیم و کوتریموکسازول و بیشترین میزان حساسیت به کلسیتین (60 درصد) اختصاص داشت. فراوانی ژن های مقاومتی اینتگرون 1، 2، 3 به ترتیب 60، 28 و 0 درصد بودند. فراوانی ژن های مقاومت به کارباپنم ها برای ژن های blaOXA-23، blaOXA-24، blaOXA-51 و blaOXA-58 به ترتیب: 74، 24، 100 و 4 درصد بود. نمونه های فوق به 26 پالسوتایپ گروه بندی شدند.
نتیجه گیریدر منطقه مورد مطالعه مقاومت به کلسیتین سیر صعودی داشته و وجود تنوع ژنتیکی بالا بیانگر تنوع در سویه های اسینتوباکتر بومانی است.
کلید واژگان: اسینتوباکتر بومانی, اینتگرون, اگزاسیلیناز, PFGE, تیپ بندی ملکولی, مقاومت آنتی بیوتیکیBackgroundBy acquiring resistance and through new mechanisms, Acinetobacter baumannii has turned into a global problem in nosocomial infections. The present study was conducted to determine the frequency of resistant strains and resistance genes and also molecular typing of hospital strains in the city of Zanjan.
Materials and MethodsA total of 250 clinical samples isolated from hospitalized patients in ICUs of Zanjan hospitals were cultured, and identified by the biochemical and blaOXA-51 gene tracking methods. The antibiotic susceptibility test was also run. The presence of integrons 1, 2 and 3, as well as oxacillinase genes was verified by PCR technique, and typing was carried out by the PFGE. The relationship of resistance genes with the antibiotic susceptibility pattern and clusters was determined.
ResultsOf the 250 samples, 68 isolates were identified as Acinetobacter, of which, 48 were Acinetobacter baumannii. 94% of the samples were identified as MDR strains, 46% as XDR strains, and 12% as PDR. The highest resistance of the 48 isolates of A. baumannii was attributed to ceftazidime, cefotaxime, and cotrimoxazole, and the highest susceptibility to Colistin (60%). The frequencies of resistance genes of integrons 1, 2, and 3 were 60%, 28%, and 0% respectively. The frequencies of carbapenem resistance genes for blaOXA-23, blaOXA-24, blaOXA-51, and blaOXA-58 were 74%, 24%, 100%, and 4%, respectively. The above samples were grouped into 26 palsutypes.
ConclusionIn the study setting, resistance to Colistin showed an ascending trend, and high genetic diversity suggested diversity of A. baumannii strains.
Keywords: Acinetobacter Baumannii, Integron, Oxacillinase, PFGE, Molecular typing, Antibiotic resistance -
تشخیص، شناسایی و اندازه گیری کمی پاتوژن های میکروبی برای محافظت از سلامت عمومی حیاتی است. علیرغم این که در حال حاضر تست های مبتنی بر کشت میکروبی و تکنیک های مولکولی متدوال ترین روش های مورد استفاده هستند، این تکنیک ها زمان بر بوده و نیاز به ابزار پیچیده و افراد آموزش دیده دارند. در نتیجه، آنالیز این تکنیک ها هزینه بر می باشد. پیدایش آپتامر، منجر به بر طرف نمودن نواقص سایر روش های مولکولی گردید. همچنین، توانایی اتصال اختصاصی آپتامرها به اهداف مختلف، پتانسیل بزرگی در آن ها به وجود آورده است که می توان از آن ها در شناسایی پاتوژن های گوناگون استفاده کرد. آپتامرها توسط یک فرآیند آزمایشگاهی تدریجی به نام SELEX از کتابخانه های ترکیبی جدا می شوند. مراحل SELEX شامل تکرار مراحل ساخت کتابخانه، اتصال/ جداسازی و تکثیر است. این مطالعه مروری بر روی کاربرد آپتامرها به عنوان عامل شناسایی و درمانی باکتری های بیماریزا است. آپتامرها با توجه به پایداری بالا و همچنین میل ترکیبی بالا در استفاده های بالینی در درمان و تشخیص باکتری های بیماریزا کاربردهای وسیع و گسترده ای دارند. قابلیت ها و کاربردهای آپتامرها و حسگرهای ساخته شده از آن ها در زمینه های علوم مختلف به خصوص تشخیص و شناسایی ویروس ها، توکسین ها و باکتری های بیماریزا اهمیت تحقیق و مطالعه هرچه بیشتر این زمینه را نشان می دهد.
کلید واژگان: آپتامر, باکتری های بیماریزا, تکنیک SELEXDetection, identification and measurement of microbial pathogens is critical for protecting public health. Although microbial culture-based tests and molecular techniques are currently the most commonly used, these techniques are time-consuming and require complex tools and experienced individuals. Consequently, it is costly to analyze these techniques. The emergence of the aptamer led to the elimination of defects of other molecular methods. Also, the ability to specifically bind aptamers to different targets has provided them with great potential that can be used to identify various pathogens. Aptamers are separated from synthetic libraries by a gradual laboratory process called SELEX. The SELEX steps include duplication of library construction, docking / duplication and replication. This study is a review of the use of aptamers as a diagnostic and therapeutic agent for pathogenic bacteria. Aptamers have wide-ranging applications due to their high stability as well as their high affinity for clinical applications in the treatment and diagnosis of pathogenic bacteria. The capabilities and applications of aptamers and their Sensors made in various fields of science, especially the detection and identification of viruses, toxins and pathogenic bacteria, make it increasingly important to research and study this field.
