Phylogenetic group determination of faecal Escherichia coli and comparative analysis among different hosts
Message:
Abstract:
Phylogenetic analysis has shown that Escherichia coli is composed of four main phylogenetic groups (A, B1, B2 and D). Characterization of phylogenetic groups is of clinical interest, as group A and B1 generally associated with commensals, whereas most enteropathogenic isolates are assigned to group D, and group B2 is associated with extra-intestinal pathotype. One hundred E. coli strains recovered from faecal samples of dog, chicken, ruminants (sheep, goat and cattle) and human were subjected to phylogenetic analysis based on triplex PCR method, according to a combination of three genetic markers chuA, yjaA and DNA fragment TspE4.C2. The majority of collected isolates belonged to group D (44%), followed by groups A (32%), and B2 (24%). By sample origin, groups D, A, and B2 were prevalent in 16.7, 50, and 33.3%, respectively for dog isolates; 52.8, 36.1, and 11.1% for chicken isolates; 41.2, 29.4, and 29.4% for ruminants isolates; and 60.9, 8.7, and 30.4% for human isolates, respectively and none of the strains among all the analysed hosts belong to group B1. This study suggests there was a significant difference in the E. coli phylogenetic groups, subgroups and genetic markers among the different hosts analysed.
Language:
English
Published:
Iranian Journal of Veterinary Research, Volume:15 Issue: 1, Winter 2014
Pages:
13 to 17
magiran.com/p1263558  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!