buffalo
در نشریات گروه علوم دام-
تاثیر استفاده از تفاله زیتون بر هضم پذیری، فراسنجه های بیوشیمیایی خون، تولید و ترکیب شیر گاومیش شیری
زمینه مطالعاتی:
تفاله زیتون به عنوان یک پس مانده محصول روغنکشی میوه ی زیتون است که بعد از خشک شدن به عنوان یکی از محصولات جانبی می تواند در تغذیه دام مورد استفاده قرار گیرد.
هدفاین مطالعه با هدف بررسی تاثیر تفاله زیتون بر عملکرد تولید، قابلیت هضم مواد مغذی، فراسنجه های بیوشیمیایی خون گاومیش های شیرده خوزستان انجام شد.
روش کاردر این آزمایش از 15 راس گاومیش شیرده با میانگین سنی 4 سال، میانگین وزن 570 کیلوگرم و 2 شکم زایش، در قالب طرح کاملا" تصادفی به صورت 3 تیمار و 5 تکرار استفاده شد. تیمارهای آزمایشی عبارت بودند از 1) جیره پایه بدون استفاده از تفاله زیتون (شاهد)، 2) جیره پایه به همراه 5/7 درصد تفاله زیتون، 3) جیره پایه به همراه 15 درصد تفاله زیتون. در پایان آزمایش، خوراک مصرفی، قابلیت هضم مواد مغذی، ترکیبات شیر و فراسنجه های خونی اندازه گیری شد.
نتایجنتایج نشان داد، چربی شیر و مواد جامد بدون چربی در تیمارهای آزمایشی افزایش یافت (P<0.05) ولی ماده خشک مصرفی، میزان تولید، پروتیین و pH شیر تحت تاثیر تیمار های آزمایشی قرار نگرفت (P>0.05). غلظت فراسنجه های خونی تحت تاثیر تیمار های آزمایشی قرار نگرفت اما غلظت کلسترول در تیمار حاوی 5/7 درصد تفاله روند افزایشی نشان داد و غلظت آلکالین فسفاتاز نیز در تیمار حاوی 15 درصد نسبت به سایر تیمارها افزایش یافت (P<0.05). قابلیت هضم مواد مغذی نیز تحت تاثیر تیمار های آزمایشی قرار نگرفت (P>0.05).
نتیجه گیری نهایی:
نتایج این آزمایش نشان داد که استفاده از تفاله زیتون به جای آرد گندم هیچ تاثیر منفی بر عملکرد تولید، غلظت فراسنجه های خونی و قابلیت هضم مواد مغذی در گاومیش های شیرده نداشت، همچنین با توجه به قیمت مناسب تفاله زیتون، جایگزینی آن تا سطح 15 درصد با آرد گندم در جیره گاومیش های شیرده پیشنهاد می شود.
کلید واژگان: تفاله زیتون، گاومیش، هضم پدیری، فراسنجه های بیوشیمیاییBackground and objectiveSince, feeding in animal husbandry is one of the most critical and costly issues, therefore should focus on cheap resources like agricultural wastes which provide adequate nutrients for livestock. Olive pomace is a residue of the oil extraction of olive fruit, which after drying can be used as a by-product in animal feed. Olive pomace contains high lignin (32% DM), cellulose and hemicellulose (Sadeghi et al., 2009). Raw olive pomace contains high amounts of 16 and 18 fatty acids; and about 96% of olive pomace fatty acids include linoleic acid and oleic acid (Nazari et al., 2008). Olive pomace is containing anti-nutritional components such as phenolic compounds and tannins (0.58 to 1.1 g/kg DM), and it may have adverse effects on livestock (Molina et al, 2003). Feeding dairy ruminants with non-core olive cake containing tocopherol, retinol and phenols can cause positive changes on milk quality, and improved oxidative stability of milk (Pauselli et al, 2007). Most of buffalo breeders use wheat flour in buffalo diet. Using wheat flour, can destroy the rumen microbial population and as an important part in human foods, increases costs. However, there is no research on wheat flour replaced with olive pomace in buffalo nutrition. Therefore, this study was conducted to explore the effect of olive cake on digestibility, blood biochemical parameters and production performance of Khuzestani dairy Buffalo.
Material and methodsFifteen dairy buffaloes average 4 years, average body weight 570 kg and 2 parities were used in a completely randomized design with 3 treatments and 5 repetitions. Experimental treatments were included 0%, 7.5%, and 15% olive pomace substituted with wheat flour, which fed two times daily for 45 days in a completely randomized design. Diets were formulated according to the NRC. The olive pomace used in this study dried by air drying. The pomaces were stirred and mixed several times daily. The crude protein, metabolizable energy, neutral detergent fiber, acid detergent fibers, and fat of olive pomace were 6.5%, 2.65 Mk / kg DM, 56, 45, and 9 %, respectively.At the end of the experiment, feed intake, nutrient digestibility, production performance and blood parameters were measured. The diets were prepared completely mixed and given daily at 7:00 and 17:00. Fresh water was also available to them. The combination of control diet consisted of corn silage, wheat straw, olive cake, wheat flour, wheat bran, rice bran, mineral supplement and vitamins, limestone. Milking was done every day in the morning and evening and milk production was recorded. Milk scanner was used to measure milk protein, fat, and lactose. The milk pH determined by using pH papers or electrical pH meters; and milk solids and non-fat solids (SNF), by lactometer.Also, blood samples were taken from all buffaloes at the end of the period, 3 to 4 hours after morning intake and blood metabolites determined. For apparent digestibility of the diets, during three consecutive days, buffalo feces were collected. Also, sampling of feed residuals in the last three days of the period was weighed. Then, the digestibility of organic matter, dry matter, crude protein, crude fat, acid detergent fibers and neutral detergent fibers were measured.The obtained data were analyzed using the General Linear Model procedure of the SAS. A comparison of the mean was made with Duncan. The model of this design was a completely randomized design with three treatments, and each treatment includes five replications based on the statistical model: Yij= µ + Ti+ eij. Also, repeated data per time were analyzed based on the mixed statistical model. Yci = µ + Tc + Ɛic + (T*P)ik.
ResultsMilk fat and SNF increased in experimental treatments at the end of the period (P<0.05). However, milk production, protein, acidity, density and pH of milk were not affected by the experimental treatments (P>0.05). Milk production increased by using dried olive kernels in dairy buffaloes (Terramoccia et al., 2013). Inclusion of unsaturated fatty acids often reduces the saturated fatty acids of milk. Also, high fat in olive pomace can be a major reason for high percentage of milk fat in the olive pomace treatment compared to control (Chilofalo et al. 2003). Also, the concentration of blood parameters was not affected by experimental diets. But, blood cholesterol in 7.5% olive cake increased and the concentration of alkaline phosphatase enzyme increased by 15% olive cake compared to the other treatments (P<0.05). Obeidat (2017) reported that adding olive pomace to the diet of Awasi lambs had no effect on blood parameters (glucose, blood urea nitrogen, aspartate aminotransferase and alanine aminotransferase). But Hashish and Al-Sameh (2012) declared that saturated fatty acids in olive pomace can increase the concentration of saturated fatty acids and blood cholesterol. Other researchers also concluded that with the increase in dietary fat concentration, blood cholesterol increased (Bhatta et al., 2011). Nutrient digestibility was not affected by experimental treatments (P>0.05). Using olive pomace up to 20% instead of barley in Lori lambs increased microbial protein production in the rumen. Also, olive pomace in the Dalagh sheep diet increased feeding efficiency and carcass weight; and reduced production costs up to 66% (Samadi, 2009). The use of olive pomace in Awasi lambs, did not influence dry matter intake, digestibility of crude protein, neutral detergent fiber and acidic detergent fiber (Obeidat, 2017).
ConclusionAccording to the recent study, replacing wheat flour with olive cake had no negative effect on production, blood parameters and digestibility of nutrients in dairy buffaloes, and due to the reasonable price of olive cake; replacing olive cake up to 15% with wheat flour in the diet of dairy buffaloes is recommended.
Keywords: Olive cake, Buffalo, blood parameters, Digestibility -
مقدمه و هدف
توسعه سریع فناوری های توالی یابی کل ژنوم و ابزارهای بیوانفورماتیک، نقطه شروعی برای کشف تنوع ژنتیکی گستره در سطح کل ژنوم موجودات را فراهم می کند. گاومیش از جمله حیوانات اهلی مهم در سطح جهانی است که ارزش اقتصادی زیادی برای جوامع انسانی دارد که برای تولید محصولاتی مثل شیر، گوشت، چرم و نیز به عنوان نیروی کار از آنها استفاده میشود. گاومیش های نژاد خوزستانی یکی از مهمترین نژاد گاومیش در ایران هستند که در غرب و جنوبغربی ایران پراکنده شدهاند. بیشترین جمعیت این نژاد در استان خوزستان وجود دارد که با شرایط جغرافیایی این منطقه کاملا سازگار شدهاند. در این مطالعه، شناسایی تنوع ژنتیکی در سطح کل ژنوم گاومیشهای نژاد خوزستانی با استفاده از تکنیک توالییابی انجام گرفت.
