به جمع مشترکان مگیران بپیوندید!

تنها با پرداخت 70 هزارتومان حق اشتراک سالانه به متن مقالات دسترسی داشته باشید و 100 مقاله را بدون هزینه دیگری دریافت کنید.

برای پرداخت حق اشتراک اگر عضو هستید وارد شوید در غیر این صورت حساب کاربری جدید ایجاد کنید

عضویت
جستجوی مقالات مرتبط با کلیدواژه

osmotic stress

در نشریات گروه بیوتکنولوژی و ژنتیک گیاهی
تکرار جستجوی کلیدواژه osmotic stress در نشریات گروه کشاورزی
تکرار جستجوی کلیدواژه osmotic stress در مقالات مجلات علمی
  • Mohsen Hoseini, Ahmad Arzani *

    The severe impact of drought and salinity on plant productivity presents a significant threat to worldwide food security. Plants exhibit the capacity to sense stimuli in their environment and adjust defense mechanisms through diverse regulatory networks to cope with abiotic stress. The complexities of drought and salinity tolerances can be deconstructed into contributing factors and mechanisms, classified under two categories: genetics and epigenetics. Epigenetic mechanisms play a role in partially attributing crop adaptation to the most formidable drought and salinity stresses. Plants respond to stress in part by undergoing stable alterations in gene expression, a process that involves the physical "marking" of DNA or its associated proteins, commonly called epigenetics. Plants utilize various epigenetic mechanisms to refine gene expression, vital for adaptation and phenotypic plasticity. These include DNA methylation, histone modifications, chromatin remodeling, epitranscriptomics, and gene silencing mediated by small RNAs. Notably, epigenetic modifications can be inherited or erased. Enhanced knowledge of epigenetics complements genetics and will aid in developing strategies to integrate them into crop improvement programs aimed at addressing adaptation to abiotic stress. This review highlights the latest and noteworthy findings regarding crop epigenetic responses to abiotic stress signals, particularly those pertinent to drought and salinity tolerance.

    Keywords: drought tolerance, CpG island, epigenomics, osmotic stress, Salt tolerance, Water stress
  • پروین صالحی*، حمیده جوادی، لیلا رسول زاده، لیلا فلاح، آرش مامدی
    سابقه و هدف

    وسعت مناطق خشک و نیمه خشک ایران بیش از 5/1 میلیون کیلومتر مربع است که نزدیک به 92 درصد از مساحت ایران را شامل می شود. به این ترتیب خشکی یکی از مهمترین تنش های غیرزیستی در این مناطق است. از آنجایی که اصلاح گیاهان برای تحمل به تنش خشکی همواره با مشکلات خاص خود مواجه است، کشت و اهلی سازی گیاهان مقاوم به خشکی بهترین راهکار برای جلوگیری از انقراض گونه های خودرو و احیای مراتع است. انتخاب گیاهان مقاوم به خشکی در حساس ترین مرحله زندگی گیاه که جوانه زنی است نقش مهمی در مراحل دیگر استقرار گیاه خواهد داشت. یکی از عوامل مهم کنترل کننده جوانه زنی در شرایط خشکی پتانسیل آب می باشد. مدل هیدروتایم رابطه درصد و سرعت جوانه زنی با پتانسیل آب را توصیف می کند. این مدل سرعت پیشروی جوانه زنی (θH)، یکنواختی جوانه زنی (σψb) و میزان مقاومت به شرایط تنش خشکی (ψb(50)) را کمی می سازد. این شاخص ها در تعیین قدرت توده ها یا ارقام بذرها، بررسی کمون در بذرها و بررسی اثر تیمارهای بهبوددهنده قدرت بذرها کاربرد دارند. به منظور تعیین گونه های مقاوم به خشکی و پیش بینی پاسخ جوانه زنی سه گونه دارویی پونه سا Nepata haussknechtii، N. pogonosperma و N. glomerulosa subsp. staffina به پتانسیل آب، از مدل هیدروتایم استفاده شد.

