به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت

فهرست مطالب مرتضی عطری

  • معصومه گیتی، مهرداد مکری، مجید شکیبا، مرتضی عطری، نسیم باتوانی، علی برهانی *
    زمینه و هدف
    سرطان های پستان فاقد رسپتور استروژن دارای سیر بالینی، ویژگی های پروگنوستیک و پاسخ به درمان متفاوتی می باشند، همچنین انکوپروتیین HER2/neu در کنترل رشد طبیعی سلول و تقسیم سلولی نقش دارد و با مهاجم بودن تومور ارتباط مستقیم دارد. هدف این مطالعه ارزیابی گذشته نگر ویژگی های تصویربرداری ماموگرافی، سونوگرافی و MRI سرطان های پستان استروژن منفی با و بدون بیان بیش از حد رسپتور HER2/neu بود.
    روش بررسی
    در این مطالعه ی مقطعی گذشته نگر، ویژگی های تصویربرداری ماموگرافیک، سونوگرافیک و MRI و وضعیت رسپتور HER2/neu بیماران دارای سرطان پستان با رسپتور استروژن منفی مراجعه کننده به انستیتو کانسر بیمارستان امام خمینی (ره) تهران از تاریخ مهر 1394 تا مهر 1396 بازنگری شد. داده های کلینیکوپاتولوژیک و همچنین ارتباط ویژگی های تصویربرداری با وضعیت رسپتور HER2/neu، بررسی شد.
    یافته ها
    از بین 72 بیمار با سرطان پستان استروژن منفی، 101 (58/8%) بیمار برای رسپتور HER2/neu مثبت بودند. ارتباط معناداری بین وضعیت رسپتور HER2/neu و نوع پاتولوژیک تومور (0/004P=) ، گرید هیستولوژیک تومور (0/024P=) و مرحله ی TNM (0/021P=) به دست آمد. تومورهای با رسپتور HER2/neu مثبت با احتمال بیشتری دارای شکل نامنظم (0/034P=) و میکروکلسیفیکاسیون (0/004P=) بودند. ارتباط معناداری بین وضعیت رسپتور HER2/neu و ویژگی های سونوگرافیک و یا MRI به دست نیامد.
    نتیجه گیری
    بین سرطان های پستان استروژن منفی، موارد HER2/neu مثبت نسبت به موارد HER2/neu منفی با گرید هیستولوژیک و مرحله ی بالاتری در هنگام تشخیص بروز می یابند، همچنین شکل توده و میکروکلسیفیکاسیون در ماموگرافی با وضعیت رسپتور HER2/neu در سرطان پستان استروژن منفی ارتباط دارند.
    کلید واژگان: سرطان پستان, رسپتور استروژن, فاکتور رشد اپیدرمال, ماموگرافی, اولتراسونوگرافی}
    Masumeh Gity, Mehrdad Mokri, Majid Shakiba, Morteza Atri, Nasim Batavani, Ali Borhani *
    Background
    Estrogen-negative breast cancers have different clinical course, prognostic features and treatment response in comparison to estrogen receptor-positive (ER-positive) breast cancers. Human epidermal growth factor receptor 2 (HER2) oncoprotein has found to have a pivotal role in natural cell growth and cell division and is suggested to be directly related to tumor invasiveness in breast cancer patients. The purpose of this study was to retrospectively assess the mammography, ultrasound, and magnetic resonance imaging (MRI) features of estrogen negative breast cancers with and without overexpression of HER2/neu receptor.
    Methods
    In this cross-sectional retrospective study, mammographic, ultrasound and MRI features as well as HER2 status were assessed in patients with ER-negative breast cancer that were referred to Cancer Institute of Imam Khomeini Hospital Complex in Tehran from October 2015 to October 2017. Clinicopathologic data and mammography, ultrasound, and MRI features were reviewed and were correlated with HER2 status of estrogen-negative tumors.
    Results
    Of the 172 patients with ER-negative breast cancer, 101 patients were positive for HER2/neu receptor (58.8%). There was a significant correlation between HER2-positivity and tumor type (P=0.004). Among estrogen negative breast cancers, significant association were found between HER2 and tumor histologic grade (P=0.024) and TNM stage (P=0.021). HER2-positive tumors were more likely to present with microcalcification (P=0.007) and have irregular shapes (P=0.034) in mammography than HER2-negative tumors. No association was found between HER-2 status and tumor size, shape, margin, posterior feature, halo or orientation of the tumor in ultrasound. We also found no correlation between HER2 status and MRI features including mass shape or margin, internal enhancement pattern or curve type among estrogen-negative breast cancers.
    Conclusion
    Findings of this study showed that among estrogen-negative breast cancers, HER2/neu positive tumors are more likely to be diagnosed at higher stage and have higher histologic grade at the time of diagnosis. Tumor mass shape and microcalcification in mammography are found to be associated with HER2 status among patients with estrogen-negative breast cancer.
    Keywords: breast neoplasms, epidermal growth factor, estrogen receptors, mammography, ultrasonography}
  • رمضان کلوندی، مرتضی عطری، سید محسن حسام زاده حجازی، محسن رجبی*

    جنس .Thymus L یکی از بزرگترین جنس های خانواده نعنا و گیاهان آروماتیک  است. گیاهان این جنس به دلیل دارا بودن اسانس های روغنی ارزش تجاری دارند. گونه Thymus eriocalyx  یکی از گونه های این جنس است که انحصاری فلات ایران است. به منظور بررسی های مولکولی در افراد جمعیت های گونه Thymus eriocalyx در ایران، 10 رویشگاه در استانهای لرستان، مرکزی، همدان، کرمانشاه و کردستان انتخاب شد (با استفاده از روش DSS) (تعداد 50 نمونه گیاهی). تعداد 15 پرایمر 10 نوکلیوتیدی انتخاب گردید. داده های مولکولی بر اساس آزمایشات RAPD، جمعیت ها را در 5 گروه مجزا قرار داد. آغازگرهای مورد استفاده 71 باند ایجاد کردند که 68 باند پلی مورفیسم نشان دادند. آغازگرهای OPA-05، OPA-17، OPD03 و OPE-20 با داشتن بالاترین درصد پلیمورفیسمی و شاخص نشانگری، دارای قابلیت بسیار خوبی برای بررسی تنوع ژنتیکی در گونه مورد مطالعه بودند. جمعیت های p2 و p7 بیشترین آلل موثر و جمعیت p9 کمترین آلل موثر را دارا بودند. بیشترین و کمترین میزان میانگین هتروزیگوسی مورد انتظار به ترتیب متعلق به جمعیت P2 و P9 بود. بیشرین تشابه ژنتیکی بین دو ژنوتیپ  P2و P3 و کمترین تشابه ژنتیکی بین دو ژنوتبپ P2 و P10 مشاهده شد. نتایج حاصل از تجزیه واریانس داده ها (AMOVA) نشان داد که میزان تنوع در درون جمعیت های این گونه (68%) از میزان تنوع در بین جمعیت ها (32%) بیشتر است که این حقیقت، اهمیت گزینش تک بوته و توجه به افراد در برنامه های اصلاحی آویشن را ثابت می کند.

    کلید واژگان: آویشن, تنوع ژنتیکی, مارکر, RAPD}
    Ramezan Kalvandi, Morteza Atri, Seyyed Mohsen Hesamzadeh Hejazi, Mohsen Rajabi *

    The genus Thymus L. is one of the largest genera of the Lamiaceae family and aromatic plants. Plants of these genera have commercial value due to their essential oils. Thymus eriocalyx is one of the species that is exclusively on the Iranian plateau. In order to investigate the molecular characteristics of Thymus eriocalyx populations in Iran, 10 habitats were selected in Lorestan, Markazi, Hamedan, Kermanshah and Kurdistan provinces (using the DSS method) (50 plant samples). Also, 15 primers with 10 N lengths selected. The molecular data, based on RAPD experiments, divided the populations into five distinct groups. Primers used in this experiment produced 71 bands, which showed 68 polymorphic bands. OPA-05, OPA-17, OPD03 and OPE-20 primers with the highest polymorphism and marker index had excellent ability to study genetic variation in studied species. P2 and P7 populations had the maximum effective allele and p9 population had the minimum value. The highest and lowest mean of expected heterozygosity belonged to P2 and P9 populations, respectively. The highest genetic similarity was observed between P2 and P3 genotypes and the lowest genetic similarity between P2 and P10. The results of analysis of variance (AMOVA) showed that the variation within the populations of these species (68%) is greater than the diversity among populations (32%), which this fact prove the importance of single plant selection and paying attention to individual in Thymus breeding programs.

