ردیابی و شناسایی برخی از گونه های جنس سودوموناس عامل پوسیدگی نرم با استفاده از ژن tuf

بیماری پوسیدگی نرم در گیاهان که توسط عوامل باکتریایی بیماری زا ایجاد می شوند، هرساله سبب کاهش محصولات تولیدی و همچنین خسارت به محصولات انباری می گردند. تحقیق حاضر به منظور ردیابی و شناسایی عوامل باکتریایی عامل پوسیدگی نرم متعلق به جنس سودوموناس در برخی از محصولات صیفی و گیاهان تزیینی انجام شد.

طی فصول زراعی در سال های 1394 تا 1396، نمونه های مشکوک و دارای علایم بیماری از میزبان های بادمجان، ذرت، برگ قاشقی، ذرت شیرین و گوجه فرنگی جمع آوری گردید. ویژگی های بیوشیمایی و موفولوژیکی جدایه ها بر اساس روش های استاندارد باکتری شناسی بررسی شدند. همچنین ژن tuf در جدایه های نماینده با استفاده از آغازگرهای Bac-tuf-F و Bac-tuf-R به روش واکنش زنجیره ای پلی مراز تکثیر و پس از توالی یابی با بانک داده های موجود در سایت NCBI با نرم افزار بلاست تجزیه وتحلیل و مقایسه شدند.

درمجموع 120 جدایه باکتریایی از نمونه های موردنظر جداسازی گردید. بر اساس تولید آنزیم تجزیه کننده پکتین، پنج جدایه از جنس سودوموناس انتخاب شد. بر اساس نتایج آزمون های بیوشیمیایی و همچنین فیلوژنی بر پایه توالی یابی ژن tuf، این جدایه ها به عنوان گونه های Pseudomonas aeruginosa، P. entomophila، P. mosselii و P. putida شناسایی شدند.

بر اساس دانش ما، این اولین گزارش از بیماری زایی P. aeruginosa در گوجه فرنگی، P. entomophila در ذرت شیرین و P. putida در بادمجان است. علاوه بر این، برای اولین بار P. aeruginosa و P. mosselii به عنوان عامل همراه بیماری به ترتیب در ذرت و بادمجان گزارش می شود.