Keywords: Aptamer, Pathogenic Bacteria, SELEX -
زمینه و هدفامروزه رنگ ها کاربرد وسیعی در صنایع مختلف غذایی اعم از صنایع تولید شیرینی، بستنی، نوشیدنی ها، و غیره دارند. رنگ ها می توانند عوارضی شبیه آسم، بیش فعالی در کودکان، و سرطان زایی داشته باشند.از این رو هدف این مطالعه، ارزیابی اثر جهش زایی مستقیم چند نوع از رنگ های طبیعی خوراکی به روش ایمز بود.روش بررسیپس از تهیه 6 رنگ طبیعی از سه برند مختلف، جهش زایی مستقیم آن ها با تست ایمز بررسی گردید. در این تست سوش های سالمونلا تیفی موریوم TA98 و TA100، حامل جهش انتخابی در اپرون هیستیدینHis-،روی محیط کشت گلوکز حداقل در حضور نمونه های رنگ کشت داده شد و تنها باکتری هایی که با جهش برگشتی His+ شده بودند تشکیل کلنی دادند.یافته هاجهش زایی مستقیم رنگ ها از طریق شمارش کلنی های برگشتی در پلیت های حاوی رنگ خوراکی و مقایسه آن با کنترل منفی سنجیده شد. نتایج نشان داد که تعداد کلنی های برگشتی در پلیت های حاوی رنگ های آلبالویی و زرد طلایی شرکت B برای هر دو سویه و قهوه ای تیره شرکت B و C و نارنجی شرکت B به ترتیب برای سویه TA100 و TA98در بعضی غلظت ها بیش از دو برابر پلیت کنترل منفی است و جهش زایی مستقیم نشان دادند. رنگ های سبز تیره و سبز روشن شرکت هایA ،B ،C و زرد طلایی شرکت هایA و C و آلبالویی و نارنجی شرکت C فعالیت جهش زایی مستقیم نداشتند.نتیجه گیریبر اساس نتایج، تعدادی از رنگ های مورد مطالعه علی رغم اینکه طبیعی عنوان شده اند، جهش زایی مستقیم نشان دادند.کلید واژگان: جهش زایی مستقیم, رنگ خوراکی طبیعی, تست ایمز, TA100, TA98Background And ObjectiveNowadays, colors are widely used in various food industries, including sweets, confectionery, ice cream, beverages, and so on. Colors can have asthma-like complications, hyperactivity in children and cancers. Therefore, the aim of this study was to evaluate the direct mutagenic effect of several types of natural colors via Ames method.Materials And MethodsAfter preparation of 6 natural colors from three different brands, their direct mutagenesis was investigated by Ames test. In this test, the strains of Salmonella typhimurium TA98 and TA100, carrying the selective mutation in His-Hiscoprotein Histidine, were cultured on glucose culture medium at least in the presence of color samples, and only the bacteria that had His mutation were colonized.ResultsDirect mutagenicity of the food colors was measured by counting colonies in the plates containing edible color and comparing it with negative controls. The results showed that the number of referent colonies in plates containing cherry red and golden yellow for company B for both strains and the dark brown color of company B and C, and orange color for TA100 and TA98 strains in some concentrations were more than twice comparing the negative control plates and had direct mutagenic effects. The dark green and light green colors of the A, B, C, and golden yellow for companies A, C and cherry red and orange for companies C did not show direct mutagenic activity.ConclusionBased on these results, some of the studied colors, despite being declared natural, showed direct mutagenic activity.Keywords: Direct mutation, Natural edible color, Ames test, TA100, TA98
-
بیوفیلم میکروبی ساختاری از جامعه میکروب ها می باشد که به صورت متصل به سطوح زنده یا غیر زنده یافت می شوند. این ساختارهای سه بعدی همواره در داخل یک ماتریکس پیچیده محصور شده اند. تشکیل بیوفیلم در هر دو رده باکتری های گرم مثبت و گرم منفی مشاهده می شود. در حقیقت یکی از اصلی ترین مکانیسم های بقاء باکتری ها در محیط های مختلف استفاده از همین توان تولید بیوفیلم و زندگی در آن می باشد. شکل گیری آن ها طی چندین مرحله مختلف انجام می شود که طی آن باکتری از فرم پلانکتونی و آزاد در محیط به فرم متصل به سطوح و ثابت تبدیل می شود. در مسیر انجام این رخداد باکتری ها اقدام به تولید و ترشح ترکیباتی با محوریت پروتئین ها می کنند که عملا جامعه آن ها را در برابر شرایط محیطی ایزوله می کند. این ماتریکس قابلیت جذب سایر میکروب های موجود در محیط و در مجاورت خود را نیز دارد. عوارض گسترده ای ناشی از تولید بیوفیلم در مسیر سلامت و زیست انسان ها ایجاد می شود. درصد بالایی از بیماری های عفونی مزمن ناشی از توان بیوفیلم زایی باکتری ها است. همچنین به دلیل شرایط اختصاصی حاکم در محیط بیوفیلم درمان و استفاده از آنتی بیوتیک های علیه آن هم یکی از اصلی ترین چالش های پیش روی علم پزشکی محسوب می شود.کلید واژگان: بیوفیلم میکروبی, ماتریکس خارج سلولی, بیماری های عفونی, آنتی بیوتیMicrobial biofilm are a structure of the microbial community that are found attached to living or non-living surfaces. These three-dimensional structures are always enclosed within a complex matrix. Biofilm formation is observed in both gram-positive and gram-negative bacteria. In fact, one of the main mechanisms of survival of bacteria in different environments is the use of biofilm production and living in it. Their formation takes place in several different stages, during which the bacteria form a planktonic and free form in the environment, converted to form on the surface and fixed. In the course of this event, bacteria produce and secrete protein-centered compounds that virtually isolate their community against environmental conditions. This matrix also has the ability to absorb other microbes in the environment and in its vicinity. The widespread effects of biofilm production on the health and life of humans are caused. A high percentage of chronic infectious diseases is due to the biofilm potential of bacteria. It is also considered as one of the main challenges facing medical science due to the specific conditions prevailing in the biofilm environment and the use of antibiotics against it.Keywords: Microbial biofilm, Extracellular matrix, Infectious diseases, Antibiotic