    Keywords: Thyme, Genetic Diversity, Marker, RAPD}
  • عالیه رحیمی*، مرتضی عطری، رمضانعلی خاوری نژاد
    پناهگاه حیات وحش میاندشت با وسعت 84435 هکتار، با میانگین بارندگی سالانه 250 میلی متر و محدوده ارتفاعی 912 تا 1085 متر از سطح دریا در جنوب غرب استان خراسان شمالی قرار دارد. پژوهش حاضر، به منظور معرفی رستنی های منطقه انجام شد. جمع آوری گیاهان طی سال های 1389 تا 1392 با روش پیمایشی و اکوفیتوسوسیولوژی انجام شد. در مجموع، 260 تاکسون متعلق به 156 جنس و 38 تیره از نهاندانگان و بازدانگان در منطقه شناسایی شد. نتایج نشان داد که تیره های Chenopodiaceae، Asteraceae، Brassicaceae، Papilionaceae و Poaceae به ترتیب با بیشترین تعداد گونه در منطقه حضور دارند و جنس Astragalus بزرگترین جنس در فلور منطقه است. بر اساس طبقه بندی Raunkiaer، 46/53 درصد گونه ها تروفیت، 08/18 درصد همی کریپتوفیت، 46/13 درصد کامه فیت، 85/8 درصد ژئوفیت و 38/5 درصد فانروفیت هستند. 24 آرایه (23/9 درصد از کل گونه ها) متعلق به 13 تیره، انحصاری ایران هستند. 17 گونه با خطر انقراض پایین و243 گونه در زمره گیاهان فاقد اطلاعات کافی در منطقه تشخیص داده شد. بررسی پراکنش جغرافیایی گونه ها نشان داد که عناصر انحصاری ایرانی-تورانی با 31/67 درصد بیشترین تعداد را دارند. عناصر مشترک ایرانی-تورانی و صحرا-سندی 92/11 درصد، عناصر مشترک ایرانی-تورانی و اروپا-سیبری 23/4 درصد، ایرانی-تورانی/مدیترانه ای46/3 درصد و عناصر سه ناحیه ای46/8 و عناصر چندناحیه ای 62/4 درصد از کل فلور را تشکیل می دهند.
    کلید واژگان: استان خراسان شمالی, شکل زیستی, فلور, گیاهان بومی, میاندشت}
    Alieh Rahimi*, Morteza Atri, Ramezan, Ali Khavarinejad
    Miandasht Wildlife Refuge covers 84435 hectars area, located in southwest of North Khorassan province. Mean annual precipitation is 250 mm and altitude range is 912-1085 m. Plants were collected during 2010-2013 by geodesic and eco-phytosociologic methodology. Totally, 260 taxa belonging to 156 genera and 38 families from Angiosperms and Gymnosperms were identified. The results showed that Chenopodiaceae, Asteraceae, Papilionaceae, Brassicaceae and Poaceae, respectively, with the most number of species, are existed in the region. Astragalus is the most divers genus in flora of Miandasht. Based on Raunkiaer classification, 53.46% of species are therophytes, 18.08% hemicryptophytes, 13.46% chamephytes, 8.85% geophytes and 5.38% phanerophytes. Twenty-four (9.23% of all species) belong to thirteen families are endemic to Iran, that fourteen of them are LR and nine species are DD. The chorologic study of plants, showed that specific elements of Irano - Turanian region with 67.31% of frequency are maximum. Percentages of common elements of IT-SS, IT-M, IT-ES are 11.92%, 3.46% and 4.23%, respectively, threeregional elements 8.46% and ploriregional element 4.62% are of total number of plants.
    Keywords: Endemic plants, Flora, Life form, Miandasht, North Khorassan province}
  • سپیده کدخدا، عطیه ذریه زهرا، فرخنده بهجتی، حسین نجم آبادی، فاطمه آقاخانی مقدم، آزاده بدیعی، فریدون سیرتی، حسین افشین علوی، مرتضی عطری، الهه کیهانی *
    مقدمه
    سرطان پستان در مردان بیماری نادری است که در حدود 1% از همه موارد سرطان پستان را به خود اختصاص می دهد. در بررسی متون مطالعه ای در رابطه با سرطان پستان مردان در ایران یافت نشد. به علت شیوع رو به افزایش آن توجه افزون تری در این زمینه مورد نیاز است. هدف از این مطالعه بررسی وجود جهش در ژن BRCA2 و تومور مارکر های ER، Her-2 و CK5/6 در بیماران مرد مبتلا به سرطان پستان به منظور نشر دانش و ایجاد انگیزه برای پژوهش در زمینه این بیماری است.
    روش بررسی
    در این مطالعه 10 مرد ایرانی مبتلا به سرطان پستان بدون در نظر گرفتن زیر گروه بافت شناسی، سن و سابقه خانوادگی از بیمارستان های مهراد، دی و پارسیان انتخاب شدند. بلوک های پارافینه از مناطق تومورال برش گیری شدند و برش ها تحت رنگ آمیزی ایمونوهیستوشیمی برای ER، Her-2 و CK5/6 قرار گرفتند. همچنین برش های لازم برای انجام رنگ آمیزی هماتوکسیلین و ائوزین تهیه شد. برای تایید نتایج IHC برای بافت هایی که نتیجه Her-2 آنها(2+)گشته بود تکنیک FISH انجام گرفت. نمونه های خون بیماران تهیه و DNA آنها توسط روش Salting out استخراج و کیفیت آنها توسط اسپکتروفتومتری ارزیابی گردید. پرایمرهای مناسب برای انجام PCR مخصوص ژن BRCA2 طراحی و نمونه های DNA بیماران تحت شرایط مناسب دمایی PCR و الکتروفورز گردید و توسط روش سنجر sequencing) (Sanger توالی یابی شد.
    یافته ها
    نتیجه ER در 8 بیمار مثبت و در 2 نفر از بیماران منفی و نتیجه مارکرهای CK5/6 و Her-2 در تمام بیماران منفی گردید. تنها در یک بیمار جهش بی معنی (Non-sence mutation) در اگزون 25 ژن BRCA2 شناسایی گردید. این جهش توسط سایت های معتبری همانند BIC، HGMD و Mutation taster تایید گشت.
    نتیجه گیری
    علی رغم تعداد کم بیماران در این مطالعه که بازتاب نادر بودن بیماری مذکور و با توجه به سایر مطالعات در دیگر کشورها می توان این گونه استنباط کرد که اکثر موارد سرطان پستان در مردان در زیرگروهA Luminalقرار می گیرد و از وضعیت تومور مارکرها نمی توان برای پیش گویی جهش در ژن BRCA2 استفاده کرد. انجام آموزش های همگانی لازم در زمینه تشخیص زود هنگام این سرطان در مردان و در نتیجه افزایش آگاهی آنها نسبت به این بیماری و همچنین ارتقا سطح کیفی روش های تشخیصی درکشور ضروری به نظر می رسد. همچنین پیشنهاد می شود پژوهش های گسترده تری در راستای این مطالعه با تعداد نمونه بیشتر انجام پذیرد.
    کلید واژگان: سرطان پستان مردان (MBC), BRCA2, ER, Her, 2 و CK5, 6}
    Sepideh Kadkhoda, Atiyeh Zorrie Zahra, Farkhondeh Behjati, Hosein Najmabadi, Fatemeh Aghakhani Moghaddam, Azadeh Badiee, Fereidon Sirati, Hosein Afshin Alavi, Morteza Atri, Elahe Keyhani *
  • حسین یوسفی، عاطفه امیراحمدی، مرتضی عطری، رضا نادری*
    در مطالعه حاضر، صفات آناتومی، گرده شناختی و انواع کرک گونه Phlomis olivieri به منظور شناخت آنها جهت به کارگیری در اهداف سیستماتیک بررسی شد. نتایج نشان داد که دستجات آوندی در ساقه در کنار هم قرار دارند. مزوفیل از یک لایه پارانشیم نرده ای و سه تا چهار لایه پارانشیم اسفنجی تشکیل شده است. دو دسته آوند همجوار در مرکز و دو دسته آوند فرعی کوچک در حاشیه دمبرگ و چهار دسته آوند کوچک در برگک وجود دارد. پنج نوع اصلی کرک (سپری، غده ای سرسان، ستاره ای، ساده تک سلولی و درختی) مشاهده شد. کرک های سرسان به سه گروه طبقه بندی شدند: نوع اول (پایه کوتاه)، نوع دوم (پایه متوسط یا سه سلولی) و نوع سوم (پایه بلند یا چهار سلولی). کرک های ستاره ای به دو گروه بدون پایک یا پایه کوتاه و پایه بلند طبقه بندی شدند. کرک های درختی نیز برای نخستین بار در این گونه گزارش می شود. دانه های گرده سه شیاری، نسبتا بزرگ، تخم مرغی و تزیینات سطح لایه خارجی دانه گرده مشبک و روزن دار هستند.
    کلید واژگان: آناتومی, تیره نعناییان (Lamiaceae), گرده شناسی, کرک, Phlomis, ایران}
    Hossein Yousefi, Atefe Amirahmadi, Morteza Atri, Reza Naderi *
    The anatomy، palynology and trichome types of Phlomis olivieri were studied in order to understand the usefulness of these characteristics for systematic purposes. Results showed that vascular bundles were next to each other in the stem، the mesophyll was composed of 1-layered palisade and 3-4 layered spongy parenchyma. There were two collateral vascular bundles in the centre and two small subsidary bundles in the corners of petiole and there were 4 small vascular bundles in the bracteole. Five main types of trichomes (peltate، capitate glandular، stellate، unicellular simple and dendroid trichomes) were observed. The capitate trichomes were subdivided into three groups: type 1 (short stalk)، type 2 (medium or tri-cellular stalk) and type 3 (long or four-cellular stalk). Stellate trichomes were subdivided into two groups: group 1، sessile or short stalked trichomes and group 2، long stalked trichomes. The dendritic trichomes also were reported for the first time in this species. The pollen grains were tricolpate، relatively large، ovate and the exine ornamentation was reticulate and perforate.
    Keywords: Anatomy, Lamiaceae, Palynology, Trichome, Phlomis, Iran}
  • مژگان عطایی کچویی، جواد نداف، محمد تقی اکبری، مرتضی عطری، جاسک مجسکی، یاسر ریاض الحسینی، مسعود گرشاسبی
    هدف
    از زمان شناسایی دو ژن پرنفوذ BRCA1/2 با وراثت بارز در دهه 1990 تاکنون ژن های مختلفی شناسایی شده است که در مجموع حدود 25 درصد اساس ژنتیکی سرطان پستان ارثی را توضیح می دهد و حداقل 75 درصد آن همچنان ناشناخته باقی مانده است. هدف از انجام این مطالعه بررسی وجود یا عدم وجود الگوی وراثتی مغلوب در این بیماری هتروژن است که احتمال وجود آن توسط برخی از محققین مطرح شده است.
    مواد و روش ها
    در این مطالعه از روش توالی یابی اگزوم که جدیدترین روش مورد استفاده در شناسایی اساس ژنتیکی بیماری ها است استفاده شد. همچنین نتایج توالی یابی اگزوم با روش توالی یابی سنگر تایید شد.
    نتایج
    در بررسی حاضر هیچ گونه جهش هموزیگوتی در خانواده مورد بررسی شناسایی نشد اما یک حذف 4 جفت بازی منجر به جهش تغییر چارچوب به صورت هتروزیگوت در اگزون 11 ژن BRCA2 و همچنین یک چند شکلی تک نوکلئوتیدی هتروزیگوت در اگزون 9 ژن STK11 در خانواده مورد نظر تشخیص داده شد.
    نتیجه گیری
    واریاسیون rs80359352 که در این خانواده شناسایی شد یکی از جهش های بیماری زای شایع در ژن BRCA2 است که در پایگاه اطلاعاتی BIC گزارش شده است و قبلا در گروه های نژادی مختلف از جمله قفقازی، هیسپانیک و چینی مشاهده شده است و از طریق این مطالعه برای اولین بار وجود آن در جمعیت ایرانی و تفکیک آن در سرطان پستان ارثی گزارش می شود.
    کلید واژگان: سرطان پستان ارثی, توالی یابی اگزوم, BRCA2, rs80359352, STK11}
    Mojgan Ataei-Kachouei, Javad Nadaf, Mohammad Taghi Akbari, Morteza Atri, Jacek Majewski, Yasser Riazalhosseini, Masoud Garshasbi
    Objective
    Since the identification of the two highly penetrant dominantly inherited genes، BRCA1/2، in the 1990s، a number of other genes have been identified which account for approximately 25% of the genetic basis for hereditary breast cancer. At least 75% are unidentified. The goal of this study is to investigate the presence or absence of a recessive pattern of inheritance in this heterogeneous disease whose possibility has been previously discussed by researchers.
    Methods
    In this study we used exome sequencing as the most recent approach for identification of the genetic basis of any disease. The results of exome sequencing were confirmed by Sanger sequencing.
    Results
    Although we did not find any homozygous mutation in this family، however a heterozygous 4bp deletion that led to a frame shift mutation was identified in exon 11 of the BRCA2 gene. Also identified was a heterozygous single nucleotide polymorphism in exon 9 of the STK11 gene.
    Conclusion
    The rs80359352 variation identified in this family is one of the frequent pathogenic mutations in the BRCA2 gene that has been reported in the BIC database. This variation has been previously observed in other ethnic populations such as Caucasians، Hispanics and the Chinese. In this study، for the first time، we report this mutation in Iranian population and its segregation in hereditary breast cancer.
    Keywords: Hereditary breast cancer, Exome sequencing, BRCA2, rs80359352, STK11}
  • بررسی تاکسونومیک گونه Tanacetum polycephalum Shultz Bip. در استان همدان با تاکید بر نشانگر فلوریستیک و استفاده از روش تعیین زیستگاه ویژه
    مریم احمدی*، طاهره قاسمخانی، مرتضی عطری، عبدالکریم چهرگانی
    جنس Tanacetum یکی از بزرگترین جنس های خانواده Asteraceae است و یکی از مشکل دارترین جنس ها از نظر پیچیدگی تاکسونومیکی، به طور خاص در ارتباط با تعیین حدود جنس، است. گونه های جنس Tanacetum سرشار از اسانس، ترکیبات تلخ و سزکویی ترپن لاکتون ها هستند.Tanacetum polycephalum Shultz Bip. یکی از گونه های رایج و چندشکل این جنس در ایران است. برای تعیین وجود تنوع درون گونه ای گیاهT. polycephalum از جنبه تاکسونومیک و تشخیص عوامل بوم شناختی موثر بر آن از روش تعیین زیستگاه ویژه استفاده شد. بر این اساس 10 زیستگاه ویژه برایT. polycephalum در استان همدان انتخاب شد. ترکیب رستنی ها (نشانگر فلوریستیک) با نرم افزارAnaphyto، به روش FCA آنالیز شدند. آنالیز داده های حاصل از مورفومتری افراد گونه مورد بررسی هر زیستگاه ویژه، با استفاده از 60 ویژگی ریخت شناسی کمی و کیفی، با نرم افزار MVSP، به روش هایUPGMA و PCO صورت گرفت. داده های بوم شناختی به روش CCA آنالیز شدند. نتایج حاصل از آنالیز داده های فلوریستیک منجر به تشخیص 4 گروه متمایز شد که گروه های ایجاد شده نشان دهنده تنوع درون گونه ای در این گیاه است. آنالیز داده های مورفومتری نیز وجود چهار گروه متمایز را تایید کرد که با نتایج حاصل از آنالیز ترکیب رستنی ها مطابقت داشت. آنالیز داده های بوم شناختی نیز مشخص نمود که عوامل بوم شناختی در گروه بندی و ایجاد تنوع زیستگاه های ویژه نقش دارند و بر این اساس سه فنواکودم قابل شناسایی و معرفی است.
    کلید واژگان: Tanacetum polycephalum, روش تعیین زیستگاه ویژه, فنواکودم}
    Taxonomic study of Tanacetum polycephalum in Hamedan province with emphasis on floristic marker and using special station method
    M. Ahmadi*, T. Ghasemkhani, M. Atri, A. Chehregani
    Tanacetum L. is one of the largest genus of Asteraceae family and constitutes one of the most problematic genera in terms of taxonomic complexity، especially concerning genus delimitation against closely related entities. The Tanacetum species are rich in essential oils، bitter components and sesquiterpene lactones. Tanacetum polycephalum Shultz Bip. is a widespread and polymorphic species in Iran. To determine intraspecific variations in T. polycephalum from taxonomic point of view and effective ecological factors، data were collected using special station method. In this way، ten special stations were recognized for T. polycephalum in Hamedan province. Floristic data (floristic marker) were analyzed with Anaphyto software by FCA method. Morphometric data analysis of individual collected from each special station، by using 60 vegetative and reproductive characters، was made with PCO and UPGMA methods and ecologic data were analyzed with CCA method. Analysis of floristic data led to the identification of 4 separate groups that were indicative of the existence of intra-specific diversity. Analysis of morphometric data confirmed the 4-mentioned floristic groups. Analysis of ecologic data showed that ecological factors are effective in grouping and forming special stations diversity، accordingly، 3 phenoecodeme are identifiable and can be introduced.
    Keywords: Tanacetum polycephalum, determination of special station method, phenoecodeme}
  • رمضان کلوندی*، مهدی میرزا، مرتضی عطری، محسن حسام زاده حجازی، زیبا جمزاد، کیوان صفی خانی
    آویشن کرک آلود با نام علمی Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas متعلق به خانواده نعناعیان (Lamiaceae) می باشد. از میان گونه های مختلف جنس Thymus که در سراسر جهان پراکنش دارند، 18 گونه در کشور ایران رویش طبیعی دارند که از این تعداد 4 گونه اندمیک ایران است. برای بررسی تنوع اسانس در افراد جمعیت های گونه مورد مطالعه در ایران از روش D.S.S. (تعیین زیستگاه ویژه) استفاده شد. در این مطالعه اندام های هوایی 5 فرد (بوته) از گونه مورد مطالعه در مرحله گلدهی از 10 زیستگاه ویژه جهت بررسی های شیمیایی جمع آوری (50 فرد در کل) و در دمای اتاق خشک گردیدند. استخراج اسانس از تمامی افراد به روش تقطیر با آب و توسط دستگاه طرح کلونجر طبق فارماکوپه بریتانیا برای مدت 4 ساعت انجام شد. ترکیب های شیمیایی اسانس ها با استفاده از دستگاه های گاز کروماتوگرافی (GC) و گاز کروماتوگرافی متصل به طیف سنج جرمی (GC/MS) شناسایی شدند. بالاترین بازده متوسط تولید اسانس توسط سرشاخه های گلدار افراد مورد مطالعه در سه بار تکرار بر حسب وزن خشک، متعلق به فرد اول از جمعیت Te2 (09/4%) و پایین ترین آن متعلق به فرد دوم از جمعیت Te10 (21/0%) بود. در مجموع در اسانس روغنی افراد 10 جمعیت مورد مطالعه 31 ترکیب شناسایی شد. مقایسه افراد داخل یک جمعیت، نشان داد که افراد یک جمعت در بین خودشان در داشتن ترکیب های شیمیایی تنوع نشان می دهند. از میان ترکیب های شیمیایی موجود در اسانس 50 فرد مورد مطالعه، ترکیب های زیر به طور گسترده ای تنوع را آشکار کردند. پاراسیمن (%1/20-1/0)، 1،8-سینئول (%4/29-4/0)، گاما-ترپینن (%7/8-1/0)، لینالول (%3/82-1/0)، کامفور (%15-1/0)، بورنئول (%7/22-6/1)، ژرانیول (%6/74-1/0)، تیمول (%7/57-1/0)، ژرانیل-استات (%6/49-1/0)، کاریوفیلن-اکساید (%1/9-2/0)، لیمونن (%24-2/0) و آلفا-ترپینئول (%2/36-1/0). نتایج حاصل از آنالیز داده های شیمیایی با نرم افزار MVSP به روش PCO و UPGMA منجر به شناسایی 9 کموتیپ به شرح زیر برای گونه مورد مطالعه گردید که 7 کموتیپ از آنها به عنوان کموتیپ های جدید برای این گونه معرفی می شود. 1- ژرانیول/ ژرانیل استات، 2- ژرانیول، 3- لینالول/ ژرانیول/ژرانیل استات، 4-لینالول، 5-آلفا-ترپینئول/1،8-سینئول، 6- ژرانیل استات، 7- ژرانیول/تیمول/بورنئول/1،8-سینئول، 8- تیمول/لیمونن و 9- تیمول/پاراسیمن/بورنئول.
    کلید واژگان: Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas, زیستگاه ویژه, ژرانیل استات, ژرانیول, آلفا, ترپینئول, لینالول, تیمول}
    R. Kalvandi*, M. Mirza, M. Atri, M. Hesamzadeh Hejazi, Z. Jamzad, K. Safikhani
    Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas belongs to the family Lamiaceae. Among different species of Thymus, distributed in the world, 18 species are growing in Iran, of which four species are endemic. To study the variation of essential oils among population individuals of this species in Iran D.S.S. (Determination of special station) method was used. In this study, the aerial parts of 5 individuals of Thymus eriocalyx were collected from 10 special stations, at full flowering stage for chemical investigation and were dried at room temperature. The essential oil was extracted by hydrodistilation method using a Clevenger-type apparatus. The chemical composition of essential oils was analyzed by GC-FID and GC-MS. Results showed that the highest average yield of essential oil in three replications based on dry weight belonged to the first individual of Te2 population (4.09%), while the lowest was recorded for the second individual of Te10 population (0.21%). Totally, thirty one compounds were identified in the essential oil of 10 studied population individuals. In this study, it is noteworthy that the individuals of a population showed variation among themselves in terms of chemical compositions. Among existing chemical compounds in the essential oil of 50 individuals, the following compounds revealed the variation widely: p-cymene (0.1-20.1%), 1,8-cineole (0.4-29.4%), γ-terpinene (0.1-8.7%), linalool (0.1-82.3%), camphor (0.1-15%), borneol (1.6-22.7%), geraniol (0.1-74.6%), thymol (0.1-57.7%), geranyl acetate (0.1-49.6%), caryophyllene oxide (0.2-9.1%), limonene (0.2-24%) and α-terpineol (0.1-36.2%). The results of the analysis of chemical data using MVSP Software by UPGMA and PCO methods led to the identification of 9 chemotypes as follows of which 7 chemotypes were introduced as new chemotypes: 1-geraniol/geranyl acetate, 2-geraniol, 3- linalool/geraniol/geranyl acetate, 4-linalool,5-α-terpineol/1,8-cineole, 6-geranyl acetate, 7-geraniol/thymol/borneol/1,8-cineole,8-thymol/limonene and 9-thymol/p-cymene/borneol.
    Keywords: Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas, special station, Geranyl acetate, geraniol, α terpineol, linalool, thymol}
  • رمضان کلوندی*، سید محسن حسام‌زاده حجازی، مهدی میرزا، مرتضی عطری، زیبا جمزاد، کیوان صفی‌خانی، مهدی احمدیان
    به‌منظور ارزیابی برخی از خصوصیات بوم‌شناختی، ریختی و همچنین تعیین سطح پلوییدی آویشن کرک‌آلود (Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas) با استفاده از روش .D.S.S (Determination of special station) 10 رویشگاه در استان‌های لرستان، مرکزی، همدان، کرمانشاه و کردستان جهت انجام مطالعات مذکور انتخاب شد. در این پژوهش در بهار سال 1388 در مرحله گلدهی، جهت ارزیابی ریختی از هر رویشگاه پنج نمونه کامل گیاهی و سرشاخه‌های گلدار جهت استخراج اسانس تهیه و به همراه بذر به‌منظور تعیین سطح پلوییدی در فصل تولید بذر جمع‌آوری شد. اطلاعات مربوط به رویشگاه‌ها یادداشت‌برداری شد. خصوصیات رویشی و زایشی هر جمعیت به‌علاوه بازده اسانس گونه مورد مطالعه در هر رویشگاه مورد بررسی قرار گرفت. به‌منظور تعیین سطح پلوییدی، در هر جمعیت حداقل 10 یاخته متافاری نوک ریشه مورد مطالعه قرار گرفت و ضمن شمارش تعداد کروموزوم، سطح پلوییدی آنها تعیین گردید. نتایج حاصل، جمعیت‌های مورد مطالعه را در چهار گروه قرارداد. نتایج همچنین نشان داد که بیشترین میانگین طول و عرض برگ گل‌آذینی، بیشترین میانگین نسبت طول به عرض برگ گل‌آذینی، بیشترین میانگین نسبت طول به عرض برگ ساقه‌ای، بیشترین میانگین طول دمبرگ، بیشترین میانگین طول لوله کاسه، بیشترین میانگین طول جام و بیشترین میانگین طول و عرض براکتیول در جمعیت Te9 بیشتر از جمعیت‌های دیگر بود. به‌طور کلی در بررسی‌های سیتوژنتیکی انجام شده مشخص شد که گیاهان جمعیت‌های Te1، Te2، Te3، Te4، Te5، Te6 و Te8 دارای 30 کروموزوم (30=x2=n2) و دیپلویید و گیاهان جمعیت‌های Te7، Te9 و Te10 دارای 60 کروموزوم (60=x4=n2) و تتراپلویید می‌باشند. بالاترین بازده اسانس متعلق به رویشگاه Te5 (04/3%) بود.
    کلید واژگان: آویشن کرک‌آلود (Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas), ویژگی‌های ریختی, سطح پلوئیدی, اسانس, تجزیه خوشه‌ای}
    R. Kalvandi *, S.M. Hesamzadeh Hejazi, M. Mirza, M. Atri, Z. Jamzad, K. Safikhani, M. Ahmadian
    In order to evaluate several ecological factors, morphological traits, essential oil productivity and ploidy levels of Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas with uses of DSS method ten natural habitats were selected  in Lorestan, Markazi, Hamadan, Kermanshah and Kurdestan provinces  in Iran. To study and evaluate morphological characters, five complete plant samples and flowering branches were collected from each locality at flowering stage for essential oil extraction in spring season of 2008. Ecological data of ten localities were also recorded. Vegetative and reproductive traits and essential oil quantity of each population were studied. Seeds were also collected in the seed production season to study seed characters, chromosome counting and ploidy level. At least 10 mitotic cells of each population were studied to determine chromosome numbers and ploidy levels. All populations were classified in 4 groups. Results revealed that specimens from "Te9 population" had the highest average length and width of inflorescence leaf, inflorescence leaf length to width ratio, stem leaf length to width ratio, petiole length, calyx tube length, corolla length and the highest average length and width of bracteole. The results of chromosome counting showed that specimens of Te1, Te2, Te3, Te4, Te5, Te6 and Te8 populations were diploid (2n=2x=30) and specimens of Te7, Te9 and Te10 populations were tetraploid (2n=4x=60). The highest essential oil production belonged to Te5 population (3.04%).
    Keywords: Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas, morphological traits, ploidy levels, essential oil, cluster analysis}
  • هاجر صالحی، عبدالکریم چهرگانی راد*، مرتضی عطری، فریبا محسن زاده

