استفاده از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی برای شناسایی اهداف بالقوه پروتئینی در پاتوژن Pseudomonas syringae به منظور کنترل این پاتوژن

شناسایی اهداف اختصاصی در هر پاتوژن برای جلوگیری از اثرهای سوء مصرف سموم شیمیایی ضروری است. در مطالعه حاضر، با استفاده از یک روش بیوانفورماتیکی مبتنی بر همولوژی، پروتئوم پاتوژن P. syringae با پروتئوم گیاه گوجه فرنگی و دیگر محصول های کشاورزی میزبان آن مقایسه و تعدادی پروتئین به عنوان اهداف بالقوه برای مبارزه در پاتوژن انتخاب شدند. پروتئوم پاتوژن با گیاهان میزبان مقایسه و پروتئین های غیرمشابه انتخاب شدند. این پروتئین ها با پروتئوم انسان و سایر موجودات غیرهدف مقایسه و پروتئین های غیرمشابه انتخاب و اهداف بالقوه تحت آنالیزهای کیفی مختلفی قرار گرفتند. نتایج آنالیزها، 95 پروتئین را به عنوان اهداف منحصر بفرد مشخص کرد. از مجموع پروتئین ها، 59 پروتئین در سیتوپلاسم، 15 پروتئین در غشاء داخلی، 17 پروتئین در فضای پری پلاسمیک، 3 پروتئین در غشاء خارجی و 1 پروتئین در خارج از سلول پاتوژن P. syringae تجمع پیدا می کردند. پروتئین های مشخص شده در این مطالعه، اهدافی بسیار موثر برای مبارزه بوده و هدف قرار دادن چنین پروتئین هایی می تواند به طور موثری باعث کنترل پاتوژن P. syringae شود. هم چنین طراحی و تولید مواد شیمیایی علیه این پروتئین های هدف، در کنار کنترل موثر این پاتوژن، می تواند طیف وسیعی از پاتوژن ها را کنترل کرده و از اثرهای مضر بر انسان، موجودات غیرهدف و محیط زیست جلوگیری کند.