صحت انتخاب ژنومی روش های پارامتری و ناپارامتری با معماری های ژنتیکی افزایشی و غالبیت
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
در بیشتر مطالعات پیش بینی ژنومی برای برآورد ارزش اصلاحی ژنومی فقط از اثرات افزایشی در مدل استفاده می کنند. از طرفی در بیشتر صفات پیچیده یک منبع مهم تنوع، اثرات غالبیت بوده که لحاظ نمودن این اثر در مدل ممکن است باعث افزایش صحت پیش بینی های ژنومی گردند. در این مطالعه که با استفاده از شبیه سازی داده انجام شد، تاثیر مقادیر مختلف وراثت پذیری (1/0، 3/0 و 5/0) و نیز مقادیر مختلف نسبت واریانس غالبیت به واریانس فنوتیپی (0، 05/0 و 15/0) بر صحت انتخاب ژنومی در روش های آماری پارامتری ( بیز A، B و LASSO) و ناپارامتری (RKHS) بررسی شد. همبستگی بین ارزش های اصلاحی حقیقی و ارزش های اصلاحی ژنومی، به عنوان معیاری از صحت پیش بینی های ژنومی برای سناریوهای مختلف به کمک نرم افزار R برآورد گردید. نتایج این مطالعه نشان داد که با افزایش مقدار وراثت پذیری در تمام روش ها صحت پیش بینی ژنومی افزایش پیدا می کند. همچنین با افزایش مقادیر نسبت واریانس غالبیت به واریانس فنوتیپی در مدل، شیب صحت ژنومی در روش های پارامتری کند گردیده ولی در روش ناپارامتری سرعت افزایش صحت ادامه پیدا نمود. میانگین مربعات خطا با افزایش مقدار نسبت واریانس غالبیت به واریانس فنوتیپی در روش ناپارامتری بیشتر کاهش یافت. از این رو می توان چنین نتیجه گرفت که با افزایش سطح نسبت واریانس غالبیت به واریانس فنوتیپی در مدل، استفاده از روش های ناپارامتری احتمالا بهتر از روش های پارامتری صحت پیش بینی های ژنومی را برآورد می کنند.
کلیدواژگان:
زبان:
فارسی
انتشار در:
صفحات:
161 تا 167
لینک کوتاه:
magiran.com/p1805905
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 1,390,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!