حضور و جایگاه تکاملی سه گروه ژنی پلی کتاید سنتازهای تیپ I و II و پپتید سنتتاز غیرریبوزومی در سه سویه استرپتومایسس Iz8، F6 و F9
غربال گری پلی کتاید سنتازها و پپتید سنتتازهای غیرریبوزومی راهی سریع برای اثبات پتانسیل تولید عامل ضدمیکروبی و کشف عوامل دارویی جدید می باشد. در این راستا حضور و جایگاه تکاملی این خوشه های ژنی در سه سویه استرپتومایسس مطالعه شد.
مواد و روش ها:
حضور احتمالی سه گروه ژنی پلی کتاید سنتازهای تیپ I و II و پپتید سنتتازهای غیرریبوزومی به ترتیب در سه سویه استرپتومایسس Iz8،F6 و F9 با استفاده از پرایمرهای لغزشی بررسی و اثبات شد. برای تفکیک قطعات مختلف با اندازه یکسان و توالی متفاوت، محصولات PCR با اندازه مربوطه به وکتور pTG19-T پیوند و سپس در سلول های اشرشیا کلی سویه TOP10 ترانسفورم شدند. برای بررسی دقیق تر تنوع قطعات، از ژل پلی آکریل آمید استفاده شد. از هر گروه ژنی چند کلون تعببن توالی و درخت فیلوژنی در نرم افزار مستربیز رسم شد.
کلون های 3 و 8 از پلی کتاید سنتاز تیپ I، کلون 4 از پلی کتاید سنتاز تیپ II و کلون 5 از پپتید سنتتازهای غیرریبوزومی در پایگاه داده GenBank در سایت NCBI ثبت شدند. درخت های فیلوژنی با هم ردیفی نوکلیوتیدی و آمینواسیدی نشان دهنده قرارگیری کلون 8 از پلی کتاید سنتاز تیپ I و کلون 4 از پلی کتاید سنتاز تیپ II در کلادهای جداگانه و احتمال تولید عوامل ضدمیکروبی جدید می باشد.
نتیجه گیری:
با رسم درخت فیلوژنی و تعیین رابطه تکاملی احتمال حضور خوشه های ژنی با ترکیب بندی جدید و بنابراین تولید محصول جدید در سویه های Iz8 و F9 نشان داده شد.
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.