-
زمینه و هدفپوسیدگی دندان ها نوعی بیماری عفونی قابل انتقال با عوامل متعدد در دهان و یکی از شایع ترین بیماری های مزمن در جهان بوده که هزینه های درمانی فراوانی می طلبد. هدف از انجام این مطالعه، بررسی تاثیر دهانشویه فلوراید 2/0% و فوکس (ترکیبی زایلیتول و فلوراید ppm 920) بر رشد باکتری استرپتوکوک موتانس و لاکتوباسیل بود.روش بررسیدر این مطالعه آزمایشگاهی، جهت بررسی اثر مهارکنندگی دهانشویه ها ابتدا از روش چاهک و سپس از روش MIC (حداقل غلظت مهارکنندگی) استفاده شد. همچنین جهت آنالیز داده ها از نرم افزار Excel 2016 استفاده گردید.یافته هانتایج مطالعه حاضر در روش MIC، بیانگر اثر مهاری هر دو دهانشویه در غلظت های خالص (128 میکروگرم) بود، بدین صورت که دهانشویه فلوراید در غلظت های بالاتر از 32 میکروگرم بر استرپتوکوک موتانس و بالاتر از 2 میکروگرم بر لاکتوباسیل اسیدفیلوس موثر بود و فوکس بر هر دو باکتری تا غلظت های بالاتر از 64 میکروگرم تاثیر داشته و پایین تر از آن بی تاثیر بود. در تست چاهک، هاله عدم رشد دهانشویه فلوراید در غلظت خالص بر روی باکتری استرپتوکوک موتانس mm17 و بر روی لاکتوباسیل اسیدوفیلوسmm 24 به دست آمد و در دهانشویه فوکس صفر بود که بیانگر تاثیر فلوراید بر روی باکتری ها و عدم تاثیر فوکس بود.نتیجه گیریفلوراید به دلیل اثر مهاری خوب در غلظت های مختلف، بر روی استرپتوکوک موتانس و لاکتوباسیل اسید فیلوس در هر دو روش، در مقایسه با دهانشویه فوکس موثرتر بود.کلید واژگان: باکتری, استرپتوکوک موتانس, پوسیدگی دندان, دهانشویه, فلوراید, زایلیتولBackground And AimsDental caries is an infectious disease transmitted by multiple factors in the mouth and one of the most common chronic diseases in the world that requires a lot of treatment expenses. The aim of this study was to evaluate the effect of fluoride 0.2% and Fuchs mouthwash (a combination of xylitol and fluoride 920 ppm) against two bacterial growths (Streptococcus mutans and Lactobacillus acidophilus).Materials And MethodsIn this in vitro study, first the well diffusion method and then MIC method (minimum inhibitory concentration) were used. Data were analyzed with Excell (2016).ResultsThe results of the MIC method showed inhibitory effect of both mouthwashes in pure concentration (128 μg/ml). However, fluoride was effective in concentration higher than 32 μg/ml for Streptococcus mutans and higher than 2 μg/ml for lactobacillus acidophilus. Fuchs was effective for both bacteria at concentration higher than 64 μg/ml and in lower concentration it was ineffective. The results of the well diffusion test showed the inhibition of fluoride mouthwash in pure concentration on the Streptococcus mutans was (17 mm) and on the lactobacillus acidophilus 24 mm was obtained. In Fuchs mouthwash was zero and it represented effectiveness of fluoride on bacteria and ineffectiveness of Fuchs.ConclusionThe fluoride mouthrinse in different concentrations, because of having a good inhibitory effect in both methods on Streptococcus mutans and Lactobacillus acidophilus was more effective compared with that of Fuchs mouthrinse.Keywords: Bacteria, Streptococcus mutans, Dental caries, Mouthwash, Fluoride, Xylitol
-
پیوند میکروب های مدفوعی (Fecal microbiota transplantation) یکی از جدیدترین گزینه های درمانی است که باعث تنظیم توازن ساختار جمعیت میکروبی روده و بهبود عملکرد آن می شود. کولون پستانداران زیستگاهی برای اکوسیستم میکروبی است که باعث افزایش مقاومت بدن در برابر عفونت ها می شود. میکروب های نرمال روده در تحریک سیستم ایمنی موکوسی، سنتز ویتامین های ضروری و افزایش میزان تامین انرژی توسط هیدرولیز کربوهیدرات های پیچیده اهمیت دارند. مطالعات کلینیکی و تجربی نشان می دهند که میکروبیوتای روده ای می توانند باعث تشدید یا بهبود بیماری های التهابی روده و سیستمیک شوند. به دلیل قابلیت آن ها در افزایش مقاومت در برابر عفونت ها و کاهش بیماری های التهابی، امروزه دستکاری جمعیت میکروبی یکی از اهداف محققان است تا بدین طریق بتوانند میزان عفونت های روده ای را کاهش دهند. در حال حاضر مشکلاتی وجود دارند که مانع می شوند تا این روش به طور گسترده مورد استفاده قرار بگیرد که یکی از آن ها مشکلات قانونی است. سازمان غذا و داروی ایالات متحده (FDA) تا کنون به طور کامل این روش درمانی را تایید نکرده است و فقط بیمارانی که سایر شیوه های درمانی در آن ها جواب نمی دهند پیوند مدفوع (FMT) در آن ها انجام می شود. با این حال مطالعات قابل توجهی در جهت بهینه سازی پروتکل های FMT مورد نیاز است تا قبل از به کارگیری این روش درمانی مورد بررسی قرار گرفته و ارزیابی شود.کلید واژگان: میکروبیوتای روده, بیماری های انسانی, پیوند مدفوع, درمانThe human colon is home to a microbial ecosystem that enhances resistance to infection, stimulates mucosal immune defenses, synthesizes essential vitamins, and promotes caloric uptake by hydrolyzing complex carbohydrates. Clinical and experimental studies demonstrated that the colonic microbiota play an essential role in enhancement or reduction of intestinal and systemic inflammatory diseases. Because of its potential to protect against invasion by pathogens, targeted manipulation of microbial populations is a growing focus of investigation as a therapeutic strategy to manage several gastrointestinal disorders. But at the moment there are some legal problems that cause this method cannot widely used for patients. United State FDA has not yet completely approved the procedure and only patients who do not respond to other treatment options, are able to use fecal microbiota transplantation (FMT). However considerable research is required to evaluate the FMT in order to optimize this therapeutic process protocols before using this therapy.Keywords: colonic microbiota, fecal transplantation, Treatment
