تعیین هویت ایزوله های بالینی مایکوباکتریوم جدا شده از بیماران ایرانی با استفاده از روش های فنوتیپیک و مولکولی

از آنجایی که گونه های مختلف مایکوباکتریوم دارای الگوی حساسیت دارویی متفاوتی می باشند، شناسایی دقیق برای به کار گیری درمان صحیح ضروری است و نهایتا می تواند بر نتیجه درمان بیمار موثر باشد. در میان روش های مولکولی گوناگون استفاده از بررسی پلی مورفیسم حاصل از هضم آنزیمی محصول (PCR (PRAبر اساس ژن hsp65 به علت آسان بودن، سریع و ارزان بودن برای شناسایی ایزوله های پاتوژن مایکوباکتریومی تا سطح گونه ارجهیت دارد. تلفیقی از روش های فنوتیپیک و PRA بر اساس قطعه 441 جفت بازی از ژن hsp65 برای شناسایی تنوع گونه های ایزوله های بالینی مایکوباکتریومی مورد استفاده قرار گرفت.
سویه های مورد بررسی شامل 270 ایزوله های بالینی مایکوباکتریومی می شدند که از 2358 بیمار در دو آزمایشگاه مرجع جمع آوری شده بودند. تعداد 207 ایزوله متعلق به مایکوباکتریوم توبرکولوزیس به وسیله روش های فنوتیپیک رایج و PCR اختصاصی بر اساس شناسایی IS6110 تشخیص داده شدند. ایزوله های متعلق به مایکوباکتریوم های محیطی (NTM) با استفاده از تعدادی تست فنوتیپکی و PRA ژن hsp65 مورد شناسایی قرار گرفتند.
از تعداد 270 سویه بالینی تعداد 207 ایزوله با استفاده از روش های فنوتیپکی و PCR اختصاصی بر اساس IS6110، به عنوان مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شناخته شدند. سویه های NTM (63 ایزوله) تنوعی از گونه های مختلف شامل 12 ایزوله M. simiae، 9 ایزوله M. fortuitum، 5 ایزوله M. gordonae، 5 ایزوله M. abscessus، 5 ایزوله M. kansasii و گونه های کمیاب شامل 3 ایزوله M. massilainase، 3 ایزوله M. thermoresitbile، 2 ایزوله M. senegalense type 2، 1 ایزوله M. conceptionense type 1 یا M. senegalense type 1، 1 ایزوله M. phlei، 1 ایزوله M. chelonae، 1 ایزوله M. nonchromogenicum، 1 ایزوله M. genavense،1 ایزوله M. montefiorense یا M. triplex،1 ایزوله M. branderi، 1 ایزوله M. novocastrense، 1 ایزوله M. nebraskense،1 ایزوله M. lentiflavumو 1 ایزوله M. avium شدند.
این مطالعه نشان داده که تکنیک hsp65-PRA یک روش ساده، سریع و دقیق برای شناسایی ایزوله های بالینی NTM می باشد.