The in Silico Characterization of a Salicylic Acid Analogue Coding Gene Clusters in Selected Pseudomonas Fluorescens Strains
Message:
Abstract:
Background
The microbial genome sequences provide solid in silico framework for interpretation their drug-like chemical scaffolds biosynthetic potential. The Pseudomonas fluorescens species is metabolically versatile and producing therapeutically important natural products.
Objectives
The main objective of the present study was to mine the publically available data of P. fluorescens strains genomes for putative drug-like metabolites identification.
Material and Methods
We implemented the computational biology resources of AntiSMASH and BAGEL3 for the secondary metabolites prediction from the P. fluorescens strains genome sequences. The predicted secondary metabolites were evaluated using drug discovery chemoinformatics resources, like Drugbank database search and molecular docking inspection.
Results
The analyses unveiled a wide array of chemical scaffolds biosynthesis in different P. fluorescens strains. Subsequently, the drug-like potential evaluation of these metabolites identified few strains, including P. fluorescens PT14, P. fluorescens A5O6, and P. fluorescens FW300-N2E3 that harbor the biosynthetic gene clusters for salicylic acid like metabolite biosynthesis. The molecular docking inspection of this metabolite against human cyclooxygenase and aldo-keto reductase targets revealed its feasible inhibitory potentials like other salicylates compounds.
Conclusion
The computational biology and drug discovery analyses identified different gene clusters in P. fluorescens genomes coding for salicylic acid like chemotypes biosynthesis. These gene clusters may worthy to target through metabolic engineering for the massive production of salicylates-like chemical scaffolds from microbial resources.
Article Type:
Research/Original Article
Language:
English
Published:
Iranian Journal of Biotechnology, Volume:17 Issue: 4, 2019
Pages:
50 - 57
magiran.com/p2117538  
برخی از خدمات از جمله دانلود متن مقالات تنها به مشترکان مگیران ارایه می‌گردد. شما می‌توانید به یکی از روش‌های زیر مشترک شوید:
اشتراک شخصی
در سایت عضو شوید و هزینه اشتراک یک‌ساله سایت به مبلغ 400,000ريال را پرداخت کنید. همزمان با برقراری دوره اشتراک بسته دانلود 100 مطلب نیز برای شما فعال خواهد شد!
پرداخت با کارتهای اعتباری بین المللی از طریق PayPal امکانپذیر است.
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی همه کاربران به متن مطالب خریداری نمایند!
توجه!
  • دسترسی به متن مقالات این پایگاه در قالب ارایه خدمات کتابخانه دیجیتال و با دریافت حق عضویت صورت می‌گیرد و مگیران بهایی برای هر مقاله تعیین نکرده و وجهی بابت آن دریافت نمی‌کند.
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.