genetic
در نشریات گروه علوم دام-
مقدمه و هدف
سوددهی گوسفند از نظر تولید گوشت تا حد زیادی به صفات رشد و ویژگی های لاشه بستگی دارد. با وجود اهمیت کیفیت گوشت گوسفند پژوهش های اندکی در این زمینه در گوسفندان بومی کشور صورت گرفته است. بنابراین، اهمیت بررسی صفات لاشه حیوانات به خصوص زمانیکه هنوز زنده اند ضروری بهنظر میرسد. هدف پژوهش حاضر تعیین و بررسی ارتباط ژنتیکی و فنوتیپی بین صفات بیومتری، اوزان بدن و صفات لاشه اندازهگیری شده با اولتراسوند در گوسفند کردی شمال خراسان بود. از آنجاییکه اندازه گیری صفات لاشه سخت و پرهزینه است و به منظور طراحی بهتر برنامه های اصلاحی جهت بهبود صفات لاشه، در صورت وجود ارتباط قوی ژنتیکی امکان جایگزینی صفاتی که اندازه گیری آنها ساده تر است با صفات لاشه که بهسختی اندازه گیری می شوند فراهم میشود.
مواد و روش هاداده های 658 راس گوسفند نژاد کردی در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند کردی شیروان واقع در استان خراسان شمالی در گستره شمالی شرق ایران میان 57 درجه طول شرقی و 37/4 درجه عرض شمالی در فصول بهار، تابستان و پاییز سال 1400 مورد استفاده واقع شد. اطلاعات مربوط به شجره و اوزان تولد (658 رکورد)، سه ماهگی (652 رکورد)، شش ماهگی (638 رکورد) و نه ماهگی (419 رکورد) از رکوردهای ثبت شده در ایستگاه مزبور استخراج شد. برای بررسی اثرات ثابت بر روی صفات از رویه ی مدل های خطی عمومی (GLM) نرم افزار SAS استفاده شد. برای برآورد پارامترها و ارتباط ژنتیکی بین صفات مزبور از روش حداکثر درست نمایی محدودشده (REML) براساس مدل حیوانی یک و دو صفتی در نرم افزار WOMBAT استفاده شد. برای دستیابی به معادله پیشبینی صفات لاشه بر اساس دیگر صفات مورد پژوهش، از رگرسیون چند متغیره استفاده شد.
یافته هاوراثت پذیری ضخامت چربی زیرجلدی، مساحت، عرض و عمق ماهیچه ی چشمی اولتراسوندی به ترتیب 0/06±0/01، 0/06±0/06، 0/03±0/10 و 0/03±0/08 برآورد شد. همبستگی ژنتیکی مثبت بالایی میان ضخامت چربی زیرپوستی و مساحت ماهیچه چشمی مشاهده شد (0/31±0/71). صفات لاشه اولتراسوندی همبستگی ژنتیکی مثبت بالایی با صفات دنبه داشتند. همبستگی ژنتیکی مثبت بالایی بین صفات لاشه ی اولتراسوندی و ارتفاع جدوگاه، ارتفاع ناحیه ی کپل، محیط دور سینه، محیط دور شکم، طول مورب بدن، محیط ران و عمق کپل بهدست آمد. مدل مربوط به مساحت ماهیچه چشمی با بالاترین میزان ضریب تعیین (0/82) از دیگر مدل ها برای پیشبینی قابل اطمینان تر است.
نتیجه گیریوراثت پذیری پایین صفات اندازه گیری شده با فن آوری اولتراسوند در گوسفندان کردی ایستگاه اصلاح نژاد گوسفند کردی شیروان نشان می دهد که امکان بهبود این صفات از طریق انتخاب انفرادی چندان موثر نیست و باید از دیگر روش های انتخاب (انتخاب فامیلی و یا انتخاب به کمک نشانگر) برای بهبود این صفات استفاده شود. بهطور کلی، با توجه به ضریب تعیین نسبتا مناسب، از مدل های رگرسیونی می توان برای پیشبینی صفات لاشه در گله ایستگاه گوسفند کردی شیروان استفاده نمود.
کلید واژگان: اولتراسوند، صفات بیومتری، صفات لاشه، گوسفند کردی، همبستگی ژنتیکی و فنوتیپیIntroduction and ObjectiveProfitability of sheep in terms of meat production largely depends on growth traits and carcass characteristics. Despite the importance of the quality of sheep meat, few researches have been conducted in this field in the native sheep of the country. Therefore, the importance of examining the characteristics of animal carcasses, especially when they are still alive, is evident. The aim of the present study was to investigate the genetic and phenotypic relationship between biometric traits, body weights and carcass traits measured by ultrasound in Kurdi sheep of North Khorasan. Since the measurement of carcass traits is difficult and expensive, and in order to better design breeding programs to improve carcass traits, if there is a strong genetic relationship, it is possible to replace traits that are easier to measure with carcass traits that are difficult to measure.
Material and MethodsThe data of 658 Kurdi sheep in the Shirvan Kurdish sheep breeding and breeding station located in North Khorasan province in the northern area of eastern Iran between 57 degrees east longitude and 37.4 degrees north latitude in the spring, summer and autumn seasons of 2021 were used. The information related to pedigree and birth weights (658 records), three months (652 records), six months (638 records) and nine months (419 records) were extracted from the records recorded in the said station. General linear models (GLM) procedure of SAS software was used to investigate fixed effects on traits. To estimate the parameters and the genetic relationship between the mentioned traits, the restricted maximum likelihood (REML) method was used based on single and two traits animal models in WOMBAT software. Multivariate regression was used to obtain the prediction equation of carcass traits based on other studied traits.
ResultsHeritability of subcutaneous fat thickness, area, width and depth of ultrasound longissimus muscle were estimated as 0.1±0.06, 0.06±0.06, 0.10±0.03 and 0.08±0.03 respectively. A high positive genetic correlation was observed between subcutaneous fat thickness and longissimus muscle area (0.71±0.31). Ultrasound carcass traits had a high positive genetic correlation with tail traits. A high positive genetic genetic correlation was found between ultrasound carcass traits and height of the withers, height at rump, heart girth, belly circumference, body diagonal length, thigh circumference and rump depth. The model related to longissimus muscle area with the highest coefficient of determination (0.82) is more reliable than other models for prediction.
ConclusionThe low heritability of traits measured by ultrasound technology in Kurdi sheep of Shirvan Kurdi sheep breeding station showed that improving these traits through individual selection is not very effective and other selection methods (family selection or marker-assisted selection) should be used for improvement of these traits. Generally, due to relatively high coefficient of determination, regression models can be used to predict carcass traits in the flock of Shirvan Kurdi sheep station.
Keywords: Kurdi sheep, Genetic, phenotypic correlation, Carcass traits, Biometric traits, Ultrasound -
Loss of local or native breeds occurs through breed replacement (primarily by imported or exotic breeds) or by dilution through cross-breeding (generally indiscriminate rather than planned). These losses in both cases generally occur for reasons unrelated to productivity. To assess the real genetic effects of breed loss or within-population selection, suitable measures of genetic variation must be available. The subject of this review is the genetics management of animal genetic resources, namely of domesticated livestock species and breeds. The conservation program itself, the necessity of identifying and prioritizing species that are threatened, and regular monitoring systems for detecting changes in the status of animal populations are all given attention. The necessity to combine preservation and better use is underlined as practical conservation challenges are assessed. The possibilities of using animal genetic resources in biotechnology are described. The institutional, financial, and administrative frameworks required for a conservation program, as well as its regional and national components, are discussed. The recommendations given are directed toward Institutional Infrastructures, Monitoring Practices, Breed Development and Conservation Programs, Biotechnology, and Legal Aspects.
Keywords: Conservation Program, Genetic, Management, Animal genetic resource -
در این پژوهش از اطلاعات طول عمر و زنده مانی مربوط به گله ایستگاه بز کرکی رایینی واقع در شهرستان بافت، که طی سال های1372 تا 1388 جمع آوری شده بودند، استفاده گردید. همچنین از طریق انجام مصاحبه و جمع آوری اطلاعات پرسشنامه ای از گله ایستگاه بز کرکی رایینی و گله های مردمی، عوامل حذف بزغاله ها، عوامل محیطی موثر بر زنده مانی و میزان زنده مانی به دست آمد. تعداد 11 گله با تنوع جغرافیایی و اندازه گله مختلف در سطح استان کرمان جهت تکمیل اطلاعات پرسشنامه ای انتخاب شد. بیش ترین و کم ترین درصد حذف بزغاله ها به ترتیب مربوط به مازاد پرواری (54/2درصد) و حذف بر اثر ناقص الخلقه بودن (0/4 درصد)بود. مرگ در اثر بیماری بعد از مازاد پرواری بیش ترین علت حذف بزغاله ها بود (22/3 درصد). میزان زنده مانی در این گله ها 89/94 درصد به دست آمد. نتایج نشان داد که میانگین کل طول عمر تجمعی 310/3 روز بود. تاثیر عوامل غیر ژنتیکی ماه تولد بزغاله، سال تولد بزغاله، جنس بزغاله ومتغیر کمکی وزن تولد بزغاله به صورت درجه دو بر زنده مانی آنها معنی دار بود. مقدار وراثت پذیری لگاریتمی کم تا متوسط (0/14 تا 0/40)، وراثت پذیری اولیه متوسط تا بالا (0/25 تا 0/70) و وراثت پذیری موثر نیز متوسط (0/23 تا 0/61) برآورد گردید. از آنجا که پارامترهای ژنتیکی برآورد شده در حد متوسط هستند می توان گفت، برای بهبود زنده مانی بزغاله ها از تولد تا سن یک سالگی و افزایش سود اقتصادی دامدار، ضمن بهبود شرایط تغذیه ای می توان به انتخاب ژنتیکی در درون نژاد نیز توجه نمود.