مواد و روشها:
کنترل کیفیت خوانشهای توالییابی شده با استفاده از پارامترهای مرتبط با کیفیت به وسیله ی نرم افزار FastQC (v0.12.1) انجام شد. ارزیابی خوانش های قطعات توالییابی نشان داد که همهی نمونه ها از کیفیت بالایی برخوردار بودند. برای هم ردیفی داده ها با ژنوم مرجع از بسته نرمافزاری BWA-MEM استفاده شد. در ادامه واریانتهای ژنومیک با استفاده از نرم افزار Freebayes به دست آمد. سپس، فیلتراسیون نهایی روی فایل واریانتها انجام گرفت. این فیلتراسیون به منظور افزایش کیفیت آنالیز و حذف واریانتهای با کیفیت پایین انجام گرفت.
یافته ها:
درصد همردیفی برای همهی نمونه ها بالاتر از 97/44 درصد و میزان همپوشانی در نمونه های توالییابی شده بین 4/3x تا 12/9x بود که نشان دهندهی کیفیت مناسب خوانشها است. همچنین، در این مطالعه تعداد 76.676.529 میلیون واریانت شناسایی شده است که به طور نسبتا مساوی در بین کروموزومهای گاومیشهای خوزستانی توزیع شده بودند. بیشترین و کمترین تعداد واریانتها به ترتیب روی کروموزوم شماره 1 و 28 مشاهده شد. در این مطالعه، تعداد جهش های جابه جایی و معکوس شناسایی شده در سطح ژنوم به ترتیب برابر با 298.193.017 و 135.694.466 و نسبت جهش های جابه جایی به معکوس به میزان 2/1989 (Ts/Tv) برآورد شد.
نتیجه گیریوجود تنوع ژنتیکی در جمعیت گاومیش های بومی ایران، پارامترهای باارزشی هستند که با مطالعه آن ها می توان پتانسیل ژنتیکی صفات اقتصادی در این جمعیت ها را به منظور طراحی برنامه های مناسب اصلاح نژادی مورد ارزیابی قرار داد.
کلید واژگان: توالی یابی کل ژنوم، خوزستانی، گاومیش، واریانتIntroduction and ObjectiveThe rapid development of sequencing technologies and bioinformatic tools has made it possible to sequence the entire genome of many species, providing a starting point for exploring the genome-wide genetic diversity of organisms. The buffalo is one of the most important domesticated animals in the world and has great economic value for humans, being used for milk, meat, leather and most importantly as labor. Khuzestani buffalo are among the most important buffalo in Iran. These animals are scattered in western and southwestern Iran. The largest population of this breed is in the Khuzestan province and they are fully adapted to the geographical features of this region
Material and MethodsIn this study, whole genome sequencing of the Khuzestan buffalo was performed in paired-end format using Illumina technology. Quality control of the readings obtained met all quality parameters and processing of the readings showed that all samples were of high quality. The BWA-MEM software package was then used to match the data to the reference genome. Genome variants were obtained with the Freebayes software. The final filtering of the variant file then took place. This filtering serves to increase the quality of the analysis and to sort out inferior variants.
ResultsThe alignment percentage for all samples was over 97.44% and also the coverage in the sequenced samples ranged from x 4.3 to x 9.12, indicating reasonable quality of the reads. Also, in this study we identified 76,676,529 million variants fairly evenly distributed on the chromosomes of the Khuzestan buffalo. The highest and the lowest number of variants were observed on chromosome 1 chromosome 28, repectively. In this study, the total number of translocation and inversion mutations in the genome level was 298,193,017 and 135,694,466, respectively. In addition, the ratio of transitions to transversion was estimated at 2.1989 (Ts/Tv).
ConclusionThe presence of genetic diversity in the native population of Iranian buffalos are valuable parameters that can be studied to evaluate the genetic potential of economic traits in these populations in order to design suitable breeding programs.
Keywords: Buffalo, Khuzestan, Variant, Whole genome sequencing -
با توجه به اهمیت سارکوسیتوزیس به عنوان بیماری مشترک در بهداشت عمومی جامعه، در این مطالعه میزان فراونی گونه های سارکوسیستیس با استفاده از ژن های Cox1 و 18srRNA در گاوها و گاومیش های کشتارشده در گشتارگاه ارومیه مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور، نمونه برداری از عضلات بین دنده ای، دیافراگم، مری و ران 100 راس گاو و 100 راس گاومیش کشتار شده در کشتارگاه شهرستان ارومیه در سال 1400 صورت گرفت. نمونه ها از نظر ماکروسکوپی و میکروسکوپی با استفاده از روش گسترش مهری و هضم بافتی مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه استخراج DNA از بافت های مورد مطالعه صورت گرفت و سپس بررسی های مولکولی با استفاده از ژن های COX1 و 18srRNA انجام گرفت. در بررسی ماکروسکوپی، هیچکدام از نمونه های بدست آمده از گاو آلوده به سارکوسیستیس نبودند، در حالی که تک یاخته از 11 (11درصد) نمونه بدست آمده از گاومیش جداسازی شد. همچنین در بررسی های میکروسکوپی با استفاده از روش گسترش مهری میزان آلودگی در گاو وگاومیش به ترتیب 27 (27 درصد) و 16 (16درصد) و در روش هضم بافتی به ترتیب برابر با 37 (37 درصد) و 23 (23 درصد) بود. همچنین بررسی های مولکولی با استفاده از ژن های COX1 و 18srRNA، حاکی از تایید آلودگی به سارکوسیتیس در 39مورد (39درصد) از 100 لاشه گاو و 26 مورد (26درصد) از 100 لاشه گاومیش مورد مطالعه بود. یافته های این مطالعه، بیانگر آلودگی نسبتا بالا در جمعیت های گاو وگاومیش استان دارد. به همین دلیل اقدامات و توصیه های لازم باید در جهت جلوگیری از مصرف گوشت خام و کم پخته در نظر گرفته شود.
کلید واژگان: سارکوسیستس، گاو، گاومیش، 18srRNA، COX1Due to the importance of Sarcocystis as a common zoonotic disease in public health, in this study, the infection rate of Sarcocystis infection and molecular identification of its species by using COX1 and 18srRNA genes in slaughtered cattle and buffaloes of the abattoir of Urmia was investigated. For this purpose, samples were taken from the intercostal muscles, diaphragm, esophagus, and thighs of 100 cows and 100 buffaloes slaughtered in the slaughterhouse of Urmia city in 2021. At first, macroscopic and microscopic evaluation were performed on samples. Then, DNA was extracted from homogenized tissues and molecular investigations were done using COX1 and 18srRNA genes. In the macroscopic examination, none of the samples obtained from cows were infected with sarcocystis, while this protozoan was isolated from 11 (%11) samples obtained from buffaloes. The infection rate in the impression smear method in cow and buffaloes samples were 27 (%27) and 16 (%16) and in peptic digestion method was 37 (%37) and 23 (%23), respectively. In parallel, molecular evaluation confirmed the presence of sarcocystis infection in 39 cases (39%) out of 100 cow carcasses and 26 cases (26%) out of 100 studied buffalo carcasses. The findings of this study indicate relatively high infection rate in cattle and buffalo populations of the province. The findings of this study indicate relatively high infection rate in cattle and buffalo populations of the province. So, it is suggested to avoid eating raw and undercooked meat.
Keywords: Sarcocystis, Cow, Buffalo, 18srRNA, COX1 -
سابقه و هدف
متابولیت های ثانویه گیاهان دارویی برای بهبود راندمان استفاده از انرژی در شکمبه و بهره وری حیوان مورد استفاده قرار میگیرند. پنیرک (Malva sylvestris) گیاهی است که عملکرد کشت آن در یک دوره سه ماهه معادل10 تن در هکتار برآورد گردیده است. برگ و گل پنیرک حاوی تانن، اگزالات کلسیم، مواد پکتیکی و موسیلاژ، آنتوسیانین ها و ویتامین ها بوده و وجود ویتامین C و فلاونوییدها منجر به کاربردهای بسیاری برای این گیاه شده است. در بعضی از مطالعات، استفاده از گیاهان دارویی اثر افزایشی بر عملکرد تولید شیر داشت. این آزمایش به منظور بررسی تاثیر تغذیه گیاه پنیرک بر تولید و ترکیب شیر، آنزیم های کبدی، گوارش پذیری مواد مغذی و فراسنجه های بیوشیمیایی خون گاومیش شیری انجام شد.
مواد و روشهادر این آزمایش از هشت راس گاومیش شیری، شکم چهارم و پنجم، با متوسط وزن 12±600 کیلوگرم که در اوایل شیرواری (ماه چهارم شیردهی) و میانگین تولید 6 لیتر بودند، استفاده شد. گاومیشها بطور تصادفی با جیره بدون پنیرک و جیره حاوی 500 گرم گیاه پنیرک به مدت یک ماه تغذیه شدند. دامها در آخورهای انفرادی مستقر و عادتپذیری آنها به جیره برای یک هفته انجام شد. آب تمیز و کافی در اختیار گاومیشها قرار گرفت.در پایان آزمایش، خوراک مصرفی و قابلیت هضم مواد مغذی، تولید و ترکیب شیر و بار میکروبی شیر اندازه گیری شدند. همچنین فراسنجه های خونی گاومیشها مانند گلوکز، کلسترول، تری گلیسرید، نیتروژن اورهای خون و آنزیمهای کبدی نیز تعیین شد. داده های این طرح در قالب طرح کاملا تصادفی تجزیه و تحلیل شدند و مقایسه میانگین ها با آزمون توکی در سطح معنی داری 5 درصد انجام شد.
