به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه

cpg island

در نشریات گروه بیوتکنولوژی و ژنتیک گیاهی
تکرار جستجوی کلیدواژه cpg island در نشریات گروه کشاورزی
تکرار جستجوی کلیدواژه cpg island در مقالات مجلات علمی
  • Mohsen Hoseini, Ahmad Arzani *

    The severe impact of drought and salinity on plant productivity presents a significant threat to worldwide food security. Plants exhibit the capacity to sense stimuli in their environment and adjust defense mechanisms through diverse regulatory networks to cope with abiotic stress. The complexities of drought and salinity tolerances can be deconstructed into contributing factors and mechanisms, classified under two categories: genetics and epigenetics. Epigenetic mechanisms play a role in partially attributing crop adaptation to the most formidable drought and salinity stresses. Plants respond to stress in part by undergoing stable alterations in gene expression, a process that involves the physical "marking" of DNA or its associated proteins, commonly called epigenetics. Plants utilize various epigenetic mechanisms to refine gene expression, vital for adaptation and phenotypic plasticity. These include DNA methylation, histone modifications, chromatin remodeling, epitranscriptomics, and gene silencing mediated by small RNAs. Notably, epigenetic modifications can be inherited or erased. Enhanced knowledge of epigenetics complements genetics and will aid in developing strategies to integrate them into crop improvement programs aimed at addressing adaptation to abiotic stress. This review highlights the latest and noteworthy findings regarding crop epigenetic responses to abiotic stress signals, particularly those pertinent to drought and salinity tolerance.

    Keywords: drought tolerance, CpG island, epigenomics, osmotic stress, Salt tolerance, Water stress
  • آزاده زحمت کش*، سعید انصاری مهیاری، مرتضی دلیری جوپاری، حمیدرضا رحمانی، ابوالفضل شیرازی
    فیلیا ژنی با اثرات مادری است و اختلال در کارکرد آن در موش منجر به کاهش باروری، و در انسان باعث سقط جنین می گردد. بررسی توالی رونوشت فیلیا در گاو در NCBI نشان می دهد که نسبت به اورتولوگ انسان و موش دارای درصد GC بالاتری است. این امر منجر به اختلال در تکثیر ژن در طی سیکل تکثیر PCR می گردد. مطالعه ی حاضر به منظور بررسی امکان تکثیر بخشی از رونوشت فیلیای گاوی با درصد بالای GC با بهینه سازی در طراحی آغازگر به اجرا درآمد. آغازگرها برای دو قطعه ی 443 و 230 جفت بازی از ژن مذکور طراحی شد به صورتی که فقط برای قطعه ی اول، دو شرط دمای ذوب بالا و اختلاف اندک دمای ذوب آغازگرها در نظر گرفته شد. بررسی بیوانفورماتیک از نظر وضعیت GC و ساختارهای ثانویه ی احتمالی این قطعات صورت گرفت. استخراج RNA از تخمک های جداشده از تخمدان های گاوی انجام گرفت. پس از واکنش رونویسی معکوس، واکنش PCR با دماهای اتصال مختلف به صورت دو و سه مرحله ای صورت گرفت. نتایج نشان داد که قطعه ی 443 جفت بازی دارای یک جزیره ی CpG و درصد GC بیشتر و قابلیت تشکیل ساختارهای ثانویه ی پیچیده تری نسبت به قطعه-ی 230 جفت بازی است. با این وجود تنها قطعه ی 443 جفت بازی که دارای آغازگرهای با ویژگی های موردنظر بود، با باند مشخصی تکثیر گردید. نتایج نشان داد اختلاف اندک دمای ذوب آغازگرها، بالا بودن دمای اتصال آن ها و دومرحله ای شدن واکنش می تواند در تکثیر اختصاصی توالی های غنی از GC موثر باشد.
    کلید واژگان: ژن فیلیای گاو، درصد GC، جزیره ی CpG، ساختار ثانویه، دمای اتصال
    Zahmatkesh A.*, Ansari Mahyari S., Daliri Joupari M., Rahmani H., Shirazi A
    Filia is a maternal effect gene, disorder in which causes decreased fertility in mouse and abortion in human. Bovine Filia transcript is predicted in NCBI database. Nucleotide analysis shows that it has a higher GC content in comparison with its mouse or human orthologs, and this can make problems in PCR amplification. This study was performed to investigate the possibility of amplification of bovine Filia transcript with high GC content by optimization of primer design. Two pairs of primers were designed to amplify 443 and 230 bp fragments. High Tm of primers and low ΔTm conditions were considered to design only the first pair of primers. Bioinformatic analysis was performed on the two fragments to analyze the GC contents and possible secondary structures. RNA was extracted from bovine oocytes. After reverse transcription, PCR amplification was performed with different annealing temperatures in two or three steps. Results showed that the 443 bp fragment has a CpG island and a higher GC content and more possibility of secondary structure formation compared with the 230 bp fragment. Nevertheless only the 443 bp fragment with the primers of interest was amplified with a sharp band. In conclusion we showed that low ΔTm, high Tm of primers and annealing temperatures and also a two-step PCR help specific amplification of GC-rich sequences.
    Keywords: Bovine Filia gene, GC percentage, CpG island, Secondary structure, Annealing temperature
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال