پلی مورفیسم ژنومی انتروکوکوس فکالیس جدا شده از موارد بالینی با استفاده از دو روش های ERIC-PCR و BOX-PCR

ژنوم انتروکوکوس تعداد زیادی توالی تکراری‎ ‎ دارد که به طور تصادفی در طول ‏DNA‏ پراکنده شده اند. در‏ERIC-PCR‏ برای هر سویه یک الگوی مجزا به دست می آید و یک تایپ جداگانه در نظر گرفته می شود. ‏ژنوم پروکاریوتی و یوکاریوتی شامل توالی های تکراری است که نسبتا کوتاه و غیر کد دهنده هستند. آغازگرهای BOX-PCR و ERIC-PCR مکمل این توالی های تکراری هستند و اجازه می دهد تا اتصال اختصاصی انجام گردد و الگوهای منحصر به فرد اثر انگشتی BOX-PCR و ERIC-PCR با قابلیت تولید مجدد فراهم شود.

در‎ ‎این‎ ‎مطالعه‎ ‎مقطعی-توصیفی، بر‎ ‎اساس‎ ‎مطالعات قبلی‎ ‎و‎ ‎سطح‎ ‎اطمینان‎ ‎‏95%‏‎ ‎با‎ ‎استفاده‎ ‎از‎ ‎فرمولn= z2P(1-P)/d2‎‏ و‎ ‎خطای‎ ‎قابل‎ ‎قبول 05/0، تعداد 60 سویه انتروکوک فکالیس از نمونه های بالینی جمع آوری و در شرایط استریل بر روی محیط KFآگار کشت و مدت 24 ساعت در حرارت 37 درجه سانتی گراد گرم خانه گذاری و به وسیله تست های بیوشیمیایی نمونه های انتروکوک فکالیس تعیین هویت شدند. DNA نمونه ها استخراج و آزمایش BOX-PCR وERIC-PCR صورت گرفت.

نتایج آزمون BOX-PCR و آنالیز دندوگرام نشان داد که، تمامی سویه ها در سطح تشابه 58 درصد به 25 کلاستر مجزا قابل تمایز بودند. هم چنین نتایج آزمون ERIC-PCR نشان داد که تمامی سویه ها در سطح تشابه 58 درصد به 15 کلاستر مجزا تفکیک شدند.

انگشت نگاری مولکولی توسط روش BOX-PCR دارای قدرت تفریق و تمایز بسیار مناسب تری نسبت به ERIC-PCR، جهت تایپینگ جدایه های باکتری ها می باشد و دارای کاربرد فراوان در مطالعات اپیدمیولوژی و ردیابی منبع عفونت و تاکسونومی هستند.