جداسازی و توالی یابی ژن مربوط به آنتی پورتر هیدروژن/ سدیم غشای واکوئلی گیاه هالوفیت (.Kochia scoparia L)

در این پژوهش از گیاه دولپه ای و شورزی کوشیا (Kochia scoparia)به عنوان منبع برای جداسازی ژن استفاده شد. ابتدا با استفاده از پرایمرهای طراحی شده در مناطق حفاظت شده این ژن در گیاهان هم خانواده، طول 1605 نوکلیوتیدی و توالی 535 اسید آمینه ای از توالی کدکننده این ژن شناسایی و توالی یابی شد. با استفاده از آنالیز BLAST میزان شباهت این توالی با 90%-87% همولوژی در سطح نوکلیوتیدی و 99%-98% در سطح اسید آمینه ای با ژن هایNHX  گیاهان خانواده اسفناجیان تعیین شد. آنالیزهای تعیین خصوصیات پروتئینی و ارتباط آن با پروتئین های دیگر با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیکیانجام شد. براساس وجود ساختارهای دوم پروتئینی مشخص شد که در پلی پپتید موردبررسی، 11 مارپیچ آلفا در ناحیه گذرنده از غشا وجود دارد و اسیدآمینه هایی با خصوصیت آب گریزی در ناحیه گذرنده از غشا واقع شده است و در ادامه انتهای کربوکسیلی با تعداد کمتری مارپیچ آلفا و میزان آب دوست بودن بالا به عنوان ناحیه سیتوپلاسمی پروتئین موردنظر مطرح می شود. این نتایج نقش دفع سدیم توسط ناقل های غشای پلاسمایی را برای وجود واکنش مقاومت به شوری در گیاه کوشیا تایید نمود.