بررسی اپی توپ های خطی ایمونوژن ایمونوگلوبولین G انسان به روش ایمونوانفورماتیک

ایمونوگلوبولین G (IgG) فراوانترین آنتی بادی سرم و مایعات خارج سلولی بوده و سطح IgG سرم با شدت بیماری هایی مثل نقائص ایمنی، عفونتها و بیماری های خود ایمنی ارتباط دارد. لذا IgG ارزش تشخیصی بالایی دارد. ایمونوانفورماتیک، شاخه ای از علم ایمونولوژی است که با استفاده از اطلاعات زیستی در کامپیوتر به حل مسائل ایمونولوژیک، فهم بهتر پاسخهای ایمنی وتشخیص دقیق تر بیماری ها کمک می کند. این پژوهش با هدف تعیین اپی توپهای ایمونوژن خطی IgG انسان با استفاده از ایمونوانفورماتیک انجام شد.
توالی و ساختار سوم IgG مرجع انسان در پایگاه داده PDB، ساختار دوم آن توسط نرم افزار Phyre2 و اپی توپهای خطی آن توسط نرم افزارهای Ellipro و IEDB تعیین شدند.
مهمترین اپی توپهای خطی IgG انسان توسط نرم افزار IEDB در ناحیه بین اسید آمینه های 160 تا 175 در زنجیره سبک و 350 تا 360 در زنجیره سنگین معرفی شدند. 11 اپی توپ خطی توسط نرم افزار Ellipro در دومینهای ثابت IgG انسان ( یکی در ناحیه اتصالی به آنتی ژن (Fab) و 10 اپی توپ دیگر در ناحیه ثابت (Fc) در دومینهای ثابت 2 و 3 زنجیره سنگین (CH2 و (CH3 با توزیع مساوی( معرفی شد. شاخص ترین اپی توپها (5 عدد) در دومین CH3 واقع شده ند.
در این مطالعه تعداد قابل توجهی از اپی توپهای خطی IgG انسان شناسایی شدند. مطالعات آزمایشگاهی قبلی در این زمینه، تایید کننده این نتایج هستند. اپی توپهای تعیین شده ابزار مناسبی جهت تولید آنتی بادی های مونوکلونال اختصاصی IgG، تعیین نقشه اپی توپهای IgG و مطالعات فیلوژنیک می باشند.