شناسایی و تعیین خصوصیات میکرو RNA های محافظت شده Coriandrum sativum L.با استفاده از داده های توالی یابی نسل جدید

میکرو RNA ها (miRNAs) گروهی از مولکول های RNA کوچک و غیر کدکننده با طولی حدود 24-18 نوکلئوتید هستند که بیان ژن های هدف خود را در سطوح مختلف رونویسی و پس از رونویسی در گیاهان کنترل می کنند. میکرو RNA ها در فرآیندهای مختلفی مانند رشد و نمو، فرآیندهای زیستی، تکثیر سلولی و پاسخ به تنش ها در گیاهان نقش مهمی بازی می کنند. گشنیز زراعی با نام علمی (Coriandrum sativum L.) گیاهی از خانواده چتریان (Apiaceae) است که دارای کاربردهای غذایی و دارویی مختلفی است. ژنوم این گیاه تاکنون توالی یابی نشده است و هیچ گونه گزارشی از شناسایی میکرو RNA ها برای آن ثبت نشده است. مطالعه حاضر به منظور شناسایی میکرو RNA های محافظت شده بالقوه و ژن های هدف آن ها در ترنسکریپتوم گیاه گشنیز صورت گرفت. ابتدا ترنسکریپتوم بافت های بذر و برگ این گیاه سرهم بندی شد و رونوشت های غیر کد کننده به پروتئین شناسایی و به عنوان توالی های کاندید پیش ساز میکرو RNA در نظر گرفته شدند. در نهایت از بین توالی های کاندید سه میکرو RNA با نام های csa-miR162، csa-miR169 و csa-miR399 متعلق به سه خانواده محافظت شده میکرو RNA پس از اعمال فیلترهای سخت گیرانه شناسایی شد. میکرو RNAهای شناسایی شده دارای بیان متفاوتی در بافت های بذر و برگ بودند و نقش ژن های هدفشان در فرآیندهای مختلف زیستی نیز مورد تایید قرار گرفت. در مجموع با توجه به اینکه میکرو RNAهای شناسایی شده در مطالعه حاضر دارای نقش تنظیمی بر طیف وسیعی از شبکه های ژنی و فرآیندهای زیستی مختلف در گیاه گشنیز هستند، می توان از آن ها به عنوان ژن های کاندید در بهبود عملکرد کمی و کیفی و همچنین مقاومت به تنش های مختلف در این گیاه بهره برد.