    تنوع درون گونه ای و بین گونه ای از ذخایر مهم تنوع زیستی و منشا مهم گونه زایی به شمار می روند. بنابراین، تعیین آنها در راستای شناخت تنوع زیستی حایز اهمیت است. این پژوهش، با هدف بررسی وجود تنوع زیستی و مقایسه الکترفورزی پروتئین های ذخیره ای بذر جمعیت هایی از جنس بومادران (Achillea) در استان های همدان و کردستان با روش تعیین زیستگاه ویژه (DSS) انجام شد. بدین منظور، با مراجعه به فلورها برای گونه های A. tenuifolia و A. biebersteinii به ترتیب 12 و 9 زیستگاه ویژه انتخاب و ترکیب فلورستیک گونه های هم باش همراه با شرایط بوم شناختی مطالعه شد. پروتئین های ذخیره ای بذر استخراج و با تکنیک الکتروفورز با روش SDS-PAGE بررسی گردید. در بررسی زیستگاه های ویژه، در مجموع 120 گونه هم باش برای گونه های مورد بررسی شناسایی شد. نتایج حاصل از داده های تبارشناختی هر دو گونه به طور مجزا، به تشخیص شش گروه متمایز منجر شد که نشان دهنده تنوع بالای درون گونه ای در این گیاهان است. تحلیل داده های بوم شناختی و الکتروفورزی پروتئین های ذخیره ای بذر دو گونه کاملا منطبق بر نتایج تبارشناختی است و شش گروه پروتئینی کاملا مشخص برای جمعیت های هر دو گونه به دست آمد. وجود نوارهای 4، 5، 8، 12 و 13 که خاص زیستگاه های ویژه گونه A. tenuifolia است و نوارهای 14، 15 و 16 که خاص زیستگاه های ویژه گونه A. biebersteinii است، دو گونه را از نظر پروتئین های بذر در دو گروه کاملا مجزا قرار داد.