کلید واژگان: بز، تابع ویبال، نرخ زنده مانی، عوامل ژنتیکی و محیطیSurvival records and pedigree information from Rayeni kids born between 1993 and 2009 from breeding station of Rayeni Cashmere goat, located in the Baft city, were used. Also, by completing questionnaire from breeding station of Rayeni Chashmere goat and flock nongovernmental, in Kerman province environmental factors affecting survival and survival rate were obtained. 11 herds with geographical diversity and different herd sizes in Kerman province were selected. The highest and lowest percentages of kid removal were related to fattening surplus (54.2%) and defective removal (0.4%), respectively. Death due to disease after fattening surplus was the most common cause of kid removal (22.3%). Survival rate in these herds was 89.94 percent. according to the results overall mean of lifetime cumulative was 310.3 days. The effect of fixed factors year and month of birth, sex of kid and kid’s birth weight as quadratic were significant. The estimates of heritability in logarithmic scale were low to medium (0.14 to 0.40), original scale were medium to high (0.25 to 0.70) and effective heritability were medium (0.23 to 0.61). Since the estimated genetic parameters for survival of goats are moderate, to improve the survival of goats from birth to one year of age and increase the economic profit of the farmer, while improving nutritional and managerial conditions, genetic selection within the breed can be considered.
Keywords: Goat, Weibull function, Survival rate, Genetic, environmental factors -
زمینه مطالعاتی
در این مطالعه فراتحلیلی، از مطالعات قبلی در زمینه تخمین پارامترهای ژنتیکی صفات تولیدی و تولیدمثلی در مرغان بومی ایران استفاده شد. این مقالات (33 مقاله) بین سال های 1386 تا 1395 منتشر شده اند. اطلاعات مورد استفاده شامل وراثت پذیری، همبستگی های ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدی و تولید مثلی شامل وزن یک روزگی، وزن هشت هفتگی، وزن دوازده هفتگی، تعداد تخم مرغ، وزن تخم مرغ، سن بلوغ جنسی و وزن بلوغ جنسی بودند.
مواد و روش هامدل فراتحلیل با اثرات تصادفی با استفاده از بسته Metacor نرم افزار R نسخه 3،3،1 و نرم افزار Comprehensive meta-Analysis (CMA) نسخه 3 برای محاسبه میانگین وزنی صفات مورد بررسی در مرغان بومی ایران مورد استفاده قرار گرفت.
نتایجبه دلیل استفاده همزمان از نتایج کلیه مطالعات موجود در زمینه تخمین پارامترهای ژنتیکی در مرغ های بومی ایران در فراتحلیل، خطای برآورد پارامترهای ژنتیکی و به تبع آن محدوده اطمینان 95% این پارامترها در مقایسه با نتایج حاصل از مطالعات انفرادی به طور قابل ملاحظه ای کاهش یافت. این کاهش بیانگر افزایش صحت برآوردها در اثر تجمیع نتایج می باشد. با توجه به نتایج حاصل از فراتحلیل، بالاترین وراثت پذیری صفات تولیدی و تولیدمثلی مربوط به صفت وزن تخم مرغ با مقدار عددی 42/0 و پس از آن وزن بلوغ جنسی با مقدار عددی 41/0 بود. کمترین میزان وراثت پذیری مربوط به صفت تعداد تخم مرغ با مقدار عددی 20/0 و پس از آن وزن یک روزگی با مقدار عددی 25/0 بود. بالاترین همبستگی ژنتیکی مثبت بین صفات تولیدی و تولیدمثلی مربوط به همبستگی بین صفت وزن هشت هفتگی با وزن دوازده هفتگی با مقدار 86/0 و پس از آن همبستگی بین صفت وزن دوازده هفتگی و وزن بلوغ جنسی با مقدار عددی 64/0 بود. بالاترین همبستگی ژنتیکی منفی مربوط به همبستگی صفت سن بلوغ جنسی با تعداد تخم مرغ با مقدار عددی 66/0- و پس از آن تعداد تخم مرغ با میانگین وزن تخم مرغ با مقدار عددی 19/0- بود. به دلیل ترکیب نتایج مطالعات گذشته با استفاده از روش فراتحلیل، استفاده از پارامترهای ژنتیکی حاصل از این مطالعه با صحت بالاتر می تواند نقش موثری در طراحی موفق برنامه های اصلاح نژادی مرغ های بومی کشور و ارتقا پیشرفت ژنتیکی در این پرندگان داشته باشد.
کلید واژگان: فراتحلیل، مرغ بومی ایران، وراثت پذیری، همبستگی ژنتیکی و فنوتیپیIntroductionNative fowl have become valuable genetic resources over the years due to their adaptation to harsh conditions in rural areas (Emamgholi et al 2009). Native fowl, despite their lower growth rate and lower egg production compared with broiler strains such as Ross and Cobb and layer strains such as Hy-Line and Lohman, perform much better in the rural system due to their good disease resistance and production under adverse nutritional and environmental conditions (Lakhi et al 2013). Breeding programs have a significant effect on improving the genetic structure of native fowl (Kiani manesh et al 2002). The purpose of this study was to combine the results of studies related to estimating genetic parameters for productive and reproductive traits in native fowl using meta-analysis method in order to improve the accuracy of estimations. In addition, the use of meta-analysis method eliminates the existing differences between studies by examining the heterogeneity between them (Field and Gillett 2010; Lortie et al 2013; Hooijmans et al 2014). Increasing the accuracy of estimates can consequently increase genetic improvement through selecting proper candidates to be parents of next generations. Higher performance will increase the courage of farmers to keep native fowl and therefore it help to keep the birds as a valuable genetic source for the future.
Materials and MethodsIn this meta-analysis study, previous studies in the field of estimating genetic parameters of productive and reproductive traits in Iranian native fowl were collected and used. These articles consisted of 33 articles which were published between years 2007 and 2016. Information used in current study included heritability, genetic and phenotypic correlations of productive and reproductive traits. These traits consisted of birth weight, weight at eight weeks of age, weight at twelve weeks of age, egg number, egg weight, age at sexual maturity and weight at sexual maturity. Cochran test and I2 criterion were used for testing heterogenty among used articles. The range of heterogeneity among studies could be from zero to 100 percent. Ranges of 0 to 25 percent, 25 to 50 percent, 50 to 75 percent and 75 to 100 percent indicate very low, low, moderate and high heterogeneity among studies, respectively. Fixed meta-analysis model is usually recommended for very low and low heterogeneity among studies and random meta-analysis model is normally used for moderate to high rates of heterogeneity among studies. Due to high heterogenty observed among studies in present study, random effects model meta-analysis was performed using Metacor package R software version 3,3,1 and Comprehensive Meta-Analysis (CMA) software version 3. The weighted average of the heritability, genetic and phenotypic correlations were calculated accordingly.
Results and DiscussionAccording to the results, the highest heritability among productive and reproductive traits was related to egg weight (0.42) and then weight at sexual maturity (0.41). The lowest heritability was related to egg number with a value of 0.20 and then birth weight with a value of 0.25. The highest positive genetic correlation between productive and reproductive traits was estimated between weight at eight and weight at twelve weeks of age (0.86) and then between weight at twelve weeks of age and weight at sexual maturity (0.64). The highest negative genetic correlation was related to the correlation between age at sexual maturity and egg number (-0.66), then egg number and egg weight (-0.19). Due to combing the results of individual studies using meta-analysis, the standard error of estimations for genetic parameters and consequently their 95% confidence interval were significantly reduced compared to individual studies (Bayssa et al 2021). This reduction indicates an increase in the accuracy of the estimates due to aggregating the results of individual studies (Field and Gillett 2010). A comparison between the results of independent studies and the results of meta-analysis shows a significant reduction in estimated standard errors for heritability and genetic and phenotype correlations in the meta-analysis method. For example, the amount of estimated standard error related to heritability of weight at twelve weeks of age in the meta-analysis was calculated to be 0.0009, while the range of reported standard error in the articles for the heritability of this trait was from 0.05 to 0.08. For weight at eight weeks of age the amount of standard error of heritability in the meta-analysis was estimated to be 0.0009, but the range reported for standard error of heritability for this trait in the articles was zero to 0.06. Similar reduction in the amount of estimated standard error were observed for reproductive traits. For example for egg number, the amount of error in the meta-analysis was estimated to be 0.0013, but the range reported in the articles was 0.01 to 0.13. The amount of estimated standard error related to egg weight in the meta-analysis was calculated to be 0.0009, while the range reported in the studied articles was from 0.004 to 0.07. This decreasing trend was similarly observed for other studied traits, which is due to the aggregation of the results obtained from independent studies.
