کلونینگ ژن PapG اشریشیاکلی یوروپاتوژن و بررسی تنوع توالی آن

اشریشیاکلی یوروپاتوژن، پاتوژن غالب در عفونت های ادراری می باشد. عفونت های دستگاه ادراری، یکی از شایع ترین عفونت‎های انسانی می باشد. با وجود آنتی ژن ها و توکسین های مختلف باکتری های دخالت کننده در ایجاد عفونت، یکی از عوامل مهم در عفونت های ناشی از اشریشیاکلی و سایر باکتری های گرم منفی، چسبیدن باکتری به سطح سلول میزبان می باشد، بنابراین مهار اتصال باکتری، راهکاری مناسب جهت مهار عفونت می باشد. با توجه به اینکه، پروتئین PapG به عنوان ادهسین عمل می نماید، کاندیدی مناسب برای تهیه واکسن می باشد.
DNA ژنومیک باکتری اشریشیاکلی سویه بالینی حاوی ژن II papG، استخراج گردید. با طراحی پرایمر برای ژن papG II، واکنش PCR انجام گرفت. محصول PCR در پلاسمید (SK-)pBluescript کلون گردید. با استفاده از نرم افزار ClustalW و MEGA4 توالی به دست آمده با توالی ژنی موجود در بانک ژن هم طراز گردید و تنوع ژنی آن بررسی گردید.
بر اساس این همطرازی، ناحیه N ترمینال در سطح پروتئین و DNA حفاظت شده می باشد.
ناحیه N ترمینال ژن PapG در بین سویه های بالینی یک توالی حفاظت شده است و می توان از آن برای طراحی واکسن علیه عفونت ادراری استفاده نمود