Perspective on Possible Recombination Event in Fusion Protein Gene of Newcastle Disease Viruses Isolated in Iran
Abstract:
Background And Aims
Newcastle disease (ND), caused by the virulent Newcastle disease virus (NDV), is one of the most important viral diseases in birds. In recent years recombination occurring throughout the NDVs genome isolated in China and Indonesia has been reported. This study was focused to investigate the recombination events in the F gene of the Iranian NDVs to generate useful data that can be applied in controlling programs.
Materials And Methods
Sequences of 1200 base pairs of the F gene of Iranian NDVs were analyzed compared with the isolates from other reference strains. Divergence between the gene sequences and the influence of natural selection were estimated. The neutralizing epitopes and potential N-glycosylation sites within F proteins were determined. Possible recombination within the sequences was analyzed using RDP3 software.
Results
Alignment and phylogenetic analysis based on the F gene revealed that Iranian NDVs share a higher nucleotide identity with NDVs representing genotype VII and further clustered into two sub-genotypes. The calculated Ka/Ks and negative Tajima’s D test indicate purifying/stabilizing selection. No recombination events were detected in F gene of Iranian NDV sequences deposited in GenBank.
Conclusions
While no recombination event was identified for the gene, constant molecular and pathological characterization of circulating NDVs are needed to detect an evolutionary feature of the viruses.
Article Type:
Research/Original Article
Language:
English
Published:
Iranian Journal of Virology, Volume:11 Issue: 2, 2017
Pages:
1 - 7
magiran.com/p1814722  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
در سایت عضو شوید و هزینه اشتراک یک‌ساله سایت به مبلغ 400,000ريال را پرداخت کنید. همزمان با برقراری دوره اشتراک بسته دانلود 100 مطلب نیز برای شما فعال خواهد شد!
پرداخت با کارتهای اعتباری بین المللی از طریق PayPal امکانپذیر است.
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی همه کاربران به متن مطالب خریداری نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.