    کلید واژگان: تنوع درون گونه ای, تنوع بین گونه ای, نیم رخ پروتئینی, تیره کاسنیان (Asteraceae)}
    Hajar Salehi, Abdolkarim Chehregani Rad, Morteza Atri, Fariba Mohsenzadeh

    Intarspecific and interspecific variations are the main reserves of biodiversity and both are important sources of speciation. On this basis، identifing and recognizing the intra and interspecific variations is important in order to recognition of biodiversity. This research was done to study biodiversity and electrophoresis comparison of seed storage proteins in the populations of the two species of the genus Achillea in Hamadan and Kurdistan provinces using of the method of determination of special station (DSS). For this purpose، 12 and 9 special stations were selected for the species A. tenuifolia and A. biebresteinii using the data published in the related flora. Seed storage proteins were extracted and then studied using electrophoresis techniques (SDS-PAGE). In survey of all special stations، 120 plant species were distinguished as associated species. The results of the floristic data for the both species determined six distinctive groups that indicated the existence of intraspecific diversity in this species. The result of analysis of ecological data and seed storage proteins for the two species was in accordance with the floristic data and showed six distinctive groups. The existence of the bands of no. 4، 5، 8، 12 and 13 in the special stations of A. tenuifolia and the bands of 14، 15 and 16 in the special stations of A. biebresteinii o separated the populations of the species in two quite different and distinctive groups.

    Keywords: Intraspecific diversity, Interspecific diversity, Protein profile, Asteraceae}
  • مرتضی عطری، عبدالکریم چهرگانی راد، سمیه یوسفی
    جنس Artemisia L. (Asteraceae) با حدود 200 تا 500 گونه، یکی از بزرگ ترین و گسترده ترین جنس های قبیله Anthemideae است. برای بررسی وجود تنوع درون گونه ای Artemisia spicigera در شمال غرب ایران از روش تعیین زیستگاه ویژه (D.S.S.) استفاده شد. با استفاده از این روش برای گونه A. spicigera، 8 زیستگاه ویژه تعیین و داده های فلوریستیک-اکولوژیک مورد نظر از هر زیستگاه ویژه جمع آوری گردید. در بررسی زیستگاه های ویژه مناطق مورد مطالعه، 75 گونه گیاهی برای A. spicigera به عنوان گونه های همباش (associated species) شناسایی شد. تحلیل داده های فلوریستیک (به عنوان نشانگر فلوریستیک) زیستگاه های ویژه، به تشخیص 6 گروه منجر شد. این گروه بندی وجود تنوع درون گونه ای را در این گیاه تعیین و مشخص نمود. تحلیل داده های اکولوژیک نیز گروه بندی های فوق را تایید نمود. برای نشان دادن وجود تنوع، از بررسی پروتئین های ذخیره ای بذر به روش الکتروفورز استفاده شد که نتایج آن با گروه بندی های فلوریستیک و اکولوژیک هم خوانی داشت. وجود تفاوت در تعداد و شدت باندهای پروتئینی در جمعیت های مورد بررسی گونه A. spicigera نشان دهنده وجود تنوع درون گونه ای در این گونه است. بنابراین، در این گونه، گروه بندی با استفاده از نشانگر فلوریستیک توسط نشانگر های اکولوژیک (بوم شناختی) و الگوی الکتروفورزی پروتئین های ذخیره ای بذر نیز تایید گردید. به این معنا که گروه بندی فلوریستیک در مواردی به تنهایی می تواند به عنوان روشی کم هزینه و کارآمد برای بررسی تنوع درون گونه ای به کار رود.
    کلید واژگان: اکولوژی (بوم شناسی), الکتروفورز, تنوع درون گونه ای, داده های فلوریستیک, Artemisia spicigera, تعیین زیستگاه ویژه (D, S, S, )}
    Morteza Atri, Abdolkarim Chehregani Rad, Somayeh Yousefi
    The genus Artemisia (Asteraceae) with about 200-500 species، is one of the largest genus in Anthemidae. In order to study intraspecific diversity in Artemisia spicigera in the North-West of Iran، D. S. S. method was used in this research work. Eight special stations were determined using D. S. S. method for A. spicigera and floristic-ecologic data collected from each special station. In the survey of all special stations، 75 plant species were distinguished as associated species. As the result of analysis of floristic data، as floristic marker، 6 groups were determined. This groupment distinguished the existence of intraspecific diversity in A. spicigera. Analysis of ecologic data was also confirmed the above mentioned groupment. Seed storage proteins were subjected to electrophoresis to determine the level and kind of intraspecific diversity. The results were also in accordance with the results of floristic and ecological results. Existence of differences regarding number and density of the protein bands indicated the intraspecific diversity in the populations of A. spicigera. Therefore، in this species، the groupment that introduced by floristic marker، was confirmed by ecological and electrophoresis data as well. This means that floristic groupment can only be used as a cost-effective and efficient method to stud intraspecific diversity.
    Keywords: Ecology, Electrophoresis, Intraspecific diversity, Floristic data, Artemisia spicigera, D.S.S}
  • بهزاد داورنیا، پروین مهدی پور، مرتضی عطری، سید سعید حسینی اصل
    زمینه و هدف
    سرطان پستان از جمله شایعترین بیماری های زنان در سراسر جهان می باشد. ژن BRCA1 به عنوان یک ژن سرکوبگر تومور شناخته شده است که فقدان آن منجر به آسیبهای متنوعی در ژنوم می گردد. بنابراین تغییرات در سطح بیان ژن BRCA1 می تواند منجر به آسیب پذیری سلول پستانی نسبت به عملکرد انکوژنها گردد. در این مطالعه سعی بر بررسی ارتباط میان سطح بیان ژن BRCA1 و داده های پاتولوژیکی تومورهای سرطان پستان، علی الخصوص درجه تومور می باشد.
    روش کار
    جهت بررسی کیفی و کمی بیان ژن BRCA1 در 27 بیمار مبتلا به سرطان پستان اولیه از روش های RT-PCR و Q-RT-PCR استفاده شد و بهره گیری از روش Nested RT- PCR (جهت جلوگیری از کسب پاسخهای منفی کاذب) به افزایش دقت آزمایش یاری رساند.
    یافته ها
    هشتاد و پنج درصد از بیماران، بیان ژن BRCA1 را نشان دادند. ارتباطات معنی دار میان وجود بیان BRCA1 و درجه تومور مشاهده گردید. میان سطح بیان ژن BRCA1 و درجه تومور بیماران نیز ارتباط معنی دار (P<0.05) بدست آمد. به گونه ای که کاهش بیان ژن با افزایش درجه تومور مرتبط بود.
    نتیجه گیری
    با توجه به نقش پر اهمیت ژن BRCA1 در سرکوب پیشرفت تومور از راه های مختلفی نظیر ترمیم DNA آسیب دیده و همسو با دیگر نتایج بدست آمده، مطالعه حاضر آشکار ساخت که کاهش بیان ژن BRCA1 با افزایش وخامت تومور مرتبط است.
    Background and Objectives
    Breast cancer is among the most frequent disorders among the world. BRCA1 gene was known as a tumor suppressor gene which its loss could be resulted in various destructions in genome. Therefore, changes occurred in its expression level could lead to increasing the effects of oncogene activity on breast cells.
    Methods
    RT-PCR and Q-RT-PCR were used for detecting BRCA1 expression status among 27 primary affected breast cancer patients. The association between its expression status and histopathologic data had been evaluated by statistical assays.
    Results
    Eighty-five percent of patients showed BRCA1 expression and this expression as well as its quantity had significant associations with tumor grade. It was found that tumors with low levels of BRCA1 expression tend to have higher grades.
    Conclusion
    BRCA1 has an important role in suppressing breast tumorogenesis. Corresponding to some of the previous reports, our findings revealed the role of decreasing in BRCA1 expression level as one of the factors which allows tumors to progress.
  • زینب طلوعی، مرتضی عطری، مسعود رنجبر، مایکل وینک