-
زمینه و هدفسویه های اشریشیاکلی عامل اصلی عفونت مجاری ادراری (UTI) بوده که به گروه بزرگی از اشریشیاکلی های بیماری زای خارج روده ای تعلق دارند. این باکتری ها به چهار گروه اصلی فیلوژنتیک B2، B1 ،A و D تقسیم می شوند. هدف از مطالعه ی حاضرتعیین گروه های فیلوژنتیک در اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک و کامنسال بود و با توجه به افزایش مصرف آنتی بیوتیک ها و افزایش مقاومت دارویی، ارزیابی الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی سویه های اشریشیاکلی و اروپاتوژن جداسازی شده از بیماران مشکوک به عفونت ادراری نیز انجام گرفت.روش بررسیدر این مطالعه ی مقطعی- توصیفی 137 ایزوله ی اشریشیاکلی اوروپاتوژن از بیماران مشکوک به عفونت ادراری از بیمارستان های زنجان و 50 ایزوله از نمونه های مدفوع بالغین سالم جمع آوری شد. بعد از تایید ایزوله ها با روش های بیوشیمیایی و استخراج DNA کل، PCR توسط پرایمرهای اختصاصی برای گروه بندی فیلوژنتیک انجام گرفت. حساسیت آنتی میکروبی ایزوله های تایید شده اشریشیاکلی اوروپاتوژن (باروش دیسک دیفیوژن)، طبق دستورالعمل CLSIدربرابر با سیزده آنتی بیوتیک انجام گرفت.یافته هابراساس نتایج به دست آمده از تست مقاومت آنتی بیوتیکی بیشترین میزان مقاومت به ترتیب مربوط به آمپی سیلین (5/74 درصد) و آزترئونام (1/59 درصد) بود، همچنین کمترین میزان مقاومت دربرابر ایمیپنم (5/1 درصد) و آمیکاسین (9/10 درصد) گزارش شد. ارزیابی PCR گروه های فیلوژنتیک سویه های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک نشان داد که بیشترین میزان فراوانی مربوط به گروه B2 (15/67درصد) سپسD (17/21 درصد) و A (68/11 درصد) بود و گروه فیلوژنتیک B1 در ایزوله های اوروپاتوژنیک مشاهده نشد. در ایزوله های اشریشیاکلی کامنسال فراوانی گروه ها به ترتیب مربوط به D 52 درصد، B2 24 درصد، A 14 درصد و B1 10درصد بود.نتیجه گیرینتایج حاصله نشان داد که درصد فراوانی گروه های فیلوژنتیکی B2 و D در ایزوله های اشریشیاکلی اوروپاتوژنیک و کامنسال مورد مطالعه بالا بوده است.کلید واژگان: اشریشیاکلی اوروپاتوژن, کامنسال, گروه فیلوژنتیکی, مقاومت آنتی بیوتیکی, PCRBackground And ObjectiveEscherichia coli strains are the major cause of urinary tract infections which belong to the large group of extra-intestinal pathogenic E. coli. They fall into four main phylogenetic groups: A, B1, B2 and D. The aim of the present study was to determine phylogenetic groups in uropathogenic and commensal Escherichia coli isolated. Also, due to increase in the rate of antibiotic usage and subsequent drug resistance, this study evaluated the antimicrobial resistance pattern of E. coli isolated from patients with UTI.Materials And MethodsIn this cross-sectional study, 137 uropathogenic Escherichia coli isolates were collected from the clinical specimens of Zanjan hospitals and 50 isolates were collected from healthy adults. After verifying isolates via biochemical methods and extraction of total DNA, Multiplex PCR was done by specific primers for phylogenetic grouping. The antibiotic susceptibility test (disk diffusion method) was done according to CLSI advice against 13 antibiotics.ResultsIn this study, the highest rates of resistance to antibiotics in UTI isolates were seen against ampicillin (74.5%) and aztreonam (59.1%). Also, the lowest rates of resistance were reported against imipenem (1.5%) and amikacin (10.9%).The distribution of UPEC phy logenetic groups typing marked the highest prevalence in group B2 (67.15 %) , and then in group D (21.17%) and the lowest prevalence in group A (11.68%). Phy logenetic B1 was not observed in uropathogenic isolates. Among the commensal isolates, 52% belonged to phylogenetic group D, 24% to B2, 14% to A, and10% to B1.ConclusionThe results indicate the higher prevalence of B2 and D phylogenetic groups in commensal and uropathogenic Escherichia coli strains in Zanjan.Keywords: Uropathogenic escherichia coli, Commensal, Phylogenrtic groups, Antibiotic resistance, PCR
-
بیش از 70 سال از ظهور اولین آنتی بیوتیک علیه عفونت های میکروبی می گذرد و در این مدت باکتری ها به عنوان موجودات زنده و هوشمند از مکانیسم های جدیدی برای بقاء خود استفاده کردند و این امر ناشی از تدابیر شگفت انگیز باکتری ها در جدال با محیط برای بقاء می باشد. اما متاسفانه مسئله نگران کننده، جان باختن بسیاری از انسان ها در اثر ابتلا به عفونت های مقاوم به درمان آنتی بیوتیکی است. آنچه که طی بررسی ها مشخص شده است؛ یکی از مهم ترین مکانیسم های مقاومت باکتریایی بیان سیستم های افلوکس پمپ است. سیستم های افلوکس پمپ علاوه بر پروکاریوت ها در سلول های یوکاریوتی نیز وجود دارد که با خروج ترکیبات خارج سلولی سمی از ایجاد غلظت کشنده برای سلول جلوگیری می نماید و موجب بقاء سلول میزبان می شوند. در سلسله پروکاریوت ها 5 خانواده efflux transporters وجود دارد. چالش پیش روی محققان یافتن راهی برای مهار مکانیسم های مقاومت باکتریایی از جمله بیان سیتم های افلوکس پمپ است.کلید واژگان: آنتی بیوتیک, مکانیسم مقاومت, سیستم های افلوکس پمپMultidrug efflux systems are one of the most important antibiotic resistance mechanisms among microorganisms. Efflux pump systems can be specific substrate or can confer resistance to multidrug antimicrobial by facilitating the extrusion of broad rang of compounds including antibiotics, biocides, heavy metals, and organic pollutants, plant-produced compounds, quorum sensing signals or bacterial metabolites. There are few efflux pump inhibitors are available in market and research in progress raises the hope that they may be found in the future.Keywords: Antibiotic, mechanism of resistance, efflux pump systems
