مقایسه توالی ژن DBAT، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، در گونه های سرخدار و قارچ های اندوفیت

هدف از این تحقیق، بررسی حضور ژن DBAT، یکی از ژن های کلیدی در مسیر بیوسنتزی تاکسول، در سرخدار (Taxus baccata) و قارچ اندوفیت مولد تاکسول آن و نیز بررسی میزان شباهت این توالی ها با توالی های موجود در بانک ژن بود.
در این تحقیق، قارچ های اندوفیت از پوست درخت سرخدار جداسازی و به روش نوک هیف خالص سازی شدند. DNA ژنومی درخت سرخدار و یکی از قارچ های مولد تاکسول (ایزوله T9) استخراج گردید. حضور ژن DBAT به وسیله واکنش زنجیره ای پلیمراز بررسی گردید. پس از توالی یابی، میزان شباهت توالی های به دست آمده از سرخدار و ایزوله T9 با توالی های سایر گونه های سرخدار و قارچ های اندوفیت، موجود در پایگاه بانک ژن، مقایسه شدند.
با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، یک قطعه bp 125 از ژن DBAT سرخدار و ایزوله T9 تکثیر گردید. هم ردیفی توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی قارچ و گیاه میزبان نشان داد که این توالی ها دارای شباهت بسیار بالایی (بیش از 98درصد) بودند. نتایج هم ردیفی این توالی ها با توالی های گونه های دیگر سرخدار و قارچ های اندوفیت، نیز شباهت بسیار بالایی (98 تا100 درصد) را نشان داد. همچنین، شباهت نسبتا بالایی در توالی نوکلئوتیدی و آمینواسیدی آنزیم DBAT و سایر آنزیم های آسیل و آروئیل ترانسفراز درگیر در مسیر بیوسنتزی تاکسول مشاهده شد.
براساس نتایج، حضور ژن DBAT در قارچ اندوفیت مولد تاکسول جداشده از سرخدار و همچنین شباهت بسیار بالا آن، در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی، با توالی بدست آمده از ژن DBAT میزبان (Taxus baccata) و توالی گونه های دیگر سرخدار و نیز قارچ های اندوفیت به اثبات رسید.