مقایسه پلی مورفیسم ژنومی و ارتباط ژنتیکی سویه های بالینی سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم در استان کرمان به روش ERIC- PCR و Box-PCR

سالمونلا از مهم ترین عوامل ایجادکننده گاستروانتریت در انسان هستند. سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم علاوه بر انسان، میزبان های زیادی داشته و امکان شیوع آن در جامعه بالاست. هدف از انجام این مطالعه، ارزیابی تنوع ژنتیکی سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم جدا شده از نمونه مدفوع انسانی توسط هر دو روش ERIC-PCR و BOX-PCR می باشد.
در این مطالعه مقطعی، 60 سویه سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم از نمونه مدفوع انسانی به دست آمد. تمامی سویه ها با استفاده از آزمون های استاندارد میکروبیولوژیکی و بیوشیمیایی تایید شدند. سپس، ERIC-PCR و BOX-PCR برای تعیین تنوع ژنتیکی سویه های سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم با پرایمرهای اختصاصی انجام گردید.
تفکیک پلی مورفیسم 60 ایزوله سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم با استفاده از روش های ERIC1، ERIC2 و BOXAIR انجام گردید. در الکتروفورز 11-2 باند با اندازه 3200-20 باز برای ERIC-PCR و 10-2 باند با اندازه 1500-200 باز برای BOX-PCR مشاهده شد؛ بنابراین، 13 کلاستر مختلف (C1-C13) در ERIC-PCR و 21 کلاستر مختلف در BOX-PCR شناسایی شد.
نتایج نشان داد که گونه های سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم گونه های غیر هومولوگ بودند؛ بنابراین، روش های ERIC-PCR و BOX-PCR روش مناسبی برای تایپ بندی مولکولی سویه های سالمونلا و تشخیص گسترش منبع عفونت برای بررسی اپیدمیولوژیک و برنامه پیشگیری از عفونت هستند.