ConclusionThe results of this study showed that the use of meta-analysis method by aggregating the results of individual studies, will increase the accuracy of genetic parameters of productive and reproductive traits in native fowls through increasing the sample size and reducing estimated standard errors. Therefore, by taking into consideration that Iranian native fowl are economically important animals and considerable demands for their products in the country, using genetic parameters obtained from this study with higher accuracy can play an effective role in the successful design of breeding programs for native fowls and promote genetic improvement in native fowl in Iran.
Keywords: Genetic, phenotypic correlation, Heritability, Iranian native fowl, Meta-analysis -
هدف از انجام این پژوهش، بررسی اثر تنش گرمایی بر عملکرد تولیدی و تولیدمثلی گاوهای شیری هلشتاین اصفهان و همچنین برآورد فراسنجههای ژنتیکی در شرایط استرس گرمایی بود. لذا از اطلاعات 169655 رکورد مربوط به 60322 گاو شیری استان اصفهان استفاده گردید. سوابق آب و هوایی گلههای مورد بررسی از 7 ایستگاه که فاصلهی کمتر از 70 کیلومتری با گلهها داشتند جمعآوری و شاخص دمایی-رطوبتی(THI) برای هر ماه در هر گله محاسبه گردید. در مدل استفاده شده، اثر گله-سال زایش، ماه زایش، نوبت زایش و شاخص دمایی-رطوبتی به عنوان اثرات مستقل قرار داده شدند. برای برآورد فراسنجههای ژنتیکی صفات تولیدمثلی از مدل حیوانی و برای صفات تولیدی از مدل رگرسیون تصادفی استفاده شد. نتایج حاصل نشان داد که شاخص دمایی-رطوبتی بیش از 72، اثرات نامطلوبی روی عملکرد داشت. میانگین وراثتپذیری روز باز و فاصله زایش تا اولین تلقیح به ترتیب 02/0 و 06/0 تخمین زده شد. با افزایش شاخص دمایی- رطوبتی، میانگین فنوتیپی صفات تولیدی کاهش یافت و این کاهش برای صفت تولید شیر از سطح آستانه72 THI= و برای صفت درصد چربی شیر از سطح 64 THI =دیده شد. میانگین وراثت پذیری در مقادیر مختلف شاخص دمایی-رطوبتی برای صفت تولید شیر 32/0 و برای صفت درصد چربی شیر 24/0 برآورد شد. به طور کلی واریانس ژنتیکی افزایشی با افزایش شاخص دمایی- رطوبتی از سطح آستانه (72 =THI) برای دو صفت تولید شیر و درصد چربی افزایش یافت. به عبارتی دیگر بین حیوانات در مواجه شدن با تنش گرمایی بعد از شاخص دمایی- رطوبتی 72 تفاوت ژنتیکی قابل توجهی وجود دارد و لذا ممکن است بتوان از طریق انتخاب ژنتیکی حیوانات مقاوم تر به تنش گرمایی را به عنوان والدین نسل بعد در نظر گرفت.
کلید واژگان: تنش گرمایی، تولید شیر روز آزمون، روزهای باز، روند ژنتیکی و فنوتیپی، فاصله زایش تا اولین تلقیحIntroductionOne of the most important environmental factors affecting the dairy industry is the temperature changes that showed a negative impact on the industry over the past few years. Increasing temperatures have declined the production and reproductive performance of herds in the tropics. Huge losses are caused annually due to heat stress. Heat stress in dairy cows is caused by a combination of environmental factors (temperature, relative humidity, solar radiation and air movement). Continual genetic selection for greater performance results to increased sensitivity to heat stress. It was one of the reasons why lactation curve during summer has decreasing trend compared to spring in which lactation curve maintained within high levels. Dairy cows at the beginning of lactation have small chances to fight off a thermal stress, and thus it has the strongest effect on the production of milk in the first 60 days of lactation. A negative balance of energy in dairy cows at the beginning of lactation is even more increased by creating and emitting of higher quantity of thermal energy in the period when animals consume less food. For this reason, a high-yielding dairy cows are more sensitive to heat stress than cows having a lower genetic potential for milk production. Impacts of heat stress on reproductive efficiency have been well documented and reviewed. Heat stress has been shown to alter the duration of estrus, colostrum quality, conception rate, uterine function, endocrine status, follicular growth and development, luteolytic mechanisms, early embryonic development and fetal growth. Therefore, the purpose of this study was to investigate the effect of heat stress on yield of dairy cattle in different months of production and also to estimate genetic parameters of production and reproductive traits under heat stress.
Material and MethodsIn this study, 169655 records of 60322 dairy cows in different parity in Isfahan province of Iran were used. The studied traits included productive and reproductive traits. Milk test day and fat percent as productive traits and open days and days to first service were considered as reproductive traits. Climatic records of herds were collected from 7 stations less than 70 km away from herds and temperature-humidity index (THI) was calculated for each month in each herd. Dairy milk production records ranged from 5 kg to 60 kg for milk and milk fat percentage from 1 to 7%. Genetic and phenotypic trends were considered by regression of the estimated breeding values on year of the birth. The model used included the effect of herd-year of calving, calving month, parity and temperature-humidity index. An animal model was used to estimate genetic parameters of reproductive traits and random regression was used for production traits. SAS software was used to investigate the significance level of independent factors and DMU software was used to estimate genetic parameters.
Results and DiscussionThe results showed that the threshold of temperature-humidity index is 72 and more than it has adverse effects on performance. Average days open and difference to first service in different Parity 112 and 60 days respectively and was estimated the average heritability of days open and difference to first service 0.02 and 0.06, respectively. With increase in temperature- humidity index, mean of production traits decreased and this decrease for milk and fat yield traits occurred at temperature-humidity threshold of 72 and 65, respectively. The average of heritability was calculated as 0.32 for milk yield and 0.24 for milk fat percentage. The results indicated that with increasing temperature humidity index in 72 the genetic variance for both traits was increased. In on other words, the cows after heat stress (THI=72). Genetic differences were significantly increased. The results of this study indicate that the additive genetic variances were higher in early lactation (5 to 100 days of lactation), for both milk yield and fat percentage.
ConclusionGenetic variance increased with increasing temperature-humidity index (THI = 72) for the two traits of milk and fat production. Also breeding value of open day correction and difference to first calving under heat stress decreased. In other words, there is a significant genetic difference between animals exposed to heat stress after temperature-humidity index 72. Therefore, it may be possible to genetically identify animals more resistant to heat stress as parents of the next generation.
Keywords: Days to first service, Genetic, Phenotypic Trends, Heat stress, Milk test day, open days -
در این پژوهش پارامترهای ژنتیکی و اجزای (کو) واریانس برای صفات وزن تولد، سه، شش، نه ماهگی، میزان اضافه وزن روزانه و نسبت کلیبر از تولد تا سه ماهگی و همچنین از سه ماهگی تا نه ماهگی در جمعیت بز کرکی خراسان جنوبی مربوط به ایستگاه سربیشه در یک دوره 16 ساله تخمین زده شد. در این مطالعه اطلاعات مربوط به 2544 رکورد دام که شامل 149 پدر و 851 مادر بودند، با استفاده از نرم افزار MTGSAM مورد آنالیز قرار گرفت. برای تمامی صفات، شش مدل حیوانی مختلف مورد آزمون قرار گرفت. برای صفات وزن شش، نه ماهگی، میزان اضافه وزن روزانه و نسبت کلی بر از سه ماهگی تا یک سالگی، مدل دوم به عنوان مناسب ترین مدل انتخاب گردید. وراثت پذیری مستقیم برای صفات مورد بررسی در دامنه 01/0 تا 36/0 تخمین زده شد به طوری که صفت وزن تولد دارای بالاترین وراثت پذیری (36/0) و صفات میزان اضافه وزن و نسبت کلی بر از تولد تا سه ماهگی دارای کم ترین وراثت پذیری (01/0) بود. روندهای فنوتیپی و ژنتیکی برای کلیه صفات به صفر برآورد شد و معنی دار نبود. تفاوت در برآورد این روندها در مقایسه با سایر گزارشات را می توان در ارتباط با تفاوت در نژاد، مدل و روش های محاسباتی، اثرات محیطی و اثر متقابل آن با عوامل ژنتیکی، وضعیت تغذیه و آب و هوا جستجو کرد.کلید واژگان: پارامترهای ژنتیکی، روند ژنتیکی و فنوتیپی، صفات رشد، بز کرکی خراسان جنوبی و آنالیز بیزینIn this study, genetic parameters and (co) variance components were estimated for weights at birth, 3, 6, 9 month, daily weight gain and Keliber ratio from birth to 3 month and also form 3 month to 9 month. Records of 2544 kids, the progeny of 149 sires and 851 dams were used to analysis data by MTGSAM program. Six different animal models were fitted for all traits. The most appropriate model for weight at 6, 9 and daily weight gain and Keliber ratio form 3 to 9 month was model 2. Estimated direct heritability varied from 0.01 to 0.36, which was minimum (0.01) for daily weight gain and Keliber ratio from birth to 3 month and maximum (0.36) for birth weight. The genetic and phenotypic trends for all traits were estimated near to zero and non-significant. Generally, differences between estimated genetic trends for these traits and estimated values of other studies, is due to difference in animal breeding standard followed by different program selection, difference between models and calculation method, effects of environment, interaction between genetic and environmental, nutrition and climate conditions.Keywords: Genetic parameters, Genetic, phenotypic trends, Growth Traits, South Khorasan cashmere goats, Gibbs sampling
-
سابقه و هدف
روش متاآنالیز برای تجمیع نتایج مطالعات انجام شده در زمینه برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات تولیدی و تولیدمثلی در گاو شیری با استفاده از داده های مقالات موجود و رسیدن به نتایجی با صحت بالاتر مورد استفاده قرار گرفت. بدین منظور یک مطالعه متاآنالیزی، از داده های مربوط به 96 مقاله منتشر شده در زمینه برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات تولیدی و تولیدمثلی گاو هلشتاین، در ایران استفاده شد. صفات مورد بررسی در گاو هلشتاین شامل تولید شیر، تولید چربی شیر، تولید پروتئین شیر، درصد چربی شیر، درصد پروتئین شیر، سن اولین زایش، فاصله گوساله زایی، روزهای خشک، روزهای باز، طول دوره آبستنی و طول دوره شیردهی بودند.
