بررسی بیوانفورماتیکی microRNA های دخیل در تنش سرما و اثر آن ها بر پروتئین های مرتبط با متابولیسم اسیدهای چرب در کلزا (Brassica napus L.)

کلزا (Brassica napus) از مهم ترین گیاهان روغنی در سطح جهان است که علاوه بر دارا بودن ذخایر غنی اسیدهای چرب، حاوی پروتئین نیز می باشد. تنش سرما از عوامل محدودکننده رشد این گیاه است که می تواند منجر به تغییرات وسیعی به لحاظ مولکولی در درون گیاه شود. در پژوهش حاضر، به منظور بررسی ارتباط بین مولکول های miRNA، تنش سرما، اسید های چرب و لیپیدها، مولکول های miRNA با اسامی bna-miR164a، bra-miR5712، bra-miR5717، bna-miR6029، bna-miR6035، bna-N_miR2، bna-N_miR16 که قبلا به صورت جداگانه در سرما و بیوسنتز اسید های چرب بررسی شده بودند، انتخاب شدند. سپس پیشبینی بیوانفورماتیکی ژن های هدف، بررسی هستیشناسی و مسیر عملکردی آن ها و ترسیم شبکه برهم کنش پروتئینها انجام شد. در نتیجه مشخص شد مولکول های miRNA که در تنش سرما موثرند، علاوه بر اثر تنظیمی بر ژن های هدفی همچون SCRM2, HOS1, STZ GLP4, PP2CA که در پاسخ به سرما و پاسخ به محرک دمایی تاثیر گذارند، بر ژن های هدف دیگری همچون ,KAS2 ,FAD8 ,FAD4 ,AAD3 FAD7,FAD2 که در مسیر فرآیندهای بیولوژیکی مانند بیوسنتز اسید چرب اشباع نشده، متابولیسم اسید چرب غیر اشباع، بیوسنتز اسید چرب، متابولیسم اسید چرب، کاتابولیسم لیپید سلولی و متابولیسم لیپید، بیوسنتز لیپید، متابولیسم لیپید سلولی نقش دارند نیز اثر گذارند. بررسی برهمکنش های پروتئین-پروتئین نیز حاکی از ارتباط ژن های هدف درگیر در تنش سرما با ژن های هدف درگیر در بیوسنتز اسید های چرب بود. گام بعدی در پژوهش های پیش رو بررسی بیان این مولکول های miRNA و ژن های هدف درطی تنش سرما است تا وجود ارتباط تنظیمی میان آن ها توسط روش های آزمایشگاهی مورد تایید بیش تر قرار گیرد.