A Comparative Analysis of Gene Expression Profile in Liver and Esophageal Cancer using Expressed Sequence Tags
Message:
Abstract:
Background and objectives
Liver and esophageal cancers are common among the Iranian population. This study aims to explore the common up-regulated genes in liver and esophageal cancer tissues using expressed sequence tags (ESTs) and to identify the role of key genes in cancer development.
Methods
EST profiles of protein-coding genes in normal and cancerous hepatic and esophageal tissues were extracted from the UniGene database. Genes with > 1500 transcripts per million were selected as highly expressed. The cancer to normal ratio of  up-regulated genes was calculated. The shared overexpressed genes between liver and esophageal cancer tissues were determined. Finally, functional classification and pathway analysis were performed on the genes using the STRING and Enrichr databases.
Results
Of 17,242 genes, 53 and 26 genes were overexpressed in the liver and esophageal cancer tissues, respectively. Nine up-regulated genes (APLP2, EEF1G, ENO1, HSP90AA1, HSP90AB1, HSPA8, KRT18, RPL4 and UBC) were shared between the two cancer tissues, which were involved in cell cycle progression through G2/M checkpoint, G1/S transition and DNA replication. They were also involved in the vascular endothelial growth factor, hypoxia-inducible factor 1 and estrogen signal pathways as well as the Toll-like receptor cascade.
Conclusion
Based on the results, the identically up-regulated genes and underlying molecular mechanisms implicated in both cancers could be valuable targets for diagnosis and treatment of cancer.
Language:
English
Published:
Journal of Clinical and Basic Research, Volume:3 Issue: 2, 2019
Pages:
27 - 35
magiran.com/p2023066  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
در سایت عضو شوید و هزینه اشتراک یک‌ساله سایت به مبلغ 400,000ريال را پرداخت کنید. همزمان با برقراری دوره اشتراک بسته دانلود 100 مطلب نیز برای شما فعال خواهد شد!
پرداخت با کارتهای اعتباری بین المللی از طریق PayPal امکانپذیر است.
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی همه کاربران به متن مطالب خریداری نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.