مواد و روش ها:
ابتدا، مقادیر وراثت پذیری و همبستگی های ژنتیکی و فنوتیپی از مقالات مرتبط استخراج شد. پس از آماده سازی داده ها، -مدل متاآنالیز با اثرات تصادفی با استفاده از بسته Metacor نرم افزار R نسخه 3،3،1 و نرم افزار CMA نسخه 3 برای برآورد میانگین وزنی وراثت پذیری و همبستگی های ژنتیکی و فنوتیپی، خطای استاندارد و حدود اطمینان 95 درصدی صفات تولیدی و تولید مثلی مورد استفاده قرار گرفت. بررسی مطالعات موجود، نشانگر وجود ناهمگنی زیاد برای اکثر صفات مورد بررسی بود. بنابراین، برای برآورد میانگین وزنی اثرات، امکان استفاده از مدل اثر ثابت وجود نداشت. داده ها توسط نرم افزار CMA مجددا مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند و نتایج حاصل از مدل اثرات تصادفی به عنوان نتایج نهایی متا آنالیز گزارش شد.
نتایجمیانگین وزنی وراثت پذیری برای صفات تولیدی در محدوده 19/0 تا 27/0 بود. بیشترین میزان وراثت پذیری مربوط به صفت درصد پروتئین شیر (27/0) و کمترین میزان وراثت پذیری مربوط به صفت تولید چربی شیر (19/0) بود. میانگین وزنی وراثت پذیری برای صفات تولیدمثلی در محدوده 03/0 تا 14/0 بود. در این بین میزان وراثت پذیری طول دوره آبستنی (14/0) از سایر صفات بیشتر و وراثت پذیری روزهای باز (03/0) از سایر صفات تولیدمثلی کمتر بود. میانگین وزنی همبستگی ژنتیکی برای صفات تولیدی و تولیدمثلی در محدوده 56/0- تا 88/0 و میانگین وزنی همبستگی فنوتیپی صفات در محدوده 42/0- تا 83/0 بود. بررسی نتایج حاصل از متاآنالیز در این پژوهش و مقایسه آن با نتایج مطالعات انفرادی نشان داد که تجمیع نتایج مطالعات و نجزیه مجدد آنها با روش متاآنالیز از طریق کاهش خطای استاندارد سبب افزایش صحت در نتایج حاصله می شود. به طور مثال دامنه تغییرات وراثت پذیری در مقالات مورد استفاده در مورد صفت تولید شیر بین 047/0 تا 41/0 ، چربی شیر بین 05/0 تا 56/0 و پروتئین شیر بین 0 تا 7/0 بود، در حالی که پس از تجمیع نتایج توسط روش متاآنالیز، محدوده 95% برای وراثت پذیری این صفات به ترتیب به 23/0 تا 25/0، 17/0 تا 21/0 و 19/0 تا 29/0 کاهش یافت. از طرفی مقایسه خطای استاندارد متاآنالیز در مورد هر صفت با خطای استاندارد مطالعات نشان داد که تجمیع نتایج و افزایش حجم نمونه باعث کاهش شدید خطای استاندارد برآورد وراثت پذیری در صفات مورد بررسی بخصوص صفات تولیدی شد.
نتیجه گیری:
بنابراین استفاده از روش هایی نظیر متآنالیز با تجمیع کلیه اطلاعات موجود منجر به بهبود برآوردها و افزایش کارایی برنامه های اصلاح نژادی و بهبود پیشرفت ژنتیکی صفات اقتصادی بخصوص در جمعیت های فاقد رکورد و یا با رکوردهای نامناسب خواهد شد.
کلید واژگان: متاآنالیز، وراثت پذیری، همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی، هلشتاینBackground and objectivesMeta-analysis method was used for gathering studies done on genetic parameters estimation in Holstein cows to increase the accuracy of estimations. For this purpose, data from 96 articles on genetic parameter estimation of productive and reproductive traits on Iranian Holstein dairy cows were used. Productive traits were milk production, amount of milk fat, amount of milk protein, milk fat percentage and milk protein percentage and reproductive traits were age at first calving, calving interval, dry days, open days, pregnancy period and lactation period.
Materials and methodsFirst, heritability estimates, genetic and phenotypic correlations were obtained from articles. After data preparation, the meta-analytical model with random effects using Metacor package, R 3.3.1 software and CMA ver.3 software were used for estimating weighted average of heritability and genetic and phenotypic correlations, standard errors and 95% confidence interval for productive and reproductive traits. Investigating available studies showed high heteroginty among studies. Therfore, using fixed model meta-analysis was not possible for estimating weighted average of effects. Data were reanalysid using CMA software and results of random model meta-analysis were reported as final results.
ResultsThe weighted average of heritability for productive traits in dairy cows were between 0.19 and 0.27. Milk protien percentage had the highest (0.27) and milk fat had the lowest (0.19) heritability estimates amonge productive traits. The weighted average of heritability for reproductive traits was in the range of 0.03 to 0.14. Pregnancy period (0.14) had the highest and open days had the lowest (0.03) heritability estimates amonge reproductive traits. The weighted average of genetic correlations of productive and reproductive traits was in the range of -0.56 to 0.88 and the mean weight of the phenotypic correlations of traits was in the range of -0.42 to 0.83. Comparing the results of meta-analysis in present study with the results of individual studies showed that aggregating studies and analyzing by meta-analysis improves the accuracy of the results through reducing standard errors. For example, in studied articles the range of heritability estimates for milk production were between 0.047-0.41, for milk fat were between 0.05-0.56 and for milk protein were between 0-0.7. However, after using meta-analysis method, these ranges were reduced to 0.23-0.25 for milk production, 0.17-0.21 for milk fat and 0.19-0.29 for milk protein. In addition, because of aggregating studies and increasing the amount of data, standard error of estimates in meta-analysis were considerably reduced compared to standard error of estimates in individual studies, especially for productive traits.
ConclusionUsing methods like Meta-analysis will increase the performance of breeding programs and will improve genetic progress of economic traits of animals by gathering all available information, especially for populations with no or not accurate data.
