Bioinformatics Comparison of Codon Usage of Genes Encoding Phosphate Transporter in Terms of Salt Tolerance, Day Length, Temperature and Pollination in Different Plants
Message:
Abstract:
In order to study and compare the phosphate transporter gene codon usage and it's respond to the traits like salt tolerance, day length, Pollination and temperature in different plants, 100 isoform from 10 plants are extracted from NCBI website and then analyzed with Gene Infinity and Minitab 16 software. The result shows that the highest codon usage similarity (81.95%) was for wheat and oryza (annual, self-polinated and Psychrophilic) from Poaceae family. The result for poaceae family shows that the highest mean abundance was for codons that have U or G at the end. In this study Cucurbita maxima (salt tolerance, annual and cross pollinated) have the lowest codon usage similarity (70.37%) in compare with other plants in this study. The highest difference between families was for Fabaceae (77.64%) but they are divided in one group at the cluster. So the results show that the families that have lowest distance have the highest codon usage similarity in terms of salt tolerance, day length, Pollination and temperature. It is conceivable that a direct relationship would exist between preferred codons and division of plant families.
Article Type:
Research/Original Article
Language:
English
Published:
International Journal of Advanced Biological and Biomedical Research, Volume:2 Issue: 2, 2014
Pages:
504 - 509
magiran.com/p2092464  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
در سایت عضو شوید و هزینه اشتراک یک‌ساله سایت به مبلغ 300,000ريال را پرداخت کنید. همزمان با برقراری دوره اشتراک بسته دانلود 100 مطلب نیز برای شما فعال خواهد شد!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی همه کاربران به متن مطالب خریداری نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.