شناسایی برخی از سیانوباکتری های هتروسیست دار مزارع برنج استان مازندران با تاکید بر رویکرد چند ژنی

در گذشته طبقه بندی سیانوباکتری ها تنها بر اساس مورفولوژی انجام می گرفت. اما امروزه از شاخص های دقیق تر مولکولی استفاده می شود. هدف از این مطالعه شناسایی تعدادی از سیانوباکتری های هتروسیست دار به واسطه تاکسونومی پلی فازیک و بررسی رویکرد چند ژنی به منظور بالابردن صحت شناسایی می باشد.

پس از بررسی شاخص های ریخت شناختی و شناسایی اولیه، به منظور بررسی وضعیت تاکسونومی و یافتن روابط فیلوژنی از توالی ژن 16S rRNA و ژن های کارکردی tufA، rbcL، psbA و rpoC1 استفاده شد. بدین منظور پس از استخراج DNA، تکثیر قطعات ژنی و توالی یابی آنها، با رسم درخت های فیلوژنی از ژن های مربوطه به کمک نرم افزار MEGA، جایگاه دقیق نمونه ها مشخص شد.

در میان ژن های کارکردی مورد مطالعه، ژن rpoC1 توانایی تفکیک بسیار خوبی در سطح جنس نشان داد، به طوری که نتایج فیلوژنی ژن 16S rRNA را کاملا تکمیل و تایید کرد و در نهایت بر اساس نتایج به دست آمده 4 نمونه از جنس  دسمونوستوک و 2 نمونه از جنس کلوتریکس معرفی شدند.

نتایج این تحقیق قدرت ژن rpoC1 در تفکیک درست جنس ها و تایید نتایج مورفولوژی و فیلوژنی ژن 16S rRNA را نشان می دهد. مطالعه فیلوژنتیکی با استفاده مارکر ژنی rpoC1 به شفاف سازی ارتباطات فیلوژنتیکی میان سیانوباکتری ها کمک می کند و علاوه بر آن شاهدی بر منشا کلروپلاستی و حضور مسیرهای تکاملی متفاوت میان آن ها می باشد.