مطالعه برهم کنش های نانو موتورهای عملکردی و پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا به عنوان استراتژی نوین ضد آلزایمر توسط مدل سازی و شبیه سازی رایانه ای

در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت.
در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده NCBI به دست آمده و سپس شبیه سازی با استفاده از نرم افزارDesigner Ascalaph انجام شد. 15 پپتید با ساختار های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به مرحله شبیه سازی انتخاب و سپس با استفاده از نرم افزار HyperChem، به مدت 30.000 پیکو ثانیه پپتیدها در مجاورت نانوموتور های بیست الکله، هایپرسینی و رتینولی سنتز شده قرار داده شدند. سرانجام 4 پارامتر؛ انرژی آزاد، انرژی بین مولکولی، پتانسیل و مجذور مربع اختلاف مقادیر، از نرم افزار استخراج و نسبت تغییرات آن ها محاسبه گردید.
هر نانوموتوری نسبت به پپتیدهای متفاوت دارای عملکردی متفاوت است. نانوموتور هایپرسینی بر پپتید 5، نانوموتور رتینولی بر پپتید 10 و نانوموتور بیست الکل نیز تا حدودی بر روی پپتید 4 بهترین عملکرد را داشتند. اما چون هر نانوموتوری تنها بر روی پپتید موتانتی خاص تاثیرگذار است و آلزایمر ناشی از موتاسیون های مختلف می باشد، نمی توان برای درمان آلزایمر تنها از یک نوع نانوموتور بهره برد.
می توان نتیجه گرفت که در تحقیقات درمانی آلزایمر با در نظر گرفتن ساختار سه بعدی و پارامتر های دینامیکی، نانوموتور رتینولی بر روی پپتید موتانت ترانس ممبرن بسیار ایده آل بوده و می تواند راهکار درمانی مناسبی باشد.