Applying High-quality DNA Melting Curve Analysis in Identifying Staphylococcus aureus and Methicillin-resistant Strains
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Background and purpose: High Resolution Melting curve analysis DNA (HRM) is one of the most sensitive and precise methods for detecting Staphylococcus aureus and resistance to Methicillin. The aim of this study was to analyze the HRM for detection of methicillin-resistant S. aureus strains.
Materials and methods
In this experimental study, standard strains of S.aureus ATCC25923 and ATCC 33592 were used. To identify S.aureus from ITS gene and methicillin resistance, the mecA gene was used. Analysis was performed using StepOne v2.3 and HRM v3.0.1. Sequencing results were used as gold standard.
Results
The analytical sensitivity of the PCR method by ITS primer was capable of detecting 104 CFU bacteria and detecting bacteria for the mecA gene up to 103 CFU. The analytical sensitivity of the HRM method was also valid for ITS gene primer to dilute 10-2 CFU and the mecA gene primer up to a dilution of 10-5 CFU to detect bacteria. In HRM analysis, the lowest error rate was observed in the melting curves of DNA. Thus, considering the closest temperature range for analysis, the melting temperature for the ITS gene was 86 ± 0.5°C and for the mecA gene was 81± 0.5°C. The results of temperature and sequence determination proved the specificity of the HRM.
Conclusion
The HRM has high sensitivity and specificity for detecting low levels of bacteria.
Language:
Persian
Published:
Journal of Mazandaran University of Medical Sciences, Volume:28 Issue: 167, 2018
Pages:
83 to 93
magiran.com/p1907361  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!