بررسی فیلوژنتیکی جدایه های جدید ایرانی ویروس بادنای یک انجیر بر اساس ترادف ژن پروتئین حرکتی

بیماری موزائیک انجیر گسترش جهانی دارد و به عنوان شایع ترین بیماری ویروسی در انجیر شناخته می شود. یکی از مهمترین ویروس هایی که در این بیماری نقش دارد، ویروس بادنای یک انجیر (FBV-1) می باشد. در تحقیق حاضر، روابط فیلوژنتیکی بین جدایه های ایرانی و سایر جدایه های گزارش شده از این ویروس مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن رمز کننده پروتئین حرکتی ویروس، قطعه ی مورد انتظار به اندازه تقریبی 1090 جفت باز از ژنوم ویروس تکثیر شد. قطعه ژنی 12 جدایه در پلاسمید pTZ57R/T همسانه و تعیین توالی شد. ترادف های به دست آمده با ترادف-های موجود در بانک ژن مقایسه و پس از همردیف سازی چندگانه، درخت فیلوژنتیکی بر اساس ژن پروتئین حرکتی FBV-1 ترسیم شد. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایه های FBV-1 در دو گروه متمایز دسته بندی شدند و جدایه های ایرانی در دو زیرگروه با 99% مشابهت نوکلئوتیدی در گروه اول قرار گرفتند. در بررسی تبارزایی بر مبنای توالی اسید آمینه ای، جدایه های مورد بررسی در سه گروه با 99-98 % مشابهت قرار گرفتند. جدایه های ایرانی از تنوع ژنتیکی پایین تری در مقایسه با جدایه های آمریکایی برخوردار بودند و شرایط جغرافیایی در تنوع ژنتیکی جدایه های موجود تاثیر داشت.