    در این بررسی، 30 نمونه (6 جمعیت) از گونه های بال بلند بخشه Onobrychis از جنسMill. Onobrychis شامل گونه های O. verae Širj., O. gontscharovii Vassilcz., O. ptychophylla Širj. & Rech. f., O. sosnovskyi Grossh. و O. araxina Schischkin، از زیستگاه های طبیعی خود در ایران جمع آوری شدند. این نمونه ها با استفاده از 45 ویژگی کمی و 15 ویژگی کیفی مورفولوژیکی مورد ارزیابی قرار گرفتند. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی گونه های مورد نظر، از داده های مربوط به توالی نوکلئوتیدی ناحیه ITS ژن nrRNAاستفاده شد. در هر محل جمع آوری، اطلاعاتی شامل طول و عرض جغرافیایی، ارتفاع، جهت و میزان شیب، بستر، حداقل و حداکثر درجه حرارت سالانه، تعداد روز های بارانی، بارش سالانه و همچنین ویژگی های مربوط به خاک از جمله بافت، رسانایی الکتریکی، کربن آلی، نیتروژن کل، فسفر و پتاسیم در دسترس، ارزش مواد خنثی شونده،pH و درصد اشباع ثبت شد. بررسی و مقایسه نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل خوشه ایداده های مورفولوژیکی، منجر به تشخیص دو گروه اصلی گردید. این گروه بندی مبین جدایی گونه های شمال غربی از شمال شرقی کشور ایران است. علاوه بر این، نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده های مربوط به توالی نوکلئوتیدی ITS نیز نتایج به دست آمده از آنالیز داده های مورفولوژیکی را تایید می کند. همچنین نتایج حاصل از آنالیز داده های اکولوژیکی به روش CCA، تعداد روزهای بارانی، بارش سالانه، درصد شن و درصد سیلت خاک را به عنوان مهمترین عوامل موثر در جدایی این دو گروه معرفی کرد. همچنین چگونگی اثر عوامل زیست محیطی را برای هر یک از گونه ها نشان داد. در این بررسیSchischkin O. araxinaبرای اولین بار از ایران گزارش می شود. کلید شناسایی گونه های بال بلند بخشOnobrychis در ایران نیز ارائه شده است.

    Z. Toluei, M. Atri, M. Ranjbar, M. Wink

    In this study, 30 specimens (6 populations) from long-winged species of Onobrychis sect. Onobrychis including O. verae Širj., O. gontscharovii Vassilcz., O. ptychophylla Širj. & Rech. f., O. sosnovskyi Grossh. and O. araxina Schischkin were collected from their natural habitats in Iran. The specimens were biometrically assessed using 45 quantitative and 15 qualitative morphological characters. In order to study the genetic variations of different species, nucleotide sequence data from the internal transcribed spacer of the nuclear rRNA genes (ITS) were obtained. Data regarding longitude, latitude, altitude, slope inclination, slope direction, substrate, min/max annual temperatures, number of rainy days, annual precipitation as well as soil traits including texture, electrical conductivity, organic carbon, total nitrogen, available phosphorus and potassium, total neutralizing value, pH, and saturation percentage were recorded in each sample site. Cluster analysis of morphological characters showed two major groups separating northwest species from northeast ones. Furthermore, the ITS data analysis results showing two main groups, which are exactly in concordance with morphological groups. Also canonical correspondence analysis (CCA) of ecological data showed the precipitation, rainy days, sand% and silt% as the most effective factors for this separation. Furthermore it showed the effect of ecological factors on each species. Onobrychis araxina Schischkin is recorded for the first time from Azerbaijan Gharbi province, Iran. An identification key to the long-winged species of section Onobrychis in Iran is presented.