-
همه باکتری ها، چه گرم مثبت باشد و چه گرم منفی، دارای مجموعه های غنی از نانوماشین های ماکرومولکولی برای ترشح طیف وسیعی از سوبستراهای تولیدی خود مثل مولکول های کوچک، پلی پپتیدها، پروتئین ها و DNA می باشند. این سوبستراهای تولیدی نقش حیاتی در پاسخ باکتری ها به محیط پیرامون خود و اجرا و حفظ فرآیندهای فیزیولوژیکی مختلفشان چون خاصیت ادهزینی، پاتوژنسیته و بیماریزایی، تطبیق با محیط پیرامون و حفظ بقایشان دارد. در سال های اخیر توجه به ساختار و مکانیسم عمل این ماشین های انتقالی، که شامل 6 سیستم ترشحی شناخته شده در باکتری های گرم منفی (از I تا VI)، سیستم ترشحی تیپ VII شناسایی شده در مایکوباکتریوم ها، مسیر ترشحی عمومی (Sec) و مسیر انتقالی Tat، بیش از پیش شده است. وسعت دانش و دانسته های ما از این سیستم های ترشحی روز به روز در حال توسعه و هر روز فهم و درک ما از مکانیسم و نحوه ترشح پروتئین ها و DNA باکتری ها به خارج از سیتوپلاسم آن ها در حال گسترش است. به علاوه افزایش روز افزون بروز مقاومت آنتی بیوتیکی در باکتری ها یکی از نگرانی های مهم جهانی به حساب می آید. از این رو دانستن مکانیسم و ساختار این سیستم های ترشحی برای تولید نسل های جدیدی از آنتی بیوتیک ها و واکسن ها و کاهش مرگ و میر ناشی از بیماری های عفونی باکتریایی امری است ضروری. در این مطالعه مروری برآنیم تا با بررسی دقیق ساختار و مکانیسم عمل سیستم های ترشحی عمومی، تک و دو مرحله ای، به طور خلاصه به بررسی نسل های جدید مواد ضد میکروبی علیه این سیستم های ترشحی بپردازیم.کلید واژگان: سیستم های ترشحی, Sec, Tat, مواد ضد میکروبی جدیدSecretion is an essential task for prokaryotic organisms to interact with their surrounding environment. In particular, the production of extracellular proteins and peptides is important for many aspects of an organisms survival and adaptation to its ecological niche. In recent years, considerable progress has been made towards elucidating the structural and molecular mechanisms of the six secretion systems (types IVI) of Gram-negative bacteria, the unique mycobacterial type VII secretion system, the General Secretory Pathways (Sec) and twin-arginine translocation (Tat). These advances have greatly enhanced our understanding of the complex mechanisms that these macromolecular structures use to deliver proteins and DNA into the extracellular environment or into target cells. In addition The rise of multidrug resistant bacteria is a major worldwide health concern. There is currently an unmet need for the development of new and selective antibacterial drugs. In this Review, we explore the structural and mechanistic relationships between these general, single- and double-membrane-embedded systems, and we briefly discuss how this knowledge can be exploited for the development of new antimicrobial strategies.Keywords: Secretion systems, Sec, Tat, New antimicrobial
-
هدف مطالعهسودوموناس آئروژینوزا باکتری فرصت طلب با فاکتورهای بیماریزایی متعدد و از عوامل مهم عفونت های بیمارستانی می باشد. ظهور مقاومت های چنددارویی در این باکتری از عوامل تهدید کننده حیات محسوب می-شود. هدف از این مطالعه شناسایی و تعیین فراوانی ژن های مولد فنازین (phzI، phzII، phzM، phzS،phzH) در بین ایزوله های سودوموناس آئروژینوزای با مقاومت چند دارویی جدا شده از نمونه های بالینی بود.مواد و روش هادر این مطالعه توصیفی مقطعی 93 ایزوله از نمونه های بالینی مختلف از بیمارستان های شهر زنجان طی سال های 94 _1393 جمع آوری و با استفاده از تست های بیوشیمیایی تعیین هویت و تست حساسیت آنتی بیوتیکی به روش کربی- بائر و طبق توصیه CLSI انجام شد. DNA ایزوله ها به روش جوشاندن استخراج و با استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای هر کدام از ژن های phzI، phzII، phzM، phzS، phzH حضور یا عدم حضور ژن های مربوطه با PCR مورد بررسی قرار گرفتند.نتایجدر بین 93 ایزوله بیشترین درصد مقاومت آنتی بیوتیکی مربوط به اریترومایسین و سفوکسیتین (6/95 درصد) و بیشترین درصد حساسیت مربوط به آمیکاسین (2/73 درصد) بود. همچنین 88 ایزوله (6/94 درصد) نسبت به سه کلاس آنتی بیوتیکی یا تعداد بیشتری مقاوم بودند و به عنوان ایزوله هایی با مقاومت چند دارویی در نظر گرفته شدند. 85 ایزوله (5/96درصد) حامل ژن phzI، 82 ایزوله (1/93درصد) حامل ژن phzII، 40 ایزوله (4/45 درصد) حامل ژن phzM، 24 ایزوله (2/27 درصد) حامل ژن های phzS و phzH بودند.نتیجه گیریبیماریزایی سودوموناس آئروژینوزا بدلیل تولید فاکتورهای بیماریزایی متعدد این باکتری است که در نهایت منجر طیف وسیعی از عفونت ها می شود. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد فراوانی ژن های phzI و phzII در بین سویه های با مقاومت چند دارویی بدست آمده از منابع مختلف بالا بوده و این می تواند هشداری برای عفونت های حاصل از این باکتری باشد.