یافته هانتایج نشان داد که چربی، پروتیین و لاکتوز شیر در تیمارهای آزمایشی تغییر نکرد (05/0 >P)، اما ماده خشک مصرفی گاومیشها و تولید شیر افزایش یافت (05/0P <). بر طبق نتایج، بار میکروبی شیر گاومیشهای تغذیه شده با گیاه پنیرک، کاهش یافت (05/0 <P). میزان گلوکز، کلسترول و تری گلیسرید خون در تیمار حاوی پنیرک کمتر از تیمار کنترل بود (05/0P <)، اما اوره خون و آنزیم های کبدی تحت تاثیر تیمارها قرار نگرفتند (05/0 >P). قابلیت هضم مواد مغذی شامل ماده خشک، پروتیین و الیاف نامحلول در شوینده خنثی در گاومیشهای تغذیه شده با گیاه پنیرک افزایش یافت (05/0 <P).
نتیجه گیریاستفاده از گیاه پنیرک در جیره گاومیشهای شیری نه تنها اثرات منفی بر عملکرد گاومیش شیری نداشت بلکه باعث افزایش تولید شیر و کاهش بار میکروبی شیر شد، بنابراین می تواند به عنوان یک مکمل مناسب در تغذیه گاومیشهای شیری استفاده شود.
کلید واژگان: پنیرک، ترکیب شیر، قابلیت هضم، گاومیشBackground and objectiveMetabolites of medicinal plants are used to improve energy efficiency in the rumen and animal productivity. Malva sylverstris is a plant whose cultivation yield in a quarterly period is estimated at 10 tons per hectare. Malva sylverstris leaves and flowers contain tannins, calcium oxalate, pectic substances and mucilage, anthocyanins, rich in vitamins, and due to the presence of vitamin C and flavonoids, many uses have been mentioned for this plant. In some studies, the use of herbs had an increasing effect on milk production performance. This experiment was conducted to investigate the effect of Malva sylverstris nutrition on milk production and composition, liver enzymes, nutrient digestibility, and blood biochemical parameters of dairy buffaloes.
Material and methodsEight khuzestani dairy buffaloes, 4-5 parities, average weight 600±12 kg in the early lactation (forth months), average milk production 6 liter, were used. Buffaloes randomly fed with a diet without Malva sylverstris and diet containing 500 g Malva sylverstri/ dry matter plant for one month. Animals were kept in individual stables and adaption to the diet was performed for one week. Sufficient and clean water was provided to the buffaloes.At the end of the experiment, feed intake, nutrient digestibility, milk production, quality and microbial load of milk were measured. Buffalo blood parameters such as glucose, cholesterol and triglyceride, urea and liver enzymes were determined. The data were analyzed in a completely randomized design and the means were compared with the Tukey test at significance level of 5%.
ResultsThe results showed that milk fat, protein, and lactose of milk did not change in the experimental treatments (P >0.05), but dry matter intake and milk production of buffaloes increased. According to the results, the milk microbial load of buffaloes fed Malva sylverstris decreased (P <0.05). Blood glucose, cholesterol, and triglyceride levels in the Malva sylverstris treatment were lower than the control treatment (P <0.05). Blood urea and liver enzymes were not affected by the treatments (P >0.05). Nutrient digestibility like dry matter, crud protein, and nautral detergent fiber in buffaloes fed Malva sylverstris increased (P <0.05).
ConclusionAccording to the result of the present study, the use of Malva sylverstris plant in the diet of dairy buffaloes not only did not have negative effects on the production performance of dairy buffaloes but also increased milk production and reduced the microbial load of milk, therefore it can be used as an appropriate supplement in the dairy buffaloes.
Keywords: Buffalo, digestibility. Malva sylverstris, milk quality -
در این تحقیق، به منظور ارزیابی ژنتیکی و اقتصادی برنامه انتخاب آزمون نتاج و انتخاب معمول گاومیش های خوزستان، تعداد 3000 گاومیش مولد با استفاده از برنامه R، شبیه سازی گردید. در هر یک از برنامه های آزمون نتاج از سطوح مختلف رکوردگیری شیر (100، 80، 50 و 20 درصد) و تلقیح مصنوعی (100، 80، 50 و 20 درصد) استفاده شد و در انتخاب معمول انتخاب بر اساس اطلاعات شجره گوساله نر و تولید مادر آن صورت گرفت. در شاخص انتخاب نیز، دو صفت تولید شیر و درصد چربی درنظر گرفته شد. برنامه های مورد مطالعه بر اساس پیشرفت ژنتیکی، تغییرات تولید، ارزش ژنوتیپی کل و میزان درآمد و هزینه مقایسه شدند. در بررسی برنامه های انتخاب اعمال شده، مشاهده شد که با افزایش نسبت گله های تحت پوشش تلقیح مصنوعی، پیشرفت ژنتیکی و تغییرات ارزش ژنوتیپی کل برنامه انتخاب آزمون نتاج افزایش داشت. این افزایش برای هزینه و درآمد هر یک از برنامه های مذکور نیز مشاهده شد. علاوه بر تلقیح مصنوعی، سیستم رکوردگیری شیر نیز بر افزایش دو پارامتر هزینه و درآمد موثر بود. با این حال، هزینه های اضافی ناشی از به کارگیری سیستم رکوردگیری شیر و عملیات تلقیح مصنوعی، از طریق افزایش درآمد حاصل از عملکرد گاومیش های بهتر جبران شد. به طورکلی، بر اساس تغییرات ارزش ژنوتیپی کل، پیشرفت ژنتیکی صفت تولید شیر و حداقل هزینه و حداکثر میزان درآمد، برنامه انتخاب آزمون نتاج با 20 درصد جمعیت تحت پوشش رکوردگیری و 100 درصد جمعیت تحت برنامه تلقیح مصنوعی برای گله های گاومیش ، به عنوان برنامه مناسب آزمون نتاج انتخاب شد.
کلید واژگان: آزمون نتاج، پیشرفت ژنتیکی، خوزستان، گاومیش، هزینهIn this study, in order to genetic and economic evaluation of the progeny testing selection program and the usual selection program of buffaloes in Khuzestan, 3000 buffalo cows were simulated using R program. In each progeny test programs, different levels of milk recording (100, 80, 50 and 20%) and artificial insemination (100, 80, 50 and 20%) were used and in usual program, the selection was based on pedigree information of male calf and its mother milk production. In the selection index, two traits of milk production and fat percentage were considered. The studied programs were compared based on genetic improvement, production changes, total genotypic value and costs and revenues of programs. In study of selection programs, it was observed that with increasing the proportion of herds covered by artificial insemination, genetic progress and changes in total genotypic value were increased in progeny testing programs. This increasing was also observed for the cost and revenue of each of considered programs. In addition to artificial insemination, the milk recording system was also effective in increasing the two parameters of cost and revenue. However, the additional costs of using milk recording system and artificial insemination were offset by increased revenue from performance of better buffaloes. In general, based on changes in total genotypic value, genetic improvement of milk production and minimum cost and maximum income of the programs, the progeny testing selection program with 20% of milk recording and 100% of artificial insemination was selected for buffalo herds as the suitable progeny testing program.
Keywords: Buffalo, Cost, Genetic improvement, Khuzestan, Progeny testing -
در این مطالعه، پارامترهای تولیدی، جمعیتی و اقتصادی تعداد 30 گله گاومیش استان خوزستان در دو وضعیت فروش، طی سال های 1396-1395، جهت برآورد ارزش اقتصادی صفات تولید، تولیدمثل و ماندگاری مورد استفاده قرار گرفت. ارزش اقتصادی صفات به ازاء یک واحد افزایش در میزان هر صفت و با استفاده از گرایش حداکثر سود برآورد شد. متوسط درآمد، هزینه و سود سالانه به ازای هر راس گاومیش در وضعیت فروش شیر و سرشیر به ترتیب برابر با با 60480817، 59270944 و 1209873 ریال و وضعیت فقط فروش شیر به ترتیب برابر با 59220881، 59270944 و 7/50062- ریال بدست آمد. در وضعیت فروش شیر و سرشیر به عنوان وضعیت فروش مناسب پیشنهادی، ارزش اقتصادی صفات تولیدی شامل تولید شیر، درصد چربی ، وزن گوساله نر پرواری و وزن شیرگیری گوساله به ترتیب 16774، 178011، 16051 و 46070- ریال، صفات تولیدمثلی شامل درصد آبستنی، میزان زنده زایی، فاصله گوساله زایی، وزن تلیسه داشتی و سن اولین زایش به ترتیب476142، 527296، 36668-، 76743- و 9504 ریال و صفات ماندگاری شامل زنده مانی گاومیش، زنده مانی گوساله تا 4 ماهگی، زنده مانی تلیسه از شیرگیری تا زایش و طول عمر اقتصادی به ترتیب 364946، 216406، 143588 و 72030 ریال به ازای هر راس گاومیش در سال برآورد شد. بر اساس نتایج حاصل، انتخاب در جهت افزایش میانگین صفات تولید شیر، درصد چربی و وزن گوساله نر پرواری منجر به بهبود وضعیت اقتصادی گاومیش دار میشود و با توجه به ارزش اقتصادی منفی صفات فاصله گوساله زایی و سن اولین زایش، اصلاح نژاد در جهت کاهش آن ها می تواند بازده اقتصادی گله را افزایش دهد. همچنین، با توجه به برتری وضعیت فروش شیر و سرشیر نسبت به فروش شیر و عدم سودآوری فروش شیر خام با توجه به کمتر بودن تولید شیر در گاومیش، در صورتی که هدف بهبود بازدهی اقتصادی باشد، فروش محصولات لبنی در کنار شیر نیز باید مورد توجه قرار گیرد.
