بررسی رابطه تاکسونومیکی ویروس موزاییک کوتولگی ذرت جدایه استان گلستان با سایر پوتی ویروس های غلات بر اساس ترادف نوکلئوتیدی ناحیه / 3 ژنوم

ویروس موزاییک کوتولگی ذرت (Maize Dwarf Mosaic Virus، MDMV) یکی از مهمترین و گسترده ترین پوتی ویروس-های ذرت در دنیا محسوب می شود. به منظور تعیین جایگاه تاکسونومیکی ویروس جدایه استان گلستان در میان پوتی ویروس های غلات و سایر سویه های MDMV و قرابت آن با سویه های سایر کشورها، گیاهان ذرت و قیاق با علائم موزاییک و کوتولگی در سال زراعی 1389 از مزارع استان گلستان جمع آوری شد. نمونه های آلوده به MDMV با آنتی سرم این ویروس در آزمون الایزای غیر مستقیم مشخص شد. نمونه آلوده به MDMV انتخاب و RNA ویروسی آن استخراج شده، سپس ناحیه /3 ژنوم آن با استفاده از آغازگرهای عمومی پوتی ویروس ها و اختصاصیMDMV به روش RT-PCR تکثیر و همسانه سازی شد. ترادف استنتاجی ناحیه CP-UTR، قطعه ای به طول 1107 نوکلئوتید بود. این ترادف با ترادف سایر جدایه های MDMV موجود در بانک ژن و نیز پوتی ویروس های دیگر غلات مورد مقایسه قرار گرفت و درخت فیلوژنتیکی حاصل از این ترادف ها به روش neighbor-joining بدست آمد. در این تجزیه فیلوژنتیکی، 46 ترادف در 6 گروه شامل SrMV، ZeMV، PenMV، JGMV، SCMV و MDMVقرار گرفت و جدایه گلستان در کنار جدایه ای از کشور بلغارستان گروه مشترکی تشکیل دادند. نتایج این آزمایش نشان می دهد احتمالا منشاء جدایه های MDMV در ایران کشورهای اروپایی یا بطور دقیق تر حوزه مدیترانه باشد