    مواد و روش ها

    در هر یک از گونه ها شش سطح پتانسیل آب، 0، 3/0-، 6/0-، 9/0-، 2/1 و 5/1 مگاپاسکال در قالب طرح کاملا تصادفی در 3 تکرار در سال 1402 در آزمایشگاه تحقیقات تکنولوژی بذر بانک ژن منابع طبیعی ایران اجرا شد. جوانه زنی بذر گونه های مختلف به صورت روزانه در دمای 25 درجه سانتی گراد ثبت گردید. از آنجایی که در سطح پتانسیل 5/1 مگاپاسکال جوانه زنی ثبت نگردید، این داده ها حذف شدند. سپس مدل هیدروتایم به داده های جوانه زنی برازش داده شد. با مدل هیدروتایم ثابت هیدروتایم (θH)، پتانسیل پایه برای جوانه زنی 50 درصد بذرها (Ψb(50)) و انحراف معیار پتانسیل آب پایه (σψb) گونه های مورد بررسی کمی سازی گردید.

    یافته ها

    نتایج تجزیه واریانس نشان داد که اثر خشکی (در پنج سطح 0، 3/0-، 6/0-، 9/0- و 2/1 مگاپاسکال) بر همه صفات جوانه زنی بذر سه گونه پونه سا در سطح پنج درصد معنی دار بود. در این مطالعه داده های جوانه زنی سه گونه پونه سا در سطوح مختلف خشکی با استفاده از مدل هیدروتایم تجزیه شد. نتایج خروجی مدل نشان داد که سرعت جوانه زنی در شرایط تنش خشکی در گونه N. haussknechtii (32/48θH=) نسبت به دو گونه N. glomerulosa (13/52θH=) و N. pogonosperma (57/56θH=) بیشتر بود. بعلاوه یکنواختی جوانه زنی N. haussknechtii (18/0=σψb) بیشتر از N. pogonosperma (24/0=σψb) و N. glomerulosa (39/0=σψb) بود. از نظر مقاومت به خشکی، گونه N. pogonosperma (006/1-=ψb(50)) نسبت به دو گونه N. haussknechtii (69/0-=ψb(50)) و N. glomerulosa (77/0-=ψb(50)) مقاوم تر بود.

    نتیجه گیری

    تنش اسمزی به طور معنی داری الگو، زمان و میزان جوانه زنی بذرهای گونه های مورد مطالعه را تحت تاثیر قرار داد. از آنجایی که کیفیت بذر در ارتباط با میزان مقاومت به خشکی، تعیین کننده سرعت و یکنواختی جوانه زنی در بذرها است، خروجی مدل هیدروتایم که شامل پارامترهای θH، σψb و ψb(50) است برای پیش بینی درصد جوانه زنی در شرایط تنش خشکی استفاده شد. با استفاده از مدل هیدروتایم گونه های متحمل به خشکی شناسایی شدند. با توجه به شاخص هایی که از مدل هیدروتایم به دست آمد، گونه N. pogonosperma نسبت به دو گونه N. haussknechtii و N. glomerulosa مقاوم تر بود. نتیجه گیری شد که مدل هیدروتایم در برنامه های اصلاحی می تواند کمک زیادی به اصلاح گران، برای شناسایی بذرهای با کارایی بالا و دارای مقاومت به شرایط در شرایط خشکی بکند.

    کلید واژگان: استرس اسمزی، پونه سا، پتانسیل پایه، ضریب هیدروتایم
    Parvin Salehi *, Hamideh Javadi, Leila Fallah
    Background and Objectives

    Iran's arid and semi-arid regions span over 1.5 million km², accounting for nearly 92% of the country's total area. Drought is one of the most critical abiotic stresses affecting these areas. Due to challenges faced in breeding improved drought-tolerant genotypes, the domestication and cultivation of drought-resistant plants have emerged as the best solution to prevent the extinction of wild species and restore pastures. Selecting drought-tolerant plants during the germination stage is crucial for successful plant establishment. Seed germination is the first and most important developmental stage, that is influenced by genetic and environmental factors. The hydrotime model describes the relationship between water potential (ψ) and seed germination rate and percentage. This model quantifies the rate of germination progression (hydrotime constant: θH), the uniformity of germination (standard deviation of the base water potential: σψb), and the stress tolerance of germination [base osmotic potential for 50% germination: ψb(50)]. These indicators can be used to determine seed vigor and seed dormancy and the effects of treatments on seed viability. This study aimed to use hydrotime model to predict of germination response of three medicinal species of Nepeta haussknechtii, N. pogonosperma, and N. glomerulosa subsp. staffina to water potential. 