کلید واژگان: ارزش اقتصادی، ماندگاری، تابع سود، گاومیش، تولیدمثل، خوزستانIn this study, production, population and economic parameters of 30 buffalo herds of Khuzestan province in two sale conditions during 2016-2017 were used to estimate the economic value for production, reproductive and survival traits. Economic value of the traits were estimated by one unit increase for each trait using the maximum profit trend. The average annual revenue, cost and profit per head of buffalo for milk and local cream condition were 60480817, 59270944 and 1209873 Rials, respectively, and for just milk sale condition were 59220881, 59270944, and -50062.7 Rials, respectively. In the milk and local cream sale condition, as a proper sale, the economic value of production traits including milk yield, fat percentage, fattening male calf weight and weaning weight were 16774, 178011, 16051 and -46070 Rials, respectively, the economic value of reproductive traits including conception rate, live birth rate, calving interval, buffalo heifer weight and age at first calving were 476142, 527296, 9504, -36668 and -76743 Rials, respectively, and the economic value of survival traits including survival rate of buffalo cow, survival rate of calf from birth to 4 months of age, survival rate of buffalo heifer from 4 months to parturition and longevity were 364946, 216406, 143588 and 72030 Rials, respectively, per head of buffalo in a year. According to the results, selection for increasing the average milk yield, fat percentage and fattening male calf weight would improve the economic condition of buffalo breeder. Considering the negative economic value of calving interval and the age at first calving, breeding in order to shorten them can increase the economic efficiency of the herd. Also, due to the superiority of milk and local cream sale condition compared to milk sale as well as taking into account that due to the lower milk production in buffalo raw milk selling was unprofitable, dairy products selling along with milk can be regarded to improve the economic efficiency.
Keywords: Economic Value, Survival, Profit Equation, Buffalo, Reproduction, Khuzestan -
این مطالعه با هدف بررسی رابطه امتیاز وضعیت بدنی زمان زایش (BCSc) با عملکرد تولید مثلی گاومیش های شیرده بر روی 43 راس گاومیش شیرده مرکز پرورش و اصلاح نژاد گاومیش شمالغرب کشور در قالب طرح کاملا تصادفی به روش آزمایش فاکتوریل 43 انجام گردید. تیمارهای آزمایشی شامل اثر 4 سطح امتیاز وضعیت بدنی زمان زایش، که بر اساس اندازه گیری ضخامت چربی زیر جلدی با استفاده از دستگاه اولتراسوند تعیین گردید و اثر تعداد زایش بود. نتایج بدست آمده نشان داد که با افزایش امتیاز وضعیت بدنی زمان زایش و تعداد زایش در گاومیش های شیری وزن تولد گوساله ها نیز بطور خطی افزایش داشت (0/05>P). کمترین زمان بروز اولین فحلی پس از زایش در گاومیش های با BCSc 99/2-5/2 مشاهده گردید، اثر تعداد زایش بر زمان اولین فحلی پس از زایش معنی دار نبود (0/05>P). درصد آبستنی در اولین تلقیح در گاومیش های با BCSc 49/3-3 و دو تا پنج شکم زایش نسبت به سایر گروه ها بیشتر بود. با افزایش BCSc در گاومیش های شیری تعداد روزهای باز و فاصله بین دو زایش بطور خطی افزایش داشت. اثر امتیاز وضعیت بدنی زمان زایش و تعداد زایش بر تعداد دفعات تلقیح منجر به آبستنی معنی دار نبود (0/05>P). راندمان تولیدمثلی با افزایش تعداد زایش افزایش معنی داری نشان داد، در این مطالعه راندمان تولیدمثلی گاومیش های شیری تحت تاثیر امتیاز وضعیت بدنی زمان زایش قرار نگرفت (0/05>P).
کلید واژگان: گاومیش، امتیاز وضعیت بدنی، راندمان تولیدمثلی، ناهنجاری های تولیدمثلیTotal of 43 milking buffaloes were considered in this experiment to investigate the effect of body condition score of calving (BCSc) on reproductive performance at North-west Buffalo Rearing and Breeding Center, West Azerbaijan, Iran. The experiment was carried out in the form of completely randomized design with 2 factors of BCS and Parity. The BCS had 4 of 2.5-2.99, 3.0-3.49, 3.5-3.99, and 4.0-4.49, and Parity had 3 levels of 1: first calving, 2: 2nd- 5th parity, and 3: 5+ parity. The BCSc of individual animals was determined by measuring animals’ backfat thickness using an ultrasound machine at the 12–13th rib (mm) at the start of the trial. The results showed a linear relationship between BCSc and parity with calf birth weight (P<0.05). The lowest age at first estrus after calving was in animals within group of BCS with 2.5 to 2.99 (P<0.05), but the effect of parity on age at first estrus after calving was not significant (P<0.05). The main effect of BCSc and parity were significant on conception rate in the first artificial insemination such that buffaloes within BCSc group of 3-3.49 and within parity group 2 had higher conception rate. In this study the open days after calving and calving intervals increased with increasing BCS (P<0.05). The effect of BCS and parity group was not significant (P>0.05) on the number of artificial insemination resulted in pregnancy. Breeding efficiency was linearly associated with number of parity (P>0.05), but it did not affected by BCS (P>0.05).
Keywords: Buffalo, Body condition score, Reproduction Performance, Reproductive disorders -
این مطالعه با هدف مقایسه مدلهای وود، دایجکسترا و سینوسی جهت توصیف منحنی شیردهی گاومیشهای خوزستان در دوره شیردهی اول و بررسی اثرات سال و فصل زایش و گله بر پارامترهای منحنی شیردهی انجام گردید. بدین منظور از 73169 رکورد تولید شیر روز آزمون 13757 راس گاومیشهای شکم اول استفاده شد که توسط مرکز اصلاح نژاد دام و بهبود تولیدات دامی، طی سال های 1372 تا 1392 جمع آوری شده بودند. با استفاده از رکوردهای روز آزمون، پارامترهای هر یک از مدلهای توصیف کننده منحنی شیردهی با استفاده از نرم افزار SASو رویه NLINبرآورد شدند. جهت مقایسه مدلها از شاخصهای ضریب تبیین تصحیح شده، ضریب آکائیک تصحیح شده، مجموع مربعات خطا، ریشه میانگین مربعات خطا و تعداد گردش مدل استفاده شد. نتایج مقایسه مدلها نشان داد که هر سه مدل وود، دایجکسترا و سینوسی توانایی توصیف منحنی شیردهی گاومیش های خوزستان در شکم اول زایش را دارند. اما مدل وود با داشتن ضریب آکائیک تصحیح شده، مجموع مربعات خطا و ریشه میانگین مربعات خطا کمتر، شایستگی بیشتری نسبت به دو مدل دیگر داشت. میانگین پارامترهای مدل وود شامل، a، b و cبه ترتیب برابر 36/2، 656/0 و 0009/0 برآورد گردید و میانگین زمان رسیدن به اوج شیردهی 84 روز بود. بیشترین و کمترین تداوم شیردهی به ترتیب در فصول تابستان و بهار به دست آمده است (05/0>P). تمامی پارامترهای مدل وود و ویژگیهای شیردهی گاومیش تحت تاثیر اثر سال زایش، گله و اثر متقابل آنها قرار داشتند (05/0>P). بنابراین میتوان از تابع وود برای ترسیم منحنی شیردهی گاومیش استفاده نمود.کلید واژگان: گاومیش، منحنی شیردهی، پارامترهای شیردهی، مدل وودThe aim of this study was to compare the Wood, Dijkstra and Sineus models for fitting the lactation curve of the first abdomen of Khuzestan Buffalo. The effect of fix factor such as year, season and herd on the curve of milk parameters were studied. In this study, 73169 test day records of milk were used. Records were collected in the animal breeding center. According to the test day record and using different initial values, using SAS software and NLIN procedure were estimated the parameters of each lactation models. R2adj, AIC, MSE, RMSE and Iterations were used for comparison of models. The results of the model's comparison were showed that all three models of Wood, Dijkstra and Sinus were able to fit the buffalo curve. But the Wood model, having the lowest AIC, MSE and RMSE was goodness than the other two models. The mean of Wood parameters such as a, b and c were 2.36, 0.656 and 0.0009 were respectively. Average the peak of lactation was 84 days. The most and least lactation continuous was in summer and spring, respectively (p<0.05). All Wood parameters and lactation indexes were affected year, herd and their interaction (p<0.05). By using the lactation curve and determining the components of lactation, it is possible to plan for feeding and management of buffaloes.Keywords: Buffalo, Milk curve, lactation Parameters, Wood Model