    Keywords: Ecogeography, Iran, ITS, morphology, Onobrychis sect. Onobrychis}
  • رمضان کلوندی، مرتضی عطری، زیبا جمزاد، کیوان صفی خانی
    جنس آویشن (Thymus L.) یکی از بزرگترین جنس های تیره نعناست. گیاهان این جنس به دلیل دارا بودن اسانس های روغنی و کاربرد وسیع در صنایع دارویی و غذایی، ارزش تجاری دارند. در ایران 18 گونه از این جنس شناسایی شده است. به علت توان انتقال ژن در میان جمعیت ها، تنوع ریخت شناختی بالایی در میان جمعیت ها به چشم می خورد. گونه Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas یکی از گونه های این جنس است که تنها در غرب ایران و شمال عراق پراکنش دارد. برای تعیین وجود تنوع درون گونه ای گیاه T. eriocalyx از جنبه تاکسونومیک و تشخیص عوامل بوم شناختی (اکولوژیک) موثر بر آن، از روش تعیین زیستگاه ویژه، برای جمع آوری داده ها استفاده شد. بر این اساس، از بین زیستگاه های مورد بررسی در کشور ایران، 10 زیستگاه ویژه انتخاب شد. نتایج حاصل از آنالیز داده های فلوریستیک (ترکیب رستنی های هر زیستگاه ویژه به عنوان نشانگر فلوریستیک) با نرم افزار MVSP، به روش PCO، به تشخیص 6 گروه متمایز منجر شد که نشان دهنده وجود تنوع درون گونه ای در این گونه گیاهی است. آنالیز داده های حاصل از بررسی مورفومتری افراد گونه مورد بررسی از هر زیستگاه ویژه، با استفاده از 33 ویژگی رویشی و زایشی، به روش های PCO و UPGMA نیز وجود پنج گروه متمایز را تایید نمود. آنالیز داده های بوم شناسی به روش CCA نیز مشخص نمود که عوامل بوم شناختی مختلفی در گروه بندی و ایجاد تنوع زیستگاه های ویژه نقش دارند که در میان آنها عامل ارتفاع، بافت خاک، نفوذپذیری خاک و جهت شیب، در بین عوامل مورد بررسی، در گروه بندی زیستگاه ها موثر بوده است و بر این اساس حداقل سه اکودیم قابل شناسایی و معرفی است.
    کلید واژگان: Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas, ریخت شناسی, تاکسونومی, زیستگاه ویژه, اکودیم, ایران}
    Ramazan Kalvandi, Morteza Atri, Ziba Jamzad, Keivan Safikhani
    Thymus L. is one of the largest genus of Lamiaceae family. This species had cammercial values due to containing essential oils and also its wide applications in food and pharmaceutical industries. From this genus، 18 species have been identified in Iran. Because of the gene flow potentiality among populations، a high morphological diversity exists among them. Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas is one of the species of this genus that is distributed only in west of Iran and also north of Iraq to determine intraspecific variations in T. eriocalyx from taxonomic point of view and effective ecological factors، data were collected using special station method. In this way، ten special stations were recognized for T. eriocalyx in west of Iran. Results from floristic data analysis (floristic composition of each special station) with MVSP software by PCO method، led to the identification of 6 separate groups that was indicative of the existence of intraspecific diversity. Furthermore morphometric data analysis of individual collected from each special station، by using 33 vegetative and reproductive characters، with PCO and UPGMA methods، confirmed 5-mentioned floristic groups. Ecologic data analysis with CCA method showed that various ecological factors are effective in grouping and forming special stations diversity، so that among studied factors، altitude، soil texture and permeability and slop direction factors were all effective in groupment of special stations. On this base، at least 3 ecodemes were identifiable and thus، could be introduced.
    Keywords: Thymus eriocalyx (Ronniger) Jalas, Ecodeme, Iran, Taxonomy, Morphology, Special stations}
  • عبدالکریم چهرگانی راد، مرتضی عطری، سمیه یوسفی
    هدف
    با توجه به اهمیت جنس Artemisia از جنبه اقتصادی، دارویی، خوراکی و زینتی، این بررسی به منظور تعیین و تشخیص تنوع درون گونه ای در جمعیت های گونهArtemisia incana در استان آذربایجان شرقی انجام گرفت.
    مواد و روش ها
    برای بررسی تنوع درون گونه ای گونه A. incana در استان آذربایجان شرقی از روش تعیین زیستگاه ویژه (D.S.S.) استفاده شد. بر اساس این روش، از بین زیستگاه های مورد بررسی، شش زیستگاه ویژه برای این گیاه تعیین و داده های فلوریستیک- اکولوژیک به همراه بذر جمعیت های این گونه از هر زیستگاه جمع آوری گردید. پروتئین های ذخیره ای بذر استخراج و با روش الکتروفورز مطالعه شد.
    نتایج
    در بررسی زیستگاه های ویژه، 54 گونه گیاهی برای A. incana به عنوان گونه های همباش شناسایی شدند. نتایج حاصل از آنالیز داده های فلوریستیک منجر به تشخیص 4 گروه متمایز شد که نشان دهنده وجود تنوع درون گونه ای در این گیاه است. آنالیز داده های اکولوژیک نیز 4 گروه فوق را تایید نمود. الگوی الکتروفورزی پروتئین های ذخیره بذر در همه جمعیت ها مورد بررسی قرار گرفت و 3 گروه پروتئینی کاملا بارز برای جمعیت های مورد بررسی به دست آمد.
    نتیجه گیری
    در بررسی الگوی الکتروفورزی، وجود تفاوت در تعداد و نوع باندهای پروتئینی در جمعیت های مورد بررسی نشان دهنده وجود تنوع درون گونه ای در گونه A. incanaاست. بنابراین در گونه مورد بررسی، گروه های جمعیتی معرفی شده با مارکر فلوریستیکی، توسط مارکر های اکولوژیکی و الگوی الکتروفورزی پروتئین های ذخیره ای بذر نیز تایید گردید که نشان می دهد گروه بندی فلوریستیکی می تواند به عنوان یک روش کم هزینه و کارآمد برای بررسی تنوع زیستی به کار رود.
    کلید واژگان: الکتروفورز, درمنه, تنوع درون گونه ای, زیستگاه ویژه}
    Chehregani Rad A., Atri M., Yousefi S
    Aim
    Regarding economic, medicinal, food and decorative importance of Artemisia genus, this study was carried out to determination of intraspecific diversity in the Artemisia incana populations collected from East Azerbaijan.
    Materials And Methods
    To study of intraspecific diversity in A. incana in East-Azerbaijan D.S.S. method was used. Six special habitats of this population were recognized. Seeds of populations as well asand floristic-ecologic data were collected from each special habitat. Seed storage proteins were subjected for electrophoresis studies.
    Results
    In survey of all special habitats, 54 species were distinguished as associated species. Analysis of floristic data (Floristic compositions of each special habitat as floristic marker) led to identification of 4 separate groups that was indicated the existence of intraspecific diversity in this species. Analysis of ecologic data was also confirmed the groupment. The analysis of seed storage protein electrophoresis banding pattern showed three quite obvious groups.
    Conclusion
    In the survey of electrophoresis pattern, existence of differences regarding number and density of the protein bands indicating existence of intraspecific diversity in the populations of A. incana. Therefore in this species, the grouping that introduced with floristic marker, confirmed also with ecological and electrophoresis markers. This means that floristic grouping can only be used as a cost-effective and efficient method for studying of intraspecific diversity.
  • سعید پیروزپناه، فروغ اعظم طالبان، سیامک صبور، پروین مهدیپور، مرتضی عطری، نازیلا فرین، آناهیتا هوشیارراد، سارا جلالی فراهانی، نادر کریمیان خسروشاهی
    زمینه و هدف
    کمبود در دریافت فولات می تواند با افزایش خطر بروز سرطان پستان همراه باشد. لذا، هدف از انجام این مطالعه بررسی روایی داده های مربوط به دریافت فولات با غلظت پلاسمایی فولات جهت بررسی روایی پرسش نامه می باشد.
    روش کار
    مطالعه حاضر یک مطالعه مقطعی (توصیفی – تحلیلی) است که روایی (Food frequency questionnaire; FFQ) نیمه کمی (136 قلمی) را در 152 بیمار مبتلا به سرطان پستان با بدخیمی تایید شده و در محدوده سنی 35 الی 85 سال مورد بررسی قرار داده است. سطح پلاسمایی فولات با استفاده از الکتروکمیلومینسنس مورد سنجش قرار گرفت. همبستگی رگرسیون خطی بین مقادیر خام، تام و تعدیل شده ازانرژی (Residual method) فولات دریافتی با سطح پلاسمایی فولات مورد بررسی قرار گرفت. جهت تعیین روایی از مولفه های حساسیت، ویژگی، سطح زیر منحنی ROC (AUC)، ارزش اخباری مثبت و منفی و نسبت شانس در دو مدل در دو مدل براساس غلظت پلاسمایی فولات (نانوگرم در هر میلی لیتر - ng/ml)[مدل I - 9/5 (رفرانس) و مدل II - 0/10(میانه و رفرانس)] استفاده شد.
    یافته ها
    سطح پلاسمایی فولات همبستگی معنی دار با دریافت تام گروه سبزی ها، نان وغلات (001/0= p)(و دریافت تام میوه ها (001/0= p) و لبنیات (026/0= p) داشت. ضرایب رگرسیون دریافت روزانه فولات و فولات تعدیل شده از انرژی با سطح پلاسمایی فولات پس از تعدیل اثر عوامل مخدوش کننده به ترتیب شامل 385/0 و 406/0 بودند (001/0= p). سطوح زیرمنحنی ROC در مدل I (سطح پلاسمایی9/5 < نانوگرم در هر میلی لیتر) 74/0 (85/0-63/0= CI 95%) و برای مدل II (سطح پلاسمایی0/10 < نانوگرم در هر میلی لیتر) 61/0 (71/0-51/0= CI 95%) تخمین زده شد. مدل I، قابلیت تشخیصی مناسبی از دریافت غذایی فولات با استفاده از FFQ را ارائه نمود (001/0= p).
    نتیجه گیری
    یافته های این مطالعه نشان داد، FFQ طراحی شده به عنوان ابزار مفید در بررسی وضعیت دریافت فولات در محتوای غذایی مبتلایان به سرطان پستان اهمیت کاربردی داشته و در عین حال برای بررسی وضعیت دریافت اقلام غذایی با محتوای فولات می تواند روایی قابل قبولی داشته باشد.
    کلید واژگان: پرسشنامه بسامد خوراک, روایی, فولات, گروه های غذایی, سرطان پستان}
    Saeed Pirouzpanah, Forough-Azam Taleban, Siamak Sabour, Parvin Mehdipour, Morteza Atri, Nazila Farrin, Anahita Houshyar-Rad, Sara Jalali-Farahani, Nader Karimian Khosroshahi
    Background
    Inadequate folate intake could be associated with increased breast cancer risk. The aim of the present study was to assess the folate intake by designed Food Frequency Questionnaire (FFQ) using plasma folate concentration.
    Methods
    This analytic cross-sectional study was conducted to evaluate the validity of the semi-quantitative FFQ (136 items) in 152 women with confirmed breast malignancy aged between 35 - 85 years old.. Folate plasma level was assessed by means of automated electrochemiluminescence. The Pearson and partial correlation coefficients were performed between the plasma level of folate and crude, total and energy-adjusted (residual) folate intakes. Area under ROC curve (AUC), sensitivity, specificity, positive and negative predictive values and odds ratio were fulfilled in two models in order to achieve validity assessment.
    Results
    The folate plasma level was significantly correlated with total intake of vegetables, bread and cereal groups (p=0.001) and also with total intake of fruits (p=0.001) and dairy products (p=0.026). After adjusting for confounders, the folate plasma levels were correlated significantly with daily (β=0.39), and residual (β=0.41) folate intake levels (p=0.001). The area under ROC curves in model I (folate plasma level <5.9 ng/ml) was 0.74 (95%CI=0.63-0.85) and for model II (folate plasma level <10.0 ng/ml) was estimated as 0.61(95%CI= 0.51- 0.71). Model I indicated more appropriate predictive value (p=0.001) of folate intake assessment via FFQ.
    Conclusion
    The results of this study showed that FFQ described in this study could be a valid and appropriate tool for assessing folate intake status in dietary content of breast cancer patients and also could be representative and valid for assessing the folate rich-food intake status.
  • مهتاب عسگری نعمتیان، مرتضی عطری، عبدالکریم چهرگانی راد
    گون (Astragalus) به عنوان بزرگترین جنس گیاهان آونددار به شمار می رود. این جنس دارای 2500-3000 گونه و 250 بخش است. این بررسی به منظور تعیین و تشخیص تنوع درون گونه ای در افراد گونه Astragalus verus Olivier از نظر فلاونوئیدها در غرب ایران انجام گرفت. ترکیبات فنلی برگ ها در جمعیت های مختلف گونه A. verus مربوط به 20 زیستگاه مختلف از غرب کشور استخراج و به روش TLC مطالعه گردید و حضور یا فقدان سه استاندارد فلاونوئیدی (فلاوون، کوئرستین و روتین) در آنها بررسی شد. سرانجام داده های به دست آمده از مطالعات فلاونوئیدی توسط نرم افزارهای MVSP و SPSS به روش های WARD وPCA و UPGMA آنالیز شدند. نتایج به دست آمده از مطالعات فلاونوئیدی، تنوع درون گونه ای در سطح ترکیبات شیمیایی را نشان داد. گروه های مختلف از نظر ترکیبات فنلی برای افراد گونه A. verus در غرب ایران از زیستگاه های مطالعه شده به دست آمد. این گروه ها در زیستگاه های مختلف تحت شرایط اکولوژیک متفاوت حضور داشتند. عوامل اکولوژیک مورد مطالعه، شامل: بافت خاک، اسیدیته، هدایت الکتریکی ارتفاع از سطح دریا، طول و عرض جغرافیایی بودند. آنالیز داده های اکولوژیک نشان داد در بین عوامل مورد مطالعه، عامل ارتفاع مهمترین نقش را در ایجاد تنوع درون گونه ای در غرب کشور دارد.
    کلید واژگان: گون, ترکیبات فلاونوئیدی, تنوع درون گونه ای}
    Mahtab Asgari Nematian, Morteza Atri, Abdolkarime Chehregani Rad
    Astragalus is the largest genus of vascular plants. This genus has 2500-3000 species and 250 sections. In regard to economic and medicinal importance of Astragalus genus, this study, was carried out to determine and to distinguish of intraspecific diversity in phenolic components of Astragalus verus in the west of Iran. For this reason, leave phenolic components belonging to 20 different stations were extracted and analyzed by TLC (Thin Layer Chromatography), to examine the presence or absence of three flavonoidic standards, such as flavones, quercetine and rutin. Finally, data of flavonoid studies were analyzed by MVSP (Multivariate Statistical Package) and SPSS (Statistical Package for the Social Science) softwares with WARD, PCA (Principle Component Analysis) and UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic mean) methods. Results of flavonoid studies showed intraspecific diversity in chemical components (chemotype) level. The results showed different phenolic groups of Astragalus verus from different stations with different ecological conditions. The studied ecological factors included soil texture, pH, EC, elevation, latitude and longitude. Ecological data analysis showed that, among studied ecological factors, elevation from sea level has the most important role in observed intraspecisic diversity of Astragalus verus in the west of Iran.
  • رویا کرمیان، علی مرادی بهجو، مرتضی عطری، مسعود رنجبر

    Onobrychis melanotricha Boiss. گونه ای علفی چند ساله متعلق به تیره پروانه آسا است که انحصاری ایران بوده و دارای دو واریته می باشد. در این مطالعه، 14 رولوه در زیستگاه های مختلف این گونه در استان همدان براساس روش براون-بلانکه زده شد و گونه مورد مطالعه به همراه داده های جامعه شناختی گیاهی مربوط به رولوه ها برداشت گردید. نتایج نشان می دهند که هر واریته یکی از زیستگاه های اصلی کوهپایه ای یا کوهستانی را اشغال می کند. واریته ها به واسطه شیب پیوسته ای از ویژگی های ریخت شناختی با هم ارتباط دارند. همچنین الگوهای تنوع و عوامل موثر در آنها مورد بررسی قرار گرفت. Onobrychis melanotricha var. ecbatanaica Ranjbar & Behjou به عنوان واریته ای جدید از استان همدان شرح داده می شود. این واریته با دارا بودن برگهای ساده بزرگ از واریته تیپ متمایز می شود.

    R. Karamian, A. Moradi Behjou, M. Atri, M. Ranjbar

    Onobrychis melanotricha (Fabaceae) is an endemic perennial herb in Iran and has two varieties. For investigating on infraspecific variation within O. melanotricha, 14 releves were performed in its different habitats in Hamedan province according to the Braun-Blanquet method and samples were gathered using phytosociological approach. Results showed that each variety occupies one of main mountainous and sub-mountainous habitats. They correlate together by a continuous gradient in morphological characters. In addition, different patterns of variation and related effective factors are discussed. O. melanotricha var. ecbatanaica is described and illustrated from Hamedan Province as a new variety. It differs from the type variety by having the large simple leaves.