    Methodology

    For each species, six water potential levels (0, -0.3, -0.6, -0.9, -1.2, and -1.5 MPa) were applied using a completely randomized design with three replications in 1402 at the Seed Technological Research Laboratory of the Natural Resources Gene Bank, Iran. Seed germination of species was recorded daily at a temperature of 25°C. Since no germination was observed at a potential level of -1.5 MPa, this treatment was excluded from the analysis. The hydrotime model was then fitted to the germination data, and the hydrotime constant (θH), base osmotic potential for 50% germination ψb(50), and standard deviation of the base water potential (σψb) were quantified. 

    Results

    The analysis of variance revealed significant effects of drought (at five levels of 0, -0.3, -0.6, -0.9, and -1.2 MPa) on all seed germination characteristics of all three Nepeta species (P<0.05). The hydrotime model results showed that the germination rate under drought stress was higher in N. haussknechtii (θH=48.32) than in N. glomerulosa (θH=52.13) and N. pogonosperma (θH=56.57). Furthermore, the germination uniformity of N. haussknechtii (σψb=0.18) was higher than that of N. glomerulosa (σψb=0.39) and N. pogonosperma (σψb=0.24). In terms of drought resistance, N. pogonosperma (ψb(50)=-1.006) exhibited greater resistance compared to N. haussknechtii (ψb(50)=-0.69) and N. glomerulosa (ψb(50)=-0.77).

    Conclusion

    Osmotic stress significantly impacted the germination pattern, timing, and rate of Nepeta seeds. Since seed quality concerning drought resistance determines the speed and uniformity of germination, the output of the hydrotime model, including parameters θH, σψb, and ψb(50), was effective in predicting germination percentages under drought stress conditions. Drought-tolerant genotypes were identified using the hydrotime model, with N. pogonosperma being the most resistant species, followed by N. haussknechtii and N. glomerulosa. The hydrotime model is a tool in breeding programs for identifying high-efficiency genotypes' resistance to stress conditions.

    Keywords: Base Potential, Hydrotime Coefficient, Nepeta, Osmotic Stress
  • Morteza Noryan, Islam Majidi Harvan, Hossein Sabouri *, Farokh Darvish Kojouri

    To evaluate the genetic basis of drought tolerance in rice, an experiment was conducted using 120 recombinant inbred lines (RILs) derived from Neda × Ahlamitarom cross. A factorial experiment based on completely randomized design with three replications was used under greenhouse conditions setting at Gonbad Kavous University. In this study, Polyethylene Glycol (PEG) 6000 was employed to induce osmotic stress (at levels of −4.5 and −9 bar) during both vegetative and reproductive stages. In addition to assessing root and shoot morphological characters, genetic linkage map was constructed using Simple Sequence Repeat (SSR), Inter Primer Binding Site (iPBS), Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism (IRAP), and Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) markers. Sixteen Quantitative Trait Loci (QTLs) were identified during vegetative growth stage, while twenty QTLs were identified during the reproductive stage. Through a comparative analysis of the three evaluated treatments, the qRN-12, qRS-11, and qRV-12 lines were determined as stable QTLs  suitable for the selection of drought-tolerant lines at the vegetative stage under varying conditions. Several new alleles associated with drought-tolerant QTLs were identified in this study. Notably, in two distinct environmental conditions, crucial QTLs, such as qNTF-12 and qNL-3, related to the numbers of fertile tillers and leaves, were identified as stable QTLs at the reproductive stage. The QTLs identified at vegetative and reproductive stages in this study can serve as stable and major QTLs for  selecting drought-tolerant lines in marker-assisted selection (MAS).

