مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با DNA استخراج شده توس کیت برای ردیابی ژن هایOPrL، ExoA، algDدر ایزوله های بالینی سودوموناس آئروژینوزا

سودوموناس آئروژینوزا، یکی از رایج ترین عوامل عفونت های بیمارستانی محسوب می شود. بیشتر آزمایشگاه ها به طور معمول برای شناسایی سودوموناس آئروژینوزا، از روش کشت و تست های بیوشیمیایی مختلف استفاده می کنند که روشی وقت گیر بوده و در برخی موارد دارای نتایج مثبت و منفی کاذب می باشد. هدف از انجام این پژوهش مقایسه دو روش مولکولی PCR با استفاده از DNA استخراج شده با کیت و PCR با استفاده از کلنی مستقیم در تشخیص ایزوله های سودوموناس آئروژینوزا بود.
در این مطالعه توصیفی – تحلیلی، از 395 ایزوله بالینی مختلف، 85 ایزوله با تست های بیوشیمیایی اولیه و کشت بر روی محیط های اختصاصی سودوموناس آئروژینوزا تشخیص داده شدند. سپس با استفاده از ژن های OPrL،ExoA ، algD با دو روش مولکولی PCR مستقیم و PCR با استفاده از DNA استخراج شده با کیت، مورد ارزیابی قرار گرفتند.
از مجموع 85 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا که به روش فنوتیپی، غربالگری شده بودند، 81 ایزوله به روش PCR با استفاده از DNA استخراج شده با کیت، حاوی ژن های OPrL، ExoA، algD (با طول نوکلئوتیدهای 504، 396 و 526 جفت باز) و80 ایزوله نیز به روش PCR مستقیم، دارای ژن های مذکور بودند.
نتایج این تحقیق نشان داد بدون استفاده از کیت های استخراج می توان به نتایج تشخیصی قابل قبول در شناسایی سودوموناس آئروزینوزا دست یافت. از طرفی، در نتایج به دست آمده می توان خطای روش های تشخیصی فنوتیپی سودوموناس آئروژینوزا را مشاهده کرد.