تنوع ژنتیکی در یک مجموعه از ژنوتیپ های گندم دوروم با استفاده از نشانگرهای IRAP و REMAP

پیام:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:

رتروترنسپوزون ها به خاطر توانایی ایجاد تنوع ژنتیکی و تغییرات ژنومی در ژنوم های گیاهی به عنوان نشانگرهای مولکولی ایده آل جهت مطالعه تنوع ژنتیکی، انگشت نگاری DNA و تهیه نقشه ژنتیکی در گونه های گیاهی بشمار می روند. در این مطالعه نشانگرهای IRAP و REMAP مبتنی برخانواده های رتروترنسپوزونی LTR دار (از گندم و جو) جهت مطالعه تنوع ژنتیکی و تعیین ساختار ژنتیکی 94 لاین و رقم بومی گندم دوروم (Triticum turgidum L.) مورد استفاده قرار گرفت. در کل با استفاده از 6 ترکیب آغازگری IRAP و 15 ترکیب آغازگری REMAP به ترتیب تعداد 63 و 141 مکان تکثیر شد. درصد چندشکلی برای آغازگرهای IRAP و REMAP به ترتیب 15/47 و 81/47 درصد بود. بین میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار (He)، تعداد الل های موثر (Ne) و شاخص شانن (I) محاسبه شده بر اساس نشانگرهای IRAP و REMAP اختلاف قابل توجهی مشاهده نشد. گروهبندی مبتنی بر هر دو روش بیزین و تجزیه خوشه ای بر مبنای الگوریتم Neighbor joining (NJ) ژنوتیپ های مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد. تنوع ژنتیکی قابل ملاحضه ای (11 درصد) بین گروه های حاصل تجزیه ساختار ژنتیکی با استفاده از نرم افزار STRUCTUR در مقایسه با تنوع درون گروهی (89 درصد) حاصل شد (PhiPT =0.111; P=0.001). بر اساس نتایج حاصل از این تحقیق می توان اظهار داشت که نشانگرهای IRAP و REMAP توسعه یافته بر اساس رتروترنسپوزون های فعال می توانند به عنوان ابزار موثر و کارا در برنامه های اصلاحی گندم دوروم جهت تشخیص والدین با فاصله ژنتیکی مناسب مورد استفاده قرار گیرند.

زبان:
انگلیسی
صفحات:
271 تا 285
لینک کوتاه:
magiran.com/p2084747 
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!