پلی اتیلن گلیکول 200 (PEG 200) بعنوان روش سریع و ارزان جهت استخراج DNA از برخی باکتری های گرم مثبت و گرم منفی

به طور کلی استخراج DNA از باکتری های گرم مثبت بسیار مشکل و پرهزینه است. هدف از این مطالعه استفاده از پلی اتیلن گلیکول 200 به منظور استخراج DNA از باکتری گرم مثبت لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و باکتری گرم منفی سودوموناس آئروژینوزا و انجام PCR روی آنها به منظور جست وجو به ترتیب برای ژن های Lacto و ExoA بود.
در این مطالعه سویه استاندارد باکتری گرم مثبت لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و باکتری گرم منفی سودوموناس آئروژینوزا به ترتیب بر روی محیط کشت MRS آگار و مولرهینتون آگار کشت داده شدند. سپس کلونی باکتری در بافر TE حل شد و با استفاده از PEG 200 استخراج DNA انجام شد. واکنش PCR بر روی ژن های Lacto (اختصاصی لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس) و ExoA (سودوموناس آئروژینوزا) اختصاصی هر ارگانیسم انجام شد.
PCR روی ژن های انتخاب شده برای هر ارگانیسم انجام و وجود ژن های Lacto با اندازه 231bp برای سویه استاندارد لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس و سویه لاکتوباسیلوس اسیدوفیلوس جداشده از لبنیات و ExoA با اندازه 396bp برای سویه استاندارد سودوموناس آئروژینوزا و سویه های بالینی سودوموناس آئروژینوزا روی ژل آگارز مشاهده شد.
از آنجایی که استخراج DNA از باکتری های گرم مثبت به دلیل داشتن دیواره بسیار محکم مشکل است، استفاده از PEG 200 می تواند روش بسیار مناسب، مقرون به صرفه و بسیار سریع و در دسترس برای استخراج DNA از باکتری های گرم مثبت باشد. علاوه بر این، با استفاده از این روش می توان به آسانی DNA باکتری های گرم منفی و قارچ ها را نیز استخراج نمود.