تعیین توالی در چند ناحیه ژنی (MLST): یک روش تایپینگ مولکولی با قدرت تمایز بسیار بالا جهت شناسایی گونه های کاندیدا آلبیکنس در مطالعات اپیدمیولوژیکی

گونه های کاندیدا مخمرهایی هستند که در همه جا یافت می شوند و به راحتی از محیط جدا می شوند. آن ها جزء پاتوژن های فرصت طلب انسان ها هستند. کاندیدیازیس در بیماران با ضعف سیستم ایمنی، نیازمند تشخیص و اقدام درمانی سریع می باشد. کاندیدا آلبیکنس بیشترین گونه جدا شده از این بیماران است. جهت پیشگیری از عفونت های بیمارستانی ناشی از کاندیدا آلبیکنس، تشخیص مولکولی آن ها برای درک بهتر اپیدمیولوژی این عفونت ها و اتخاذ استراتژی های پیشگیری مناسب، ضروری است. در یکی دو دهه اخیر، روش های تایپینگ مولکولی مختلفی برای کاندیدا آلبیکنس شرح داده شده است. یکی از این روش ها، تعیین توالی در چند ناحیه ژنی (MLST یا Multilocus sequence typing) است که برای مطالعات اپیدمیولوژیکی و جمعیتی، بسیار کاربرد دارد. MLST روشی با قدرت تمایز بسیار بالا متکی بر آنالیز پلی مورفیسم های نوکلئوتیدی در توالی های 7 ناحیه ژنی برای کاندیدا آلبیکنس است. توالی های به دست آمده از هر ناحیه ژنی به عنوان یک آلل و آلل های به دست آمده در هر ناحیه، در مجموع، یک سکانس تیپ (ST یا Sequence type) نامیده می شود. در این زمینه، پایگاه داده ها در سایت www.mlst.net قابل دسترس می باشد که با استفاده از نتایج تایپینگ گونه ها در این پایگاه، آنالیز داده ها انجام می گیرد. آنالیز تعداد زیادی کاندیدا آلبیکنس از میزبان های مختلف و مواضع بالینی متفاوت با روش MLST، باعث افزایش بینش محققان در اپیدمیولوژی عفونت های کاندیدایی کسب شده از بیمارستان به علاوه ساختار جمعیتی کاندیدا آلبیکنس می شود و الگوهای انتقال و تکامل کاندیدا آلبیکنس آشکار می گردد و به ارزیابی تنوع ژنتیکی و پویا شناسی جمعیت کاندیدا آلبیکنس، کمک می کند.