تعیین اپی توپ های فضایی جزء دارای قابلیت کریستالی مولکول ایمونوگلوبولین G انسان توسط ایمونوانفورماتیک

ایمونوگلوبولین ها گروهی از پروتئین های سرم هستند که نقش مهمی در دفاع علیه میکروارگانیسم ها بر عهده دارند. ایمونوگلوبولین G فراوان ترین ایمونوگلوبولین سرم بوده و بین شدت برخی بیماری ها از جمله عفونت ها و سطح ایمونوگلوبولین G، ارتباط وجود دارد. برای سنجش دقیق ایمونوگلوبولین G، ابزارهای شناسایی اختصاصی از جمله آنتی بادی های منوکلونال مورد نیاز می باشند. ایمونوانفورماتیک شاخه ای از ایمونولوژی است که با به کارگیری داده های زیستی موجود در کامپیوتر به تشخیص دقیق تر بیماری ها کمک می کند. هدف از پژوهش کنونی تعیین اپی توپ های فضایی جزء دارای قابلیت کریستالی مولکول ایمونوگلوبولین G انسان به وسیله ایمونوانفورماتیک می باشد.
این مطالعه از نوع مطالعات علوم پایه بوده که از تیر 1392 تا خرداد 1393 در دانشکده پزشکی دانشگاه شاهد در شهر تهران انجام شد. توالی اسیدهای آمینه و ساختار سوم IgG مرجع انسان در پایگاه اطلاعاتی Protein Data Bank (PDB)، ساختار دوم IgG مرجع توسط نرم افزار Phyre2 (http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/~phyre2/) و اپی توپ های فضایی بخش Fc مولکول IgG انسان توسط نرم افزارهای ElliPro (http://tools.iedb.org/ellipro/) و DiscoTope (http://www.cbs.dtu.dk/services/DiscoTope/) تعیین شدند.
دو اپی توپ فضایی توسط نرم افزار ElliPro (یکی در دمین CH2 و دیگری مشترک بین دمین های CH2 و CH3) و دو اپی توپ فضایی توسط نرم افزار DiscoTope که هر دو مشترک بین دمین های CH2 و CH3 هستند در بخش Fc مولکول IgG انسان شناسایی شدند.
در این پژوهش تعدادی از اپی توپ های فضایی بخش Fc مولکول IgG انسان توسط دو نرم افزار ایمونوانفورماتیکی شناسایی شدند. اپی توپ های شناسایی شده توسط هر دو نرم افزار، در دمین های CH2 و CH3 زنجیره سنگین مولکول IgG واقع شده اند.