کلید واژگان: سودوموناس آئروژینوزا, مقاومت آنتی بیوتیکی, فنازینBackgroundPseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen with numerous virulence factors and is one of the most etiological agents in nosocomial infections. The emergence of multi-drug resistant P. aeruginosa has become a serious public health threat worldwide. The aim of this study was to determine the frequency of phzM, phzS, phzH, phzI and phzII genes in multidrug resistant P. aeruginosa strains isolated from clinical samples.Materials And MethodsIn this cross sectional study, 93 isolates of P. aeruginosa collected from different clinical samples in Zanjan in 1393-94. After identification of isolates by biochemical tests, antibiotic susbtibility test (Kirby-Bauer) was performed according to CLSI guideline. Then, total DNA extracted and PCR was done to detection of phzM, phzS, phzH, phzI and phzII genes.ResultsP. aeruginosa isolates exhibited high-level resistance to Erythromycin and Cefoxitin (95.6%). Amikacin showed the highest activity against isolates with 73.2% susceptibility. Eighty eight (94.6%) isolates were multidrug resistant (MDR). The frequency of phzI, phzII, phzM, phzS and phzH genes among MDR isolates was 96.5%, 93.1%, 45.4%, 27.2% and 27.2%, respectively.ConclusionThe pathogenesis of P. aeruginosa is clearly multifactorial as underlined by the large number of virulence factors and the broad spectrum of diseases the bacterium causes. According to our results, the frequency of phzI and phzII genes were high in multidrug resistant P. aeruginosa strains and this can be an alarm for the infections caused by this microorganism.Keywords: Pseudomonas aeruginosa, multidrug resistant, Phenazine
-
زمینه و هدفاستافیلوکوکوس اورئوس به عنوان یکی از شایع ترین علل مسمومیت های غذایی در بسیاری از کشورها شناخته شده است. این باکتری دارای توکسین های متعددی است که در بین آن ها انتروتوکسین از اهمیت بالاتری برخوردار بوده و مصرف غذاهای آلوده به این توکسین باعث ایجاد مسمومیت غذایی می شود. انتروتوکسین های استافیلوکوکی (SEs) پروتئین های خارج سلولی تک زنجیری با وزن مولکولی پایین (29-22 کیلو دالتون) می باشند که از نظر فعالیت بیولوژیکی مشابه هم بوده ولی از نظر آنتی ژنی با هم تفاوت دارند. این توکسین ها 23 نوع مختلف دارند که باعث ایجاد تهوع، استفراغ، اسهال، دردهای عضلانی و شکمی و گاهی نیز منجر به مرگ می شوند. هدف از این مطالعه، مروری بر نقش و اهمیت انتروتوکسین های استافیلوکوکوس اورئوس در مسمومیت غذایی، پاتوژنز، روش های آزمایشگاهی تخلیص و تشخیص این توکسین ها می باشد.روش بررسیاین مطالعه از نوع Systematic Review بوده که به جمع آوری اطلاعات با استفاده از پایگاه های اطلاعات متعدد مانند PubMed، Scopus، Science Direct، پایگاه اطلاعات علمی SID و IRAN MEDEX پرداخته است. بدین منظور تعداد 5 کلید واژه (Staphylococcal Enterotoxins، Staphylococcal food poisoning، Food borne diseases، structure of Staphylococcal Enterotoxins و Detection of Staphylococcal Enterotoxins) برای جمع آوری اطلاعات از پایگاه های مذکور استفاده شد. بازه زمانی برای مطالعه، بین سال های 1967 تا 2014 در پایگاه داده ها انجام شد. در نهایت تعداد 40 مقاله برای استخراج داده ها و جمع آوری اطلاعات از پایگاه های علمی مذکور مورد بررسی قرار گرفتند.بحث و نتیجه گیریاستافیلوکوکوس اورئوس در طیف وسیعی از درجه حرارت و pH رشد می کند لذا ممکن است در طیف گسترده ای از مواد غذایی حضور داشته و رشد نماید. همچنین مواد غذایی که با سویه های تولید کننده انتروتوکسین آلوده شده باشند، اگر در شرایط نامناسب سردخانه گذاری شوند، می تواند منبع شیوع بیماری های ناشی از انتروتوکسین های استافیلوکوکی واقع گردند. بنابراین لزوم همکاری اپیدمیولوژیست ها، میکروبیولوژیست ها، کارشناسان دامپزشکی و بهداشت مواد غذایی با همدیگر به منظور کاهش مسمومیت های غذایی استافیلوکوکی که ناشی از خوردن انتروتوکسین این باکتری ایجاد می گردد، یک پیش نیاز برای تحقق سلامت عمومی است.
کلید واژگان: ستافیلوکوکوس اورئوس, انتروتوکسین های استافیلوکوکوس اورئوس (SEs), مسمومیت غذایی استافیلوکوکی (SFP)Background and AimStaphylococcus aureus as one of the most common causes of food poisoning known in many countries. These bacteria have a variety of toxins, that they enterotoxin more important, and foods contaminated with the toxin that causes food poisoning. Staphylococcal enterotoxins (SEs) is proteins of the extracellular single chain of low molecular weight (22-29 kDa); Biological activity of these enterotoxins are similar But the antigen together different. These toxins are 23 different types, that cause nausea, vomiting, diarrhea, muscle aches and abdominal and sometimes lead to death. The purpose of this study was to review the role and importance of the Staphylococcus aureus enterotoxins (SEs) in food poisoning, pathogenesis, laboratory methods for purification and detection of the SEs in foods.MethodologyThis study was a systematic review; the data was collected using by various databases such as PubMed, Scopus, Science Direct, Scientific Information Database SID and IRAN MEDEX. For this purpose, the 5 key words (Staphylococcal Enterotoxins, Staphylococcal food poisoning, Food borne diseases, structure of Staphylococcal Enterotoxins and Detection of Staphylococcal Enterotoxins) was used to collected information from the database. The timeframe for this study was conducted between 1967- 2014 in the database. Inclusion criteria in the selection of articles was the keywords in the articles listed above. Finally, 40 articles to collect data and information from the scientific base were reviewed. Discussion &ConclusionStaphylococcus aureus grows in a wide range of temperature and pH, the bacteria may grow in a wide assortment of foods. Therefore, food that is contaminated with SE-producing strains, if investment conditions are cold, can actually be the source of SE-outbreaks. Thus the need for cooperation epidemiologists, microbiologists, health food and veterinary experts together to reduce food poisoning caused by staphylococcal enterotoxin eating bacterium caused a prerequisite for the realization of public health.Keywords: Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus enterotoxins (SEs), staphylococcal food poisoning (SFP), Systematic review -
