نسب شناسی ژنی برای قطعه توالی های افتراقی بیان شده Trichoderma harzianum در طول کلونیزه شدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه فرنگی

بعضی سویه های تریکودرما به عنوان عامل کنترل بیولوژیک علیه بیمارگرهای گیاهی استفاده شده اند. روش نمایش افتراقی تکثیر نسخه های معکوس mRNA (DDRT-PCR) استفاده شد تا ژن های متمایز بیان شده سویه T. harzianum T7 در طول مراحل کلونیزه شدن اسپرموسفر و سطح ریشه گوجه فرنگی ردیابی شود. تولیدات DDRT-PCR روی ژل آگارز تفکیک و 42 باند افتراقی برش خالص سازی، همسانه سازی و توالی یابی شد. قطعه توالی های بیان شده به دست آمده با استفاده از جست وجوی BLAST2GO به پایگاه اطلاعات NCBI معرفی و نسب شناسی ژنی آنها بررسی شد. اغلب قطعه توالی های بیان شده مرتبط با پروتئین های شناخته شده یا فرضی بود. این پروتئین ها مرتبط با گروه های کارکردی مختلف بودند و عمدتا در سوخت وساز، انتقال سیگنال درون و بین سلولی، برهم کنش با میزبان، انتقال پروتئین، ترجمه پروتئین ها، کنترل رشد و بقای سلولی، عادت به تغییرات محیطی، انتقال مولکول های زیستی بین هسته و سیتوپلاسم، تنظیم کارکرد پروتئین ها، تقسیم سلولی، تسریع در واکنش های آنالوگ، تعمیر مولکول های آسیب دیده DNA و دیگر کارکردهای حیاتی در موجودات مختلف نقش داشتند. بعضی قطعه توالی های بیان شده ردیابی شده در این مطالعه مرتبط با ژن هایی بودند که آنزیم های درگیر در تامین غذایی تریکودرما را در زیستگاه شان کد می کنند.