Keywords: genetic parameters, Genetic, phenotypic correlation, Heritability, Holstein, meta-analysis -
بهینه سازی جمعیت مرجع در ارزیابی های ژنومیک به دلیل تاثیر آن بر صحت برآورد اثرات نشانگرها و ارزش-های ارثی ژنومیک نقش کلیدی در اصلاح حیوانات اهلی دارد. در مطالعه حاضر هفت روش متفاوت انتخاب جمعیت مرجع شامل انتخاب همه، انتخاب بیشترین و کمترین عملکردها، انتخاب تصادفی، انتخاب افراد با بیشترین و کمترین شباهت نشانگر و ژنگاه مورد ارزیابی قرار گرفت. در مطالعات پویش ژنومی روش انتخاب همه به عنوان جمعبت مرجع، نشانگرهای با فراوانی متوسط و بالا با اثر بزرگ بر روی صفت را تعیین نمود، اما استفاده از روش بیشترین و کمترین عملکردها، نشانگرهای با فراوانی نادر با اثر بزرگ بر روی صفت را گزارش نمود. استفاده هم زمان از تراکم بالای نشانگری و مرجع انتخابی در مقایسه با تراکم پایین و مرجع کامل، موجب کاهش صحت ارزیابی ها گردید، ولی رتبه بندی حیوانات را تغییر نداد. بین روش های انتخاب جمعیت مرجع با نسل (P≤0.0134) و همچنین با عدم تعادل لینکاژ (P≤ 2e-16) اثر متقابل وجود داشت. به طور کلی انتخاب همه حیوانات به عنوان جمعیت مرجع منتج به صحت های بالاتری در مقایسه با شش روش مرجع انتخابی گردید. بین روش های انتخاب، در جمعیت های با اندازه موثر کم (255/0r2 = ، 100=Ne) اختلافی وجود نداشت ، اما در جمعیت های با اندازه موثر زیاد (086/0r2= ،400=Ne) روش های انتخاب جمعیت مرجع با صحت های متفاوتی ارزش های اصلاحی ژنومی را پیش بینی کردند. بیشترین و کمترین صحت پیش بینی ارزش اصلاحی ژنومی به ترتیب متعلق به روش های انتخاب دام ها بر اساس حداکثر شباهت ژنگاه و نشانگری بود(0231/0≥P)کلید واژگان: نشانگر، ژنتیک، انتخاب، ژنوتایپ، ژنگاهThe optimization of the reference population in genomic evaluation plays an important role in livestock breeding, because of its potential impact on the accuracy of estimating the marker effects and genomic breeding values. In the present study, seven different train set selection methods including selection of all, selection of the highest and lowest performances, random selection, selection of individuals with the most and least marker and QTL similarity were evaluated. In genome wide association study selection of all as train set detected common SNPs which make a high variation on the trait. However selective train set was just reported rare SNPs with a major effect on the trait. In genomic selection simultaneous use of high-density markers and selective train set in comparison with low-density and selection of all as train set reduced accuracy, but did not change the ranking of animals. There was also an interaction between train set selection method and generation (P≤0.0134) as well as the linkage disequilibrium (P≤ 2e-16). In general, selection of all animals as a train set resulted in higher accuracy compared to six selective train set methods. There were no differences between the methods of selecting train set in populations with a low effective size (r2 = 0.255, Ne =100), but in populations with a high effective size (r2 = 0.086, Ne =400) methods, with different accuracy predicted genomic breeding values. The highest and lowest accuracy were respectively belonged to most QTL and marker similarity methods.Keywords: Marker, Genetic, Selection, Genotyping, QTL
-
هدفدر این تحقیق از اطلاعات وزن تولد، وزن از شیرگیری، وزن شش ماهگی و نه ماهگی مربوط به تعداد 7363 راس گوسفند نژاد لری برای برآورد روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات رشد استفاده گردید.
زمینه مطالعاتی: این رکوردها مربوط به گله های عشایری بوده و بین سال های 1380 تا 1389 توسط سازمان جهاد کشاورزی استان لرستان جمع آوری گردیده است.روش کاراجزای (کو)واریانس، پارامترهای ژنتیکی و ارزش های اصلاحی صفات رشد با استفاده از روش حداکثر درست نمائی محدود شده و بر اساس مدل دام تک صفتی به وسیله نرم افزار DFREML برآورد گردید.نتایجبیشترین و کمترین وراثت پذیری مستقیم برآورد شده به ترتیب مربوط به وزن تولد (33/0) و وزن شش ماهگی (052/0) بود. روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات مورد مطالعه به ترتیب بر اساس تابعیت وزنی میانگین ارزش اصلاحی و تابعیت وزنی میانگین فنوتیپی دام ها بر اساس سال تولد با استفاده از نرم افزار SPSS برآورد گردید. روند ژنتیکی مستقیم وزن تولد، وزن از شیرگیری، وزن شش و نه ماهگی به ترتیب 2±13، 5±73، 8±48 و 21±242 گرم در سال برآورد گردید. روند فنوتیپی برای این صفات به ترتیب 12±38، 74±242، 98±185، 94±129 گرم در سال برآورد گردید. پیشرفت ژنتیکی مستقیم و مادری صفات مورد بررسی پس از 10 سال به ترتیب 42/161 و 40/52، 99/571 و 39/140، 14/466 و 71/140 گرم و پیشرفت ژنتیکی مستقیم صفت وزن نه ماهگی 59/469 گرم برآورد شد.
نتیجه گیری نهایی: در این پژوهش روند ژنتیکی صفات رشد مثبت ولی اندک بود. با توجه به اینکه بالاترین وراثت پذیری مستقیم و مادری برآورد شده مربوط به وزن تولد بود، این صفت می تواند در برنامه های اصلاح نژادی مورد توجه قرار گیرد.کلید واژگان: روند ژنتیکی و فتوتیپی، صفات رشد، گوسفند لریObjectivesIn this study 7363 records of birth weight, weaning weight, weight at six months and nine months of age from Lori sheep were used to estimate the genetic and phenotypic trend of growth traits under nomadic rearing system.BackgroundThe records that related to the nomadic herds were collected during years of 2001 to 2010 by agricultural organization of Lorestan province.Methods(Co) variance components, genetic parameters and breeding values of growth traits were estimated using restricted maximum likelihood method based on univariate animal model by the DFREML software.ResultsThe highest and the lowest direct heritability estimated were birth weight (0.33) and weight in six months (0.052), respectively. The genetic and phenotypic trends were calculated using SPSS software, based on dependency of the breeding value mean and dependency of phenotypic mean on birth year, respectively. The direct genetic trend for birth weight, weaning weight, six months and nine months weight were 13±2, 73±5, 48±8 and 242±21 gr/year, respectively. Phenotypic trend for birth weight, weaning, six months and nine months weights were 38±12, 242±74, 185±98, 129±94 gr/year, respectively. Direct and maternal genetic improvement of birth, weaning, six months weights after 10 years were 161.42 and 52.40, 571.99 and 140.39, 466.14 and 140.71 gr, respectively and direct genetic progress for nine months weight was 469.59 gr.ConclusionsGenetic trend of traits under study was positive and upward. Considering that the highest direct and maternal heritability estimates in this study was related to birth weight, this attribute can be considered in breeding programs.Keywords: Genetic, phenotypic trends, Growth traits, Lori sheep -
در این تحقیق، تخمین اجزای واریانس -کواریانس و وراثت پذیری برای صفات عملکردی وزن بدن در 12 هفتگی، وزن بدن در سن بلوغ جنسی، سن بلوغ جنسی و تعداد تخم مرغ تعداد 43180 قطعه مرغ بومی آذربایجان که طی 14 نسل (سال 1367 تا 1389) این صفات رکورد برداری شده بودند، انجام شد. تجزیه و تحلیل داده ها و برآورد مولفه های واریانس برای محاسبه پارامترهای ژنتیکی با استفاده از روش حداکثر درست نمایی محدود شده و مدل حیوانی چهار صفتی صورت گرفت. محدوده وراثت پذیری در صفات عملکردی مدل چهار صفتی در محدوده097/0 تا409/0 به ترتیب برای تعداد تخم مرغ و وزن بدن در 12 هفتگی بدست آمد. همبستگی ژنتیکی بالایی بین سن بلوغ جنسی و تعداد تخم مرغ و وزن بدن در 12 هفتگی با وزن بدن در بلوغ جنسی (به ترتیب 83/0- و 744/0) برآورد شد.طی بررسی های انجام شده روند ژنتیکی (تفاوت ارزش اصلاحی مرغان نسل پایه با آخرین نسل) حاصل از صفات وزن بدن در 12 هفتگی، وزن بدن در سن بلوغ جنسی، سن بلوغ جنسی و تعداد تخم مرغ به ترتیب 29/14 گرم، 5/5- گرم، 62/1- روز و 23/0 عدد بود. نتایج این تحقیق نشان می دهد که کاهش سن بلوغ جنسی سبب افزایش تعداد تخم مرغ خواهد شد.کلید واژگان: روندهای ژنتیکی و فنوتیپی، مرغانی بومی آذربایجان، وراثت پذیریIn this study, (co)variance components and heritability for performance traits of body weight in 12 weeks, body weight at sexual maturity, age at sexual maturity and egg number of 43,180 birds native Azerbaijan during 14 generations (1988 to 2010) were estimated. Data analysis were undertaken using restricted maximum likelihood method through applying a multivariate animal model. Heritability of the traits was in the range of 0.097 (egg number) to 0.409 (body weight in 12 weeks). High genetic correlations were found between age at sexual maturity and egg number (-0.83) and between body weight at 12 weeks and body weight at sexual maturity (0.744). Genetic trends for body weight at 12 weeks, body weight at sexual maturity, age at sexual maturity and the number of eggs were 14.29 g, -5.5 g, -1.62 day and 0.23 numbers, respectively. The findings of this research revealed that lowering the age of sexual maturity will increase the egg number.Keywords: Genetic, phenotypic trends, Azerbaijan's native chickens, Heritability
