طراحی و داکینگ اکسیم های جدید به عنوان فعالسازهای استیل کولین استراز مهارشده با عوامل عصبی

در این مطالعه یک گروه از اکسیم های بر پایه نایترون دارای بخش پیریدینیوم، به عنوان کاندیدهای دارویی جدید در فعال سازی استیل کولین استراز (AChE) مهار شده، با مطالعات داکینگ معرفی شده اند.
ساختار شیمیایی فعال سازهای جدید با استفاده از برنامه هایپرکم ساخته شدند و مطالعات کانفورماسیونی از طریق روش نیمه تجربی انجام گردید. در محاسبات داکینگ اکسیم های طراحی شده از برنامه AutoDock استفاده گردید.
انرژی اتصال برای ابیدوکسیم و پارالیدوکسیم به ترتیب 59/8- و 61/5- حاصل گردید. این اکسیم های رایج در جایگاه فعال برهمکنش های هیدروژنی و π-π داشتند. محاسبات داکینگ نشان داد که اکسیم های بر پایه نایترونی برهمکنش های هیدروژنی و π-π با دنباله های آروماتیکی، آنیونی محیطی و سه گانه کاتالیستی در جایگاه فعال ایجاد می کنند. همچنین، این ترکیبات انرژی اتصال بالاتری نسبت به پارالیدوکسیم برخوردار بوده و انرژی اتصال قابل مقایسه ای نسبت به ابیدوکسیم داشته اند.
بررسی نتایج نشان داد، اکسیم های طراحی شده، انرژی اتصال نویدبخشی در مقایسه با اکسیم های رایج ابیدوکسیم و پارالیدوکسیم دارند. بیس-پیریدینیوم اکسیم ها نسبت به مونو-پیریدینیوم اکسیم ها، به دلیل برهمکنش های اضافی هیدروژنی و π-π در جایگاه فعال، نتایج بهتری نشان داده اند. همچنین، اکسیم های طراحی شده ای که حلقه ایمیدازول در موقعیت 3 حلقه پیریدینیوم قرار داشت در اکثر موارد جهت گیری و برهمکنش های مناسب تری در جایگاه فعال نشان دادند.