مقدمهتولید آنزیم های بتالاکتاماز وسیع الطیف در اشریشیا کلی مشکلات فراوانی را در درمان بیماران ایجاد نموده است. این آنزیم ها بر روی عناصر قابل انتقال واقع شده و هیدرولیزکننده پنی سیلین ها، سفالوسپورین های وسیع الطیف و آزترئونام می باشند. هدف از این مطالعه، تعیین فراوانی ایزوله های بالینی اشریشیا کلی مولد بتالاکتامازهای blaSHV و blaTEM در شهر زنجان بود.روش کاراین مطالعه توصیفی - مقطعی، بر روی 200 ایزوله اشریشیاکلی از نمونه های کلینیکی شامل ادرار، مدفوع و ترشحات انجام شد. پس از کشت بر روی محیط EMB آگار و انجام تست های افتراقی مختلف برای تایید ایزوله ها، حساسیت آنتی بیوتیکی سویه ها با روش دیسک دیفیوژن و تولید آنزیم های بتالاکتاماز طیف وسیع با استفاده از روش دیسک ترکیبی Disk) (Combined تعیین گردید. در نهایت حضور ژن های blaTEM و blaSHV با استفاده از پرایمرهای اختصاصی توسط PCR مورد بررسی قرار گرفت.نتایجبیشترین درصد مقاومت مربوط به آنتی بیوتیک آموکسی سیلین با 5/68% (137 ایزوله) و کمترین درصد مقاومت مربوط به ایمیپنم با صفر درصد بود. میزان مقاومت به کوتریموکسازول 5/46% (93 ایزوله)، سفوتاکسیم 5/34% (69 ایزوله)، سفتازیدیم 5/31% (63 ایزوله)، سفپیم 5/29% (59 ایزوله)، جنتامایسن 5/28% (57 ایزوله)، آزترئونام 45% (90 ایزوله)، سپیروفلوکسازین 5/25% (51ایزوله)، کوآموکسی کلاو 5/18% (37 ایزوله)، سفوکسیتین 19% (38 ایزوله) و آمیکاسین 5/4% (9 ایزوله) مشاهده شد. با آزمون Combined disk، 66 (33%) سویه مولد آنزیم بتالاکتاماز طیف وسیع بودند و فراوانی ژن های blaTEM وSHV bla به ترتیب 9/46% (31 ایزوله) و 56% (37 ایزوله) بدست آمد.نتیجه گیریبا توجه به مقاومت سویه های ESBL به آنتی بیوتیک های موجود و همچنین توانایی انتقال این ژن ها به سایر سویه های بالینی، ضرورت انجام تست های حساسیت آنتی بیوتیکی و شناسایی بتالاکتامازهای وسیع الطیف در آزمایشگاه ها به منظور کاهش شکست درمانی به نظر می رسدکلید واژگان: اشریشیا کلی - بتالاکتاماز, واکنش زنجیره ای پلیمرازFrequency of E. coli clinical isolates producing blaSHV and blaTEM extended-spectrum beta-lactamasesIntroductionProduction of extended-spectrum beta-lactamase enzymes (ESBLs) in E. coli creates many problems for patients. These enzymes are located on transferable elements and can hydrolyze penicillins, broad-spectrum cephalosporins, and aztreonam. This study aimed to determine the clinical isolates of E. coli producing ESBLs of blaSHV and blaTEM in the city of Zanjan.MethodsThis cross-sectional study was performed on 200 E. coli isolates from clinical samples, including urine, feces, and secretions. The samples were cultured on EMB agar medium and the isolates were confirmed with various diagnostic tests. Then the sensitivity of strains to antibiotics and the production of ESBLs were determined by disc diffusion and combined disc methods, respectively. Finally, the presence of blaSHV and blaTEM genes was investigated by PCR using specific primers.ResultsAmoxicillin had the highest resistance by 68.5% (137 isolates) and imipenem the lowest by zero percent. Resistance to the studied antibiotics were as follows; co-trimoxazole 46.5% (93 isolates), cefotaxime 34.5% (69 isolates), ceftazidime 31.5% (63 isolates), cefepime 29.5% (59 isolates), gentamycin 28.5% (57 isolates), aztreonam 45% (90 isolates), ciprofloxacin 25.5% (51 isolates), co-amoxiclave 18.5% (37 isolates), cefoxitin 19% (38 isolates), and amikacin 4.5% (9 isolates). According to the combined disc test, 66 strains (33%) were ESBL-producing enzymes and the frequency of blaTEM and blaSHV genes was 46.9% (31 isolates) and 56% (37 isolates), respectively.ConclusionGiven the resistance of ESBL strains to existing antibiotics and the ability to transfer these genes to other clinical isolates, performing antibiotic sensitivity tests and detection of ESBLs in laboratories is necessary for reducing treatment failure.Keywords: Escherichia Coli, β lactamase, Polymerase Chain Reaction
-
زمینه و هدفکک انسان (Pulex irritans) یکی از مهم ترین انگل های خارجی انسان است که با گزش وخونخواری از انسان و حیوانات باعث بروز حساسیت جلدی و انتقال عوامل بیماری زای مختلف می شود. تدوین برنامه های کنترل این ناقل مستلزم درک نرخ آلودگی به عوامل بیماریزا در جمعیت های مختلف آن می باشد. بدین منظور آلودگی بارتونلایی و ریکتزیایی پولکس ایریتانس در مناطق مختلف استان زنجان مورد بررسی قرار گرفت.روش بررسیطی شهریور 1391 لغایت آبان 1393 نمونه های کک با استفاده از طعمه انسانی و آسپیراتور برقی از اماکن حیوانی شهرستان های خدابنده و ماهنشان جمع آوری شدند. پس از استخراج DNA پولکس ایریتانس، بخشی از ژن gltA (جهت شناسایی ریکتزیاها) و ناحیه ITS (برای شناساسایی بارتونلاها)، در حضور پرایمرهای اختصاصی به روش PCR تکثیر و تعدادی از محصولات پس از خالص سازی، تعیین توالی شدند.یافته هادر این مطالعه 1136 نمونه کک صید شد، که 1079 مورد (98/94 درصد) کک انسان، 36 مورد (16/3 درصد) کک سگ (Ctenocephalides canis) و 21 مورد (84/1 درصد) (Ctenocephalides felis) بود. از 182 مورد کک انسان بررسی شده، 6/4 درصد نمونه ها آلودگی ریکتزیایی داشتند و باکتری باتونلا در آن ها دیده نشد.نتیجه گیریبالا بودن وفور نسبی پولکس ایریتانس و وجود آلودگی ریکتزیایی این کک در مناطق موردبررسی، ضرورت تدوین و بازنگری برنامه های کنترل این ناقل را در منطقه می طلبد. هرچند که آلودگی بارتونلایی در نمونه های مورد مطالعه دیده نشد، ولی بررسی های جامع تر می تواند این نکته را به طور دقیق مشخص کند.