    Keywords: Major QTL, osmotic stress, Quantitative trait loci, Rice
  • پریسا دادگر*، زهره علیزاده، محمدقادر قادری، علی ایزانلو

    تنش خشکی از موانع اصلی در تولید محصولات زراعی محسوب می شود. آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی در چهار تکرار، فاکتور اول ارقام گندم شامل روشن و کویر (متحمل به خشکی)، قدس و مهدوی (حساس به خشکی) و شعله و طبسی (مقاومت متوسط نسبت به خشکی) و فاکتور دوم تنش اسمزی اعمال شده با پلی اتلین گلیکول8000 در سه سطح صفر، 5- و 10- بار، بذور ارقام جوانه زده را در محیط کشت هوگلند به مدت 15 روز تحت تنش اسمزی اجرا شد. در مطالعه حاضر بررسی اهمیت بیان ژن های P5CS و P5CR در ارتباط با تجمع پرولین و MDA و نقش فیزیولوژیکی آن ها تحت شرایط تنش اسمزی در شش رقم گندم می باشد. اثر ارقام بر میزان تجمع پرولین در سطح احتمال پنج درصد معنی دار شد. مقدار پرولین برگ و ریشه ارقام متحمل به خشکی نسبت به ارقام مقاوم به خشکی در شرایط تنش اسمزی 10- بار مقاوم تر مشاهده شد. برای مقایسه میانگین اثر متقابل تنش اسمزی×ارقام که بیشترین میانگین را رقم روشن (متحمل به خشکی) در سطح تنش اسمزی 10- بار نشان داد. در ارقام روشن و کویر که به عنوان ارقام مقاوم تر شناخته می شوند تجمع معنی دار پرولین را نشان ندادند. افزایش سطح تنش اسمزی سبب تخریب غشاهای سلولی و افزایش غلظت MDA به ترتیب در رقم شعله و طبسی بیش از ارقام دیگر شد. با اعمال افزایش سطح تنش اسمزی در ارقام، میزان بیان نسبی رونوشت ژن ها P5CS و P5CR افزایش نشان داد. این ژن های در سطح تنش اسمزی 10- بار در رقم قدس (حساس) بیشترین بیان رونوشت نسبی را نشان دادند، در حالی که در سطح تنش اسمزی 5- بار در رقم روشن (متحمل به خشکی) بیشترین بیان نسبی مشاهده شد.

    کلید واژگان: بیان ژن، پرولین، پلی اتلین گلیکول، تنش اسمزی، گندم، مالون دی آلدئید
    P. Dadgar*, Z. Alizadeh, MGH .Ghaderi, A. Izanir

    Drought stress is one of the main obstacles in the of crops  production. A factorial experiment in a completely randomized design with four replications, first factor cultivars include Roshan and Kaver (Drought tolerate), Qods and Mahdavi (drought sensitive), Shole and Tabasi (medium resistance to drought) and the second factor was the osmotic stress applied with polyethylene glycol 8000 at three levels of 0,- 5 and -10 bar, Seeds of germinated cultivars were cultured under hogland conditions for 15 days under osmotic stress. In this study, the importance of the expression of P5CS and P5CR genes in relation to proline and MDA accumulation and their physiological role under osmotic stress conditions in six wheat cultivars was investigated. The effect of cultivars on proline accumulation was significant at 5% level .Proline contents of leaf and root of drought tolerant cultivars was -10 times more resistant than drought sensitive cultivars. In order to compare the mean interactions of osmotic stress × cultivars, the highest mean in the cultivars bright (drought tolerant) at osmotic stress level of -10 bars was showed. No significant accumulation of proline was observed in Roshan and Kaver cultivars, which are known as more resistant cultivars. Increasing osmotic stress and increasing MDA concentration were higher in Shole and Tabasi cultivars than other cultivars. By increasing the level of osmotic stress in the cultivars, the relative expression of genes P5CS and P5CR transcription increased. The genes showed at the level of osmotic stress -10 bar in Qods cultivar (sensitive), the gave highest expression in relative transcripts. While The highest relative expression was observed in the osmotic stress level of -5 bar in the Roshan cultivar (drought resistant).

    Keywords: Gene expression, Malondialdehyde, Osmotic stress, Polyethylene glycol, Proline, Wheat
  • مریم صادقی، اکرم صادقی*

