تعیین گروه فیلوژنی جدایه های مدفوعی باکتری اشریشیا کلی و بررسی مقایسه ای آن بین میزبان های مختلف

مطالعات فیلوژنی نشان داده اند که باکتری اشریشیا کلی (E. coli) از چهار گروه اصلی فیلوژنی A)، B1، B2 و (D تشکیل شده است. تعیین گروه های فیلوژنی دارای اهمیت کلینیکی می باشد چنان که گروه A و B1 عموما در ارتباط با سویه های کمنسال بوده در حالی که بیشتر جدایه های بیماریزای روده ای در گروه D طبقه بندی می شوند و گروه B2 مربوط به سویه های بیماریزای خارج روده ای می باشد. تعداد 100 سویه باکتری اشریشیا کلی جدا شده از نمونه های مدفوع سگ، طیور، نشخوارکنندگان (گوسفند، بز و گاو) و انسان تحت مطالعه فیلوژنی بر اساس روش triplex PCR و با استفاده از ترکیب سه مارکر ژنتیکی chuA، yjaA و قطعه TspE4.C2 از DNA قرار گرفت. بیشتر جدایه های جمع آوری شده متعلق به گروه(D (44% و سپس گروه(A (32% و(B2 (24% بودند. بر اساس منشاء نمونه، گروه های D، A و B2 به ترتیب دارای شیوع16.7%، 50% و 33/3% برای جدایه های سگ،52.8 %، 36.1% و 11/1% برای جدایه های طیور،41.2%، 29.4% و 29.4% برای جدایه های نشخوارکنندگان و 60.9%،8.7% و 30.4% برای جدایه های انسان بوده و هیچ کدام از سویه ها در میزبان های مورد مطالعه متعلق به گروه B1 نبوده اند. این مطالعه نشانگر وجود تفاوت مشخص در گروه ها و زیرگروه های فیلوژنی و مارکرهای ژنتیکی باکتری اشریشیا کلی در بین میزبان های مختلف مورد مطالعه می باشد.