-
هدف از این پژوهش برآورد میزان نامتعادلی پیوستگی، تعیین ساختار بلوک های تک جوری (هاپلوتیپی) و اندازه موثر جمعیت گاومیش آذربایجانی با استفاده از اطلاعات نشانگرهای SNP پراکنده در سراسر ژنگان (ژنوم) حاصل از تراشه های متراکمK 90 (SNPchip 90k) بود. حیوان های مورد بررسی و ارزیابی 243 راس گاومیش آذربایجانی پراکنده در استان های گیلان، اردبیل، آذربایجان شرقی و آذربایجان غربی بود. پس از کنترل کیفیت داده های نژادگانی (ژنوتیپی) ، 62141 SNP برای تجزیه وتحلیل ساختار جمعیت، شناسایی ساختار تک جور ها و اندازه موثر جمعیت استفاده شد. بیشترین میانگین نامتعادلی پیوستگی در کل جمعیت در فاصله بین 5/2 کیلو جفت باز تا 5 کیلو جفت باز بین 25/0-29 /0 و کمترین میانگین نامتعادلی پیوستگی (r2) در فاصله 900-1000 کیلو جفت باز بین 014/0-012/0 به دست آمد. مقدار r2 با افزایش فاصله میان جفت SNPها کاهش زیادی نشان داد. در کل نمونه های تجزیه شده، 1693 بلوک مشاهده شد که 11 درصد کل SNPها درون بلوک های تک جوری خوشه بندی شدند و 4/3±202 مگا جفت باز از کل ژنگان اتوزومی را پوشش می دهند. اندازه موثر جمعیت با استفاده از آماره (r2) محاسبه شد. اندازه موثر جمعیت حدود دو نسل پیش نزدیک به 422 برآورد شد.کلید واژگان: اندازه موثر جمعیت، بلوک تک جوری، چند شکلی تک نوکلئوتیدی، گاومیش، نامتعادلی پیوستگیThe aim of this study was to determine genomewide linkage disequilibrium (LD), Haplotype block and effective population size using the information obtained from 243 Azarbaijani breed buffalo using a high density SNP panel (Axiom® Buffalo Genotyping 90K). After quality control of SNP markers data, 62,141 SNP markers remained for identification of linkage disequiliberum, haplotype blocks and effective population size. LD was measured by the square of the correlation coefficient (r2) between alleles. The maximum LD measured by r2 varied from 0.25 to 0.29 at a distance of < 2.5 kb, and the minimum average values of r2 varied from 0.012 to 0.014 at distances ranging from 900 to 1000 kb, clearly showing that the average r2 reduced with the increase in SNP pair distances. Overall, 1693 blocks were observed through the genome. Eleven percent of all SNPs were clustered into haplotype blocks, covering 202 ±3.4 Mb of the total autosomal genome size. Effective population size (Ne) was estimated based on expected linkage disequilibrium. Ne was estimated to be 422 in our population.Keywords: Buffalo, effective population size, haplotype blocks, linkage disequilibrium, SNP
-
به منظور بررسی منحنی شیر و ترکیبات آن برای گاومیش های خوزستان، از تعداد 9061 رکورد تولید شیر، چربی و پروتئین روزانه دوره شیردهی اول گاومیش ها که طی سال های 1394-1372 جمع آوری شده بود، استفاده شد. پنج تابع وود، ویلمینک، پارابولیک، مختلط لگاریتمی و چندجمله ای معکوس به منظور برازش منحنی شیردهی گاومیش ها با استفاده از رویه NLINنرم افزار SAS 9.1 مورد بررسی قرار گرفت. با مقایسه آماره های توابع مورد بررسی، تابع وود به عنوان بهترین تابع جهت پیش بینی منحنی شیردهی بدست آمد. توابع پارابولیک و چندجمله ای معکوس با نتایج یکسان برای منحنی درصد چربی، تابع پارابولیک برای مقدار چربی و درصد پروتئین و توابع چندجمله ای معکوس و وود برای منحنی مقدار پروتئین، مناسب ترین مدل ها بودند. بر اساس مناسب ترین مدل ها، مقدار مورد انتظار تولید روزانه شیر، درصد چربی، مقدار چربی، درصد پروتئین و مقدار پروتئین در ابتدای شیردهی (روز پنجم شیردهی) به ترتیب 10/6 کیلوگرم با مقدار اوج تولید 46/8 کیلوگرم در روز 89 شیردهی، 51/5 درصد با مقدار اوج 35/6 درصد در روز 210 شیردهی، 75/427 گرم با مقدار اوج 73/513 گرم در روز 153 شیردهی، 20/4 درصد با مقدار اوج 23/4 درصد در روز 210 شیردهی و 70/317 گرم با مقدار اوج 43/334 گرم در روز 82 شیردهی، برآورد گردید. نتایج بدست آمده نشان داد که گاومیش های خوزستان از نظر میزان تولید شیر و اوج تولید همتراز و یا نزدیک به بسیاری از نژادهای دنیا هستند که با توجه به سنتی بودن جایگاه های پرورش گاومیش در استان خوزستان، انتظار می رود با بهبود شرایط محیطی از قبیل تغذیه و مدیریت، زمینه برای بروز حداکثر توانایی ژنتیکی این دام فراهم گردد.کلید واژگان: گاومیش، تابع وود، منحنی شیردهی، درصد چربی، تابع پارابولیکIn order to investigate the milk and its components curve of Khuzestani buffaloes a total of 9061 data of test-day milk, fat and protein yield of the first lactation period buffaloes collected during 1993-2013 were used. The buffaloes having less than 4 test-day records were removed. The lactation days was considered from the 5th to 210th days of lactation. Five different functions of Wood, Wilmink, Parabolic, Mixed Logarithmic and Reverse Polynomial were tested for fitting the lactation curve of buffaloes using the NLIN procedure of SAS 9.1 software. Comparing the studied functions, the Wood function was the best predictor of the lactation curve. The most suitable models for the fat and protein percentage, fat and protein content were Parabolic and Inverse Polynomial with the same results, Parabolic, Parabolic and Inverse Polynomial with Wood functions, respectively. Based on the suitable models, the expected daily milk yield, fat percentage, fat and protein content and protein percentage at the beginning of lactation (the 5th day of lactation) were 6.10 kg with a peak yield of 8.46 kg on the 89th day of lactation, 5.51% with a peak of 6.35% on the 210th day of lactation, 427.75 g with a peak of 513.73 g on the 153th day of lactation, 4.20% with a peak of 4.23% on the 210th day of lactation, 317.70 g with a peak of 344.43 g on the 82th day of lactation, respectively. The results showed that Khuzestani buffaloes have the same production as other breeds in the world in terms of milk production and peak yield or close to them. Considering the rural breeding situation of buffaloes in Khuzestan province, it is expected that improvement of environmental conditions such as nutrition and management provide the condition for incidence of the maximum genetic ability of the buffaloes.Keywords: Buffalo, Wood function, Lactation curve, Fat percentage, Parabolic function
-
Fitting five models to describe milk production curve for Khuzestani Buffaloes of Iran in different parities and seasons
In this research, to evaluate the lactation curve of Khuzestani buffaloes and to determine its describing function, 89140 test day records of buffaloes, collected in 1991 to 2015, were used. All the studied functions (Wood, Wilmink, Parabolic, Mixed Logarithmic and Inverse Polynomial models) were fitted using NLIN procedure of SAS 9.1 software. The results showed that the lactation curve of Khuzestani buffaloes became more typical from 4th and 6th lactation, as it was completed with three steps of increasing production, peak yield and decreasing phase in the 7th and 8th parities. Based on the criteria, studied functions did not have the same performance for lactation curve so that the Wood function was the best model. According to best function, peak of milk production increased from the first lactation and its maximum value was obtained for the 8th lactation. The time of peak yield for the studied curves were vary variable (between 79 and 90 days). In terms of estimated amount for persistency, there was not much difference among curves of different lactation, so that obtained values were very close together. We can say the lactation curves of studied buffaloes were flat, as the difference between the beginning and the end of production was very low. The results also showed that among different calving seasons, the Parabolic function had the best fitting for lactation curve of buffaloes with calving in spring, autumn and winter seasons and the Mixed Logarithmic function was the best for buffaloes with calving season of summer.