    تغییر در پتانسیل آب محیطی که در اثر خشکی و شوری ایجاد می شود، یکی از مهمترین عوامل تنش زای غیرزیستی در بسیاری از زیستگاه های طبیعی موجودات زنده است. محلول های سازگار به عنوان عوامل محافظت کننده، نقش مهمی در افزایش پایداری ملکول های زیستی و کل سلول در برابر تنش شوری ایفا می کنند. اکتوئین و مشتق آن هیدروکسی اکتوئین به عنوان محلول سازگار به طور گسترده ای توسط باکتری ها و تعداد معدودی از آرکی ها و یوکاریوت ها در پاسخ به شوری و فشار اسمزی بالا تولید می شوند. تولید اکتوئین با استفاده از مهندسی ژنتیک و انتقال ژن های ectA، ectB و ectC منجر به افزایش تحمل فشار اسمزی بالا در چند گیاه مدل شده است. در این مقاله مروری، اهمیت کاربرد های فعلی و بالقوه اکتوئین به عنوان محافظت کننده از ماکروملکول ها، سلول ها و بافت ها مورد بحث قرار گرفته است. همچنین، یک تئوری پیشرو در مورد سازوکار و چگونگی محافظت اکتوئین از پروتئین ها که شامل کنار رفتن ملکول های اکتوئین از سطح ماکروملکول ها، کند سازی انتشار آب از اطراف ملکول های زیستی و کمک به حفظ حالت طبیعی پروتئین ها است شرح داده شده است. داده های تجربی دهه های گذشته در مورد کاهش تنش خشکی و شوری توسط اکتوئین ها و چشم انداز استفاده از آن ها در زمینه های مختلف بیوتکنولوژی مدرن از جمله مهندسی ژنتیک در این مقاله مروری خلاصه شده است.

    کلید واژگان: اکتوئین، محلول های سازگار، تنش اسمزی، مهندسی ژنتیک
    Maryam Sadeghi, Akram Sadeghi*

    Fluctuations in environmental water potential caused by drought and salinity are the most important abiotic stress factors in many natural habitats of organisms. Compatible solutes stabilize biomolecules and whole cells and play as stress-protective agents. Ectoine and its derivative 5-hydroxyectoine as compatible solutes are synthesized widely by the members of the bacteria, a few archaea, and eukarya in response to high salinity and osmolarity. Previously reported that the genetically engineered ectoine synthesis using ectA, ectB or ectC has resulted in increased hyperosmotic tolerance of model plants. In this review, the importance of current and potential applications of ectoines as protecting agents for macromolecules, cells, and tissues, are discussed. Besides, the leading theory for the protection mechanism of ectoines including the exclusion of ectoines molecules from the protein surface, slows the diffusion of water molecules and preserve the native state of the protein were explained. The experimental data of the past decades concerning alleviating drought and salinity stresses by ectoines and the prospects for their use in different fields of modern biotechnology, including genetic engineering techniques, have been summarized in this review article.

