تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلئوکپسید ویروس برونشیت عفونی پرندگان جدا شده از گله های گوشتی در سالهای 1393-1394

برونشیت عفونی یک بیماری مهم از نظر اقتصادی در ماکیان بوده که به دلیل ظهور ژنوتیپ های جدید ویروس برونشیت عفونی، کنترل این بیماری بعنوان یک مشکل جدی در صنعت طیور در دنیا مطرح است و پیش از این، مطالعه جامعی برروری این ژن بر روی ژنوتیپ های سال های اخیر مختلف کشور انجام نگردیده بود.
لزوم از انجام این مطالعه تعیین هویت مولکولی و شجره شناسی بر اساس ژن نوکلئوکپسید ویروس برونشیت عفونی جدا شده از گله های گوشتی ایران در سال های 1393-1394 می باشد.
در این بررسی ژن نوکلئو کپسید ده جدایه از چهار نوع ژنوتیپ متفاوت ویروس برونشیت عفونی با استفاده از پرایمر های اختصاصی تکثیر و با نرم افزار های مناسب شجره شناسی و تعیین ساختار مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند.
از نظر شجره شناسی ویروس های برونشیت عفونی گروه ماساچوست، QX و 793/B در گروه خود قرار گرفتند و ژنوتیپ ویروس واریانت 2 در کنار سایر ویروس های جدا شده از ایران قرار داشتند. در صد تشابه بر اساس اسید آمینه، بین سویه های مختلف مورد مطالعه بین 97/89 تا 75/99٪ تشابه وجود داشت. بیشترین تشابه بین دو ژنوتیپ IBKG-1و IBKG-8 مورد مطالعه در گروه 793/B و کمترین تشابه بین دو ژنوتیپ QX و واریانت 2 (ویروس های IBKG-5 و IBKG-9) بوده، که این میزان تفاوت برای ژن نوکلئوکپسید (محافظت شده) نسبتا بالا می باشد. بررسی بیوانفورماتیک نشان داد که پروتئین در این ویروس ها بین 6 تا 7 صفحه بتا و بین 8 تا 10 مارپیچ آلفا دارند.
نتیجه گیری نهایی: نتایج حاصل از این مطالعه می تواند اطلاعات مناسبی در زمینه استفاده از اطلاعات این پروتیئن در تولید پروتئین های نو ترکیب جهت تولید کیت های الایزا و روش های تشخیص سریع، واکسن های نو ترکیب و همچنین اپیدمیولوژی مولکولی این بیماری ویروسی مهم در کشور نماید.