شناسایی ژن های تنظیم کننده سیستم ایمنی با استفاده از داده های RNA-Seq لوکوسیت گاو

بررسی شبکه های ژنی از جمله مطالعاتی است که بر روی داده های توالی یابی رونوشت سلولی انجام می شود. مطالعه حاضر با بررسی شبکه ژنی داده های رونوشت سلول های لوکوسیت گاوی، سعی بر شناسایی ژن های م‍وثر بر سیستم ایمنی و فعالیت سلول های لوکوسیت دارد. در این مطالعه پس از شناسایی ژن ها و ایزوفرم های مختلف و اندازه گیری سطح بیان آن ها، شبکه ژنی با بسته آماری GeneNet که مرتبط با نرم افزار R می باشد، مورد مطالعه قرار گرفت. ژن هایی که به عنوان تنظیم کننده در این شبکه ی ژنی به آن ها پرداخته شده است غالبا بر فرآیندهای مختلفی نظیر مسیرهای سیگنال دهی مرتبط با فعالیت لوکوسیت ها، نابودی سلولی و عفونت ها، پلاریزه شدن ماکروفاژ، مهاجرت لوکوسیت ها و کموتاکسیس و فاگوسیتوز در نوتروفیل ها موثرند. با وجود این که عملکرد تعدادی از این ژن ها هنوز به خوبی شناسایی نشده است ولی با توجه به نقش اصلی این ژن ها در شبکه ژنی، احتمال می رود با بررسی پلی مورفیسم این ژن ها و ارتباط آلل های مختلف آنان با پاسخ های ایمنی، بهترین آلل ها شناسایی شده و در انتخاب دام ها به کمک ژن ها، طراحی ریز آرایه و انتخاب ژنومی از آن ها استفاده شود.