The structure of Genetic Diversity of Pistacia atlantica subsp. mutica Revealed by RAPD-PCR Molecular Markers
Abstract:
Pistacia atlantica subsp. mutica is one of the most valuable forest tree species in Iran that has been severely exploited for a long time. Therefore, understanding the genetic diversity of different populations can be an important step towards the development and restoration of the habitat of this invaluable tree species. In this study, in order to study the genetic diversity, 10 populations including 59 genotypes via 13 RAPD primers, totally 97 alleles were generated with an average of 7.46 alleles per primer that 100% alleles were polymorphic. Polymorphic information content (PIC) varied from 0.11 (primer Oligo342) to 0.21 (primer Oligo18). Marker index criterion ranged from 0.39 (primer Oligo203) to 4.35 (primer Oligo342). Abdanan population indicated the highest value of polymorphic alleles (57.73 %) and Shannons index (0.251) and the highest value of unbiased expected heterozygosity index (0.172) was observed for the Banaeh population. Whereas the lowest value of polymorphic alleles (13.40 %), unbiased expected heterozygosity (0.074) and Shannons index (0.081) were observed for out of Zagros population. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed that a larger proportion of genetic variation (78%) belonged to intra-populations, while 22% of genetic variation was observed for inter-populations. Cluster Analysis could not completely separate samples and showed the lack of association between molecular diversity and geographic diversity populations. The genetic diversity among the evaluated samples can be promising for restoring the habitats of P. atlantica.
Keywords:
AMOVA , He Index , P. atlantica , genetic diversity , PCO , RAPD , PCR
Language:
Persian
Published:
Journal of Forest and Wood Products, Volume:69 Issue: 2, 2016
Pages:
237 to 248
magiran.com/p1603244
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!