انگشت نگاری و ارزیابی تنوع ژنتیکی ارقام برنج با استفاده از نشانگر (ISSR (Inter Simple Sequence Repeat

برنج به عنوان یکی از مهمترین محصولات کشاورزی دارای پتانسیلی بالقوه جهت مبارزه با فقر و تامین امنیت غذایی در جهان است. در این مطالعه به منظور بدست آوردن اطلاعات پایه در برنامه های اصلاحی برنج از مارکر Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) برای انگشت نگاری و تعیین روابط خویشاوندی بین 32 رقم برنج استفاده شد. از میان 17 پرایمر استفاده شده 12 پرایمر، 184 قطعه ی مجزا و تکرارپذیر با پلیمرفیسم 88% را تکثیر کردند و از این بین 29 لوکوس که دارای بیشترین میزان پلیمرفیسم بودند جهت انگشت نگاری ارقام انتخاب شدند. نتایج بدست آمده نشان داد که میزان شباهت ارقام مابین 39% -88.4% و مقدار PIC با میانگین 23% مابین 0.1 (برای پرایمر 3#) تا 0.34 (برای پرایمر 2#) متغیر است. خوشه بندی براساس ضریب Jaccard و الگوریتم UPGMA ارقام را به شش گروه در نقطه ی برش 64% تقسیم کرد که دو رقم ایتالیایی Ribe و Roma کمترین فاصله ی ژنتیکی و ارقام Vialonenano و Anbar Bou بیشترین فاصله ی ژنتیکی را نسبت به یکدیگر نشان دادند. در کل بررسی روابط ژنتیکی با استفاده از مارکر ISSR تنوع بالایی میان ارقام مورد مطالعه نشان داد و پرایمرهای واجد تکرارهای GA بیشترین تعداد باندهای حاصل از تکثیر لوکوس ها را به خود اختصاص دادند که بیانگر فراوانی موتیفی بیشتر این تکرارها در ژنوم گیاه برنج است. نتایج بدست آمده از ماتریکس تشابه و آنالیز خوشه اینشان داد که که رقم عنبربو دارای بیشترین فاصله ی ژنتیکی در مقایسه با سایر ارقام مورد بررسی است و می تواند به عنوان والد در برنامه های اصلاحی مورد استفاده قرار گیرد. نتایج بدست آمده از این تحقیق می تواند به عنوان مارکری ژنتیکی جهت شناسایی ارقام برنج و منبعی برای تحقیقات آینده با هدف بهبود و اصلاح ارقام برنج باشد.