    Keywords: ectoines, compatible solutes, osmotic stress, genetic engineering
  • مسعود عمرانی دهکهان، احمد معینی*، زهرا موحدی
    در این تحقیق، آثار غلظت زئاتین ریبوزاید (0.6, 0.8, 1, 1.2 and 1.4 mg l-1)، مدت زمان تنش دمای35 °C (6، 8، 10 و 12 روز) و غلظت مانیتول (0, 10, 20, 30 and 40 mg l-1) روی کشت بساک چهار رقم بادمجان بررسی شد. بر اساس نتایج تجزیه واریانس، اثر متقابل بین ارقام و تیمارها معنی دار بود و بیشترین درصد گیاهچه های باززایی شده حاصل از جنین (25%) با استفاده از1 mg l-1 زئاتین ریبوزاید و 8 روز تنش حرارتی در رقم شانتال به دست آمد. همچنین نتایج نشان داد که استفاده از10 mg l-1 مانیتول، منجر به تولید بیشترین درصد گیاهچه های باززایی شده حاصل از جنین (6/66 %) در رقم شانتال شده است. در ارقام هاردیان و فاسلیس، سطوح پلوییدی همه گیاهان حاصل از کشت بساک (به ترتیب 10 و 21 گیاه) از طریق فلوسایتومتری تعیین شدند و بر اساس نتایج، به ترتیب 60% و 1/57% گیاهان بررسی شده، هاپلویید بودند. در ارقام شانتال و والنتینا، تعداد 30 گیاه باززایی شده برای بررسی سطح پلوییدی انتخاب شدند و نتایج نشان داد که به ترتیب 2/40% و 5/51% آنها هاپلویید بودند.
    کلید واژگان: آندروژنز، هاپلوئیدی، تنش اسمزی
    Masoud Emrani Dehkehan, Ahmad Moieni *, Zahra Movahedi
    In this research, the effects of zeatin riboside (0.6, 0.8, 1, 1.2 and 1.4 mg l-1), duration of heat stress of 35 °C (6, 8, 10 and 12 days) and mannitol (0, 10, 20, 30 and 40 mg l-1) on anther culture of four eggplant cultivars were investigated in independent experiments. These experiments were performed according to a factorial arrangement in a randomized complete blocks design layout. The results showed significant interaction effects between the cultivars and treatments. The highest percentage of embryo-derived plantlets (25%) was obtained in cultivar Chantal using 1 mg l-1 zeatin riboside and 8 days of the heat stress. The results also indicated that the use of 10 mg l-1 mannitol had the highest embryo-derived plantlets (66.6%) in cultivar Chantal. In cultivars Hadrian and Faselis, the ploidy levels of all regenerated plants from anther culture (10 and 21 plants, respectively) were determined through flow cytometry and it was found that 60% and 57.1% of the tested plants were haploid, respectively. In cultivars Chantale and Valentina, 30 regenerated plants were selected for determining their ploidy levels and the results showed that 40.2% and 51.5% of the plants were haploid, respectively.
    Keywords: Androgenesis, Haploidy, Osmotic stress
  • حسین صبوری *، شریفه محمد آلق، عباس بیابانی، احمدرضا دادرس، عاطفه صبوری، مهناز کاتوزی، محبوبه نجار عجم، ماهم پیراسته، رسول خاتمی نژاد
    تنش های اسمتیک از جمله خشکی در برنج یکی از جدی ترین عامل های تولید و پایداری عملکرد در جهان می باشد. به منظور مکان یابی QTLهای مرتبط با تحمل به تنش های اسمتیک در مرحله جوانه زنی و تعیین سهم هر QTL در تنوع فنوتیپی صفات 96 لاین نسل هشتم تلاقی ارقام عنبربو × سپیدرود (به ترتیب متحمل و حساس به تنش خشکی در مرحله جوانه زنی) در دانشگاه گنبد کاووس طی سال های 92-1390 مورد مطالعه قرار گرفتند. برای تشکیل نقشه پیوستگی، چند شکلی 365 جفت آغازگر SSR و 35 ترکیب پرایمری AFLP روی والدین مورد بررسی قرار گرفت. از 136 نشانگر SSR و 21 ترکیب پرایمری چند شکل برای تهیه نقشه پیوستگی استفاده شد. مولفه های جوانه زنی شامل طول ریشه چه، ساقه چه، کلئوپتیل و درصد جوانه زنی روی 100 بذر هر لاین در شرایط تنش اسمتیک 5 بار حاصل از ساکارز، سوربیتول و مانیتول ثبت شد. برای طول ریشه چه در هر سه شرایط تنش روی کروموزوم 4، QTLهایی یافت شد که اثر افزایشی آن در همه موارد مثبت بود. از بین QTLهای شناسایی شده qSUC-5 (طول کلئوپتیل در تنش حاصل از ساکارز) روی کروموزوم 5، qSUR-2 (طول ریشه چه در تنش حاصل از ساکارز) روی کروموزوم 2 و qSUR-4 (طول ریشه چه در تنش حاصل از ساکارز) روی کروموزوم 4 به ترتیب 23، 23 و 26 درصد تغییرات فنوتیپی طول کلئوپتیل و طول ریشه چه را در شرایط تنش اسمتیک توجیه نمودند. این QTLها به دلیل بالا بودن درصد توجیه پس از تعیین اعتبار، کاندید مناسبی برای برنامه های انتخاب به کمک نشانگر در جمعیت لاین های نوترکیب برنج ایرانی می باشند.
    کلید واژگان: برنج (Oryza sativa، L)، جوانه زنی، مکان یابی، تنش اسمتیک
    Hossein Sabouri*, Sharifeh Mohammad Alegh, Abbas Biabani, Ahmad, Reza Dadras, Atefeh Sabouri, Mahnaz Katouzi, Mahboubeh Najjar Ajam, Maham Pirasteh, Rasoul Khatami Nejad