-
این پژوهش با هدف برآورد مشخصه (پارامتر)های ژنتیکی و روندهای ژنتیکی، محیطی و فنوتیپی صفات تولیدی گاوهای هلشتاین استان همدان انجام شد. در این پژوهش از 11986 رکورد 305 روز، سه زایش نخست گاوهای هلشتاین استان همدان که در سال های 1369 تا 1390 گردآوری شده بود، استفاده شد. اجزای واریانس-کوواریانس و ارزش های اصلاحی با مدل مختلط حیوانی، بر پایه الگوریتم میانگین اطلاعات بیشترین درست نمایی محدودشده (AI-REML) برآورد شدند. در مدل به کار برده شده، عامل های گله-سال-فصل و شکم زایش اثرگذاری های ثابت بودند و عامل های ژنتیکی افزایشی و محیطی دائمی به عنوان اثرگذاری های تصادفی در نظر گرفته شدند. وراثت پذیری تولید شیر، تولید شیر تصحیح شده برای چربی، درصد چربی، درصد پروتئین، تولید چربی و تولید پروتئین، به ترتیب 16/0، 14/0، 20/0، 11/0، 15/0 و 13/0 و تکرارپذیری آن ها به ترتیب، 44/0، 39/0، 31/0، 20/0، 35/0 و 39/0 برآورد شدند. روندهای ژنتیکی این صفات به ترتیب، 42/3 و 51/2 کیلوگرم در سال، 002/0- و 000/0- درصد در سال و 082/0 و 020/0- کیلوگرم در سال، روندهای محیطی به ترتیب، 89/85 و 61/67 کیلوگرم در سال، 028/0- و 007/0- درصد در سال و 12/1 و 62/1 کیلوگرم در سال و روندهای فنوتیپی به ترتیب، 54/89 و 26/70 کیلوگرم در سال، 030/0- و 007/0- درصد در سال و 22/1 و 69/1 کیلوگرم در سال برآورد شدند. نتایج این بررسی نشان دادند که صفات تولیدی در گاوهای هلشتاین استان همدان پیشرفت ژنتیکی شایان توجهی در سال های گذشته نداشته اند و بیشتر افزایش تولید شیر و چربی ناشی از بهبود شرایط محیطی بوده است.کلید واژگان: روند های ژنتیکی، گاوهای هلشتاین استان همدان، مشخصه های ژنتیکی، محیطی و فنوتیپیThe present study was conducted to estimate genetic parameters and genetic, environmental and phenotypic trends of milk production traits in Holstein cattle of Hamedan province. In this study 11986 305-d records of first three parities of Hamedan province Holstein cattle, which were gathered during 1990-2011, were used. Variance-covariance components and breeding values were estimated using animal mixed model, based on Average Information algorithm of Restricted Maximum Likelihood (AI-REML). Herd-year-season and parity were fixed effects and directs additive and permanent environmental factors were considered as random effects. Heritability estimates for milk yield, fat corrected milk yield, fat percentage, protein percentage, fat yield and protein yield were 0.16, 0.14, 0.20, 0.11, 0.15 and 0.13 and their repeatability estimates were 0.44, 0.39, 0.31, 0.20, 0.35 and 0.39, respectively. Genetic trends of these traits were, 3.42 kg/yr, 2.51 kg/yr, -0.002 %/yr, -0.000 %/yr, 0.082 kg/yr and -0.020 kg/yr, environmental trends were 85.89 kg/yr, 67.61 kg/yr, -0.028 %/yr, -0.007 %/yr, 1.12 kg/yr and 1.62 kg/yr and their phenotypic trends were 89.54 kg/yr, 70.26 kg/yr, -0.030 %/yr, -0.007 %/yr, 1.22 kg/yr and 1.69 kg/yr, respectively. The results of this study showed that the production traits of Hamedan province Holstein cattle did not have noticeable genetic improvements in past years and most of milk and fat yield increment have been induced by improvement of environmental conditions.Keywords: Environmental, phenotypic trends, genetic, genetic parameters, Hamadan province holstein cattle
-
BackgroundIn this study, 2554 calving records from 1484 Holstein cows were used.MethodsThe data were collected from one of the East Azerbaijan herds, during 2009 to 2013. The studied traits were production traits (305 d milk and 305 d fat yields) and reproduction disorders (dystocia and retained placenta).ObjectivesEstimation of genetic parameters was performed by repeatability animal linear (305 d milk and 305 d fat yields) and threshold models (dystocia and retained placenta), by single and two-trait analyses.ResultsHeritability for 305 d milk yield and 305 d fat with single-trait analysis were estimated 0.33 and 0.23, respectively and the repeatability of these traits were estimated 0.35 and 0.25, respectively. Heritability of dystocia and retained placenta were estimated 0.09 and 0.1, respectively and the repeatability for both was estimated 0.11. Genetic correlation between production traits were estimated 0.98 and genetic correlation between reproduction disorders were estimated 0.51. Estimated genetic correlations between production traits and reproduction disorders were from -0.85 (305 d fat and retained placenta) to 0.21 (305 d milk yield and dystocia).ConclusionConsidering negative genetic correlation between milk production and dystocia and a relatively strong positive correlation between these two reproductive disorders, planning of selection programs in dairy cows based on a combination of production and reproduction traits is recommendable. Also ignoring these relationships in selection may negatively influence overall performance in a long term.Keywords: Dystocia, Genetic, Phenotype Correlation, Heritability, Retained Placenta
-
تحقیق حاضر به منظور بررسی ارتباط ژنتیکی و فنوتیپی بین صفت رشد و صفات بیومتری در گوسفندان بلوچی انجام گرفت. صفات مورد مطالعه شامل افزایش وزن روزانه تا یک سالگی (ADG) و صفات بیومتری، ارتفاع جدوگاه (HW)، ارتفاع از پشت (HB)، طول بدن (BL)، دور سینه (HG)، دور ران (LG)، دور بیضه (TG) بود. از تعداد 4542 رکورد مربوط به سال های 1380 الی 1390 گله های (8 گله) تحت پوشش مرکز تحقیقات استفاده شد. داده ها با استفاده از روش مدل های خطی عمومی (GLM) و توسط نرم افزار SAS مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. برای برآورد پارامترها و ارتباط ژنتیکی بین صفات ازروش حداکثردرست نمایی محدود شده براساس مدل حیوانی (REML) یک و چند صفت از نرم افزار WOMBAT استفاده شد. وراثت پذیری برآورد شده برای صفات ADG، BL، HG، HW، HB، TG و LG به ترتیب برابر با 10/0±13/0، 06/0±11/0، 07/0±21/0، 06/0±17/0، 06/0±17/0، 10/0±32/0 و 06/0±2/0 شد. مطالعه حاضر نشان داد که صفت دور بیضه (TG) دارای بیشترین وراثت پذیری است. برآورد نشان می دهد که با انجام انتخاب، روی صفات HG و TG، بهبود ژنتیکی در صفات بیومتریک گوسفندان بلوچی قابل انتظار خواهد بود. همبستگی ژنتیکی وفنوتیپی بین صفات مورد مطالعه مثبت و به ترتیب در دامنه بین 15/0 الی 97/0 و 32/0 الی 94/0 قرارداشت.
کلید واژگان: افزایش وزن روزانه، صفات بیومتریک، گوسفندان بلوچی، ارتباط ژنتیکی و فنوتیپی، مدل حیوانیThe study was designed to investigate the relationship between growth trait and biometric traits in Baluchi sheep. This study was conducted to estimate the genetic and phenotypic biometric traits including daily gain (ADG) and height at withers (HW), height at back (HB), body length (BL), heart girth (HG), leg girth (LG) and testis girth (TG) in Baluchi sheep. Total data of 4542 records from six experimental herds of Jahad Organization Research Centre of Mashhad County were collected since 2001 to 2011. Data were analyzed using General Linear Model (GLM) of SAS. For the estimation of genetic parameters and genetic correlation between traits, animal model uni and multi-trait by restricted maximum likelihood (REML) of WOMBAT 32 (Meyer 2007) have been used. The mean heritability of ADG, BL, HG, HW, HB, TG and LG traits was estimated 0.13±0.01, 0.11±0.06, 0.21±0.07, 0.17±0.06, 0.32±0.1 and 0.2±0.06 respectively. The results of the current study showed that the TG trait has the highest heritability. The estimations shows genetic improvement will be predictable in biometric traits of Baluchi sheep. The genetic correlation between traits was positive, ranged between 0.15-0.97. Moreover, phenotypic correlation was positive and was estimated in range of 0.32 to 0.94.Keywords: Daily Gain, Biometrics Traits, Baluchi Sheeps, Genetic, Phenotypic Relationship, Animal Model -
در این تحقیق از 1802 رکورد طول عمر میش، جمع آوری شده در سال های 1367 تا 1389 از گله ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند لری بختیاری واقع در استان چهارمحال و بختیاری، برای برآورد روند های ژنتیکی، محیطی و فنوتیپی صفت طول عمر استفاده شد. به منظور برآورد ارزش اصلاحی طول عمر اقتصادی میش ها از روش حداکثر درست نمایی محدودشده و تجزیه تک صفتی مدل حیوانی استفاده شد. بهترین پیش بینی نااریب خطی از ارزش های اصلاحی میش ها و روند ژنتیکی به صورت تابعیت میانگین ارزش های اصلاحی از سال تولد برآورد شد. روندهای محیطی و فنوتیپی نیز به صورت تابعیت انحرافات محیطی و فنوتیپی (انحرافات مقادیر فنوتیپی از میانگین کل) از سال تولد میش ها برآورد شد. نتایج این تحقیق نشان داد که روند ژنتیکی طول عمر اقتصادی مثبت (033/0 روز) و غیرمعنا دار از صفر بود. روندهای محیطی و فنوتیپی طول عمر اقتصادی معادل81/27- و 78/27- روز و معنا دار از صفر بودند (05/0P<). در نتیجه انتخاب برای صفات رشد در گله مورد بررسی به تغییرات قابل ملاحظه ژنتیکی برای صفت طول عمر اقتصادی میش های این نژاد منجر نشده است و با اصلاح شرایط محیطی می توان از روند فنوتیپی منفی جلوگیری کرد.
