تنوع ژنتیکی و آنالیز فیلوژنتیکی زنجیره سبک ایمونوگلوبولینY در مرغهای بومی خراسان

ایمنوگلوبولینY که همولوگ ایمونوگلوبولین G در پستانداران می باشد، دارای 4 زنجیره پلی پپتیدی حاوی دو زنجیره سبک و دو زنجیره سنگین است. شاخه سبک ایمونوگلوبولینY درپرندگان یک ناحیه متغیر و یک ناحیه ثابت را دارا می باشد. ساختمان ناحیه ثابت مشخصه یک کلاس یا زیر کلاس ایمونوگلوبولین ها و ناحیه متغیر مخصوصا قطعات CDR بیشترین نقش را در متصل شدن با انتی ژن دارند. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی و آنالیز فیلوژنتیکی ژن های کد کننده شاخه سبک ایمونوگلوبولین Y در مرغ های بومی خراسان در سطح mRNA می باشد. بدین منظور 20 نمونه طحال از مرغ های غیر خویشاوند بومی خراسان جمع آوری شد. پس از استخراج mRNA و تولید cDNA از طریق رونویسی معکوس، تکثیر قطعه 764 جفت بازی زنجیره سبک IgY توسط آغازگرهای اختصاصی و با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز انجام پذیرفت. بعد از توالی یابی، بررسی جهش ها در نواحی متغیر و ثابت انجام پذیرفت. نتایج حاکی از این بود که نواحی CDR3 دارای بیشترین تنوع و نواحی C کمترین تنوع را داشتند. همچنین نتایج آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد، که مرغ بومی خراسان از نظر ژن کد کننده شاخه سبک ایمونوگلوبولینY در بین گونه هایی که دارای این نوع ایمونوگلوبولین هستند کمترین فاصله ژنتیکی را با مرغ لگهورن سفید و مرغ لگهورن فرانسه دارد. همچنین بررسی اسیدامینه ای و تعیین جایگاهای فعال جهت تشکیل ساختارثانویه، نشان داد که نواحی ثابت 4 جایگاه فعال برای تشکیل ساختار ثانویه مارپیچ الفا را دارند ولی در مقابل، نواحی متغیر هیچ جایگاهی برای تشکیل این ساختار را ندارند. این مطالعه برای اولین بار تنوع ژنتیکی مرغ های بومی خراسان را بر اساس درخت تبار شناسی نشان می دهد.