تعیین توالی و آنالیز مقایسه ای ژنهای فلاژلین FliA و FliB در جدایه های گاوی کلستریدیوم شوای

کلستریدیوم شوای عامل شاربن علامتی است که بعنوان یک عفونت درون زا در گاو شناخته شده است. فلاژلین (liC) بعنوان عامل اصلی در ایجاد ایمنیت حفاظتی در دام ها علیه عفونت های کلستریدیایی نقش دارد. کلستریدیوم شوای دو کپی از ژن فلاژلین ( fliC) که fliA و fliB نامیده می شوند را دارا می باشد. تعیین توالی و آنالیز نوکلئوتیدی هر دو کپی ژن fliC در سویه واکسینال و جدایه های فیلدی کلستریدیوم شوای هدف این مطالعه بوده است.
شش پرایمراختصاصی برای تکثیر ژن فلاژلین و دو کپی آن با استفاده از نرم افزار الیگو طراحی گردید. واکنش زنجیره ای پلیمراز به منظور تکثیر یک قطعه 700 جفت بازی برای هر دو ژن fliA و fliB بکار گرفته شد. درصد تشابه و اختلاف نوکلئوتیدی بین جدایه ها با استفاده از نرم افزارهای BLAST و MegAlign محاسبه گردید.
یافته های آنالیز توالی های نوکلئوتیدی نشان داد که میزان تنوع در ژن fliB بیشتر از fliA می باشد. شش ناحیه کاملا حفاظت شده، سی و یک تغییر تک نوکلئوتیدی، سیزده اختلاف اسید آمینه ای در ژن fliC جدایه های ایرانی کلستریدیوم شوای شناسایی گردید. مقایسه توالی نوکلئوتیدین های fliA و fliB، نشان داد که قرابت سویه واکسینال با جدایه های فیلدی به ترتیب 3/97 و 2/98٪ می باشد.
نتیجه گیری نهایی: کپی های ژن fliC بعنوان مارکر های خیلی مناسب برای مطالعات اپیدمیولوزیک و شناسایی تنوع در جدایه های کلستریدیوم شوای شناخته شد. وجود تنوع ژنتیکی در بین دو آلل ژن fliC برای اولین بار از ایران گزارش می شود. علی رغم وجود تفاوت های ژنتیکی مذکور، آزمایش ایمنیت متقاطع قدرت حفاظت واکسن تهیه شده از سویه بومی (توسط موسسه رازی) را در چالنج با سویه های همولوگ و هترولوگ نشان داد.