Keywords: buffalo, function, lactation, parity, peak yield -
این آزمایش به منظور بررسی تاثیر جایگزینی یونجه با غلاف سوبابل (0، 9 و 18 درصد ماده خشک) بر قابلیت هضم، تخمیر آزمایشگاهی و تجزیه پذیری شکمبه ای در گاو و گاومیشفیستوله شده انجام شد. تخمیر جیره های آزمایشی با تولید گاز، قابلیت هضم با تلی و تری و تجزیه پذیری با روش کیسه های نایلونی تعیین شد (چهار تکرار برای هر جیره) و داده ها در قالب طرح کرت های خرد شده تجزیه شدند. قابلیت هضم ماده خشک و الیاف نامحلول در شوینده خنثی و اسیدی در جیره های حاوی سطوح مختلف غلاف سوبابل بین گاو و گاومیش تفاوتی نداشت (05/0
P). جایگزینی یونجه با غلاف سوبابل اثری بر نرخ تولید گاز، تولید توده میکروبی و دیگر فراسنجه های تخمیری در گاو و گاومیش نداشت (05/0P>). بالاترین مقدار تجزیه دیواره سلولی مربوط به تیمار شاهد (در گاومیش، 9/23 درصد و در گاو، 9/35 درصد) و کمترین مقدار مربوط به تیمار حاوی 18 درصد غلاف سوبابل (در گاومیش، 1/64 درصد و در گاو، 3/64 درصد) بود (05/0>P). جایگزینی یونجه با غلاف سوبابل، فراسنجه های تجزیه پذیری شکمبه ای در گاو و گاومیش را تحت تاثیر قرار نداد (05/0P>). با توجه به نتایج، جایگزینی علوفه یونجه با غلاف سوبابل در جیره گاو و گاومیش، بر قابلیت هضم و تولید گاز تاثیر نداشت، اما تجزیه پذیری شکمبه ای را بهبود داد. بنابراین شاید بتوان 50 درصد غلاف سوبابل را به جای یونجه در تغذیه گاو و گاومیش استفاده کرد.
کلید واژگان: تجزیه پذیری، غلاف سوبابل، قابلیت هضم آزمایشگاهی، گاو، گاومیشThis experiment was conducted to investigate effect of replacing alfalfa with subabul pod (0, 9 and 18 % of DM) on digestibility, in vitro fermentation and ruminal degradability in fistulated cow and buffalo. Fermentation of experimental diets was determined by gas production, digestibility by tilly and terry and degradability by in situ (4 replicates per diet) and the data were analyzed by split plot design. Digestibility of dry mater, NDF and ADF of diets containing different levels of subabul pod were not different in cow and buffalo (P>0.05). But potential of gas production in diets containing subabul pod was lower than control diet (P0.05). Cell wall degradability was greatest for control treatment (in buffalo 23.9 % and cow 35.9 %, respectively) and the lowest value was for diet containing 18 % subabul pod (in buffalo 64.1% and cow 64.3%, respectively) (P0.05). According the result, replacement of alfalfa hay with subabul pod in cow and buffalo diet, didnt affect in vitro digestibility and gas production parameters, but improved in situ ruminal degradability. Therefore, it seems 50 % subabul pod can be used instead of alfalfa in cow and buffalo nutrition.Keywords: Degradability, Subabul pod, In vitro digestibility, Cow, Buffalo -
اطلاع از ساختار ژنتیکی جمعیت دام ها در راستای اجرای بهتر برنامه های اصلاح نژادی و حفظ ذخایر ژنتیکی آن ها بسیار ارزشمند است. داده های ژنگانی (ژنومی) فرصتی برای حل پیچیدگی تاریخچه تکاملی جمعیت ها و بازسازی رویدادهای تاریخی نادر، را فراهم می آورند. در این پژوهش برای ارزیابی ساختار جمعیتی گاومیش های ایران روش های تجزیه وتحلیل مولفه های اصلی (PCA) و تجزیه وتحلیل جداسازی مولفه های اصلی (DAPC) اجرا شد. از شمار 404 گاومیش از سه نژاد شمالی، آذری و خوزستانی خون گیری شد و تعیین ژنوتیپ با تراشه های اسنیپ 90k توسط شرکت پادانو در کشور ایتالیا انجام شد. نتایج به دست آمده از تجزیه مولفه های اصلی و تجزیه جداسازی مولفه های اصلی، جداسازی سه نژاد را به خوبی نشان داد و هر دو تصویر آشکاری از ساختار ژنتیکی جمعیت های مورد بررسی را نشان دادند. در روش DAPC، برای ارزیابی شمار بهینه خوشه با معیار ارزیابی BIC، K=3 بهترین نتیجه را نشان داد. نتایج اعتبارسنجی متقابل برای نگه داشتن شمار مولفه اصلی بهینه برای تجزیه وتحلیل تشخیصی، 50 مولفه اول MSE کمتری نسبت به مولفه های دیگر داشت. در این بررسی روش DAPC احتمال عضویت افراد جمعیت ها را با درستی 100 درصد پیش بینی کرد ولی روش PCA قادر به ارزیابی گروه ها نبوده و برای به دست آوردن تصویر روشن از واریانس بین جمعیت ها DAPC مناسب تر از PCA عمل می کند. روش DAPC در بررسی ساختار جمعیتی نسبت به روش PCA به دلیل افزایش واریانس بین گروه ها و کاهش واریانس درون گروه ها و همچنین ارائه تصویر آشکاری از ساختار جمعیتی کارآمد بود و می تواند در کنترل کیفیت و تصحیح لایه بندی جمعیتی در بررسی های ارتباطی جایگزینی برای PCA باشد.کلید واژگان: تراشه های اسنیپ، ساختار جمعیتی، گاومیش، PCA، DAPCUnderstanding of population genetic structure is valuable for better implementation of breeding programs and most importantly, preservation of genetic resources. Genomic data provide an opportunity to consider complex evolutionary history of populations and reconstruct rare historical events. In this research, the structure of Iranian buffalo populations was studied by using principal component analysis and discriminant analysis principal component methods. For this purpose, the number of 404 buffalos from three breeds including North, Azari and Khozestani were sampled and genotyped by SNPChip 90k from Padano Company in Italy. The results of principal component analysis and discriminant analysis principal component showed a clear picture of the genetic structure of the studied populations. Assessing the optimal number of clusters with criteria BIC, K = 3 by the DAPC method showed the best results. The result of cross-validation for retaining principal components was optimized to 50 first components that showed the lowest MSE. In this study, DAPC predicted assignment of individuals to clusters and membership probabilities with 100% accuracy. PCA method was not able to provide a group assessment and DAPC method outperformed than PCA in achieving a clear variance difference between populations. DAPC method can be applied in quality control and stratification population correction of GWAS as an alternative to the PCA because of summarizing the genetic differentiation between groups and overlooking within-group variation and providing better population structure.Keywords: Buffalo, DAPC, PCA, SNPChip, structure population
-
The present study aimed to evaluate the effect of brilliant cresyl blue (BCB) stain on quality and developmental competence of mature and immature buffalo oocytes. Oocytes were exposed to BCB stain diluted in mDPBS (DPBS with 0.4% BSA) for 60 min at 38.5ºC in a humidified air atmosphere before, after maturation. The cleavage and blastocyst rates were determined. Results showed the percentage of BCB+: BCBˉ in immature and mature buffalo oocytes was 54:45 and 70:30 respectively. In immature oocytes percentage of embryo cleavage rate was highly significantly (P<0.0001) increased in BCB+ than BCB¯ oocytes. Lower cleavage rates were reported in immature BCB+ (P<0.05) and BCB¯(P<0.0001) compared to control non exposed oocytes. There was no significant difference between control and BCB+ oocytes in cleavage rate but there was a significant (P< 0.05) decrease in mature BCB¯ than control oocytes. In conclusion, BCB had a detrimental effect on immature buffalo oocytes, but had no effect on mature oocytes. Thus, it was recommended that BCB was not suitable for oocytes selection as it toxic, time and money consuming.Keywords: Buffalo, oocytes, BCB, embryo development
-
این آزمایش به منظور بررسی جایگزینی 0، 50 و100 درصد برگ برهان یا درخت ابریشم به جای یونجه بر فراسنجه های تجزیه پذیری، تخمیری و قابلیت هضم آزمایشگاهی در گاو و گاومیش خوزستان انجام شد. قابلیت هضم ماده خشک جیره حاوی 50 درصد برگ در گاومیش، 70/85 درصد و در گاو، 94/82 درصد بود. صرف نظر از نوع تیمار قابلیت هضم ماده خشک و NDF بین گاو و گاومیش متفاوت نبود. صرف نظر از نوع دام، پتانسیل تولید گاز در جیره های حاوی 0، 50 و 100 درصد برگ به ترتیب 059/175، 44/108 و 140/103 میلیلیتر بود. اثر جیره های حاوی برگ بر pf، توده میکروبی، راندمان سنتز توده میکروبی و ماده آلی واقعا هضم شده معنی دار نبود. راندمان سنتز توده میکروبی درگاومیش (7281/0 درصد) بالاتر از گاو (6308/0 درصد) بود. بخش کند تجزیه (b)، ثابت نرخ تجزیه (c)، پتانسیل تجزیه پذیری (PD) و تجزیه پذیری موثر (ED) ماده خشک به طور معنی داری در سطح 50 درصد برگ بالاترین مقدار را دارا بود. بخش سریع تجزیه (a) و تجزیه پذیری موثر (ED) پروتئین در سطح 50 و 100 درصد برگ بالاترین مقادیر را نسبت به جیره شاهد نشان داد. با توجه به نتایج بالا می توان نتیجه گرفت برگ برهان یا درخت ابریشم به دلیل بهبود شرایط تخمیری در شکمبه می تواند به جای یونجه در جیره گاو و گاومیش در شرایط آزمایشگاه استفاده شود.کلید واژگان: برگ برهان یا گل ابریشم، فراسنجه های تجزیه پذیری، گاو، گاومیش، هضم پذیریIntroduction Siris is a tropical legume. It has common names such as silk tree. Compositional studies indicated carbohydrates as major components and potassium was found in the highest amount and copper in the lowest. Siris leaf has high content of N (16 to 23 percent crude protein) and Ca, a low content of tannins and phenolic compounds. Levels of total tannins in the leaf of siris is 4%. The amino acids profile indicated that arginine and lysine are present in large amounts in seeds while glutamic acid and aspartic acid are higher in pods. Siris is an economically important plant for industrial and medicinal uses. This experiment was conducted to investigate the different levels (0, 50 and 100 %) of siris leave or silk tree instead of alfalfa on degradability parameters, fermentative and in vitro digestibility in cows and buffalo Khouzestan.