    Osmotic stress (such as drought stress) is a serious limiting factor to rice production and yield stability in worldwide. In order to locate the QTL associated with tolerance to osmotic stresses in germination stage and determine the contribution of each QTL on the phenotypic variation caused 96 lines of F8 Anbarboo × Sepeedrud (tolerant and sensitive to drought stress in germination stage, respectively) an experiment was conducted at Gonbad Kavous university in 2011-2013. For construction of genetic linkage map, 365 SSR marker and 32 primer combination were evaluated. 136 polymorphic SSR markers and 21 primer combination were used for providing of linkage map. Germination components including root length, shoot, coleoptile and the percentage of seed germination was recorded for 100 seed of each line in the osmotic stress resulting from sucrose, sorbitol and mannitol. For root length in all three stress conditions was found a QTL on chromosome 4 that had positive effect in all cases. Among the identified QTL, qSUC-5 (QTL for coleoptile length under sucrose stress) on chromosome 5, qSUR-2 (QTL for radicle length under sucrose stress) on chromosome 2 and qSUR-4 (QTL for radicle length under sucrose stress) on chromosome 4, respectively, 23, 23 and 26% of phenotypic variation for coleoptile and root length were justified in terms of osmotic stress. This QTL explained that due to the high percentage of candidates for marker-assisted selection programs recombinant line population of Iranian rice.
    Keywords: Rice (Oryza sativa L.), Germination, Mapping, Osmotic stress
  • الهام محولاتی، سیروس قبادی*، بدرالدین ابراهیم سیدطباطبایی، غزاله خاکسار، محمدعلی تقدس
    عامل نسخه برداری DREB (پروتئین متصل شونده به عنصر پاسخ دهنده به کم آبی) یکی از چهار سیستم تنظیمی مستقل در گیاهان است که در فعال شدن ژن های پاسخ دهنده به تنش های محیطی نقش دارد. به منظور شناسایی و جداسازی برخی از ژن های DREB در انگور، گیاهان تحت تنش 150 میلی مولار NaCl قرار گرفته و سپس RNA کل استخراج شد. آغازگرهای اختصاصی براساس ژن فرضی DREB و همولوگ ژن SbDREB2A گیاه نمک دوست Salicornia brachiata با انگور طراحی و ژن های VvDREB و DREB like 2C (ارتولوگ SbDREB) از انگور جدا شد. نتایج نشان داد که ژن VvDREB با ژن های DREB گروه دو خانواده سویا در حدود 85 درصد و دو ژن SbDREB2Aو DREB like 2C درحدود 80 درصد شباهت دارد. رسم ساختار ثانویه پروتئین VvDREB و پروتئین های DREB2 سویا نشان داد که در ناحیه حفاظت شده AP2 آن ها ساختارHelix مشابه وجود دارد. مطالعه و مقایسه موتیف های پروتئین VvsDREB وSbDREB2A در سایت ELM حاکی از عدم وجود پنج موتیف متفاوت (BRCT، MAPK، PKB، NES، NLS) در پروتئین VvsDREB بود که احتمال می رود دلیل بر ناکارایی موثر عملکرد آن باشد.
    کلید واژگان: انگور، تنش اسمزی، زیست رایانه، DREB، Salicornia brachiata
    Mahvelati E., Ghobadi C.*, Sayed Tabatabaei Be, Khaksar G., Taghaddos Ma
    DREB transcription factors are one of the four independent regulation systems in plants which involves in abiotic stress signaling pathway and activation of stress responsive genes. For identification and isolation of DREB genes, one-year-old own-rooted grapevine’ were used. Potted plants were subjected to150mM NaCl during the experiment and total RNA was extracted. Specific primers were designed based on predicted DREB and SbDREB2A gene homologue in halophilic plant Salicornia brachiata. VvDREB and VvsDREB (DREB like 2C) genes were isolated from grapevine (Vitis vinifera L.’ Askari’). Bioinformatics results indicated that VvDREB gene has 85% similarity with DREB2 genes from soybean family and VvsDREB gene has 80% similarity with SbDRE 2A gene. SbDREB2A and VvsDREB proteins motif studies in ELM database showed that there are no five motifs (BRCT, MAPK, PKB, NES, NLS) in VvsDREB protein.
    Keywords: Bioinformatics, DREB, Grapevine, Osmotic stress, Salicornia brachiata
نکته
  • نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شده‌اند.
  • کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شده‌است. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
  • در صورتی که می‌خواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.
درخواست پشتیبانی - گزارش اشکال