    Keywords: clinal variation, endemic, FCA, Hamedan, Iran, O. melanotricha, PCA, phytosociology, UPGMA}
  • زینب طلوعی، مرتضی عطری، مسعود رنجبر
    جنس Onobrychis Mill. با حدود 60 گونه، دومین جنس بزرگ تیره Fabaceae در ایران است. گیاهان این جنس به دلیل ارزش غذایی بالا، اغلب به عنوان علوفه استفاده می شوند. بخش Onobrychis، با تقریبا 15 گونه در ایران یکی از بخش های مهم این جنس است. گونه Onobrychis transcaspica V. Nikitin، یکی از گونه های این بخش است که در شمال شرق ایران پراکنش دارد. برای تعیین وجود تنوع درون گونه ای گیاهO. transcaspica از جنبه تاکسونومیک و تشخیص عامل اکولوژیک مؤثر بر آن، از روش تعیین زیستگاه ویژه، برای جمع آوری داده ها استفاده شد. بر این اساس، از بین زیستگاه های مورد بررسی در شمال شرق ایران، چهار زیستگاه ویژه تعیین شد. نتایج حاصل از آنالیز داده های فلوریستیک (ترکیب رستنی های هر زیستگاه ویژه به عنوان مارکر فلوریستیک) با نرم افزار MVSP، به روش PCO، به تشخیص سه گروه متمایز منجر شد که نشان دهنده وجود تنوع درون گونه ای در این گونه گیاهی است. آنالیز داده های حاصل از بررسی مورفومتری افراد گونه مورد بررسی از هر زیستگاه ویژه، با استفاده از 65 ویژگی رویشی و زایشی، به روش های PCO و UPGMA نیز وجود سه گروه متمایز را تایید نمود. آنالیز داده های اکولوژی به روش CCA نیز مشخص نمود که سه گروه ریختی مذکور، به عنوان سه فنواکودیم حاصل از تاثیر ارتفاع، قابل شناسایی و معرفی است.
    کلید واژگان: V, Nikitin Onobrychis transcaspica, ارتفاع, ایران, تاکسونومی, ریخت شناسی, فلوریستیک}
    Zeinab Toluei, Morteza Atri, Massoud Ranjbar
    Onobrychis Miller is the second largest genus of Fabaceae in Iran with nearly 60 species. These species are used as valuable forage plants. Onobrychis sect. Onobrychis with nearly 15 species in Iran is one of the important sections of the genus. Onobrychis transcaspica V. Nikitin, is one of the species of this section that is distributed in NE of Iran. To determine intraspecific variations in O. transcaspica from taxonomic point of view and effective ecological factor, data were collected using special station method. In this way, four special stations were recognized for O. transcaspica in NE of Iran. Results from floristic data (Floristic composition of each special station) analysis with MVSP software by PCO method, led to identification of 3 separate groups that was indicative of existence of intraspecific diversity. Morphometric data analysis of individual collected from each special station, by using 65 vegetative and reproductive characters, with PCO and UPGMA methods, confirmed 3 mentioned floristic groups. Ecologic data analysis with CCA Method showed the presence of 3 phenoecodeme based on 3 morphologic groups resulting from altitudinal variations.
  • جهانگیر رافت، مرتضی عطری
    زمینه و هدف
    سرطان پستان شایعترین بدخیمی در جمعیت زنان بالغ است. اختلافات متعددی از نظر میزان بروز و مرگ و میرناشی از آن در جمعیت های مختلف وجود دارد. یکی از مهم ترین و اساسی ترین عواملی که می تواند به میزان بالایی بر مرگ و میر ناشی از یک سرطان در یک جمعیت تاثیر بگذارد، مرحله ای است که در آن، سرطان تحت توجه پزشکی واقع می گردد. در این مطالعه، ما مشخصات 1500 مورد سرطان پستان را در زمان تشخیص، شرح دادیم و همراهی احتمالی پاره ای از عوامل را با مرحله ای که در آن سرطان تحت توجه پزشکی قرار می گیرد، مورد ارزیابی قرار دادیم.
    مواد و روش ها
    در این مطالعه گذشته نگر، پرونده های 1500 بیمار مبتلا به سرطان پستان مورد بررسی قرار گرفت. این بیماران به یک کلینیک خصوصی سرطان پستان مراجعه کرده بودند و تشخیص سرطان پستان توسط مطالعه آسیب شناسی، تایید شده بود. داده های مربوط به عوامل زیر از پرونده ها استخراج شدند: سن بیماران، سطح تحصیلات، شغل، فاصله بین جست و جوی توجه پزشکی و تایید تشخیص، سابقه خانوادگی سرطان پستان در خویشاوندان درجه اول، روش تشخیص، نتایج ماموگرافی، اندازه تومور، تعداد گره های لنفاوی درگیر، تعداد کل گره های لنفاوی برداشته شده و مرحله آسیب شناسی تومور.
    یافته ها
    میانگین سنی بیماران 46/10±38/49 سال بود. از میان بیماران با اندازه شناخته شده تومور 5/74%، اندازه تومور بیشتر از 2 سانتی متر بود و در میان بیمارانی که مرحله تومور آنها شناخته شده بود، 3/78% از بیماران در مرحله 2 یا بالاتر قرار داشتند که بدین معناست که آنها حداقل یک گره لنفاوی درگیر داشته اند. به طور میانگین، فاصله 15/1±73/2 ماه بین زمان شک به بیماری و زمان تشخیص قطعی موجود بوده است.
    نتیجه گیری
    براساس یافته های این مطالعه نتیجه می گیریم که مرحله سرطان پستان در زمان تشخیص بیماری، در بیماران ما در مقایسه با کشورهای غربی بالاتر است. این تفاوت نتیجه پذیرش پایین تر از سوی بیماران و نیز نقائص خدمات عمومی می باشد.
    کلید واژگان: سرطان پستان, آسیب شناسی}
    Raafat J., Atri M.
    Introduction &
    Objective
    Breast cancer is the most common malignancy in adult female population. Great variations exist in incidence and mortality rate of this cancer in different populations. One of the most important and central factors that can greatly affect mortality of a cancer in a population is the stage of cancer which comes under medical attention. In this study, we describe characteristics of 1500 cases of breast cancer at the time of diagnosis and evaluate probable association between some factors and stage of cancer in which cancer comes under medical attention.
    Materials and Methods
    This retrospective study reviewed files of 1500 cases of female breast cancer. These cases had been referred to a breast cancer private clinic and diagnosis of breast cancer was confirmed by pathologic study. Data about following factors were extracted from files: age of patients, educational level, profession, interval between seeking medical attention and diagnosis confirmation, family history of breast cancer in first-degree relatives, method of diagnosis, results of mammography, tumor size, number of involved lymph nodes, total number of resected lymph nodes, and pathologic stage of tumor. All data of been obtained at the time of diagnosis.
    Results
    Mean age of patients was 49.38± 10.46 years. From patients with known size of tumor, 74.5% had a size of more than 2 cm in our population and in patients with known stage of disease, 78.3% of patients were stage 2 or more which means that they had at least one involved lymph node. On an average, an interval of 2.73 ±1.15 years existed between the time of suspicion and time of definite diagnosis.
    Conclusions
    Finally we conclude that stage of breast cancer at presentation is higher in our country when compared with western countries. This difference is both the result of lower compliance of patients and defects in public services.
  • سعید پیروزپناه، فروغ اعظم طالبان، علیرضا ابدی، مرتضی عطری، پروین مهدی پور
    مقدمه و اهداف
    بیان ژنی رتینوئیک اسید رسپتور- بتا2 (RARβ2) در سلول های تومور پستان اهمیت درمانی داشته و معمولا به واسطه هیپرمتیلاسیون در بخش تنظیم کننده بیان ژن (پروموتر) می تواند مهار می گردد. هدف از انجام این پژوهش، بررسی ارتباط مقادیر فولات، ویتامین ب12 و هموسیستئین تام پلاسما با وضعیت هیپرمتیلاسیون ژن RARβ2 وابسته به سن در بیماران مبتلا به سرطان پستان بود.
    روش کار
    این مطالعه در جامعه ای مشتمل بر 126 بیمار مبتلا به سرطان پستان در سنین بین 28 الی 85 سال انجام شد. وضعیت هیپرمتیلاسیون ژن RARβ2 در بافت تومور با استفاده از روش Methylation-specific PCR مورد بررسی قرار گرفت.
    نتایج
    هیپرمتیلاسیون ژن RARβ2 در 5/36 درصد از بیماران مشاهده گردید. هیپرمتیلاسیون ژن RARβ2 با سن در زمان تشخیص بیماری و تاریخچه فامیلی سرطان پستان ارتباط عکس نشان داد. در بیماران سنین 48 سال به بالا، سطح فولات پلاسما در گروه متیله کمتر از گروه غیر متیله بود (05/0P<). در حالیکه در بیماران سنین 48 سال به پایین، میزان هموسیستئین تام پلاسما در گروه متیله بیشتر از گروه غیر متیله بود(05/0P<). در سنین بالاتر از 48 سال، ارتباط عکس و معنی دار بین سطوح فولات (887/0-052/ 0CI:95% و214/0=OR)، ویتامین ب 12 پلاسما (919/0-002/0:CI95% و 039/0 =OR) و وضعیت هیپرمتیلاسیون RARβ2 مشاهده شد. در همین گروه سنی، سطح بالای هموسیستئین پلاسما (7/25-067/1: CI95%،55/7 =OR) در افزایش شانس بروز هیپرمتیلاسیون RARβ2 نقش داشت.
    نتیجه گیری
    سطوح پایین فولات و ویتامین ب12 پلاسما و سطح بالای هموسیستئین پلاسما می توانند در پیش آگهی هیپرمتیلاسیون RARβ2 در مبتلایان به سرطان پستان نقش داشته باشند.
    کلید واژگان: هیپرمتیلاسیون, سرطان پستان, رتینوئیک اسید رسپتور, بتا 2, فولات, ویتامین ب 12, هموسیستئین}
    Background and Objectives
    The repression of retinoic acid receptor-β2 (RARβ2) expression is a concerning aspect of breast cancer, which is often induced by hypermethylation at promoter of the gene. We aimed to explore the correlation of plasma folate, vitamin B12 and total homocysteine (tHcy) levels with hypermethylation status of RARβ2 gene among Iranian breast cancer patients.
    Methods
    The hypermethylation status was investigated in 137 specimens tissues from primary breast cancer patients aged 28-85 years thorough methylation-specific PCR.
    Results
    Hypermethylation at RARβ2 gene was observed in 36.5 %. The hypermthylated RARβ2 associated with younger age at diagnosis and negative family history of breast cancer. The plasma level of folate was found lower in cases aged ≥48 years with hypermethylated RARβ2 gene (P<0.05). In contrast the level of tHcy was shown higher in cases aged <48 y (P<0.05). The risk of hypermethylation at RARβ2 gene increased with low plasma levels of folate (OR=0.21, 95%CI: 0.05-0.88) and vitamin B12 (OR=0.04, 95%CI: 0.01-0.92) and high plasma level of tHcy (OR=7.55, 95%CI: 1.07-25.7) in cases older than 48y.
    Conclusions
    Low plasma levels of folate, Vitamin B12 and high plasma level of total homocysteine could have important roles as prognostic factors in hypermethylation status of RARβ2 gene in breast cancer.
  • سید محمد فخر طباطبایی، محمود ملکی، محمدرضا رحیمی نژاد، مرتضی عطری، محمدرضا نقوی، محسن مردی، سیدمصطفی پیر سیدی، مسعود میرمعصومی، مجید نوجوان
    جمعیتهای گندم بوئتیکوم (Triticum boeoticum) بعنوان عمومی ترین جمعیتهای گندم وحشی در ایران، بویژه از نظر تنوع زیستی بسیار ناشناخته اند. به منظور مطالعه تنوع جمعیتهای مذکور از نشانگر های فلوریستیکی، فیتوشیمیایی و مولکولی استفاده شد. هر سه نشانگر مورد استفاده، تقریبا بطور مشابه تنوع بالایی در این جمعیتها نشان داد. به بیان دقیق تر، گروه های جمعیتی معرفی شده با نشانگر فلوریستیکی توسط نشانگر های فیتوشیمیایی و مولکولی نیز تایید گردید. این تایید به معنای آن است که گروهبندی فلوریستیکی در مواردی به تنهایی می تواند بعنوان یک روش کم هزینه و کارآمد برای بررسی تنوع جمعیتها به کار رود.
    کلید واژگان: Triticum boeoticum, تنوع زیستی, نشانگرهای فلوریستیک, نشانگرهای فیتوسیمیایی, نشانگرهای ملکولی}
    Little information is available regarding genetic variation in Triticum boeoticum, as a common wild wheat relative in Iran. In order to study floristic, phytochemical and molecular classification of this species, an analysis was conducted on populations of the T. boeoticum collected from different regions of Iran. All three markers nearly showed a high variability in T. boeoticum populations. In another word, distinguished grouping of populations in floristic method was confirmed by both phytochemical and molecular methods. The results from our study indicate that floristic classification in some way is still useful, efficient, and economic tools for characterizing the amount and distribution of genetic variation in natural populations.
  • مسعود شیدایی*، سارا سعیدی، مرتضی عطری