Materials and methods The leave of siris were collected from shushtar and milled. Levels of 0, 50 and 100% leave replaced alfalfa in the diet. Rumen fluid was collected from fistulated cow and buffalo before the morning feeding. About 500 ± 10 mg experimental samples (1.0 mm screen) incubated with 35 ml buffered rumen fluid under continuous CO2 reflux in 100 ml vials for 2, 4, 6, 8, 10, 12, 16, 24, 48, 72 and 96 h, in a water bath maintained at 39°C. Cumulative gas production data were fitted to the exponential equation Y=B (1−e−Ct). Partitioning factor, microbial biomass, actually degradable organic matter was calculated. Digestibility of dry matter and NDF of the samples were determined using an in vitro procedure. Dry matter and crude protein degradability were measured by in situ technique using fistulated animals (fed 60% forage% concentrate). Samples put in the polyester bags and incubated in the rumen for 2, 4, 6, 8, 16, 24, 48, 72 and 96 hours. After the specific incubation periods, the bags immediately were hand-rinsed under cold tap water until clear, and dried in a forced-air oven (60 °C, 48 hour). Disappearance of DM and CP of samples from bags with incubation time were calculated using the equation of, P = a b (1- e -ct), P= fraction degraded in the time t, a= soluble fraction, b= potentially degradable fraction, c= degradation rate and t= incubation time. The effective degradability was calculated using the equation of ED = a (bc/(c). Data were subjected to analysis as a split plot design using the General Linear Model (GLM) procedure of SAS.
Results and Discussion Dry matter digestibility of the diet containing 50% siris leave in Buffalo was 85.70 % and in cows, 82/94 %. Regardless of the type of treatment digestibility of dry matter and NDF was not significant between cow and buffalo. Regardless of the type of animal, the potential of gas production in the diets containing 0, 50 and 100 % siris leave was 175.05, 108.44 and 103.14 ml, respectively. The effect of diets containing leave on pf, microbial biomass, microbial biomass efficiency and organic matter digested was not significant. The efficiency of the microbial biomass in Buffalo (0.7281%) was higher than the cow (0.6308%). Slowly degradable fraction (b), constant degradable rate (c), potential of degradability (PD) and effective degradability (ED) of dry matter at 50 % leaf was the highest. Fraction a rapidly degradable (a) and effective degradability (ED) protein at 50 and 100 % the leave was the highest amount in compared to the control diet. In agreement with results, the researchers reported tropical legumes because of high quantity of protein and carbohydrate and lower fiber can be used as a suitable substrate for rumen microbial growth. Also legumes ability to provide required nitrogen, energy and vitamins for microorganisms. But presence of anti-nutritional factors such as tannin, saponin and oxalate in siris might be reduce fibrolytic enzyme activity and consequently fiber digestibility and fermentation.ConclusionAccording to the results it ccan be concluded siris leaves or silk tree improved fermentation condition in the rumen, therefore can be used instead of alfalfa in the diet of cow and buffalo in vitro.Keywords: Buffalo, Cow, Digestibility, Fermentation, Siris leave or Silk tree -
هدف این تحقیق گروه بندی گاومیش های استان های آذربایجان شرقی، غربی و اردبیل از بوم جور (اکوتیپ) آذری و استان گیلان از بوم جور شمالی و درنهایت قابلیت جداسازی افراد مناطق مختلف با روش یادگیری ماشین بود. به شمار 258 گاومیش از مناطق مختلف دو بوم جور شمالی و آذری نمونه گیری شد و با استفاده از SNPChip 90K مربوط به شرکت افی متریکس در کشور ایتالیا تعیین ژنوتیپ شد. برای پیش بینی عملکرد روش ماشین بردار پشتیبان برای گروه بندی افراد، دو روش متریک اعتبارسنجی متقابل و سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد سامانه (AUC) اعمال شد. نتایج آزمون اعتبارسنجی متقابل و سطح زیر منحنی برای گروه بندی افراد چهار منطقه به ترتیب 92 و 96 درصد بود که گویای این است که باوجود نزدیک بودن افراد گله های مختلف و سخت بودن جداسازی این افراد، روش ماشین بردار پشتیبان با درستی بالایی، توانایی اختصاص دادن افراد به گله های مربوط به خود را دارد. نتایج آزمون های اعتبارسنجی متقابل و سطح زیر منحنی مشخصه عملکرد سامانه برای دو بوم جور به ترتیب برابر 96 و 98 درصد بود که نشان دهنده قابلیت جداسازی بهتر دو بوم جور است. روش یادگیری ماشین با توجه به این موارد و با پیش بینی هایی که برای گروه بندی هر فرد انجام می دهد می تواند در کنترل کیفیت و کاربردهای ژنتیکی کارآمد باشد.کلید واژگان: SNPChip 90K، گاومیش، گروه بندی، ماشین بردار پشتیبانThe purpose of this research was to classify buffaloes from different areas of the two Azari (West and East Azarbayjan and Ardabil provinces) and North (Guilan province) ecotypes using support vector machine method. A total of 258 buffalo were sampled and genotyped using the Axiom Buffalo 90K Genotyping Array at the Parco Technologic Padano lab in Italy. Two metric methods of cross validation and the area under the receiver operating characteristic (AUC) were used to determine the predictive performance of support vector machine (SVM) to classify individuals. The results of cross validation and methods for classifying different regions of the two ecotypes (4 provinces) were 92% and 96%, respectively that showed despite the difficulty of identifying individuals from provinces close to each other, support vector machine (SVM) method shows higher accuracy in assigning animals to their herds. Result of two ecotypes showed accuracy about 96% and 98% which represents the better ability to separate the two ecotypes. Machine learning method provides predictions for classification of each individual which can be efficient in quality control and genetic studies.Keywords: Buffalo, classification, SNPChip 90K, support vector machine
-
تولید و ترکیبات شیر جزء دسته صفات کمی و چندژنی می باشند وتحت تاثیر تعداد زیادی ژن قرار دارند. این تحقیق به منظور تعیین چندشکلی ژن های بتالاکتوگلوبولین، پرولاکتین و DGAT1، به عنوان ژن های کاندید موثر برصفات تولید شیر و ترکیبات آن،با استفاده از تکنیک PCR-RFLP درگاومیش های استان خوزستان صورت گرفت. از تعداد 200 راس از گاومیش های استان خوزستان نمونه خون تهیه و استخراج DNA از نمونه ها به روش بهینه شده و تغییریافته استخراج نمکی صورت گرفت. بعد از انجام مراحل استخراج DNA، ژنوتیپ حیوانات با استفاده از روش PCR-RFLP تعیین گردید. برای تعیین ژنوتیپ حیوانات، قطعه 262 جفت باز از ناحیه اگزون و اینترون 4 ژن بتالاکتوگلوبولین، قطعه 411 جفت باز از اگزون 8 ژن DGAT1 و قطعه 156 جفت بازی از ناحیه اگزون 3 ژن پرولاکتین تکثیر و به ترتیب با استفاده از آنزیم های محدودالاثر HeaIII، CfrI و RsaI مورد هضم قرار گرفتند. محصولات هضم شده با استفاده از آنزیم، جهت تعیین ژنوتیپ بر روی آگارز 2% الکتروفورز گردیده و با اتیدیوم برماید رنگ آمیزی شدند. نتایج این تحقیق نشان داد که در گاومیش های مورد مطالعه آلل B در جایگاه بتالاکتوگلوبولین، آلل A در جایگاه پرولاکتین و آلل K در جایگاه DGAT1 تثبیت شده است و برای هیچ یک از جایگاه ها چندشکلی مشاهده نشد.کلید واژگان: پرولاکتین، چندشکلی، گاومیش، ژن DGAT1Milk production and its components are belong to quantitative and polygenic traits and affected by many genes. This study was conducted to determine the polymorphism in β-lactoglobulin, prolactin and DGAT1 genes of buffaloes in Khuzestan province using PCR-RFLP technique. Therefore, blood samples were collected from 200 buffaloes of Khuzestan province and then DNA samples were extracted using optimal and modified salting-out method. After DNA extraction, the genotype of the animals was determined by PCR-RFLP. For genotyping of animals, the 262 bp fragment of exon and intron 4 of the beta-lactoglobulin, the 411 bp fragment of exon 8 of the DGAT1 and the 156 bp fragment of exon 3 of the prolactin genes were amplified and then digested using restriction enzyme HeaIII, CfrI and RsaI, respectively. Then restricted PCR products electrophoresed on 2% agaros gel and stained in etediumbromide. Results of this study showed that the allele of B, the allele of A and the allele of K has been fixed in beta-lactoglobulin, prolactin and DGAT1 loci in buffalo population of Khuzestan, respectively and polymorphism was not seen for any of these loci.Keywords: Prolactin, Polymorphism, Buffalo, DGAT1 gene