کلید واژگان: روند ژنتیکی و فنوتیپی، طول عمر اقتصادی، میش لری بختیاریIn this study، the number of 1802 longevity records of ewes collected during 1989 to 2010 in Breeding Station of Lori-Bakhtiari sheep flocks were used to estimate of genetic، environmental and phenotypic trends for economic lifetime. The breeding values of a ewe’s lifetime were estimated by restricted maximum likelihood procedure under an animal model of univariate analysis. The best linear unbiased prediction of breeding values estimated and genetic trends were estimated as a regression coefficient of average breeding values on the birth year of ewes. The environmental and phenotypic trends estimated as a regression coefficient of average environmental deviation and phenotypic deviation (deviations of phenotypic values from overall mean) on the birth year of ewes. The results showed that، genetic trend of longevity was positive (0. 033 days) but insignificant from zero. While the environmental and phenotypic trends were equal to -27. 81 and -27. 78 days، respectively، and significantly different from zero (P<0. 05). Thus، selection for growth traits did not affect longevity traits as genetically and to exhibit negative phenotypic trend for longevity the environmental factors should improve firstlyKeywords: Genetic, phenotypic trends, economic lifetime, Lori, Bakhtiari ewe -
این تحقیق با استفاده از اطلاعات ایستگاه اصلاح نژاد گوسفند کرمانی شهربابک که از سال 1382تا 1388 جمع آوری شده بود انجام گرفت. داده های مورد استفاده مربوط به صفات وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن شش ماهگی، وزن نه ماهگی و وزن یکسالگی بود. برآورد مولفه های (کو) واریانس با استفاده از مدل حیوانی تک صفتی و چند صفتی و روش حداکثر درست نمایی محدود شده با استفاده از برنامه DFREML انجام شد. علاوه بر این مدل های مختلف برازش شده معنی داری آثار مدل ها با نسبت درستنمایی آزمون شدند. در این نژاد، برازش اثر ژنتیکی افزایشی مستقیم بدون منظور کردن سایر آثار تصادفی موجب شد وراثت پذیری مستقیم بیش از حد برآورد شود. کاهش در این برآوردها در نتیجه برازش آثار مادری به خصوص اثر ژنتیکی افزایشی مادری، با و بدون منظور کردن اثر کوواریانس ژنتیکی، نشان داد که بخش قابل ملاحظه ای از واریانس فنوتیپی مشاهده شده بر وزن بدن در سنین مختلف قبل از شیرگیری ناشی از اثر ژنتیکی افزایشی مادری است. درتجزیه تک صفتی، وراثت پذیری مستقیم برای صفات وزن تولد، وزن شیرگیری، وزن شش ماهگی، وزن نه ماهگی و وزن یکسالگی به ترتیب 0/003، 0/0، 0/08، 0/0006 و 0/06 برآورد گردید. وراثت پذیری مستقیم صفات موردنظردر آنالیز پنج صفتی به ترتیب 42/0، 17/0، 09/0، 02/0 و 11/0 برآورد گردید. نتایج ژنتیکی حاصل از این تجزیه نشان داد که همبستگی ژنتیکی بین وزن تولد با وزن شیرگیری و وزن شش ماهگی به ترتیب 0/33 و 015 و با وزن یکسالگی 0/09 است. برآورد همبستگی های فنوتیپی وزن یکسالگی با وزن تولد و وزن شیرگیری به ترتیب 0/01 و 0/09 و برای بقیه صفات منفی بودند که بیانگر تغییرات شدید وزن هادر شرایط مرتع با توجه به شرایط محیطی است.
کلید واژگان: پارامترهای ژنتیکی و فنوتیپی، مقایسه مدل، نسبت درستنمایی، صفات رشد، گوسفند کرمانیData of Kermani sheep which collected during 2003-2009 were used in this study. The data included birth weight (BW)، weaning weight (WW)، six month weight (6MW)، nine month weight (9MW) and yearling weight (YW) traits. Estimate of (CO) variance component with the DFREML program and animal model with unitrait and multitrait analysis. In this study، fitting six different animal models and significant effects on the models were tested by likelihood ratio. In this breed، direct additive genetic analysis without other random effects result in overestimated direct heritability. underestimate the maternal effect especially، maternal additive effects، with and without genetic covariance effect، showed that a significant portion of phenotypic variance of body weight at different ages، especially before weaning due to maternal genetic effect. Estimate direct Heritability of the traits by univariate analysis was 0. 003، 0. 1، 0. 08، 0. 0006 and 0. 06، respectively. Direct heritability results by multitrait analysis was 0. 42، 0. 17، 0. 09، 0. 02 and 0. 11، respectively. Genetic correlation between BW with WW and 6MW were 0. 33 and 0. 15 and the correlation for BW and YW was 0. 09. phenotypic correlations between yearling weight، BW and WW were 0. 01 and 0. 09 respectively، and the other traits were negative correlation. This result indicate sever weight changes controlled by environmental conditions.Keywords: Genetic, phenotypic parameters, Model comparison, Likelihood ratio, Growth traits, Kermani sheep -
در این تحقیق، از رکورد های متعلق به 64220 راس گاو شیری نژاد هلشتاین در دوره اول شیرواری استفاده گردید. داده های مذکور مربوط به 749 گله بوده که طی سال های 1375 تا 1388 توسط مرکز اصلاح نژاد و بهبود تولیدات دامی کشور جمع-آوری شده بود. صفات مورد بررسی شامل صفات تولیدی (تولید شیر 305 روز، درصد چربی شیر 305 روز، درصد پروتئین شیر 305 روز و طول دوره شیردهی) و صفات تولید مثلی (طول دوره خشکی، سن هنگام اولین زایش، فاصله گوساله زایی و روز های باز) بود. تجزیه و تحلیل ژنتیکی صفات مورد بررسی با استفاده از روش حداکثر درست نمایی محدود شده توسط نرم-افزار DFREML انجام شد. وراثت پذیری تولید شیر، درصد چربی شیر، درصد پروتئین شیر و طول دوره شیردهی به ترتیب 197/0، 282/0، 333/0 و 031/0 و وراثت پذیری طول دوره خشکی، سن هنگام اولین زایش، فاصله گوساله زایی و روز های باز به ترتیب 015/0، 079/0، 035/0 و 036/0 برآورد گردید. همبستگی های ژنتیکی بین صفات تولیدی در دامنه 52/0- (تولید شیر و درصد چربی شیر) تا 74/0 (درصد چربی و درصد پروتئین شیر) و بین صفات تولید مثلی در محدوده 07/0 (سن هنگام اولین زایش و فاصله گوساله زایی) تا 95/0 (روزهای خشکی و فاصله گوساله زایی) برآورد گردید. همبستگی های ژنتیکی برآورد شده بین صفات تولیدی و تولید مثلی در دامنه 63/0- (تولید شیر و طول دوره خشکی) تا 96/0 (طول دوره شیردهی و فاصله گوساله زایی) بود. با توجه به همبستگی ژنتیکی قوی و نامطلوب بین صفات تولیدی و تولید مثلی، طراحی برنامه های انتخاب در گاو های شیری بر اساس ترکیبی از این صفات توصیه می گردد.
کلید واژگان: صفات تولیدی، صفات تولید مثلی، همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی، گاوهای هلشتاین ایرانIn this study, records of 64220 first lactation dairy cows were used. Data were collected from 749 herds during 1996 to 2009 by the Animal Breeding Center of Iran. Data included of production (305 d milk yield, 305 d fat percentage, 305 d protein percentage and lactation length) and reproduction (dry days, age at first calving, calving interval and days open) traits. Data analysis was performed by restricted maximum likelihood procedure using DFREML software. The estimated heritabilities of milk yield, fat percentage and protein percentage and lactation length were 0.197, 0.282, 0.333 and 0.031, respectively. The estimated heritabilites of dry days, age at first calving, calving interval and days open were 0.015, 0.079, 0.035 and 0.036, respectively. Genetic correlations between production traits were from 0.52 for milk yield and fat percentage to 0.74 for fat percentage and protein percentage. Genetic correlations between reproduction traits were from 0.07 (age at first calving and calving interval) to 0.95 (dry days and calving interval). Estimated genetic correlation between production and reproduction traits were from -0.63 (milk yield and dry days) to 0.96 (lactation length calving interval). Considering negative genetic correlation between production and reproduction traits, planning of selection programs in dairy cows based on a combination of production and reproduction traits is recommendable.Keywords: Production traits, Reproduction traits, Genetic, phenotypic correlations, Iranian Holstein cows -
در این پژوهش مولفه های (کو) واریانس و پارامترهای ژنتیکی صفات رشد شامل وزن تولد (BW)، وزن از شیرگیری (WW) و وزن شش ماهگی (6MW) و همچنین پارامترها و روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثلی شامل مجموع وزن بره های از شیر گرفته شده به ازای هر میش مولد (TWLW) و تعداد بره های متولد شده در هر زایش به ازای هر میش مولد (NLBE) در گوسفند نژاد لری با استفاده از روش بیزی برآورد شد. اطلاعات مورد استفاده شامل 7363 رکورد وزن تولد، 7054 رکورد وزن از شیرگیری، 6765 رکورد وزن شش ماهگی، 1012 رکورد برای TWLW و 1048 رکورد برای NLBE بود که طی سال های 1380 تا 1389 توسط سازمان جهاد کشاورزی استان لرستان جمع آوری شده بود. وراثت پذیری مستقیم برآورد شده برای صفات BW، WW و 6MW به ترتیب 36/0، 11/0 و 05/0 بود. روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثل به ترتیب از تابعیت میانگین ارزش های اصلاحی بر سال تولد و تابعیت میانگین عملکرد بر سال تولد محاسبه شد. وراثت پذیری، روند ژنتیکی و فنوتیپی برای صفت TWLW به ترتیب 05/0، 16/1±4/5 و 45/36±255 گرم در سال بود. وراثت پذیری، روند ژنتیکی و فنوتیپی برای صفت NLBE به ترتیب 09/0، 02/0±002/0 و 07/0±125/0 برآورد شد. پیشرفت ژنتیکی صفات TWLW و NLBE در دوره مورد بررسی به ترتیب 64/31 گرم و 008/0 بره بود. با توجه به بالا بودن ضریب وراثت پذیری وزن تولد نسبت به سایر صفات مورد مطالعه، انتخاب بر اساس این صفت میزان پیشرفت ژنتیکی را افزایش خواهد داد. روند ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثل معنی دار نبوده و مقدار روند ژنتیکی این صفات ناچیز بود.
