آنالیز بیان افتراقی ژن ها در پاسخ به عصاره لیپوپلی ساکاریدی ازباکتری اشیرشیاکولای در سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاوی

لیپو پلی ساکارید1(LPS)، بخشی از ساختار غشای بیرونی باکتری های گرم منفی است که در فرآیند های پاتوژنی که منجر به ورم پستان و التهاب رحم در گاوهای شیری می شود، دخالت دارد. هم چنین LPS باعث التهاب اندومتریوم و شکست لانه گزینی در بسیاری از گونه های حیوانی می شود. باتوجه به اهمیت اقتصادی این بیماری ها در صنعت گاو شیری، آنالیز بیان افتراقی ژن ها و شناسایی مسیرهای مرتبط در پاسخ به عصاره لیپوپلی ساکاریدی از باکتری اشیرشیا کولای با استفاده از آنالیز ترانسکریپتوم برای فهم مکانیسم دقیق این فرآیند بسیار حیاتی و ضروری است. در این پژوهش، بعد از مراحل جداسازی و تیمار سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاو با دوزهای مختلفی ازLPS (صفر، 2 و 8 میلی گرم بر میلی لیتر) در محیط کشت، RNA کل استخراج و برای تهیه کتابخانه ترانسکریپتومی مورد استفاده قرار گرفت. در مجموع 12 کتابخانه ترانسکریپتومی از سه گاو قرمز سوئدی (4 نمونه به ازای هر راس گاو) توسط تکنولوژی با توان عملیاتی بالا تعیین توالی و آنالیز بیان افتراقی ژن ها و هم چنین مسیرهای بیولوژیکی مرتبط مورد شناسایی قرار گرفتند. نتایج این پژوهش نشان داد در مجموع 2035 ژن در بین گروه های شاهد و تیمار شده با LPS دارای بیان متفاوت بوده که تعداد 752 ژن در مسیر تکثیر و مرگ سلولی نقش داشتند. هم چنین نتایج شمارش سلول های اپی تلیال نشان داد که عصاره لیپوپلی ساکاریدی توانست به طور معنی داری باعث افزایش تکثیر سلولی شود. آنالیز مسیرهای بیولوژیکی نشان داد که این ژن ها در تعدادی از مسیرهای سیگنالی از جمله سیستم ایمنی شامل مسیر سیگنالی Toll-Like Receptor، T Cell Receptor، MAPK، شیموکین ها، سرطان اندومتریوم رحمی و هم چنین مسیر سیگنالی مرگ و تکثیر سلولی دخالت دارند. طبق اطلاعات ما این مطالعه، نخستین تحقیقی است که روی سلول های اپی تلیال اندومتریوم گاوی انجام شده است که می تواند درک ما را در ارتباط با مکانیسم های مرتبط به التهاب های ناشی از عفونت های رحمی در گاو شیری افزایش دهد.