پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گاومیش های خوزستانی و مازندرانی

شناسایی مناطق ژنومی که هدف انتخاب بوده اند، از بحث برانگیزترین مباحث در حوزه تحقیقات ژنتیک حیوانی، به خصوص در حیوانات اهلی است. در این مطالعه، پویش کل ژنوم برای شناسایی مناطقی از ژنوم که در گاومیش های خوزستانی و مازندرانی هدف انتخاب های طبیعی یا مصنوعی قرار گرفته اند، اجرا شده است. بدین منظور 148 راس گاومیش رودخانه ای شامل جمعیت های خوزستانی (121 راس) و مازندرانی (27 راس)، به وسیله آرایه های ژنومیکی Axiom® Buffalo Genotyping 90K تعیین ژنوتیپ شدند. جهت جستجوی نشانه های انتخاب از برآوردگر نااریب (FST (θ استفاده شد. در مجموع 23 منطقه که نشانگرهای SNP آن ها بالاتر از 1/0 درصد حد بالای توزیع تجربی FST بود، به عنوان نشانه های انتخاب شناسایی شده و مورد بررسی های بیشتر قرار گرفتند. بعد از انطباق مناطق ژنومی انتخاب شده با مناطق ژنومی متناظر آن روی ژنوم گاو UMD3.1 Bos Taurus Genome)، 64) ژن و 27 QTL شناسایی شد. تعدادی از این ژن ها در مطالعات قبلی نیز به عنوان نشانه های انتخاب گزارش شده اند. برخی از این ژن ها احتمالا در مسیرهای بیولوژیکی که با اهلی شدن حیوانات (توسعه مغز و عملکردهای رفتاری، پیگماسیون و آداپته شدن به محیط زندگی و شرایط جغرافیایی) و تولید شیر مرتبط می باشند، درگیرند. بررسی ها همچنین نشان داد که QTLهای شناسایی شده در این تحقیق با صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با راندمان تبدیل غذایی، وزن بدن، چربی زیرپوستی، افزایش وزن روزانه، تیپ، تردی گوشت، ترکیبات شیر، اتصالات پستانی، اندازه گوساله و گوساله زایی آسان ارتباط دارند. به هرحال جهت شناسایی نقش دقیق این ژن ها و QTLها لازم است مطالعات پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام گیرد.