کلید واژگان: کک انسان, ریکتزیا, بارتونلا, ژنgltABackground And ObjectiveHuman flea (Pulex irritans) is one of the most important human ectoparasites that transmits various pathogens and causes skin irritation by biting humans and animals. Planning control measures against this vector in various regions requires the knowledge of the pathogens within the vector. Thus, this study was carried out to identify Bartonella and Rickettsia infection of P. irritans in Zanjan province.Materials And MethodsFlea samples were collected via human baits from animal farms in Khodabande and Mahneshan districts from September 2013 to October 2014. DNA was extracted from human fleas, and a part of gltA gene for identification of Rickettsia, and ITS region for identification of Bartonella were amplified by specific primers. A number of PCR products were sequenced after purification.ResultsOut of 1136 collected flea samples 1079 (94.98%) were P. irritas, 36 (3.16%) C. canis and 21 (1.84%) were C. felis. 4.9 % of human flea samples had Reckettsia infection, while no Bartonella infection was observed.ConclusionHigh frequency and rickettsial infection of P. irritans in the studied areas need more attention of administrators and taking into account control measures against this vector. Although Bartonella infection was not observed in our samples, more comprehensive studies are required to verify this viewpoint.Keywords: Pulex irritans, Rickettsia, Bartonella, gltA gene -
زمینه و هدفسودوموناس آئروژینوزایک پاتوژن فرصت طلب بیمارستانی است. شیوع سویه های سودوموناس آئروژینوزای مولد MBL از مشکلات عمده در درمان عفونت های ناشی از این ارگانیسم محسوب می شود. هدف از تحقیق حاضر تعیین فراوانی اینتگرون های کلاس I وII در سویه های سودوموناس آئروژینوزای مولد متالوبتالاکتاماز جدا شده از نمونه های بالینی بیمارستان های شهر زنجان بود.روش بررسیدر این مطالعه ی توصیفی مقطعی، 120 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا از نمونه های بالینی مختلف از بیمارستان های شهر زنجان طی سال های 1392-1391 جمع آوری شد. به منظور تایید ایزوله ها از تست های بیوشیمیایی استفاده و سپس الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی آن ها نسبت به 7 آنتی بیوتیک با روش دیسک دیفیوژن بر اساس استانداردهای CLSI تعیین گردید. جهت بررسی وجود آنزیم های MBL از روش فنوتیپی DDST استفاده و حضور ژن های intI1،intI2، blaVIM و blaGIM با روش PCR ردیابی شد.یافته هادر این مطالعه ی بیشترین و کمترین میزان مقاومت آنتی بیوتیکی به ترتیب مربوط به سفوتاکسیم در 52 ایزوله (43/3 درصد) و آمیکاسین در 26 ایزوله (21/6 درصد) بود. از 120 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا، 35 ایزوله (29درصد) مقاوم به ایمی پنم بودند. از 35 ایزوله مولدMBL، 32(91)درصد ایزوله حامل ژن intI1 شامل 3 (9 درصد) ایزوله حامل ژن intI2 و 6 (17درصد) ایزوله حامل ژن blaVIM بود. سویه واجد ژن blaGIM یافت نشد. همچنین هر 3 ایزوله intI2 مثبت، حامل ژن های intI1 و blaVIM نیز بودند.نتیجه گیرینتایج تحقیق حاضر نشان دهنده ی شیوع بالای اینتگرون کلاس I در ایزوله های سودوموناس آئروژینوزای مولد MBL بود. باتوجه به نقش اینتگرون ها در انتقال ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی، شناسایی و پیشگیری از انتشار این عناصر ضروری به نظر می رسد.
کلید واژگان: اینتگرون, سودوموناس آئروژینوزا, متالوبتالاکتامازBackground And ObjectivePseudomonas aeruginosa is an opportunistic nosocomial pathogen. Evidence suggests that the incidence of enzyme-producing strains of Pseudomonas aeruginosa Metalo Beta Lactamases (MBL) is a major problem in the treatment of infections caused by this organism. The aim of this study was to investigate the frequency of class I and II integrons among metalobetalactamase producing Pseudomonas aeruginosa isolated from clinical samples from Zanjan hospitals.Materials And MethodsIn this cross-sectional study, 120 Pseudomonas aeruginosa isolates from clinical specimens were collected from Zanjan hospitals in 2012-2013. After verifying isolates by biochemical tests, antibiotic susceptibility testing (Kirby-Baur method) was performed according to CLSI guidelines against 7 antibiotics. The DDST was then carried out for detection of MBLs. Finally, the presence of IntI1, IntI2, blaVIM and blaGIM genes was determined by PCR.ResultsIn our study, the highest and the lowest resistant patterns were related to Cefotaxime and Amikacin with 43.3% and 21.6%, respectively. Of 120 isolates, the metallo- beta-lactamase was detected in 35 (29%) isolates. According to results, the frequency of intI1, intI2, blaVIM genes in MBL producers were 32(91%), 3(9%), and 6(17%), respectively, but no blaGIM positive isolate was detected. Also all of IntI2 positive isolates carried IntI1 and blaVIM,, simultaneously.ConclusionThe results of this study indicate high frequency of class I integron gene among MBL producing Pseudomonas aeruginosa isolates. Due to the importance of integrons in dissemination of antibiotic resistance genes, detection and prevention of these elements are necessary.Keywords: Integron, Mtallo, beta, lactamase, Pseudomonas aeruginosa
- در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
- همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
- در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
©2000-2025 magiran.com All Rights Reserved.