-
The present study aimed to evaluate the effect of brilliant cresyl blue (BCB) stain on quality and developmental competence of mature and immature buffalo oocytes. Oocytes were exposed to BCB stain diluted in mDPBS (DPBS with 0.4% BSA) for 60 min at 38.5ºC in a humidified air atmosphere before, after maturation. The cleavage and blastocyst rates were determined. Results showed the percentage of BCB: BCBˉ in immature and mature buffalo oocytes was 54:45 and 70:30 respectively. In immature oocytes percentage of embryo cleavage rate was highly significantly (PKeywords: Buffalo, oocytes, BCB, embryo development
-
در این پژوهش، کاریوتایپ جمعیت گاومیش های مازنی در مقایسه با جمعیت گاومیش های آذری مورد مطالعه قرار گرفت. مطالعات کاریوتایپی یک ابزار قدرتمند برای تعیین کاریوتایپ احشام است و موجب شناسایی پایه ای ناهنجاری های کروموزومی می گردد. نمونه های خونی از ده (5 نر و 5 ماده) گاومیش مازنی و سی (15 نر و 15 ماده) گاومیش آذری جمع آوری شدند. گاومیش های مازنی متعلق به استان مازندران و گاومیش های آذری متعلق به استان های آذربایجان غربی و شرقی و اردبیل هستند. نمونه های خونی در دمای 37 درجه به مدت 72 ساعت و در حضور فیتوهماگلوتینین کشت داده شدند و گستره های متافازی بر روی لام تهیه گردید. از گیمسا برای رنگ آمیزی کروموزوم ها استفاده شد. گاومیش مازنی و آذری کاریوتایپ مشابه با عدد دیپلوئید 2n = 50 را نشان دادند. تعداد بازوان (NF) در جنس نر و ماده، 60 بدست آمد. دسته بندی استبینز نشان داد که گاومیش های مازنی و آذری هر دو به گروه 3B تعلق دارند. هر دو جمعیت از گاومیش های رودخانه ای بودند ولی از لحاظ تقارن کاریوتایپی، گاومیش های مازنی تقارن بیشتری را نسبت به گاومیش های آذری نشان دادند. شواهد کروموزومی و سایر جزئیات آنالیز کاریوتایپ گونه ها می تواند در تعیین روابط خویشاوندی گونه ها از نظر صفات کروموزومی، سازماندهی جمعیت های مختلف و کشف ارتباط میان آن ها به ما کمک کند.
کلید واژگان: شمارش کروموزومی، ایدیوگرام، تقارن کاریوتایپی، گاومیشIn the present study karyotype of Mazani buffalo was studied in comparison with those of Azeri buffalo populations from Iran. Karyotyping analysisis a powerful instrument to determine the karyotype of farm animal and to turn up more about fundamental basis for chromosomal abnormalities.Blood samples were taken from ten (5 males and 5 females) Mazani buffaloes and thirty (15 males and 15 females) Azeri buffaloes. The Mazani buffaloes belong to state of Mazendaran and Azeri buffaloes belong to states of west and east Azerbaijan and Ardebil. Blood lymphocytes cultured at 37ºC for 72 hours in the presence of phytohemagglutinin and the metaphase spreads were performed on microscopic slide. Giemsa was used to stain chromosomes. The Mazani and Azeri Buffalo exhibited the same karyotype with diploid number of 2n = 50. The fundamental numbers (NF) were 60 in male and female. Stebbins classifications show both Mazani and Azeri buffaloes belong to 3B group. Both of Mazani and Azeri buffaloes are riverine. Based on the karyotype symmetry parameters, Mazani buffalo populations showed more symmetry that Azeri buffalo populations. The chromosomal evidences and other detailed karyotype analysis allows us to detect interrelationships of spices from a chromosomal point of view, to group the different populations and postulate relationships among them.Keywords: Chromosome number, Idiogram, Karyotype symmetry, Buffalo -
هدف این تحقیق بررسی اثر افزودن تمپول به رقیق کننده در اسپرماتوزوییدهای گاومیش قبل و بعد از انجماد- ذوب است. بیست و پنج نمونه منی از 5 گاومیش نر سالم (5 نمونه از هر گاومیش در 5 زمان مختلف) مورد استفاده قرار گرفت. هر نمونه در C°37 در رقیق کننده تریس-اسید سیتریک (بدون زرده تخم مرغ) حاوی 0 (شاهد)، 5/0، 1، 4، 8 و 12 میلی مول تمپول رقیق گردید. تحرک روبه جلو و میزان زنده ماندن اسپرماتوزوییدهای منی رقیق شده در 0 (T0) (بلافاصله بعد از رقیق کردن)، 60 (T1) و 120 (T2) دقیقه بعد از رقیق کردن اندازه گیری شد. در مرحله بعد همین دوزهای تمپول، زرده تخم مرغ و گلیسرول به رقیق کننده فوق افزوده، نمونه های منی در آن رقیق شد و ظرف 2 ساعت تا C°4 سرد گردید، به مدت 4 ساعت در آن دما نگهداشته شد تا به حالت تعادل درآید و سنجه های منی (تحرک روبه جلو، زنده ماندن، یکپارچگی غشا و میزان آسیب دیدن DNA) ارزیابی شد. منی متعادل شده در پایدتهای فرانسوی 5/0 میلی لیتری بسته بندی و در ازت مایع منجمد گردید. بعد، منی را ذوب کرده همان سنجه ها به اضافه توان آنتی اکسیدانی تام آن اندازه گیری شد. نتایج نشان داد افزودن 5/0 و 1 میلی مول تمپول به رقیق کننده منی در قیاس با نمونه های شاهد تحرک روبه جلو اسپرماتوزوییدها را در نمونه رقیق و متعادل شده بدون تاثیر بر بقیه سنجه ها بهبود می بخشد. در منی منجمد- ذوب شده در رقیق کننده حاوی 5/0 و 1 میلی مول تمپول، تحرک رو به جلو، زنده ماندن، یکپارچگی غشا و توان آنتی اکسیدانی تام اسپرماتوزوییدها بالاتر ومیزان آسیب دیدن DNA کمتری از شاهد مشاهده شد. نتیجه آن که، افزودن 5/0 و 1 میلی مول تمپول به رقیق کننده، کیفیت منی گاومیش را هنگام انجماد – ذوب حفظ میکند.
کلید واژگان: گاومیش، منی، آنتی اکسیدان، 4-هیدروکسی تمپوThe aim of the present study is to investigate the effects of in vitro supplementation of Tempol on spermatozoa of buffalo bulls before and after freeze-thawing. A total of 25 samples from five healthy buffalo bulls (5 ejaculates from each bull on 5 different occasions) were used. Each ejaculate was diluted at 37°C in tris-citric acid based extender (without egg yolk) containing 0 (control), 0.5, 1, 4, 8 and 12 mM Tempol. Sperm progressive motility and viability were evaluated in diluted semen at 0 (T0) (immediatelyafter dilution), 60 (T1) and 120 (T2) minutes after semen dilution. In the next step, the same doses of Tempol, egg yolk and glycerol were added to the above extender and semen samples diluted, cooled to 4°C within 2 h, equilibrated for 4 hours and sperm parameters (progressive motility, viability, membrane integrity and DNA damage) estimated. The equilibrated semen was packed into 0.5 mL French straws and frozen in liquid nitrogen. Later, the semen was thawed and analyzed for the same parameters, as well as total antioxidant capacity (TAC). Results showed that adding 0.5 and 1 mM Tempol to the semen extender preserved the sperm progressive motility in diluted and equilibrated semen compared to the control without affecting other parameters. However, in frozen-thawed semen, extenders containing 0.5 and 1 mM Tempol significantly preserved sperm progressive motility, viability, membrane integrity and semen total antioxidant capacity and also resulted in lower DNA damaged sperm counts. It was concluded that addition of 0.5 or 1mM tempol to the extender would preserve semen quality during freeze-thawing.
Keywords: Buffalo, Semen, Antioxidant, 4, hydroxy Tempo
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.