PHYLOGENETIC ANALYSIS AMONG FOUR SECTIONS OF GENUS DENDROBIUM SW. (ORCHIDACEAE) BASED ON LOW COPY NUCLEAR GENE (XDH) SEQUENCES IN PENINSULAR MALAYSIA
Author(s):
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:

The present study focused on the molecular phylogeny of the four sections (Aporum, Crumenata, Strongyle, and Bolbidium) of genus Dendrobium SW. (Orchidaceae) based upon low copy nuclear gene, Xanthine Dehydrogenase (Xdh) sequences using maximum parsimony (MP), maximum likelihood (ML) and Bayesian (BI) methods. Single and low copy nuclear genes have been increasingly used in phylogenetic reconstruction because they contain large amounts of genetic information and are biparentally inherited. Classifications based on morphological characters have not been able to clearly divide these four sections and neither do they support their monophyletic origins. Therefore, detailed analysis using molecular data is required to ascertain their status. This study includes 20 species of genus Dendrobium and 2 species from genus Bulbophyllum (section Sestochilus) as outgroup taxa. According to the results, the aligned sequences consisted of 733 nucleotide characters of which 131characters were parsimony informative. The analysis revealed that the nuclear genes can be reliable marker for the phylogenetic study of genus Dendrobium. The results suggested that the four sections are probably best considered as one section instead of four and based on the International code of Botanical Nomenclature (ICBN) rules can be named as section Aporum for this new classification.

Language:
English
Published:
The Iranian Journal of Botany, Volume:21 Issue: 2, Summer and Autumn 2015
Pages:
169 to 178
magiran.com/p1494799  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!