    پروتئین های ذخیره ای بذر در 21 جمعیت 17 گونه و واریته Bromus ایران بررسی شد. بطور کلی تعداد 83 باند پروتئینی مشاهده شد. گونه های مطالعه شده در تعداد و شدت باند تفاوت داشتند که بیانگر تفاوت های ژنتیکی آنهاست. تعدادی باند منحصر به فرد در اکثر گونه ها وجود داشتند که نشان دهنده وجود ژن های خاص در این گونه هااست که در طی گونه زایی بدست آمده اند. از این باندهای منحصر به فرد می توان در شناسایی و تفکیک گونه های Bromus استفاده کرد. روش های مختلف تجزیه خوشه ایو رسته بندی جدایی گونه های دو بخش Bromus و Pnigma را نشان داد.

    M. Sheidai, S. Saeidi*, M. Atri

    Seed proteins were studied in 21 populations of 17 Bromus species and varieties growing in Iran. In total 83 protein bands were observed in all the species studied. The number of bands and their density varied in these species, indicating their genetic differences. Some specific bands were observed in most of the species indicating the presence of specific genes in these species as a result of species diversification. Such specific protein bands may be of use in the Bromus species identification. Different clustering and ordination methods showed separation of the species of sect. Bromus from the species of the sect. Pnigma, indicating the use of seed proteins in taxonomic delimitation of these two sections.

    Keywords: Bromus, Poaceae, seed proteins, Iran}
  • سعید پیروزپناه، فروغ اعظم طالبان، مرتضی عطری، علیرضا ابدی، پروین مهدیپور
    سابقه و هدف
    بیان ژنتیکی گیرنده استروژن-آلفا (α،ERα (Estrogen receptor-در سلول های تومور پستان اهمیت درمانی دارد و بیان این ژن می تواند به واسطه هیپرمتیلاسیون در اگزون 1 مهار شود. هدف از انجام این پژوهش، بررسی ارتباط بین مقادیر فولات، ویتامین B12 و هموسیستئین تام پلاسما با وضعیت هیپرمتیلاسیون ERα در مبتلایان به سرطان پستان برای اولین بار بود.
    مواد و روش ها
    جامعه مورد بررسی 137بیمار مبتلا به سرطان پستان در سنین بین 28 تا 85 سال بود. مقادیر پلاسمایی فولات و کوبالامین توسط دستگاه کمیلومینسنس خودکار و هموسیستئین تام پلاسما به وسیله HPLC اندازه گیری شد. وضعیت هیپرمتیلاسیون ERα در بافت تومور با استفاده از روش Methylation-specific PCR مورد بررسی قرار گرفت. برای آنالیز داده ها، از رگرسیون لجیستیک با تعدیل اثر عوامل مخدوش کننده ممکن استفاده شد.
    یافته ها
    هیپرمتیلاسیون ERα در 1/51 درصد از بیماران مشاهده شد. هیپر متیلاسیون ژن ERα با تاریخچه مصرف سیگار، طول مدت باروری، به طور مستقیم و با بیان پروتئین ER ارتباط معکوس نشان داد. بعد از تعدیل اثر عوامل مخدوش کننده، بین سطح فولات (668/0-052/0، CI95% و187/0=OR)و ویتامین B12 پلاسما (953/0-036/0، CI95% و 185/0=OR) و وضعیت هیپرمتیلاسیون ژن ERα ارتباط معکوس یافت شد. افزون بر این، همبستگی قابل توجهی بین مقدار هموسیستئین تام پلاسما و خطر پیشرفت هیپرمتیلاسیون ژن ERα مشاهده شد (2/73-26/1، 95% CI و 61/9=OR).
    نتیجه گیری
    یافته های این بررسی اثر بالقوه سطح هموسیستئین پلاسما و معکوس فولات و ویتامین B12 پلاسما بر وضعیت هیپرمتیلاسیون ژن ERα در بیماران مبتلا به سرطان پستان را نشان داد.
    کلید واژگان: ژن گیرنده استروژن, آلفا, هیپرمتیلاسیون, سرطان پستان, فولات, هموسیستئین}
    S. Pirouzpanah, Fa Taleban, M. Atri, Ar Abadi, P. Mehdipour
    Background And Objectives
    The translation of estrogen receptor-α (ERα) is vital in therapeutic regimens in breast cancer. The repression of its expression could be attributed to regional CpG island methylation in exon1. We aimed to explore the association of plasma levels of folate, vitamin B12 and total homocysteine (tHcy) with the hypermethylation status of ERα genes in breast cancer patients.
    Materials And Methods
    The hypermethylation status was determined in dissected tissues from 137 primary breast cancer patients aged 28-85 years, using methylation-specific PCR. In addition, the plasma levels of folate and vitamin B12 of the patients were assessed by automated chemiluminescence, and their total plasma homocysteine was determined by HPLC. The logistic regression analysis was used for analyzing the data after adjusting for potential confounding factors.
    Results
    Hypermethylation at ERα was observed in 51.1% of the participants. It was related positively to smoking history and duration of exposure to estradiol, and inversely with ER translation. After adjustments for confounding factors, an inverse association was also found between the hypermethylation status of ERα gene and the plasma levels of folate (OR=0.187; 95%CI, 0.052-0.668) and vitamin B12 (OR=0.185; 95%CI, 0.036-0.953). The data also showed that the risk of hypermethylation at ERα gene increased with the high plasma levels of tHcy (OR=9.61; 95%CI, 1.26-73.2).
    Conclusion
    It may be concluded that a high plasma tHcy level can potentially increase the risk of hypermethylation of the ERα gene, while plasma folate and vitamin B12 levels may reduce the risk, in cancer patients
  • ارتباط ناهنجاری های کروموزوم 8 با پیش آگهی در سرطان پستان
    فرخنده بهجتی، مرتضی عطری، حسین نجم آبادی، پروین مهدی پور
    سرطان پستان یکی از علل اصلی مرگ و میر زنان در دنیا و شایعترین سرطان در بین زنان ایرانی است و شیوع آن رو به افزایش است. از آنجایی که طبق شاخص های بالینی و بافت شناسی موجود برای طبقه بندی سرطان پستان و استفاده از روش های درمانی بر اساس این طبقه بندی تنها 60% زنان مبتلا می توانند فارغ از گسترش سرطان برای مدت طولانی زنده بمانند، نیاز مبرمی برای طبقه بندی دقیق تر بیماران مبتلا بر اساس شاخص های جدید می باشد که بتوانند سیر پیشرفت بیماری را پیش بینی و به انتخاب روش درمانی دقیق تر کمک نمایند. نشانگرهای ژنتیکی از جمله ناهنجاری های کروموزومی در این راستا می توانند مفید واقع گردند.مطالعه کروموزوم A در ارتباط با عوامل پیش آگهی می تواند با اهمیت باشد، زیرا که این کروموزوم محل قرار گیری انواع انکوژن ها و ژن های سرکوبگر توموری است.به منظور بررسی اهمیت بالینی و پیش آگهی تعداد کروموزوم 8 در سلول های سرطان پستان، در این بررسی با استفاده از داده های موجود در یک مطاله گذشته نگر، 25 زن ایرانی مبتلا به سرطان پستان اولیه غیر ارثی از نوع تهاجمی داکتال مورد استفاده قرار گرفتند. با استفاده از پروب های سانترومریک ویژه کروموزوم 8 و روش اینترفازی دورگ سازی فلورسانس درجا (Interphase FISH) سلول های توموری تثبیت شده در تثبیت گر کارنوی (Carnoy) و قالب های پارافینی بایگانی شده برای نیوزومی کروموزوم 8 بررسی شدند.یافته های FISH در ارتباط با شاخص های مختلف بالینی- پاتولوژیک (مرحله، درجه، اندازه تومور، گسترش، محل تومور)، ایمونوهیستوشیمی (وضعیت گیرنده های استروژن، پروژسترون، پروتئین p53 و آنزیم کاتپسین (D، محتوای DNA، سن و وضعیت بقای بیماران مورد بررسی قرار گرفتند.کلیه بیماران بررسی شده یک الگوی ناهمگون از تعداد سیگنال های FISH برای کروموزوم 8 نشان دادند. بیش از 3000 سلول مطالعه شدند. میانگین درصد تعداد سلول ها برای مجموعه انیوزومی کروموزوم 8، 35 درصد بود که مشابه یافته های سایر مطالعات می باشد. افزایش تعداد سلول های حاوی هیپودیپلوئیدی کروموزوم 8 در بیماران زیر 50 سال، فاقد گیرنده پروژسترون، با مرحله پیشرفته سرطان، افزایش آنزیم کاتپسین D، اندازه بزرگتر تومور، دارا بودن پروتئین P53 و درگیری غدد لنفاوی در گسترش مشاهده گردید، هر چند که این ارتباط معنی دار نبود. یافته های این پژوهش بر نقش پیش آگهی انیوزومی کروموزوم 8 در سرطان پستان تاکید می نماید.
    کلید واژگان: سرطان پستان, زنان ایرانی, اینترفاز FISH, انیوزومی کروموزوم 8, پیش آگهی}
نمایش عناوین بیشتر...
بدانید!
  • در این صفحه نام مورد نظر در اسامی نویسندگان مقالات جستجو می‌شود. ممکن است نتایج شامل مطالب نویسندگان هم نام و حتی در رشته‌های مختلف باشد.
  • همه مقالات ترجمه فارسی یا انگلیسی ندارند پس ممکن است مقالاتی باشند که نام نویسنده مورد نظر شما به صورت معادل فارسی یا انگلیسی آن درج شده باشد. در صفحه جستجوی پیشرفته می‌توانید همزمان نام فارسی و انگلیسی نویسنده را درج نمایید.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را با شرایط متفاوت تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مطالب نشریات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال