بررسی ترنسکریپتوم و تخمین بیان ایزوفرم های سه ژن از مسیر پیام رسانی PI3K و FGFR در سرطان مثانه

پیرایش متناوب غیرمعمول در سلول های سرطانی، شایع بوده و ایزوفرم های حاصل می توانند به عنوان بیومارکر و یا هدف درمانی برای طراحی دارو مورد استفاده قرار گیرند. شناسایی ایزوفرم ها، جهت توسعه استراتژی های درمانی سرطان حایز اهمیت می باشد. هدف این مطالعه شناسایی ایزوفرم ها و بیان 3 ژن PIK3CA، FGFR3 و FGFR1 با استفاده از فناوری جدید تعیین توالی RNA و Real-Time PCR در سرطان مثانه بود.
در این مطالعه مقطعی، که در بازه زمانی شهریور 1393 تا مهر 1395 در مرکز تحقیقات اورولوژی دانشگاه علوم پزشکی تهران انجام گرفت. 30 نمونه بافت تازه تومور و 30 نمونه بافت نرمال مجاور تومور در فاصله مناسب، از افراد مبتلا به سرطان مثانه تهیه شد. RNA از بافت ها استخراج و پس از بررسی کمی و کیفی و ساخت کتابخانه cDNA، تعیین توالی RNA انجام و داده های حاصله توسط نرم افزارهای مربوطه آنالیز گردید.
ایزوفرم های هر سه ژن در بافت نرمال و تومور از لحاظ تعداد و الگوی بیان تفاوت نشان دادند. ژن PIK3CA در بافت نرمال یک رونوشت و در بافت سرطانی سه ایزوفرم، ژن FGFR3 و FGFR1 در بافت تومور به ترتیب 6 و 12 و در بافت نرمال 7 و 9 رونوشت داشتند. افزایش بیان ژن (0/01P=)FGFR3 و کاهش بیان ژن (0/01P=) FGFR1 معنادار بود.
پیرایش متناوب غیرمعمول در سلول های سرطانی مثانه منجر به ایجاد ایزوفرم هایی گردید که بعضی از آن ها در سلول های نرمال وجود نداشته و یا میزان بیان متفاوتی داشتند و به عنوان هدف درمانی و یا مارکر تشخیصی در مطالعات آتی قابل استفاده می باشند.