بررسی خصوصیات مولکولی جمعیت نوترکیب اینبرد برنج با استفاده از نشانگر رتروترانسپوزونی iPBS

در مطالعات ژنتیکی علاوه بر نشانگرهایمولکولی مبتنی برDNA می توان ازرتروترانسپوزون یا ژن های پرشی به عنوان نشانگر جهت ارزیابی ویژگی ها و خصوصیات تنوع ژنتیکی در گونه های گیاهی استفاده نمود. از آنجایی که رتروترانسپوزون ها قابلیت جابجایی در طول ژنوم را دارا هستند از این رو باعث ایجاد تغییر در ترکیب ژنوم می گردند. بدین ترتیب باعث افزایش بیان بعضی از ژن ها و یا خاموش شدن ژن های دیگر می گردند. از طرفی رتروترانسپوزون ها فعالیت رونوشت برداری ژن ها را در بافت ها و همچنین تنش های زیستی و غیرزیستی تحت تاثیر قرار می دهند. در این پژوهش جهت بررسی خصوصیات مولکولی و تمایز 130 لاین اینبرد برنج که حاصل تلاقی برنج ندا و هاشمی می باشند از نشاگر مولکولی رتروترانسپوزونی iPBS استفاده شد. 21 آغازگر استفاده شده 2990 باند را تولید کردند که 1449 باند چندشکل بودند. با توجه به تجزیه بسط چندشکلی آغازگرها، آغازگر R2020 در مجموع 443 باند چندشکل را نشان داد که با79/56 درصد بیشترین چندشکلی را در بین آغازگرها از خود نشان داد. هیچ آغازگری با باند تک شکل مشاهده نشد. لاین های 149، 151، 154، 146 و 148 همراه با والدین در یک کلاستر قرار گرفته و لاین های 67، 63 و 82 در کلاستر دوم با نزدیک ترین فاصله به کلاستر والدین قرار گرفتند که در مجموع این لاین ها از نظر حضور ژن های رتروترانسپوزونی دارای بیشترین شباهت ژنتیکی با والدین خود می باشند.نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که می توان از نشانگرمولکولی iPBS در ارزیابی خصوصیات مولکولی لاین های ژنتیکی در یک جمعیت اصلاحی و برنامه های به نژادی به منظور ترسیم نقشه های ژنتیکی استفاده نمود.
در مطالعات ژنتیکی علاوه بر نشانگرهایمولکولی مبتنی برDNA می توان ازرتروترانسپوزون یا ژن های پرشی به عنوان نشانگر جهت ارزیابی ویژگی ها و خصوصیات تنوع ژنتیکی در گونه های گیاهی استفاده نمود. از آنجایی که رتروترانسپوزون ها قابلیت جابجایی در طول ژنوم را دارا هستند از این رو باعث ایجاد تغییر در ترکیب ژنوم می گردند. بدین ترتیب باعث افزایش بیان بعضی از ژن ها و یا خاموش شدن ژن های دیگر می گردند. از طرفی رتروترانسپوزون ها فعالیت رونوشت برداری ژن ها را در بافت ها و همچنین تنش های زیستی و غیرزیستی تحت تاثیر قرار می دهند. در این پژوهش جهت بررسی خصوصیات مولکولی و تمایز 130 لاین اینبرد برنج که حاصل تلاقی برنج ندا و هاشمی می باشند از نشاگر مولکولی رتروترانسپوزونی iPBS استفاده شد. 21 آغازگر استفاده شده 2990 باند را تولید کردند که 1449 باند چندشکل بودند. با توجه به تجزیه بسط چندشکلی آغازگرها، آغازگر R2020 در مجموع 443 باند چندشکل را نشان داد که با79/56 درصد بیشترین چندشکلی را در بین آغازگرها از خود نشان داد. هیچ آغازگری با باند تک شکل مشاهده نشد. لاین های 149، 151، 154، 146 و 148 همراه با والدین در یک کلاستر قرار گرفته و لاین های 67، 63 و 82 در کلاستر دوم با نزدیک ترین فاصله به کلاستر والدین قرار گرفتند که در مجموع این لاین ها از نظر حضور ژن های رتروترانسپوزونی دارای بیشترین شباهت ژنتیکی با والدین خود می باشند.نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که می توان از نشانگرمولکولی iPBS در ارزیابی خصوصیات مولکولی لاین های ژنتیکی در یک جمعیت اصلاحی و برنامه های به نژادی به منظور ترسیم نقشه های ژنتیکی استفاده نمود.