استفاده از روش های سری زمانی جهت پیش بینی بیان ژن های دفاعی گندم تلقیح شده با Zymoseptoria tritici و اسیدسالیسیلیک

اندازه گیری میزان بیان ژن های دفاعی گیاهی روشی پرکاربرد و مفید برای بررسی مکانیسم مقاومت در گیاهان است، اما این روش در عین حال هزینه بر و زمان بر نیز می باشد. به منظور بررسی تاثیر اسیدسالیسیلیک بر تغییرات بیان بعضی از ژن های دفاعی درگیر در مقاومت (NADPH اکسیداز، اگزالات اکسیداز، پروتئین Stress responsive، گلوتاتیون S ترانسفراز و سوپراکسید دیسموتاز) گندم های تلقیح شده با بیمارگر  Z. triticiبه روش نوردرن بلات معکوس بررسی شد. بر اساس اطلاعات به دست آمده از نوردرن بلات معکوس جهت پیش بینی بیان ژن های درگیر در مقاومت از روش های میانگین متحرک ساده، میانگین متحرک وزنی و هموار سازی نمایی استفاده شد. در  24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر در همه ژن های مورد بررسی و در هر دو تیمار میزان بیان به بیشترین مقدار خود رسید و علی رغم تفاوت در هر ژن روند کلی افزایشی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که استفاده از روش هموارسازی نمایی، با توجه به محاسبه و مقایسه شاخص‏های قدرت پیش بینی، دارای دقت بالاتری نسبت به دو روش دیگر می باشد. میزان بیان، در مورد سه ژن NADPH اکسیداز، گلوتاتیون S ترانسفراز و اگزالات اکسیداز روند مشابه داشتند، به عبارتی تا 24 ساعت بعد از تلقیح بیمارگر، اسیدسالیسیلیک باعث افزایش شد و سپس میزان بیان روند کاهشی در پیش گرفت. بررسی بیان ژن روش بسیار حساسی است، و باید تحت شرایط کنترل شده باشد، و فقط تیمار مورد نظر محقق، تاثیرگذار بر روی بیان ژن در گیاه باشد، در این شرایط، پیشنهاد می شود اطلاعات بیان ژن ها در طی دوره هایی ابتدایی اندازه گیری شود، سپس با استفاده از این اطلاعات و روش های پیش‏بینی میزان بیان، برای زمان های بعدی مورد پیش بینی قرار گیرد.