همسانه سازی مولکولی ترادف رمزکننده ژن H+- ATPase غشای پلاسمایی در گراس شورزی Aeluropus littoralis

پمپ پروتونی H+-ATPase یکی از پروتئین های مهم موجود در غشای پلاسمایی گیاهان می باشد که نقش مهمی در فیزیولوژی مولکولی پاسخ به تنش ایفاء می کند. گراس Aeluropus littoralis بواسطه مقاومت به برخی از استرس های محیطی مثل تنش شوری و عناصر سنگین مدل خوبی برای مطالعه ساختار و عملکرد این پمپ می باشد. در این مطالعه بعنوان نقطه آغاز، ترادف کامل ناحیه کدکننده این ژن در هالوفیت Aeluropus littoralis شناسایی و همسانه سازی شد. اطلاعات اولیه بدست آمده نشان می دهد ترادف نوکلئوتیدی پمپ پروتونی H+-ATPase غشای پلاسمایی یک ناحیه ORF کامل بطول bp 2856 می باشد که همولوژی معنی داری با گونه های Sorghum bicolor، Oryza sativa و Zea mays دارد. همچنین ترادف آمینواسیدی این ژن، پپتیدی با وزن مولکولی 104567 دالتون متشکل از 951 اسیدآمینه را رمز می کند که از نظر نوع و ساختار دامین، بیشترین تطابق را با پروتئین های H+-ATPase غشای پلاسمایی گیاهی و قارچی نوع سوم (type III) از خانواده بزرگ پمپ های ATPase p-type دارد. همردیفی مقایسه ای ترادف آمینواسیدی ژن H+-ATPase غشای پلاسمایی گیاه Aeluropus littoralis (Alha) برخی گونه ها نشان می دهد که جایگزینی های نوکلئوتیدی نقاط حساس و عملکردی پروتئین را هدف قرار نداده و این مناطق در توالی مورد بررسی، حفاظت شده باقی مانده اند. در نهایت این ترادف با شماره دسترسیGI:346230720 در پایگاه داده NCBI ثبت گردید.