کلید واژگان: پارامترهای ژنتیکی، روند ژنتیکی و فنوتیپی، صفات رشد و تولیدمثل(Co) variance components and genetic parameters for growth traits including birth weight (BW), weaning weight (WW) and six-month weight (6MW) as well as parameters, genetic and phenotypic trends of reproductive traits including total weight of lambs weaned per the ewe (TWLW) and the number of lambs born at birth per ewe (NLBE) in Lori sheep were estimated using the Bayesian method. The data included 7363 records for BW, 7054 records for WW, 6765 records for 6MW, 1012 records for TWLW and 1048 records for NLBE. The data were collected by the Agricultural Organization of Lorestan Province between the 2001 to 2010 years (for growth traits) and 2003 to 2010 years (for reproductive traits). The estimates of direct heritability for lamb body weights were 0.36 at birth, 0.11 at weaning and 0.05 at six months of age. The genetic and phenotypic trends reproductive traits were calculated based on regression of the mean of breeding value on birth year and mean of phenotypic value on birth year, respectively. Heritability, genetic and phenotypic trends for TWLW trait were 0.05, 5.4±1.16 and 255±0.45 grams per year, respectively. Heritability, genetic and phenotypic trends of NLBE trait were 0.09, 0.002±0.02 and 0.125±0.07, respectively. Genetic improvement of TWLW and NLBE traits at considered period were 31.64 grams and 0.008 of Lamb. The estimate of heritability at birth was higher than other traits so selection based on this trait would increase the genetic advances. Genetic and phenotypic trends for reproductive traits were not significant and the genetic trend was low.Keywords: Genetic, phenotypic trends, Growth, reproduction traits, Genetic parameters -
-
به منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولیدمثلی گاوهای هلشتاین استان آذربایجان شرقی، اطلاعات دوازده سال (1376-1388) در شش گله گاو شیری بزرگ استفاده شد. پارامترهای ژنتیکی و فنوتیپی صفات با روش حداکثر درستنمایی محدود شده تحت مدل های حیوانی یک و چند صفتی برآورد شد. وراثت پذیری سن اولین زایش، تعداد تلقیح به ازای هر آبستنی، روزهای باز، نرخ آبستنی، طول آبستنی، فاصله بین دو زایش متوالی، فاصله تلقیح تا تلقیح منجر به آبستنی و فاصله زایش تا اولین تلقیح به ترتیب 12، 1/7، 1/4، 3/7، 6، 7/4، 4/4، 21 درصد برآورد شد. بیشترین مقدار همبستگی ژنتیکی بین اولین تلقیح تا تلقیح منجر به آبستنی و تعداد تلقیح منجر به آبستنی (97درصد) و کمترین مقدار بین روزهای باز با تعداد تلقیح منجر به آبستنی (2/0 درصد) بود. همبستگی ژنتیکی بین تعداد تلقیح منجر به آبستنی با فاصله زایش تا اولین تلقیح و سن اولین زایش به ترتیب 001/0 و 001/0- بود.
کلید واژگان: صفات تولیدمثلی، پارامتر ژنتیکی و فنوتیپی، گاوهلشتاینGenetic and phenotypic parameters were estimated for calving interval (CI)، open days (OD)، conception rate (CR)، gestation length (GL)، number of service per conception (NSPC)، interval from calving to first service (CTFS)، age at first calving (AFC) and Interval from first service to conception (FSTC) in 6 large Holstein dairy herds in East Azerbaijan province. The reproductive traits used in this study were collected from 1997 to 2009 at the Livestock Service of the Ministry of Jihad Agriculture. Genetic and phenotypic parameters of the traits were estimated using restricted maximum likelihood (REML) procedure under univarite and multivariate animal models applying WOMBAT software. The estimated heritabilities for CI، OD، CR، GL، NSPC، CTFS، AFC and FSTC were 0. 047، 0. 041، 0. 073، 0. 060، 0. 071، 0. 21، 0. 12 and 0. 044، respectively. The estimated genetic correlations among the traits ranged from 0. 002 for OD–NSPC to 0. 97 for FSTC–NSPC. The estimated phenotypic correlations were generally lower than those of genetic correlations and ranged from 0. 001 to 0. 71.Keywords: Reproductive Traits, Genetic, Phenotypic Parameters, Holstein Cows -
برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات تولید و تولید مثل در گاومیش های بومی ایران / نوید قوی حسین زاده؛ مصطفی مدد، عبدالاحد شادپروردر این تحقیق، از رکورد زایش 4221 گاومیش بومی ایران متعلق به 621 گله که طی سال های 1372 تا 1389 به وسیله مرکز اصلاح نژاد دام و بهبود تولیدات دامی جمع آوری شده بود برای برآورد وراثت پذیری و همبستگی های ژنتیکی و فنوتیپی صفات تولید شیر، مقدار چربی شیر، سن اولین زایش و فاصله بین اولین و دومین زایش با استفاده از مدل حیوانی تک صفته و دوصفته استفاده شد. بیشترین وراثت پذیری مربوط به صفت تولید شیر (01/0±46/0) و کمترین آن مربوط به فاصله بین دو زایش (29/0±01/0) برآورد شد. وراثت پذیری برآورد شده برای سن اولین زایش و مقدار چربی شیر در جمعیت مورد مطالعه به ترتیب 21/0±21/0 و 17/0±27/0 بود. همبستگی ژنتیکی مثبت و بالا بین صفات تولید شیر و مقدار چربی شیر (55/0) در این مطالعه نشان دهنده افزایش در مقدار چربی شیر به ازای افزایش تولید شیر است. همبستگی ژنتیکی منفی و متوسط بین تولید شیر و سن اولین زایش (25/0-) بیانگر آن است که انتخاب ژنتیکی بر مبنای تولید شیر سبب کاهش سن اولین زایش می شود. با توجه به همبستگی ژنتیکی مثبت و بالای بین سن اولین زایش و فاصله بین اولین و دومین زایش (96/0) می توان نتیجه گرفت که انتخاب بر مبنای سن اولین زایش پایین می تواند سبب کاهش فاصله بین اولین و دومین زایش شود.
کلید واژگان: صفات تولیدی و تولید مثلی، گاومیش، مدل حیوانی، وراثت پذیری، همبستگی های ژنتیکی و فنوتیپیIn this study, calving records of 4221 Iranian native buffaloes from 621 herds which were collected by the Animal Breeding and Livestock Products Improvement Center of Iran from 2003 to 2010 were used to estimate heritability, genetic and phenotypic correlations between milk production, milk fat production, age at first calving and first calving interval using univariate and bivariate animal models. The highest and the lowest heritabilities were estimated for milk production (0.46±0.01) and first calving interval (0.01±0.29), respectively. Heritability estimates for age at first calving and milk fat production in the studied population were 0.21±0.21 and 0.27±0.17, respectively. Positive and high genetic correlation between milk yield and milk fat production (0.55) in this study indicated that milk fat increased along with increasing in milk production. Negative and medium genetic correlation between milk production and age at first calving (-0.25) indicated that genetic selection for milk production cause decrease in age at first calving. Positive and high genetic correlation between age at first calving and first calving interval (0.96) indicated that selection based on lower age at first calving cause reduced first calving interval.Keywords: Animal model, Genetic, phenotypic correlations, Heritability, Buffalo, Productive, reproductive traits
- نتایج بر اساس تاریخ انتشار مرتب شدهاند.
- کلیدواژه مورد نظر شما تنها در فیلد کلیدواژگان مقالات جستجو شدهاست. به منظور حذف نتایج غیر مرتبط، جستجو تنها در مقالات مجلاتی انجام شده که با مجله ماخذ هم موضوع هستند.
- در صورتی که میخواهید جستجو را در همه موضوعات و با شرایط دیگر تکرار کنید به صفحه جستجوی پیشرفته مجلات مراجعه کنید.